MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009442	AACA	2	8	170630	170637	75 %	0 %	0 %	25 %	146317842
3502	NC_009442	GATTTG	2	12	170665	170676	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146317842
3503	NC_009442	TGG	2	6	170678	170683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317842
3504	NC_009442	TGG	2	6	170945	170950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317842
3505	NC_009442	AAG	2	6	171159	171164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317842
3506	NC_009442	AGA	2	6	171174	171179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317842
3507	NC_009442	GCA	2	6	171187	171192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317842
3508	NC_009442	TGC	2	6	171198	171203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317842
3509	NC_009442	GCA	2	6	171217	171222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317842
3510	NC_009442	GGAG	2	8	171258	171265	25 %	0 %	75 %	0 %	146317842
3511	NC_009442	AGG	2	6	171312	171317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_009442	ATT	2	6	171363	171368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009442	AGA	2	6	171397	171402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317843
3514	NC_009442	TGGA	2	8	171403	171410	25 %	25 %	50 %	0 %	146317843
3515	NC_009442	AATC	2	8	171515	171522	50 %	25 %	0 %	25 %	146317843
3516	NC_009442	GAA	2	6	171546	171551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317843
3517	NC_009442	TGGT	2	8	171603	171610	0 %	50 %	50 %	0 %	146317843
3518	NC_009442	GAA	2	6	171651	171656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317843
3519	NC_009442	TGA	2	6	171728	171733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317843
3520	NC_009442	CTG	2	6	171776	171781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317843
3521	NC_009442	A	6	6	171855	171860	100 %	0 %	0 %	0 %	146317843
3522	NC_009442	CAAG	2	8	171875	171882	50 %	0 %	25 %	25 %	146317843
3523	NC_009442	TAGA	2	8	171905	171912	50 %	25 %	25 %	0 %	146317843
3524	NC_009442	CATTG	2	10	171936	171945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3525	NC_009442	ATT	2	6	171971	171976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009442	A	6	6	172091	172096	100 %	0 %	0 %	0 %	146317844
3527	NC_009442	CAGT	2	8	172097	172104	25 %	25 %	25 %	25 %	146317844
3528	NC_009442	AAT	2	6	172144	172149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317844
3529	NC_009442	GAA	2	6	172168	172173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317844
3530	NC_009442	GGA	2	6	172233	172238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317844
3531	NC_009442	AAC	2	6	172248	172253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317844
3532	NC_009442	TGA	2	6	172278	172283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317844
3533	NC_009442	TA	3	6	172346	172351	50 %	50 %	0 %	0 %	146317844
3534	NC_009442	AAC	2	6	172394	172399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317844
3535	NC_009442	CAGCAA	2	12	172447	172458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146317844
3536	NC_009442	AGA	2	6	172527	172532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317844
3537	NC_009442	CTT	2	6	172548	172553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317844
3538	NC_009442	AG	3	6	172615	172620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009442	TGG	2	6	172712	172717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009442	T	6	6	172727	172732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009442	AGT	2	6	172739	172744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009442	ATTTTT	2	12	172757	172768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009442	AGG	2	6	172832	172837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009442	AAAG	2	8	172894	172901	75 %	0 %	25 %	0 %	146317845
3545	NC_009442	AGC	2	6	172940	172945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317845
3546	NC_009442	TCAA	2	8	172967	172974	50 %	25 %	0 %	25 %	146317845
3547	NC_009442	TTG	2	6	172975	172980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317845
3548	NC_009442	TTCC	2	8	172989	172996	0 %	50 %	0 %	50 %	146317845
3549	NC_009442	ATACA	2	10	173002	173011	60 %	20 %	0 %	20 %	146317845
3550	NC_009442	AAAG	2	8	173053	173060	75 %	0 %	25 %	0 %	146317845
3551	NC_009442	ATCT	2	8	173089	173096	25 %	50 %	0 %	25 %	146317845
3552	NC_009442	AAG	2	6	173102	173107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3553	NC_009442	CTT	2	6	173116	173121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317845
3554	NC_009442	ATCT	2	8	173122	173129	25 %	50 %	0 %	25 %	146317845
3555	NC_009442	ATT	2	6	173178	173183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317845
3556	NC_009442	ACA	2	6	173200	173205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317845
3557	NC_009442	ATC	2	6	173282	173287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317845
3558	NC_009442	GAA	2	6	173299	173304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3559	NC_009442	GT	3	6	173360	173365	0 %	50 %	50 %	0 %	146317845
3560	NC_009442	GAA	2	6	173413	173418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3561	NC_009442	CAA	2	6	173434	173439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317845
3562	NC_009442	ATT	2	6	173447	173452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317845
3563	NC_009442	AGA	2	6	173469	173474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3564	NC_009442	GA	3	6	173473	173478	50 %	0 %	50 %	0 %	146317845
3565	NC_009442	T	6	6	173496	173501	0 %	100 %	0 %	0 %	146317845
3566	NC_009442	TTTA	2	8	173508	173515	25 %	75 %	0 %	0 %	146317845
3567	NC_009442	AGGG	2	8	173564	173571	25 %	0 %	75 %	0 %	146317845
3568	NC_009442	ATT	2	6	173604	173609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317845
3569	NC_009442	TGC	2	6	173643	173648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317845
3570	NC_009442	GAT	2	6	173710	173715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317845
3571	NC_009442	TAC	2	6	173830	173835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317845
3572	NC_009442	AGA	2	6	173886	173891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3573	NC_009442	A	7	7	173916	173922	100 %	0 %	0 %	0 %	146317845
3574	NC_009442	TGG	2	6	173997	174002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317845
3575	NC_009442	CAA	2	6	174019	174024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317845
3576	NC_009442	GTT	2	6	174049	174054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317845
3577	NC_009442	TGA	2	6	174239	174244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317845
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3579	NC_009442	ATT	2	6	174264	174269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317845
3580	NC_009442	GATTGA	2	12	174312	174323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317845
3581	NC_009442	TTA	2	6	174328	174333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317845
3582	NC_009442	TTG	2	6	174338	174343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317845
3583	NC_009442	TCA	2	6	174360	174365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317845
3584	NC_009442	TCAA	2	8	174401	174408	50 %	25 %	0 %	25 %	146317845
3585	NC_009442	AGA	2	6	174444	174449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
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3587	NC_009442	AGA	2	6	174585	174590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3588	NC_009442	AGA	2	6	174645	174650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3589	NC_009442	GAA	3	9	174808	174816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317845
3590	NC_009442	CAA	2	6	174823	174828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317845
3591	NC_009442	ACA	2	6	174858	174863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317845
3592	NC_009442	AGG	2	6	174872	174877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317845
3593	NC_009442	GGT	2	6	175010	175015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317846
3594	NC_009442	TG	3	6	175036	175041	0 %	50 %	50 %	0 %	146317846
3595	NC_009442	TAT	2	6	175105	175110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317846
3596	NC_009442	ATGA	2	8	175115	175122	50 %	25 %	25 %	0 %	146317846
3597	NC_009442	GGTTT	2	10	175160	175169	0 %	60 %	40 %	0 %	146317846
3598	NC_009442	GCA	2	6	175319	175324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317847
3599	NC_009442	G	6	6	175336	175341	0 %	0 %	100 %	0 %	146317847
3600	NC_009442	TTG	2	6	175353	175358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317847
3601	NC_009442	TTG	3	9	175365	175373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317847
3602	NC_009442	ATT	2	6	175388	175393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317847
3603	NC_009442	GTT	2	6	175451	175456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317847
3604	NC_009442	AAT	2	6	175460	175465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317847
3605	NC_009442	AT	3	6	175573	175578	50 %	50 %	0 %	0 %	146317847
3606	NC_009442	CA	3	6	175595	175600	50 %	0 %	0 %	50 %	146317847
3607	NC_009442	TA	3	6	175602	175607	50 %	50 %	0 %	0 %	146317847
3608	NC_009442	TGGG	2	8	175671	175678	0 %	25 %	75 %	0 %	146317847
3609	NC_009442	GTG	2	6	175797	175802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317847
3610	NC_009442	TAG	2	6	175803	175808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317847
3611	NC_009442	TAAGTC	2	12	175825	175836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146317847
3612	NC_009442	TTTG	2	8	175933	175940	0 %	75 %	25 %	0 %	146317847
3613	NC_009442	GTG	2	6	175971	175976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317847
3614	NC_009442	GCA	2	6	176021	176026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317847
3615	NC_009442	TTATC	2	10	176037	176046	20 %	60 %	0 %	20 %	146317847
3616	NC_009442	GTT	2	6	176141	176146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317847
3617	NC_009442	GGT	2	6	176198	176203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317847
3618	NC_009442	ATT	2	6	176216	176221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317847
3619	NC_009442	CTT	2	6	176269	176274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317847
3620	NC_009442	GGT	2	6	176312	176317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317847
3621	NC_009442	GCTA	2	8	176467	176474	25 %	25 %	25 %	25 %	146317847
3622	NC_009442	A	6	6	176549	176554	100 %	0 %	0 %	0 %	146317847
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