MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37004	NC_009442	TAC	2	6	1812392	1812397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319571
37005	NC_009442	TTGA	2	8	1812480	1812487	25 %	50 %	25 %	0 %	146319571
37006	NC_009442	ATCA	2	8	1812576	1812583	50 %	25 %	0 %	25 %	146319571
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37009	NC_009442	TCA	2	6	1812793	1812798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319571
37010	NC_009442	GGTA	2	8	1812806	1812813	25 %	25 %	50 %	0 %	146319571
37011	NC_009442	CAAG	2	8	1812998	1813005	50 %	0 %	25 %	25 %	146319571
37012	NC_009442	CTG	2	6	1813052	1813057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319571
37013	NC_009442	CCAAG	2	10	1813112	1813121	40 %	0 %	20 %	40 %	146319571
37014	NC_009442	CAT	3	9	1813182	1813190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319571
37015	NC_009442	CTG	2	6	1813239	1813244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319572
37016	NC_009442	GGCA	2	8	1813250	1813257	25 %	0 %	50 %	25 %	146319572
37017	NC_009442	TTC	2	6	1813281	1813286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319572
37018	NC_009442	TTC	2	6	1813434	1813439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319572
37019	NC_009442	T	6	6	1813576	1813581	0 %	100 %	0 %	0 %	146319572
37020	NC_009442	CAC	2	6	1813673	1813678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319572
37021	NC_009442	GAC	2	6	1813695	1813700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319572
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37023	NC_009442	CAT	2	6	1813760	1813765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319572
37024	NC_009442	CAA	2	6	1813944	1813949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319572
37025	NC_009442	GCC	2	6	1814017	1814022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319572
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37028	NC_009442	TTCT	2	8	1814065	1814072	0 %	75 %	0 %	25 %	146319572
37029	NC_009442	ATG	2	6	1814080	1814085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319572
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37031	NC_009442	GTA	2	6	1814212	1814217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319573
37032	NC_009442	AAG	2	6	1814256	1814261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319573
37033	NC_009442	TGA	2	6	1814306	1814311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319573
37034	NC_009442	TTAG	2	8	1814348	1814355	25 %	50 %	25 %	0 %	146319573
37035	NC_009442	TAA	2	6	1814604	1814609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319573
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37038	NC_009442	TCTT	2	8	1814834	1814841	0 %	75 %	0 %	25 %	146319573
37039	NC_009442	AT	3	6	1815038	1815043	50 %	50 %	0 %	0 %	146319573
37040	NC_009442	TCT	2	6	1815110	1815115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319573
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37049	NC_009442	CTT	2	6	1815610	1815615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319573
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37054	NC_009442	TGAA	2	8	1815940	1815947	50 %	25 %	25 %	0 %	146319573
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37088	NC_009442	T	6	6	1817509	1817514	0 %	100 %	0 %	0 %	146319574
37089	NC_009442	AAG	2	6	1817526	1817531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319574
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37091	NC_009442	CT	3	6	1817733	1817738	0 %	50 %	0 %	50 %	146319574
37092	NC_009442	ATC	2	6	1817751	1817756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319574
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37096	NC_009442	TTC	2	6	1818034	1818039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37097	NC_009442	CTTTC	2	10	1818175	1818184	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37098	NC_009442	TA	3	6	1818197	1818202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37099	NC_009442	TTA	2	6	1818219	1818224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37100	NC_009442	A	7	7	1818230	1818236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37101	NC_009442	ATT	2	6	1818360	1818365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319575
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37103	NC_009442	TTGG	2	8	1818460	1818467	0 %	50 %	50 %	0 %	146319575
37104	NC_009442	CCTC	2	8	1818477	1818484	0 %	25 %	0 %	75 %	146319575
37105	NC_009442	CAATC	2	10	1818590	1818599	40 %	20 %	0 %	40 %	146319575
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37107	NC_009442	ATC	2	6	1818831	1818836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319575
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37111	NC_009442	A	7	7	1819058	1819064	100 %	0 %	0 %	0 %	146319575
37112	NC_009442	CTT	2	6	1819078	1819083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319575
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37114	NC_009442	CATT	2	8	1819153	1819160	25 %	50 %	0 %	25 %	146319575
37115	NC_009442	CAA	2	6	1819204	1819209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319575
37116	NC_009442	CTT	2	6	1819233	1819238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319575
37117	NC_009442	ATT	2	6	1819266	1819271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319575
37118	NC_009442	TGGA	2	8	1819374	1819381	25 %	25 %	50 %	0 %	146319575
37119	NC_009442	GCC	2	6	1819488	1819493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319575
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37121	NC_009442	CTGT	2	8	1820148	1820155	0 %	50 %	25 %	25 %	146319575
37122	NC_009442	CAAG	2	8	1820275	1820282	50 %	0 %	25 %	25 %	146319575
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37124	NC_009442	GTC	2	6	1820300	1820305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319575
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37127	NC_009442	ACAA	2	8	1820390	1820397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37128	NC_009442	GCCA	2	8	1820471	1820478	25 %	0 %	25 %	50 %	146319576
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37148	NC_009442	ATC	2	6	1821503	1821508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319576
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37164	NC_009442	CTT	2	6	1822267	1822272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319576
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37169	NC_009442	GAAC	2	8	1822698	1822705	50 %	0 %	25 %	25 %	146319576
37170	NC_009442	GAGG	2	8	1822711	1822718	25 %	0 %	75 %	0 %	146319576
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37216	NC_009442	TTTAG	2	10	1825102	1825111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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37218	NC_009442	CTC	2	6	1825137	1825142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37219	NC_009442	ATT	2	6	1825156	1825161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319577
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37226	NC_009442	CTT	2	6	1825747	1825752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319578
37227	NC_009442	TGC	2	6	1825820	1825825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319578
37228	NC_009442	ATC	3	9	1825832	1825840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319578
37229	NC_009442	GCT	2	6	1825845	1825850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319578
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37231	NC_009442	T	6	6	1825920	1825925	0 %	100 %	0 %	0 %	146319578
37232	NC_009442	GATT	2	8	1825936	1825943	25 %	50 %	25 %	0 %	146319578
37233	NC_009442	CGG	2	6	1825983	1825988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319578
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37332	NC_009442	T	6	6	1830771	1830776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37333	NC_009442	CT	3	6	1830831	1830836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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37348	NC_009442	ATT	2	6	1831539	1831544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37349	NC_009442	TA	3	6	1831570	1831575	50 %	50 %	0 %	0 %	146319583
37350	NC_009442	AAATG	2	10	1831582	1831591	60 %	20 %	20 %	0 %	146319583
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37352	NC_009442	GTC	2	6	1831656	1831661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319583
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37354	NC_009442	TGAT	2	8	1831695	1831702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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37457	NC_009442	A	7	7	1836465	1836471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37458	NC_009442	ATA	2	6	1836548	1836553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319589
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37469	NC_009442	GAT	2	6	1837211	1837216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37472	NC_009442	AAG	2	6	1837281	1837286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319590
37473	NC_009442	ACG	2	6	1837302	1837307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319590
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