MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_009442	AAT	2	6	1762188	1762193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319518
36003	NC_009442	ATG	2	6	1762216	1762221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319518
36004	NC_009442	ATA	2	6	1762263	1762268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319518
36005	NC_009442	TAA	2	6	1762307	1762312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319518
36006	NC_009442	ACC	2	6	1762380	1762385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319518
36007	NC_009442	TAAT	2	8	1762517	1762524	50 %	50 %	0 %	0 %	146319518
36008	NC_009442	CG	3	6	1762558	1762563	0 %	0 %	50 %	50 %	146319518
36009	NC_009442	GGA	2	6	1762582	1762587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319518
36010	NC_009442	T	6	6	1762608	1762613	0 %	100 %	0 %	0 %	146319518
36011	NC_009442	CTC	2	6	1762633	1762638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36012	NC_009442	ATA	2	6	1762679	1762684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319519
36013	NC_009442	CAA	2	6	1762702	1762707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319519
36014	NC_009442	CAA	2	6	1762726	1762731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319519
36015	NC_009442	ACC	2	6	1762828	1762833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319519
36016	NC_009442	AAGA	2	8	1762859	1762866	75 %	0 %	25 %	0 %	146319519
36017	NC_009442	CT	3	6	1762914	1762919	0 %	50 %	0 %	50 %	146319519
36018	NC_009442	AAT	2	6	1762972	1762977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319519
36019	NC_009442	TGT	2	6	1763005	1763010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319519
36020	NC_009442	AAG	2	6	1763186	1763191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319519
36021	NC_009442	TAT	2	6	1763307	1763312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319519
36022	NC_009442	ATG	2	6	1763324	1763329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319519
36023	NC_009442	CAA	2	6	1763334	1763339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319519
36024	NC_009442	GTT	2	6	1763343	1763348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319519
36025	NC_009442	TCAA	2	8	1763480	1763487	50 %	25 %	0 %	25 %	146319519
36026	NC_009442	CAT	2	6	1763509	1763514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319519
36027	NC_009442	CAA	2	6	1763520	1763525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319519
36028	NC_009442	ATA	2	6	1763546	1763551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319519
36029	NC_009442	ATC	2	6	1763561	1763566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319519
36030	NC_009442	ACG	2	6	1763575	1763580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319519
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36032	NC_009442	TGA	2	6	1763631	1763636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319520
36033	NC_009442	AC	3	6	1763662	1763667	50 %	0 %	0 %	50 %	146319520
36034	NC_009442	TCA	2	6	1763676	1763681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319520
36035	NC_009442	CAG	2	6	1763716	1763721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319520
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36039	NC_009442	ATT	2	6	1763810	1763815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319520
36040	NC_009442	ATG	2	6	1763862	1763867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319520
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36042	NC_009442	CA	3	6	1763878	1763883	50 %	0 %	0 %	50 %	146319520
36043	NC_009442	AAT	2	6	1764014	1764019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319520
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36049	NC_009442	ATG	2	6	1764201	1764206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319520
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36051	NC_009442	T	6	6	1764284	1764289	0 %	100 %	0 %	0 %	146319520
36052	NC_009442	TTG	2	6	1764300	1764305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319520
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36070	NC_009442	TCA	2	6	1765212	1765217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319521
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36076	NC_009442	TCAA	2	8	1765577	1765584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36077	NC_009442	TA	3	6	1765636	1765641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36078	NC_009442	ACT	2	6	1765642	1765647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36083	NC_009442	A	6	6	1765869	1765874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36084	NC_009442	TCT	2	6	1765907	1765912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36100	NC_009442	CAT	2	6	1766677	1766682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319522
36101	NC_009442	GCT	2	6	1766718	1766723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319522
36102	NC_009442	GAC	2	6	1766763	1766768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319522
36103	NC_009442	TTTCA	2	10	1766858	1766867	20 %	60 %	0 %	20 %	146319522
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36106	NC_009442	CAC	2	6	1767103	1767108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319522
36107	NC_009442	CAT	2	6	1767116	1767121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319522
36108	NC_009442	TCA	2	6	1767162	1767167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319522
36109	NC_009442	CAA	2	6	1767205	1767210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319522
36110	NC_009442	TGCC	2	8	1767276	1767283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36111	NC_009442	GTC	2	6	1767414	1767419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319523
36112	NC_009442	CGT	2	6	1767434	1767439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319523
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36115	NC_009442	TCA	2	6	1767502	1767507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319523
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36117	NC_009442	CTG	2	6	1767569	1767574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319523
36118	NC_009442	TGC	2	6	1767618	1767623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319523
36119	NC_009442	TGC	2	6	1767645	1767650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319523
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36340	NC_009442	TAA	2	6	1778389	1778394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36347	NC_009442	A	8	8	1778629	1778636	100 %	0 %	0 %	0 %	146319534
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36351	NC_009442	CTA	2	6	1778786	1778791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36472	NC_009442	TTA	2	6	1784743	1784748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36473	NC_009442	CTA	2	6	1784766	1784771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319541
36474	NC_009442	AGG	2	6	1784829	1784834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319541
36475	NC_009442	ACA	2	6	1784895	1784900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319541
36476	NC_009442	TTG	2	6	1784944	1784949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319541
36477	NC_009442	CACGGA	2	12	1785010	1785021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319541
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36480	NC_009442	TGAC	2	8	1785072	1785079	25 %	25 %	25 %	25 %	146319541
36481	NC_009442	CGA	2	6	1785159	1785164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319541
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36483	NC_009442	TCT	2	6	1785338	1785343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36486	NC_009442	AG	3	6	1785505	1785510	50 %	0 %	50 %	0 %	146319542
36487	NC_009442	TTGG	2	8	1785570	1785577	0 %	50 %	50 %	0 %	146319542
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36492	NC_009442	CCA	2	6	1785682	1785687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319542
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36498	NC_009442	AGCA	2	8	1785921	1785928	50 %	0 %	25 %	25 %	146319542
36499	NC_009442	ATCAAT	2	12	1786002	1786013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146319542
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