MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009442	GTT	2	6	145904	145909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009442	T	6	6	145908	145913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009442	TTTG	2	8	145924	145931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009442	CTT	2	6	145948	145953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_009442	ATT	2	6	145975	145980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009442	AGG	2	6	146006	146011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009442	GAAAA	2	10	146033	146042	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009442	CTATT	2	10	146059	146068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_009442	A	6	6	146101	146106	100 %	0 %	0 %	0 %	146317816
3010	NC_009442	TTTG	2	8	146184	146191	0 %	75 %	25 %	0 %	146317816
3011	NC_009442	GTTTA	2	10	146238	146247	20 %	60 %	20 %	0 %	146317816
3012	NC_009442	TGG	2	6	146307	146312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317816
3013	NC_009442	AAT	2	6	146428	146433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317816
3014	NC_009442	ATT	2	6	146443	146448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317816
3015	NC_009442	ATTA	2	8	146466	146473	50 %	50 %	0 %	0 %	146317816
3016	NC_009442	CTG	2	6	146489	146494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317816
3017	NC_009442	GT	3	6	146522	146527	0 %	50 %	50 %	0 %	146317816
3018	NC_009442	ATG	2	6	146570	146575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317816
3019	NC_009442	A	7	7	146586	146592	100 %	0 %	0 %	0 %	146317816
3020	NC_009442	ATG	2	6	146607	146612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317816
3021	NC_009442	A	9	9	146643	146651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009442	GA	3	6	146688	146693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009442	TCG	2	6	146703	146708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_009442	TGA	2	6	146738	146743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009442	TCG	2	6	146823	146828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_009442	ACTT	2	8	146851	146858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_009442	TGC	2	6	146896	146901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317817
3028	NC_009442	AAG	2	6	146906	146911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317817
3029	NC_009442	CAG	2	6	146951	146956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317817
3030	NC_009442	TGA	2	6	146968	146973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317817
3031	NC_009442	CGT	2	6	146981	146986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317817
3032	NC_009442	ATG	2	6	146994	146999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317817
3033	NC_009442	GTC	2	6	147006	147011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317817
3034	NC_009442	TCG	2	6	147047	147052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317817
3035	NC_009442	AAT	2	6	147080	147085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317818
3036	NC_009442	CAT	2	6	147161	147166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317818
3037	NC_009442	TGA	2	6	147172	147177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317818
3038	NC_009442	TGA	2	6	147200	147205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317818
3039	NC_009442	TGA	2	6	147335	147340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317818
3040	NC_009442	ACA	2	6	147378	147383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317818
3041	NC_009442	GAA	2	6	147422	147427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317818
3042	NC_009442	TTCA	2	8	147461	147468	25 %	50 %	0 %	25 %	146317818
3043	NC_009442	CCAGAA	2	12	147477	147488	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146317818
3044	NC_009442	TTC	2	6	147489	147494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317818
3045	NC_009442	GGT	2	6	147546	147551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317818
3046	NC_009442	ATA	2	6	147583	147588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317818
3047	NC_009442	TCA	2	6	147644	147649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317818
3048	NC_009442	AGTT	2	8	147730	147737	25 %	50 %	25 %	0 %	146317818
3049	NC_009442	GCATG	2	10	147758	147767	20 %	20 %	40 %	20 %	146317818
3050	NC_009442	CTT	2	6	147860	147865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317818
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3052	NC_009442	TGG	2	6	147920	147925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317818
3053	NC_009442	AAAAT	2	10	148171	148180	80 %	20 %	0 %	0 %	146317818
3054	NC_009442	AGCACC	2	12	148184	148195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146317818
3055	NC_009442	TGA	2	6	148223	148228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317818
3056	NC_009442	CGT	2	6	148233	148238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317818
3057	NC_009442	CTTC	2	8	148257	148264	0 %	50 %	0 %	50 %	146317818
3058	NC_009442	TAA	2	6	148536	148541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009442	T	6	6	148582	148587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009442	ATAAA	2	10	148610	148619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009442	GT	3	6	148648	148653	0 %	50 %	50 %	0 %	146317819
3062	NC_009442	T	6	6	148703	148708	0 %	100 %	0 %	0 %	146317819
3063	NC_009442	TTG	2	6	148771	148776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317819
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3065	NC_009442	ATC	2	6	148888	148893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317819
3066	NC_009442	ACA	2	6	148927	148932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317819
3067	NC_009442	TCT	2	6	148936	148941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317819
3068	NC_009442	CGG	2	6	148951	148956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317819
3069	NC_009442	ATG	2	6	149080	149085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317819
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3071	NC_009442	TTG	2	6	149211	149216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317819
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3074	NC_009442	TCAA	2	8	149278	149285	50 %	25 %	0 %	25 %	146317819
3075	NC_009442	TGA	2	6	149291	149296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317819
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3078	NC_009442	GA	3	6	149399	149404	50 %	0 %	50 %	0 %	146317819
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3082	NC_009442	AGG	2	6	149749	149754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317819
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3089	NC_009442	TAT	2	6	149951	149956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317819
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3091	NC_009442	TTC	2	6	149997	150002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317819
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3094	NC_009442	AGT	2	6	150155	150160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317819
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3099	NC_009442	GAT	2	6	150383	150388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317820
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3103	NC_009442	ATA	2	6	150457	150462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317820
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3106	NC_009442	CTTT	2	8	150581	150588	0 %	75 %	0 %	25 %	146317820
3107	NC_009442	A	6	6	150605	150610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009442	GTCT	2	8	150626	150633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_009442	GT	3	6	150813	150818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_009442	ACTAAG	2	12	150826	150837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3111	NC_009442	CTA	2	6	150920	150925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_009442	ATT	2	6	150949	150954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009442	A	6	6	150957	150962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009442	AG	3	6	150983	150988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009442	TAA	2	6	151133	151138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009442	AAAG	2	8	151157	151164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009442	TGG	2	6	151222	151227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317822
3118	NC_009442	T	6	6	151304	151309	0 %	100 %	0 %	0 %	146317822
3119	NC_009442	GTGGCG	2	12	151392	151403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146317822
3120	NC_009442	TGG	2	6	151441	151446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317822
3121	NC_009442	TCC	2	6	151472	151477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317822
3122	NC_009442	TGG	2	6	151492	151497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317822
3123	NC_009442	CCG	2	6	151514	151519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317822
3124	NC_009442	CAG	2	6	151744	151749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317822
3125	NC_009442	AGA	2	6	151796	151801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317822
3126	NC_009442	ACG	2	6	151872	151877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317823
3127	NC_009442	CAGT	2	8	151972	151979	25 %	25 %	25 %	25 %	146317823
3128	NC_009442	ATT	3	9	151986	151994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317823
3129	NC_009442	GCT	2	6	152120	152125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317823
3130	NC_009442	GA	3	6	152161	152166	50 %	0 %	50 %	0 %	146317823
3131	NC_009442	ACT	2	6	152232	152237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317823
3132	NC_009442	AG	3	6	152271	152276	50 %	0 %	50 %	0 %	146317823
3133	NC_009442	TGA	2	6	152281	152286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317823
3134	NC_009442	AGAT	2	8	152288	152295	50 %	25 %	25 %	0 %	146317823
3135	NC_009442	CCT	2	6	152314	152319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317824
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3137	NC_009442	GCCA	2	8	152391	152398	25 %	0 %	25 %	50 %	146317824
3138	NC_009442	TGG	2	6	152408	152413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317824
3139	NC_009442	GGT	2	6	152414	152419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317824
3140	NC_009442	GAG	2	6	152469	152474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317824
3141	NC_009442	TTG	2	6	152478	152483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317824
3142	NC_009442	GGCTGT	2	12	152513	152524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146317824
3143	NC_009442	GCT	2	6	152571	152576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317824
3144	NC_009442	GGC	2	6	152642	152647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317824
3145	NC_009442	GCGG	2	8	152648	152655	0 %	0 %	75 %	25 %	146317824
3146	NC_009442	GGAGTT	2	12	152660	152671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146317824
3147	NC_009442	GAT	2	6	152763	152768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317824
3148	NC_009442	GGGTC	2	10	152795	152804	0 %	20 %	60 %	20 %	146317824
3149	NC_009442	TTTC	2	8	152911	152918	0 %	75 %	0 %	25 %	146317824
3150	NC_009442	CAG	2	6	152961	152966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317824
3151	NC_009442	AAG	2	6	153045	153050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317824
3152	NC_009442	TGG	2	6	153079	153084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317824
3153	NC_009442	GCGG	2	8	153087	153094	0 %	0 %	75 %	25 %	146317824
3154	NC_009442	GCT	2	6	153129	153134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317824
3155	NC_009442	AGC	2	6	153206	153211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317824
3156	NC_009442	GCTG	2	8	153240	153247	0 %	25 %	50 %	25 %	146317824
3157	NC_009442	TTGG	2	8	153399	153406	0 %	50 %	50 %	0 %	146317825
3158	NC_009442	TTC	2	6	153417	153422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317825
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3161	NC_009442	GAT	2	6	153489	153494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317825
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3163	NC_009442	AGT	2	6	153542	153547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317825
3164	NC_009442	ATC	2	6	153576	153581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317825
3165	NC_009442	TA	3	6	153633	153638	50 %	50 %	0 %	0 %	146317825
3166	NC_009442	T	6	6	153737	153742	0 %	100 %	0 %	0 %	146317825
3167	NC_009442	GAT	2	6	153743	153748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317825
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3177	NC_009442	GTTATA	2	12	154313	154324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146317826
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3180	NC_009442	TAT	2	6	154371	154376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317826
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3202	NC_009442	TGG	2	6	155491	155496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317827
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3229	NC_009442	ATGC	2	8	156660	156667	25 %	25 %	25 %	25 %	146317829
3230	NC_009442	CTT	2	6	156668	156673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317829
3231	NC_009442	TTTG	2	8	156705	156712	0 %	75 %	25 %	0 %	146317829
3232	NC_009442	TAA	2	6	156821	156826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317829
3233	NC_009442	TGA	2	6	156856	156861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317829
3234	NC_009442	TGGTC	2	10	156953	156962	0 %	40 %	40 %	20 %	146317829
3235	NC_009442	ATG	2	6	156972	156977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317829
3236	NC_009442	TGA	2	6	157012	157017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317829
3237	NC_009442	GGA	2	6	157130	157135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317829
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3239	NC_009442	TTTG	2	8	157235	157242	0 %	75 %	25 %	0 %	146317829
3240	NC_009442	TGG	2	6	157442	157447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317829
3241	NC_009442	AGG	2	6	157456	157461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317829
3242	NC_009442	TTA	2	6	157519	157524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317830
3243	NC_009442	TAT	2	6	157569	157574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317830
3244	NC_009442	CTT	2	6	157597	157602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317830
3245	NC_009442	AGA	2	6	157649	157654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317830
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3492	NC_009442	AGT	2	6	170254	170259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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