MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_009442	ACT	2	6	1662628	1662633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319416
34002	NC_009442	AAT	2	6	1662756	1662761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319416
34003	NC_009442	CAA	2	6	1662814	1662819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319416
34004	NC_009442	T	6	6	1662832	1662837	0 %	100 %	0 %	0 %	146319416
34005	NC_009442	CTAT	2	8	1662852	1662859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34006	NC_009442	CTA	2	6	1662915	1662920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34007	NC_009442	TAA	2	6	1662964	1662969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34008	NC_009442	TCA	2	6	1662976	1662981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34009	NC_009442	T	6	6	1663007	1663012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_009442	T	6	6	1663028	1663033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_009442	AAC	2	6	1663096	1663101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34012	NC_009442	A	7	7	1663246	1663252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_009442	TAT	2	6	1663280	1663285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34014	NC_009442	ATC	2	6	1663307	1663312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319417
34015	NC_009442	CAT	2	6	1663372	1663377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319417
34016	NC_009442	CGA	2	6	1663390	1663395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319417
34017	NC_009442	GCAC	2	8	1663416	1663423	25 %	0 %	25 %	50 %	146319417
34018	NC_009442	CGG	2	6	1663428	1663433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319417
34019	NC_009442	CTC	2	6	1663448	1663453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319417
34020	NC_009442	GCT	2	6	1663461	1663466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319417
34021	NC_009442	CTC	3	9	1663478	1663486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319417
34022	NC_009442	CGAT	2	8	1663530	1663537	25 %	25 %	25 %	25 %	146319417
34023	NC_009442	CCT	2	6	1663558	1663563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319418
34024	NC_009442	AG	3	6	1663624	1663629	50 %	0 %	50 %	0 %	146319418
34025	NC_009442	GAA	2	6	1663682	1663687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319418
34026	NC_009442	TCT	2	6	1663740	1663745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319418
34027	NC_009442	GCA	3	9	1663767	1663775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319418
34028	NC_009442	GCTG	2	8	1663916	1663923	0 %	25 %	50 %	25 %	146319418
34029	NC_009442	CAT	2	6	1663997	1664002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319418
34030	NC_009442	GCTG	2	8	1664037	1664044	0 %	25 %	50 %	25 %	146319418
34031	NC_009442	CCAA	2	8	1664114	1664121	50 %	0 %	0 %	50 %	146319418
34032	NC_009442	ACG	2	6	1664156	1664161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319418
34033	NC_009442	GAA	2	6	1664207	1664212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319418
34034	NC_009442	AGG	2	6	1664217	1664222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319418
34035	NC_009442	CTG	2	6	1664284	1664289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319418
34036	NC_009442	AGT	2	6	1664299	1664304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319418
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34042	NC_009442	CGGA	2	8	1664697	1664704	25 %	0 %	50 %	25 %	146319418
34043	NC_009442	TGG	2	6	1664757	1664762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319418
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34049	NC_009442	GCTG	2	8	1665222	1665229	0 %	25 %	50 %	25 %	146319418
34050	NC_009442	GTC	2	6	1665297	1665302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319418
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34052	NC_009442	TCT	2	6	1665367	1665372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319418
34053	NC_009442	TCT	2	6	1665390	1665395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319418
34054	NC_009442	CTG	2	6	1665407	1665412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319418
34055	NC_009442	GGCGT	2	10	1665445	1665454	0 %	20 %	60 %	20 %	146319418
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34057	NC_009442	CCAAG	2	10	1665565	1665574	40 %	0 %	20 %	40 %	146319418
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34062	NC_009442	T	6	6	1665661	1665666	0 %	100 %	0 %	0 %	146319419
34063	NC_009442	CTT	2	6	1665825	1665830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319419
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34084	NC_009442	AAGT	2	8	1666775	1666782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34085	NC_009442	TA	4	8	1666807	1666814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34091	NC_009442	CTTT	2	8	1667229	1667236	0 %	75 %	0 %	25 %	146319420
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34097	NC_009442	CTT	2	6	1667484	1667489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34108	NC_009442	T	7	7	1668046	1668052	0 %	100 %	0 %	0 %	146319421
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34113	NC_009442	TCT	2	6	1668318	1668323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34114	NC_009442	ACG	2	6	1668332	1668337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34116	NC_009442	A	6	6	1668439	1668444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34117	NC_009442	CTAT	2	8	1668458	1668465	25 %	50 %	0 %	25 %	146319422
34118	NC_009442	GAT	2	6	1668512	1668517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319422
34119	NC_009442	CAT	2	6	1668550	1668555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319422
34120	NC_009442	TAT	2	6	1668556	1668561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319422
34121	NC_009442	GTAG	2	8	1668565	1668572	25 %	25 %	50 %	0 %	146319422
34122	NC_009442	ACC	2	6	1668599	1668604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319422
34123	NC_009442	GTC	2	6	1668660	1668665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319422
34124	NC_009442	GCC	2	6	1668741	1668746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319422
34125	NC_009442	AGCG	2	8	1668818	1668825	25 %	0 %	50 %	25 %	146319422
34126	NC_009442	GCC	2	6	1668834	1668839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319422
34127	NC_009442	CAA	2	6	1668859	1668864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319422
34128	NC_009442	GCC	2	6	1668888	1668893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319422
34129	NC_009442	ATA	2	6	1668900	1668905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319422
34130	NC_009442	CCA	2	6	1669026	1669031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319422
34131	NC_009442	AACC	2	8	1669080	1669087	50 %	0 %	0 %	50 %	146319422
34132	NC_009442	CAC	2	6	1669244	1669249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319423
34133	NC_009442	CCGTAT	2	12	1669345	1669356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146319423
34134	NC_009442	CTG	2	6	1669418	1669423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319423
34135	NC_009442	TCA	2	6	1669443	1669448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319423
34136	NC_009442	TGA	2	6	1669465	1669470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319423
34137	NC_009442	TTC	2	6	1669484	1669489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319423
34138	NC_009442	GA	3	6	1669498	1669503	50 %	0 %	50 %	0 %	146319423
34139	NC_009442	CTT	2	6	1669522	1669527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319423
34140	NC_009442	TTCA	2	8	1669625	1669632	25 %	50 %	0 %	25 %	146319423
34141	NC_009442	GTT	2	6	1669662	1669667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319423
34142	NC_009442	GTT	2	6	1669747	1669752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319423
34143	NC_009442	ACC	2	6	1669757	1669762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319423
34144	NC_009442	CAA	2	6	1669814	1669819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319423
34145	NC_009442	TCTT	2	8	1669833	1669840	0 %	75 %	0 %	25 %	146319423
34146	NC_009442	TCT	2	6	1669887	1669892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319423
34147	NC_009442	TTGA	2	8	1670114	1670121	25 %	50 %	25 %	0 %	146319423
34148	NC_009442	ATGG	2	8	1670123	1670130	25 %	25 %	50 %	0 %	146319423
34149	NC_009442	T	6	6	1670159	1670164	0 %	100 %	0 %	0 %	146319423
34150	NC_009442	CTG	2	6	1670165	1670170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319423
34151	NC_009442	CTC	2	6	1670229	1670234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319424
34152	NC_009442	TAG	2	6	1670254	1670259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319424
34153	NC_009442	TCA	2	6	1670278	1670283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319424
34154	NC_009442	TC	3	6	1670477	1670482	0 %	50 %	0 %	50 %	146319424
34155	NC_009442	CAT	2	6	1670552	1670557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319424
34156	NC_009442	ATG	2	6	1670614	1670619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319424
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34158	NC_009442	TCT	2	6	1670710	1670715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319424
34159	NC_009442	GACT	2	8	1670755	1670762	25 %	25 %	25 %	25 %	146319424
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34166	NC_009442	T	6	6	1671174	1671179	0 %	100 %	0 %	0 %	146319424
34167	NC_009442	ATC	3	9	1671213	1671221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319424
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34169	NC_009442	ATC	2	6	1671396	1671401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319424
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34173	NC_009442	AAGT	2	8	1671442	1671449	50 %	25 %	25 %	0 %	146319424
34174	NC_009442	CTG	2	6	1671471	1671476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319424
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34176	NC_009442	CAT	2	6	1671539	1671544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319424
34177	NC_009442	CTA	2	6	1671611	1671616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34178	NC_009442	T	6	6	1671662	1671667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34179	NC_009442	T	6	6	1671777	1671782	0 %	100 %	0 %	0 %	146319425
34180	NC_009442	GCT	3	9	1671823	1671831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319425
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34182	NC_009442	CTG	2	6	1671965	1671970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319425
34183	NC_009442	GCT	2	6	1672102	1672107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319425
34184	NC_009442	GAA	2	6	1672109	1672114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319425
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34187	NC_009442	TTC	2	6	1672179	1672184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319425
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34189	NC_009442	AAG	2	6	1672300	1672305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319425
34190	NC_009442	TAAT	2	8	1672365	1672372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34191	NC_009442	TCA	2	6	1672402	1672407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34192	NC_009442	TCA	2	6	1672460	1672465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34193	NC_009442	AAT	2	6	1672489	1672494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319426
34194	NC_009442	A	7	7	1672505	1672511	100 %	0 %	0 %	0 %	146319426
34195	NC_009442	GCA	2	6	1672522	1672527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319426
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34198	NC_009442	TATC	2	8	1672608	1672615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34199	NC_009442	TTTC	2	8	1672628	1672635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34200	NC_009442	T	7	7	1672648	1672654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34201	NC_009442	ATA	2	6	1672709	1672714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34202	NC_009442	AT	3	6	1672738	1672743	50 %	50 %	0 %	0 %	146319427
34203	NC_009442	CTA	2	6	1672744	1672749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319427
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34205	NC_009442	CCA	2	6	1672885	1672890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319427
34206	NC_009442	GGAA	2	8	1672924	1672931	50 %	0 %	50 %	0 %	146319427
34207	NC_009442	ATG	2	6	1673024	1673029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319427
34208	NC_009442	TGA	2	6	1673112	1673117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319427
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34210	NC_009442	ATCA	2	8	1673177	1673184	50 %	25 %	0 %	25 %	146319427
34211	NC_009442	ACC	2	6	1673222	1673227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319427
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34214	NC_009442	CTTT	2	8	1673432	1673439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34215	NC_009442	T	6	6	1673442	1673447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34216	NC_009442	A	6	6	1673502	1673507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34217	NC_009442	A	6	6	1673596	1673601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34218	NC_009442	A	6	6	1673620	1673625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34219	NC_009442	T	7	7	1673646	1673652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34220	NC_009442	TA	3	6	1673661	1673666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34221	NC_009442	GAA	2	6	1673667	1673672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34222	NC_009442	A	6	6	1673678	1673683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34223	NC_009442	CT	3	6	1673688	1673693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34224	NC_009442	CCTC	2	8	1673721	1673728	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34225	NC_009442	T	6	6	1673732	1673737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34226	NC_009442	T	6	6	1673756	1673761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34227	NC_009442	GGA	2	6	1673791	1673796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34228	NC_009442	ACT	3	9	1673806	1673814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319428
34229	NC_009442	GAAAT	2	10	1673879	1673888	60 %	20 %	20 %	0 %	146319428
34230	NC_009442	AAG	2	6	1673894	1673899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319428
34231	NC_009442	AGC	2	6	1673910	1673915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319428
34232	NC_009442	AAG	2	6	1673951	1673956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319428
34233	NC_009442	CAT	2	6	1674030	1674035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319428
34234	NC_009442	A	6	6	1674139	1674144	100 %	0 %	0 %	0 %	146319428
34235	NC_009442	AAG	2	6	1674236	1674241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319428
34236	NC_009442	GAA	2	6	1674313	1674318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319428
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34238	NC_009442	A	6	6	1674401	1674406	100 %	0 %	0 %	0 %	146319428
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34469	NC_009442	AAT	2	6	1685275	1685280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319438
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