MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_009442	GATA	2	8	1615529	1615536	50 %	25 %	25 %	0 %	146319360
33002	NC_009442	CTT	2	6	1615658	1615663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319360
33003	NC_009442	T	6	6	1615714	1615719	0 %	100 %	0 %	0 %	146319360
33004	NC_009442	CTG	2	6	1615766	1615771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319360
33005	NC_009442	TTC	2	6	1615818	1615823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319360
33006	NC_009442	A	6	6	1615882	1615887	100 %	0 %	0 %	0 %	146319360
33007	NC_009442	ATA	2	6	1615906	1615911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319360
33008	NC_009442	CTTT	2	8	1615940	1615947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33009	NC_009442	A	6	6	1615955	1615960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33010	NC_009442	GAAT	2	8	1615971	1615978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33011	NC_009442	TCCCAG	2	12	1615980	1615991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33012	NC_009442	ATT	2	6	1615996	1616001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319361
33013	NC_009442	T	6	6	1616000	1616005	0 %	100 %	0 %	0 %	146319361
33014	NC_009442	CTTG	2	8	1616006	1616013	0 %	50 %	25 %	25 %	146319361
33015	NC_009442	TTG	2	6	1616021	1616026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319361
33016	NC_009442	TTG	2	6	1616048	1616053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319361
33017	NC_009442	TCA	3	9	1616089	1616097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319361
33018	NC_009442	CAC	2	6	1616182	1616187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319361
33019	NC_009442	CAATA	2	10	1616198	1616207	60 %	20 %	0 %	20 %	146319361
33020	NC_009442	TAT	2	6	1616300	1616305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33021	NC_009442	TCAAAA	2	12	1616340	1616351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146319362
33022	NC_009442	TCT	2	6	1616373	1616378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319362
33023	NC_009442	ACG	2	6	1616390	1616395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319362
33024	NC_009442	ATC	2	6	1616397	1616402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319362
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33026	NC_009442	GAC	2	6	1616446	1616451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319362
33027	NC_009442	GTTGTA	2	12	1616453	1616464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146319362
33028	NC_009442	ATGA	2	8	1616495	1616502	50 %	25 %	25 %	0 %	146319362
33029	NC_009442	GTT	2	6	1616558	1616563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319362
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33033	NC_009442	GTA	2	6	1616987	1616992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319362
33034	NC_009442	ATA	2	6	1617126	1617131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319362
33035	NC_009442	AAAC	2	8	1617265	1617272	75 %	0 %	0 %	25 %	146319362
33036	NC_009442	ATG	2	6	1617303	1617308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319362
33037	NC_009442	TCA	2	6	1617331	1617336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319362
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33039	NC_009442	CTT	3	9	1617373	1617381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319362
33040	NC_009442	GGTGTC	2	12	1617402	1617413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146319362
33041	NC_009442	TCA	2	6	1617498	1617503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319362
33042	NC_009442	CTT	2	6	1617550	1617555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319362
33043	NC_009442	TCA	2	6	1617590	1617595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33044	NC_009442	TAT	2	6	1617607	1617612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33045	NC_009442	CCA	2	6	1617647	1617652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33046	NC_009442	AAAT	2	8	1617663	1617670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33047	NC_009442	TAA	2	6	1617697	1617702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33048	NC_009442	AT	3	6	1617710	1617715	50 %	50 %	0 %	0 %	146319363
33049	NC_009442	GATTTT	2	12	1617726	1617737	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146319363
33050	NC_009442	TGC	2	6	1617929	1617934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319363
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33052	NC_009442	CAA	2	6	1618116	1618121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319363
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33055	NC_009442	CCTC	2	8	1618370	1618377	0 %	25 %	0 %	75 %	146319363
33056	NC_009442	ATT	2	6	1618550	1618555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319363
33057	NC_009442	CGT	2	6	1618562	1618567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319363
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33083	NC_009442	CAT	2	6	1619613	1619618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319364
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33088	NC_009442	TAT	2	6	1619756	1619761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319364
33089	NC_009442	TAA	3	9	1619771	1619779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319364
33090	NC_009442	ATC	2	6	1619811	1619816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33098	NC_009442	AGA	2	6	1620080	1620085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319365
33099	NC_009442	ACC	2	6	1620102	1620107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319365
33100	NC_009442	T	6	6	1620138	1620143	0 %	100 %	0 %	0 %	146319365
33101	NC_009442	ATG	2	6	1620204	1620209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319365
33102	NC_009442	TAAA	2	8	1620347	1620354	75 %	25 %	0 %	0 %	146319366
33103	NC_009442	CGC	2	6	1620373	1620378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319366
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33105	NC_009442	GACT	2	8	1620530	1620537	25 %	25 %	25 %	25 %	146319366
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33107	NC_009442	GGA	2	6	1620592	1620597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319366
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33112	NC_009442	TCAA	2	8	1620995	1621002	50 %	25 %	0 %	25 %	146319366
33113	NC_009442	AAG	3	9	1621005	1621013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319366
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33115	NC_009442	TGT	2	6	1621028	1621033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319366
33116	NC_009442	CTTTT	2	10	1621095	1621104	0 %	80 %	0 %	20 %	146319367
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33118	NC_009442	AAT	2	6	1621324	1621329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319368
33119	NC_009442	GAT	2	6	1621330	1621335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319368
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33124	NC_009442	A	7	7	1621543	1621549	100 %	0 %	0 %	0 %	146319369
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33157	NC_009442	A	6	6	1622579	1622584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33158	NC_009442	AG	3	6	1622649	1622654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33159	NC_009442	CT	3	6	1622665	1622670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33177	NC_009442	CTTTT	2	10	1623170	1623179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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33217	NC_009442	G	6	6	1624872	1624877	0 %	0 %	100 %	0 %	146319372
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33220	NC_009442	TTC	2	6	1624978	1624983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319372
33221	NC_009442	T	7	7	1625027	1625033	0 %	100 %	0 %	0 %	146319372
33222	NC_009442	CA	3	6	1625067	1625072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33223	NC_009442	TCC	2	6	1625160	1625165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319373
33224	NC_009442	AGG	2	6	1625177	1625182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319373
33225	NC_009442	TTCAT	2	10	1625203	1625212	20 %	60 %	0 %	20 %	146319373
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33227	NC_009442	CTT	2	6	1625276	1625281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319373
33228	NC_009442	CAA	2	6	1625292	1625297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319373
33229	NC_009442	CT	3	6	1625380	1625385	0 %	50 %	0 %	50 %	146319373
33230	NC_009442	A	6	6	1625393	1625398	100 %	0 %	0 %	0 %	146319373
33231	NC_009442	ATA	2	6	1625435	1625440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319373
33232	NC_009442	ATT	2	6	1625470	1625475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319373
33233	NC_009442	TCAA	2	8	1625557	1625564	50 %	25 %	0 %	25 %	146319373
33234	NC_009442	AAC	2	6	1625565	1625570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319373
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33354	NC_009442	A	6	6	1631667	1631672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33355	NC_009442	TTTCCG	2	12	1631689	1631700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146319380
33356	NC_009442	GATTT	2	10	1631746	1631755	20 %	60 %	20 %	0 %	146319380
33357	NC_009442	CTT	2	6	1631790	1631795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319380
33358	NC_009442	GGT	2	6	1631819	1631824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319380
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33363	NC_009442	TTG	2	6	1632113	1632118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319380
33364	NC_009442	CTT	2	6	1632189	1632194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319380
33365	NC_009442	ATCA	2	8	1632310	1632317	50 %	25 %	0 %	25 %	146319380
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33373	NC_009442	CAT	2	6	1632807	1632812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319380
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33375	NC_009442	ATCA	2	8	1632826	1632833	50 %	25 %	0 %	25 %	146319380
33376	NC_009442	TCT	2	6	1632899	1632904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319380
33377	NC_009442	CTC	3	9	1632999	1633007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33378	NC_009442	AAT	2	6	1633019	1633024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319381
33379	NC_009442	GTT	2	6	1633056	1633061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319381
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33388	NC_009442	CAC	2	6	1633575	1633580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33390	NC_009442	TTC	2	6	1633603	1633608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33391	NC_009442	ATA	2	6	1633636	1633641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33392	NC_009442	ACG	2	6	1633680	1633685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33424	NC_009442	TGAC	2	8	1635103	1635110	25 %	25 %	25 %	25 %	146319383
33425	NC_009442	CTG	2	6	1635115	1635120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319383
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33455	NC_009442	CG	3	6	1636512	1636517	0 %	0 %	50 %	50 %	146319385
33456	NC_009442	AAT	2	6	1636546	1636551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319385
33457	NC_009442	AG	3	6	1636605	1636610	50 %	0 %	50 %	0 %	146319385
33458	NC_009442	TAAC	2	8	1636712	1636719	50 %	25 %	0 %	25 %	146319385
33459	NC_009442	CAA	2	6	1636749	1636754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319385
33460	NC_009442	TCA	2	6	1636761	1636766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319385
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33470	NC_009442	A	6	6	1637249	1637254	100 %	0 %	0 %	0 %	146319385
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