MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_009442	TGA	2	6	1511897	1511902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319242
31002	NC_009442	CCCCA	2	10	1511975	1511984	20 %	0 %	0 %	80 %	146319242
31003	NC_009442	ATT	2	6	1512046	1512051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_009442	TTAT	2	8	1512059	1512066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_009442	CT	3	6	1512111	1512116	0 %	50 %	0 %	50 %	146319243
31006	NC_009442	TTGA	2	8	1512121	1512128	25 %	50 %	25 %	0 %	146319243
31007	NC_009442	TAGA	2	8	1512137	1512144	50 %	25 %	25 %	0 %	146319243
31008	NC_009442	GCA	2	6	1512156	1512161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319243
31009	NC_009442	AGA	2	6	1512165	1512170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319243
31010	NC_009442	CAC	2	6	1512199	1512204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319243
31011	NC_009442	TCA	2	6	1512214	1512219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319243
31012	NC_009442	AAT	2	6	1512222	1512227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319243
31013	NC_009442	T	6	6	1512227	1512232	0 %	100 %	0 %	0 %	146319243
31014	NC_009442	A	6	6	1512249	1512254	100 %	0 %	0 %	0 %	146319243
31015	NC_009442	TCACAA	2	12	1512325	1512336	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146319243
31016	NC_009442	AAT	2	6	1512407	1512412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319243
31017	NC_009442	AAT	2	6	1512422	1512427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319243
31018	NC_009442	CAA	2	6	1512510	1512515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319243
31019	NC_009442	CAA	2	6	1512518	1512523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319243
31020	NC_009442	AAG	2	6	1512535	1512540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319243
31021	NC_009442	CAAA	2	8	1512583	1512590	75 %	0 %	0 %	25 %	146319243
31022	NC_009442	T	6	6	1512672	1512677	0 %	100 %	0 %	0 %	146319243
31023	NC_009442	A	7	7	1512713	1512719	100 %	0 %	0 %	0 %	146319243
31024	NC_009442	CTG	2	6	1512724	1512729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319243
31025	NC_009442	A	6	6	1512806	1512811	100 %	0 %	0 %	0 %	146319243
31026	NC_009442	TCA	2	6	1512840	1512845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319243
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31028	NC_009442	GAT	2	6	1513048	1513053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319244
31029	NC_009442	AG	3	6	1513100	1513105	50 %	0 %	50 %	0 %	146319244
31030	NC_009442	CTGA	2	8	1513185	1513192	25 %	25 %	25 %	25 %	146319244
31031	NC_009442	TTTC	2	8	1513238	1513245	0 %	75 %	0 %	25 %	146319244
31032	NC_009442	CTC	2	6	1513253	1513258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319245
31033	NC_009442	ATC	2	6	1513259	1513264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319245
31034	NC_009442	A	6	6	1513268	1513273	100 %	0 %	0 %	0 %	146319245
31035	NC_009442	TCT	2	6	1513393	1513398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319245
31036	NC_009442	CCTA	2	8	1513417	1513424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31037	NC_009442	ATAAAA	2	12	1513447	1513458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31038	NC_009442	TCT	2	6	1513472	1513477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31039	NC_009442	GTTT	2	8	1513485	1513492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_009442	A	8	8	1513565	1513572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_009442	ACC	2	6	1513578	1513583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31042	NC_009442	GGT	2	6	1513593	1513598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_009442	CCAG	2	8	1513626	1513633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31044	NC_009442	TAC	2	6	1513712	1513717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319246
31045	NC_009442	TA	3	6	1513798	1513803	50 %	50 %	0 %	0 %	146319246
31046	NC_009442	ATA	2	6	1513843	1513848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319246
31047	NC_009442	CAT	2	6	1513909	1513914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319246
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31049	NC_009442	ACT	2	6	1514068	1514073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319246
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31051	NC_009442	T	7	7	1514237	1514243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_009442	TCG	2	6	1514254	1514259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31053	NC_009442	GGT	2	6	1514275	1514280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_009442	AAT	2	6	1514359	1514364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319247
31055	NC_009442	AGG	2	6	1514408	1514413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319247
31056	NC_009442	CCA	2	6	1514420	1514425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319247
31057	NC_009442	TAGG	2	8	1514538	1514545	25 %	25 %	50 %	0 %	146319247
31058	NC_009442	TTGC	2	8	1514563	1514570	0 %	50 %	25 %	25 %	146319247
31059	NC_009442	GTCTG	2	10	1514580	1514589	0 %	40 %	40 %	20 %	146319247
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31062	NC_009442	GAA	2	6	1514719	1514724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319247
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31064	NC_009442	CGCAT	2	10	1514753	1514762	20 %	20 %	20 %	40 %	146319247
31065	NC_009442	CGTT	2	8	1514787	1514794	0 %	50 %	25 %	25 %	146319247
31066	NC_009442	AT	3	6	1514805	1514810	50 %	50 %	0 %	0 %	146319247
31067	NC_009442	AAG	2	6	1514846	1514851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319247
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31069	NC_009442	TTC	3	9	1514872	1514880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319247
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31072	NC_009442	TACT	2	8	1514966	1514973	25 %	50 %	0 %	25 %	146319247
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31075	NC_009442	ATCC	2	8	1515202	1515209	25 %	25 %	0 %	50 %	146319247
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31091	NC_009442	T	6	6	1516063	1516068	0 %	100 %	0 %	0 %	146319247
31092	NC_009442	GCT	2	6	1516110	1516115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319247
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31099	NC_009442	TGA	2	6	1516471	1516476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319248
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31101	NC_009442	T	6	6	1516552	1516557	0 %	100 %	0 %	0 %	146319248
31102	NC_009442	AGA	2	6	1516569	1516574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319248
31103	NC_009442	CTGG	2	8	1516630	1516637	0 %	25 %	50 %	25 %	146319248
31104	NC_009442	TGA	2	6	1516639	1516644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319248
31105	NC_009442	GCT	3	9	1516666	1516674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319248
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31110	NC_009442	ATA	2	6	1517001	1517006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319248
31111	NC_009442	AG	3	6	1517074	1517079	50 %	0 %	50 %	0 %	146319248
31112	NC_009442	CTTTT	2	10	1517133	1517142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31113	NC_009442	A	6	6	1517223	1517228	100 %	0 %	0 %	0 %	146319249
31114	NC_009442	CTT	2	6	1517238	1517243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319249
31115	NC_009442	GCA	2	6	1517312	1517317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319249
31116	NC_009442	GA	3	6	1517327	1517332	50 %	0 %	50 %	0 %	146319249
31117	NC_009442	CT	3	6	1517414	1517419	0 %	50 %	0 %	50 %	146319249
31118	NC_009442	ATC	2	6	1517452	1517457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319249
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31120	NC_009442	TGAA	2	8	1517600	1517607	50 %	25 %	25 %	0 %	146319249
31121	NC_009442	ATC	2	6	1517674	1517679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319249
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31199	NC_009442	T	6	6	1521550	1521555	0 %	100 %	0 %	0 %	146319253
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31229	NC_009442	TGC	2	6	1523464	1523469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319254
31230	NC_009442	TTC	2	6	1523470	1523475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319254
31231	NC_009442	ATAA	2	8	1523536	1523543	75 %	25 %	0 %	0 %	146319254
31232	NC_009442	CTA	2	6	1523550	1523555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319254
31233	NC_009442	CTG	2	6	1523556	1523561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319254
31234	NC_009442	AAGCA	2	10	1523599	1523608	60 %	0 %	20 %	20 %	146319254
31235	NC_009442	T	6	6	1523665	1523670	0 %	100 %	0 %	0 %	146319254
31236	NC_009442	TAGA	2	8	1523673	1523680	50 %	25 %	25 %	0 %	146319254
31237	NC_009442	TGCAAT	2	12	1523698	1523709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146319254
31238	NC_009442	AAT	2	6	1523713	1523718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319254
31239	NC_009442	CCT	2	6	1523812	1523817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319255
31240	NC_009442	TCA	2	6	1523869	1523874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319255
31241	NC_009442	TGT	2	6	1523967	1523972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319255
31242	NC_009442	ATG	2	6	1524082	1524087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319255
31243	NC_009442	TCC	2	6	1524117	1524122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319255
31244	NC_009442	CT	3	6	1524186	1524191	0 %	50 %	0 %	50 %	146319255
31245	NC_009442	TTC	2	6	1524207	1524212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319255
31246	NC_009442	TTTCA	2	10	1524225	1524234	20 %	60 %	0 %	20 %	146319255
31247	NC_009442	CTG	2	6	1524285	1524290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319255
31248	NC_009442	A	8	8	1524354	1524361	100 %	0 %	0 %	0 %	146319255
31249	NC_009442	CTT	2	6	1524455	1524460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319255
31250	NC_009442	AATC	2	8	1524527	1524534	50 %	25 %	0 %	25 %	146319255
31251	NC_009442	ATC	3	9	1524532	1524540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319255
31252	NC_009442	TCC	2	6	1524608	1524613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319256
31253	NC_009442	CCT	2	6	1524645	1524650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319256
31254	NC_009442	TTG	2	6	1524679	1524684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319256
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31256	NC_009442	AATTT	2	10	1524698	1524707	40 %	60 %	0 %	0 %	146319256
31257	NC_009442	CTG	2	6	1524723	1524728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319256
31258	NC_009442	TCCA	2	8	1524754	1524761	25 %	25 %	0 %	50 %	146319256
31259	NC_009442	TCT	2	6	1524807	1524812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319256
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31262	NC_009442	CTC	2	6	1524987	1524992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31263	NC_009442	CTA	2	6	1525027	1525032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31264	NC_009442	ACA	3	9	1525042	1525050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31265	NC_009442	TCC	2	6	1525066	1525071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31266	NC_009442	T	6	6	1525092	1525097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31267	NC_009442	A	7	7	1525109	1525115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31268	NC_009442	TTA	2	6	1525160	1525165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31269	NC_009442	ACAAA	2	10	1525229	1525238	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31270	NC_009442	TCT	3	9	1525416	1525424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319257
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31272	NC_009442	TCT	2	6	1525566	1525571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319257
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31291	NC_009442	TCT	2	6	1526224	1526229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319258
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31304	NC_009442	AGAT	2	8	1526772	1526779	50 %	25 %	25 %	0 %	146319259
31305	NC_009442	GTA	2	6	1526818	1526823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319259
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31328	NC_009442	CTTC	2	8	1528086	1528093	0 %	50 %	0 %	50 %	146319260
31329	NC_009442	TA	3	6	1528125	1528130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31330	NC_009442	TACT	2	8	1528137	1528144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31331	NC_009442	A	6	6	1528194	1528199	100 %	0 %	0 %	0 %	146319261
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31349	NC_009442	T	7	7	1529134	1529140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31350	NC_009442	ATT	2	6	1529143	1529148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31351	NC_009442	TTAT	2	8	1529160	1529167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31352	NC_009442	CTT	2	6	1529176	1529181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31353	NC_009442	A	6	6	1529238	1529243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31354	NC_009442	GCT	2	6	1529247	1529252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31355	NC_009442	AG	3	6	1529260	1529265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31471	NC_009442	CTT	2	6	1535653	1535658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319271
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31477	NC_009442	CAA	2	6	1535992	1535997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319271
31478	NC_009442	TGCT	2	8	1535999	1536006	0 %	50 %	25 %	25 %	146319271
31479	NC_009442	CAG	2	6	1536087	1536092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319271
31480	NC_009442	ACC	2	6	1536104	1536109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319271
31481	NC_009442	TTC	2	6	1536129	1536134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319271
31482	NC_009442	CAT	2	6	1536145	1536150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319271
31483	NC_009442	GCTC	2	8	1536193	1536200	0 %	25 %	25 %	50 %	146319271
31484	NC_009442	CTT	2	6	1536229	1536234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319271
31485	NC_009442	CAA	2	6	1536285	1536290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319271
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31487	NC_009442	CCAG	2	8	1536438	1536445	25 %	0 %	25 %	50 %	146319271
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31489	NC_009442	T	6	6	1536625	1536630	0 %	100 %	0 %	0 %	146319272
31490	NC_009442	CCA	2	6	1536633	1536638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319272
31491	NC_009442	TAGA	2	8	1536706	1536713	50 %	25 %	25 %	0 %	146319272
31492	NC_009442	ACT	2	6	1536725	1536730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319272
31493	NC_009442	AGT	2	6	1536753	1536758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319272
31494	NC_009442	T	7	7	1536760	1536766	0 %	100 %	0 %	0 %	146319272
31495	NC_009442	CAAAG	2	10	1536813	1536822	60 %	0 %	20 %	20 %	146319272
31496	NC_009442	ATC	2	6	1536830	1536835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319272
31497	NC_009442	TCC	2	6	1536923	1536928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319272
31498	NC_009442	AGCA	2	8	1537035	1537042	50 %	0 %	25 %	25 %	146319272
31499	NC_009442	T	6	6	1537119	1537124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31500	NC_009442	AGT	2	6	1537146	1537151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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