MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_009442	CTC	2	6	1488392	1488397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319213
30503	NC_009442	CAT	2	6	1488399	1488404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30504	NC_009442	CTT	2	6	1488512	1488517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319213
30505	NC_009442	ATC	2	6	1488546	1488551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30506	NC_009442	ATA	2	6	1488573	1488578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319213
30507	NC_009442	GGT	2	6	1488653	1488658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319213
30508	NC_009442	TGG	2	6	1488691	1488696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319213
30509	NC_009442	ATG	2	6	1488811	1488816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319213
30510	NC_009442	ATC	2	6	1488940	1488945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30511	NC_009442	TCA	2	6	1489060	1489065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30512	NC_009442	ACCAA	2	10	1489077	1489086	60 %	0 %	0 %	40 %	146319213
30513	NC_009442	CAT	2	6	1489088	1489093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30514	NC_009442	AACA	2	8	1489098	1489105	75 %	0 %	0 %	25 %	146319213
30515	NC_009442	TCT	2	6	1489153	1489158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319213
30516	NC_009442	GTT	2	6	1489185	1489190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319213
30517	NC_009442	GTTT	2	8	1489208	1489215	0 %	75 %	25 %	0 %	146319213
30518	NC_009442	GAT	2	6	1489222	1489227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319213
30519	NC_009442	TGA	2	6	1489252	1489257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319213
30520	NC_009442	CTT	2	6	1489721	1489726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319213
30521	NC_009442	CT	3	6	1489792	1489797	0 %	50 %	0 %	50 %	146319213
30522	NC_009442	CTT	2	6	1489802	1489807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319213
30523	NC_009442	T	6	6	1489842	1489847	0 %	100 %	0 %	0 %	146319213
30524	NC_009442	ATTC	2	8	1489898	1489905	25 %	50 %	0 %	25 %	146319213
30525	NC_009442	GGA	2	6	1489964	1489969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319213
30526	NC_009442	CGAT	2	8	1490016	1490023	25 %	25 %	25 %	25 %	146319213
30527	NC_009442	T	7	7	1490063	1490069	0 %	100 %	0 %	0 %	146319213
30528	NC_009442	GAT	2	6	1490112	1490117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319213
30529	NC_009442	TC	3	6	1490183	1490188	0 %	50 %	0 %	50 %	146319213
30530	NC_009442	TCT	2	6	1490194	1490199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319214
30531	NC_009442	TTTA	2	8	1490230	1490237	25 %	75 %	0 %	0 %	146319214
30532	NC_009442	AGG	2	6	1490276	1490281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319214
30533	NC_009442	AATG	2	8	1490287	1490294	50 %	25 %	25 %	0 %	146319214
30534	NC_009442	CTA	2	6	1490391	1490396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319214
30535	NC_009442	TTA	2	6	1490421	1490426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319214
30536	NC_009442	TTG	2	6	1490448	1490453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319214
30537	NC_009442	TGC	2	6	1490473	1490478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319214
30538	NC_009442	TGA	2	6	1490527	1490532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319214
30539	NC_009442	TATG	2	8	1490549	1490556	25 %	50 %	25 %	0 %	146319214
30540	NC_009442	GGTT	2	8	1490557	1490564	0 %	50 %	50 %	0 %	146319214
30541	NC_009442	ACT	2	6	1490616	1490621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319214
30542	NC_009442	CTCCA	2	10	1490624	1490633	20 %	20 %	0 %	60 %	146319214
30543	NC_009442	CATCC	2	10	1490687	1490696	20 %	20 %	0 %	60 %	146319214
30544	NC_009442	CAAC	2	8	1490731	1490738	50 %	0 %	0 %	50 %	146319214
30545	NC_009442	AGC	2	6	1490743	1490748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319214
30546	NC_009442	ATTA	2	8	1490776	1490783	50 %	50 %	0 %	0 %	146319214
30547	NC_009442	GAT	2	6	1490827	1490832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319214
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30550	NC_009442	A	7	7	1491111	1491117	100 %	0 %	0 %	0 %	146319214
30551	NC_009442	CTT	2	6	1491191	1491196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319215
30552	NC_009442	TGC	2	6	1491213	1491218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319215
30553	NC_009442	CCTT	2	8	1491244	1491251	0 %	50 %	0 %	50 %	146319215
30554	NC_009442	CAT	2	6	1491266	1491271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319215
30555	NC_009442	GAA	2	6	1491296	1491301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319215
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30557	NC_009442	CTC	2	6	1491408	1491413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319215
30558	NC_009442	TC	3	6	1491429	1491434	0 %	50 %	0 %	50 %	146319215
30559	NC_009442	AGC	2	6	1491480	1491485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319215
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30562	NC_009442	GAT	2	6	1491628	1491633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319215
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30571	NC_009442	AAT	2	6	1492104	1492109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319215
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30578	NC_009442	ATC	2	6	1492570	1492575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319216
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30584	NC_009442	TCA	2	6	1492784	1492789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319216
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30588	NC_009442	GTCT	2	8	1493004	1493011	0 %	50 %	25 %	25 %	146319216
30589	NC_009442	CTC	3	9	1493034	1493042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319216
30590	NC_009442	CT	3	6	1493077	1493082	0 %	50 %	0 %	50 %	146319216
30591	NC_009442	GGAA	2	8	1493099	1493106	50 %	0 %	50 %	0 %	146319216
30592	NC_009442	CGC	2	6	1493124	1493129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319216
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30599	NC_009442	ATTT	2	8	1493578	1493585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30600	NC_009442	ATA	2	6	1493589	1493594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30601	NC_009442	AAAG	2	8	1493595	1493602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30602	NC_009442	AG	3	6	1493601	1493606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30603	NC_009442	TTCTA	2	10	1493658	1493667	20 %	60 %	0 %	20 %	146319217
30604	NC_009442	T	7	7	1493684	1493690	0 %	100 %	0 %	0 %	146319217
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30613	NC_009442	CTTT	2	8	1494050	1494057	0 %	75 %	0 %	25 %	146319218
30614	NC_009442	A	8	8	1494075	1494082	100 %	0 %	0 %	0 %	146319218
30615	NC_009442	GATTG	2	10	1494102	1494111	20 %	40 %	40 %	0 %	146319218
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30859	NC_009442	GTTT	2	8	1505570	1505577	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30860	NC_009442	T	6	6	1505606	1505611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30977	NC_009442	CCA	2	6	1510717	1510722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319239
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30979	NC_009442	GATTT	2	10	1510894	1510903	20 %	60 %	20 %	0 %	146319240
30980	NC_009442	AATT	2	8	1510948	1510955	50 %	50 %	0 %	0 %	146319240
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30982	NC_009442	ATC	2	6	1511088	1511093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31000	NC_009442	GTCG	2	8	1511829	1511836	0 %	25 %	50 %	25 %	146319242

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