MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_009442	GAG	2	6	1464684	1464689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319186
30003	NC_009442	AAG	2	6	1464755	1464760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319186
30004	NC_009442	CAA	2	6	1464762	1464767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319186
30005	NC_009442	CTT	2	6	1464819	1464824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319186
30006	NC_009442	T	6	6	1464823	1464828	0 %	100 %	0 %	0 %	146319186
30007	NC_009442	CTC	2	6	1464844	1464849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319186
30008	NC_009442	ATC	2	6	1464850	1464855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319186
30009	NC_009442	TGA	2	6	1464876	1464881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319186
30010	NC_009442	AATCC	2	10	1464932	1464941	40 %	20 %	0 %	40 %	146319186
30011	NC_009442	A	6	6	1464977	1464982	100 %	0 %	0 %	0 %	146319186
30012	NC_009442	ATG	2	6	1465193	1465198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319186
30013	NC_009442	CTTG	2	8	1465226	1465233	0 %	50 %	25 %	25 %	146319186
30014	NC_009442	CAC	2	6	1465300	1465305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319187
30015	NC_009442	GTGG	2	8	1465312	1465319	0 %	25 %	75 %	0 %	146319187
30016	NC_009442	CAT	2	6	1465327	1465332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319187
30017	NC_009442	TACT	2	8	1465362	1465369	25 %	50 %	0 %	25 %	146319187
30018	NC_009442	GTTT	2	8	1465398	1465405	0 %	75 %	25 %	0 %	146319187
30019	NC_009442	CGC	2	6	1465523	1465528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319187
30020	NC_009442	TCT	2	6	1465632	1465637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319187
30021	NC_009442	CAA	2	6	1465651	1465656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319187
30022	NC_009442	TC	3	6	1465738	1465743	0 %	50 %	0 %	50 %	146319187
30023	NC_009442	TGA	2	6	1465851	1465856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319187
30024	NC_009442	GTC	2	6	1465892	1465897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319187
30025	NC_009442	CAAG	2	8	1465986	1465993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30026	NC_009442	AAT	3	9	1466110	1466118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30027	NC_009442	T	6	6	1466136	1466141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30028	NC_009442	AAT	2	6	1466143	1466148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30029	NC_009442	TCA	2	6	1466179	1466184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30030	NC_009442	ATG	2	6	1466212	1466217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30031	NC_009442	GGA	2	6	1466251	1466256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319188
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30040	NC_009442	TTG	2	6	1466694	1466699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319188
30041	NC_009442	TTA	2	6	1466775	1466780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_009442	TTGC	2	8	1466795	1466802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30043	NC_009442	AT	3	6	1466819	1466824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_009442	T	8	8	1466839	1466846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_009442	A	6	6	1466848	1466853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30046	NC_009442	A	6	6	1466870	1466875	100 %	0 %	0 %	0 %	146319189
30047	NC_009442	CAAATC	2	12	1466991	1467002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146319189
30048	NC_009442	A	7	7	1467115	1467121	100 %	0 %	0 %	0 %	146319189
30049	NC_009442	T	6	6	1467165	1467170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_009442	A	6	6	1467179	1467184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30051	NC_009442	ACT	2	6	1467271	1467276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319190
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30084	NC_009442	T	6	6	1468847	1468852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30085	NC_009442	TC	3	6	1468912	1468917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30086	NC_009442	ATA	2	6	1468918	1468923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30121	NC_009442	AGC	2	6	1470509	1470514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319192
30122	NC_009442	T	7	7	1470554	1470560	0 %	100 %	0 %	0 %	146319192
30123	NC_009442	TCA	2	6	1470591	1470596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319192
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30125	NC_009442	TTA	2	6	1470648	1470653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319192
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30240	NC_009442	ACGA	2	8	1476039	1476046	50 %	0 %	25 %	25 %	146319198
30241	NC_009442	CGT	2	6	1476055	1476060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319198
30242	NC_009442	AAGG	2	8	1476071	1476078	50 %	0 %	50 %	0 %	146319198
30243	NC_009442	TCCA	2	8	1476102	1476109	25 %	25 %	0 %	50 %	146319198
30244	NC_009442	CTT	2	6	1476152	1476157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319198
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30247	NC_009442	GTCAC	2	10	1476464	1476473	20 %	20 %	20 %	40 %	146319199
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30266	NC_009442	ATCGC	2	10	1477560	1477569	20 %	20 %	20 %	40 %	146319201
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30321	NC_009442	ATAC	2	8	1479863	1479870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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30341	NC_009442	A	6	6	1480943	1480948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30342	NC_009442	CAG	2	6	1480976	1480981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30350	NC_009442	TCT	2	6	1481264	1481269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319206
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30355	NC_009442	TTG	2	6	1481547	1481552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319206
30356	NC_009442	ACG	2	6	1481563	1481568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319206
30357	NC_009442	ATG	2	6	1481624	1481629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319206
30358	NC_009442	CT	3	6	1481637	1481642	0 %	50 %	0 %	50 %	146319207
30359	NC_009442	T	6	6	1481642	1481647	0 %	100 %	0 %	0 %	146319207
30360	NC_009442	T	6	6	1481649	1481654	0 %	100 %	0 %	0 %	146319207
30361	NC_009442	A	7	7	1481665	1481671	100 %	0 %	0 %	0 %	146319207
30362	NC_009442	A	6	6	1481675	1481680	100 %	0 %	0 %	0 %	146319207
30363	NC_009442	ATTT	3	12	1481699	1481710	25 %	75 %	0 %	0 %	146319207
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30365	NC_009442	TTA	2	6	1481748	1481753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319208
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30371	NC_009442	A	6	6	1481980	1481985	100 %	0 %	0 %	0 %	146319208
30372	NC_009442	TTGT	2	8	1481990	1481997	0 %	75 %	25 %	0 %	146319208
30373	NC_009442	AGCC	2	8	1482044	1482051	25 %	0 %	25 %	50 %	146319208
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30381	NC_009442	TTTC	2	8	1482487	1482494	0 %	75 %	0 %	25 %	146319208
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30385	NC_009442	AATCA	2	10	1482713	1482722	60 %	20 %	0 %	20 %	146319208
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30391	NC_009442	ATA	2	6	1482941	1482946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319208
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30400	NC_009442	TTA	2	6	1483346	1483351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30402	NC_009442	CAA	2	6	1483432	1483437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319209
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30429	NC_009442	CTTTT	2	10	1484863	1484872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30430	NC_009442	T	6	6	1484869	1484874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30460	NC_009442	ACCAA	2	10	1486385	1486394	60 %	0 %	0 %	40 %	146319211
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30463	NC_009442	CAA	2	6	1486578	1486583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319211
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30469	NC_009442	T	6	6	1486794	1486799	0 %	100 %	0 %	0 %	146319212
30470	NC_009442	CTG	2	6	1486808	1486813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319212
30471	NC_009442	CTC	2	6	1486854	1486859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319212
30472	NC_009442	CAG	2	6	1486925	1486930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319212
30473	NC_009442	TTC	2	6	1486932	1486937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319212
30474	NC_009442	CAT	2	6	1486988	1486993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319212
30475	NC_009442	GA	3	6	1487018	1487023	50 %	0 %	50 %	0 %	146319212
30476	NC_009442	T	6	6	1487037	1487042	0 %	100 %	0 %	0 %	146319212
30477	NC_009442	CTG	2	6	1487066	1487071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319212
30478	NC_009442	ATAG	2	8	1487074	1487081	50 %	25 %	25 %	0 %	146319212
30479	NC_009442	CTT	2	6	1487117	1487122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319212
30480	NC_009442	TTG	2	6	1487166	1487171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319212
30481	NC_009442	GC	3	6	1487255	1487260	0 %	0 %	50 %	50 %	146319212
30482	NC_009442	CAA	2	6	1487289	1487294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319212
30483	NC_009442	TGT	2	6	1487319	1487324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319212
30484	NC_009442	CAT	2	6	1487327	1487332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319212
30485	NC_009442	TCT	2	6	1487368	1487373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319212
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30487	NC_009442	TTA	2	6	1487557	1487562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319212
30488	NC_009442	AAGG	2	8	1487591	1487598	50 %	0 %	50 %	0 %	146319212
30489	NC_009442	T	7	7	1487605	1487611	0 %	100 %	0 %	0 %	146319212
30490	NC_009442	CAT	2	6	1487663	1487668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319212
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30494	NC_009442	CTA	2	6	1487914	1487919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319212
30495	NC_009442	TTTTCA	2	12	1487984	1487995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146319212
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30497	NC_009442	AT	3	6	1488025	1488030	50 %	50 %	0 %	0 %	146319213
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30499	NC_009442	TCA	2	6	1488080	1488085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319213
30500	NC_009442	TC	3	6	1488104	1488109	0 %	50 %	0 %	50 %	146319213

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