MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_009442	CTT	2	6	1439583	1439588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319155
29503	NC_009442	A	6	6	1439633	1439638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29504	NC_009442	GAT	2	6	1439648	1439653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29505	NC_009442	TAC	2	6	1439786	1439791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29506	NC_009442	T	6	6	1439882	1439887	0 %	100 %	0 %	0 %	146319156
29507	NC_009442	TTG	2	6	1440043	1440048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319156
29508	NC_009442	CTT	2	6	1440097	1440102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319156
29509	NC_009442	AGC	2	6	1440173	1440178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319156
29510	NC_009442	CTT	2	6	1440181	1440186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319156
29511	NC_009442	GAA	2	6	1440220	1440225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319156
29512	NC_009442	GTC	2	6	1440226	1440231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319156
29513	NC_009442	TGA	2	6	1440316	1440321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319156
29514	NC_009442	TTC	2	6	1440341	1440346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319156
29515	NC_009442	CAG	2	6	1440379	1440384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319156
29516	NC_009442	ATG	2	6	1440468	1440473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319156
29517	NC_009442	CAG	2	6	1440496	1440501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319156
29518	NC_009442	GAT	2	6	1440515	1440520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319156
29519	NC_009442	ACC	2	6	1440563	1440568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319156
29520	NC_009442	TTC	2	6	1440612	1440617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319156
29521	NC_009442	CTT	2	6	1440652	1440657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319156
29522	NC_009442	TGAA	2	8	1440658	1440665	50 %	25 %	25 %	0 %	146319156
29523	NC_009442	TGAG	2	8	1440716	1440723	25 %	25 %	50 %	0 %	146319156
29524	NC_009442	ACC	2	6	1440725	1440730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319156
29525	NC_009442	TGA	2	6	1440733	1440738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319156
29526	NC_009442	TCA	2	6	1440742	1440747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319156
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29528	NC_009442	CAG	3	9	1440814	1440822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319156
29529	NC_009442	TTG	2	6	1440920	1440925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319156
29530	NC_009442	GAT	2	6	1440944	1440949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319156
29531	NC_009442	GTT	2	6	1440965	1440970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319156
29532	NC_009442	ACCAAG	2	12	1440995	1441006	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146319156
29533	NC_009442	ACTTCA	2	12	1441110	1441121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319156
29534	NC_009442	TAA	2	6	1441171	1441176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319156
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29536	NC_009442	A	6	6	1441253	1441258	100 %	0 %	0 %	0 %	146319157
29537	NC_009442	GAAA	2	8	1441273	1441280	75 %	0 %	25 %	0 %	146319157
29538	NC_009442	CCTT	2	8	1441292	1441299	0 %	50 %	0 %	50 %	146319157
29539	NC_009442	TAC	2	6	1441347	1441352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29540	NC_009442	TAC	2	6	1441355	1441360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29541	NC_009442	AGT	2	6	1441462	1441467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29542	NC_009442	GTC	2	6	1441471	1441476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29543	NC_009442	CTC	2	6	1441524	1441529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29544	NC_009442	CAA	2	6	1441565	1441570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29545	NC_009442	ACTA	2	8	1441577	1441584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29546	NC_009442	TAC	2	6	1441609	1441614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29547	NC_009442	ATC	2	6	1441619	1441624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29548	NC_009442	A	6	6	1441629	1441634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29549	NC_009442	CA	3	6	1441664	1441669	50 %	0 %	0 %	50 %	146319158
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29552	NC_009442	A	7	7	1441741	1441747	100 %	0 %	0 %	0 %	146319158
29553	NC_009442	CCTT	2	8	1441761	1441768	0 %	50 %	0 %	50 %	146319158
29554	NC_009442	ATA	2	6	1441831	1441836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29555	NC_009442	CATT	2	8	1441920	1441927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29556	NC_009442	CTTT	2	8	1441939	1441946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29557	NC_009442	ATAA	2	8	1441995	1442002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29558	NC_009442	ATA	2	6	1442004	1442009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29559	NC_009442	CCT	2	6	1442042	1442047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319159
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29569	NC_009442	CCT	2	6	1442414	1442419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319159
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29584	NC_009442	TAT	2	6	1443168	1443173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29587	NC_009442	TAT	2	6	1443271	1443276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319160
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29601	NC_009442	TTG	2	6	1444150	1444155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29602	NC_009442	A	7	7	1444202	1444208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29603	NC_009442	GCT	2	6	1444235	1444240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29604	NC_009442	T	6	6	1444303	1444308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29605	NC_009442	TGAC	2	8	1444514	1444521	25 %	25 %	25 %	25 %	146319161
29606	NC_009442	TTGAT	2	10	1444649	1444658	20 %	60 %	20 %	0 %	146319161
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29611	NC_009442	CCA	2	6	1444776	1444781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319161
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