MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_009442	ATG	2	6	1414942	1414947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319126
29002	NC_009442	CTA	2	6	1414961	1414966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319126
29003	NC_009442	ACC	2	6	1414978	1414983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319126
29004	NC_009442	GGCAAT	2	12	1415037	1415048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319126
29005	NC_009442	CGG	2	6	1415060	1415065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319126
29006	NC_009442	ACT	2	6	1415154	1415159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319126
29007	NC_009442	A	6	6	1415169	1415174	100 %	0 %	0 %	0 %	146319126
29008	NC_009442	AAG	2	6	1415221	1415226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319126
29009	NC_009442	GAA	2	6	1415232	1415237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319126
29010	NC_009442	ATCAGA	2	12	1415282	1415293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29011	NC_009442	GCAGAT	2	12	1415303	1415314	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29012	NC_009442	TCA	2	6	1415326	1415331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29013	NC_009442	CAA	2	6	1415340	1415345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29014	NC_009442	TTTTA	2	10	1415412	1415421	20 %	80 %	0 %	0 %	146319127
29015	NC_009442	TA	3	6	1415420	1415425	50 %	50 %	0 %	0 %	146319127
29016	NC_009442	ACC	2	6	1415567	1415572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319127
29017	NC_009442	CCA	2	6	1415714	1415719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319127
29018	NC_009442	GTCTT	2	10	1415786	1415795	0 %	60 %	20 %	20 %	146319127
29019	NC_009442	CTGT	2	8	1415846	1415853	0 %	50 %	25 %	25 %	146319127
29020	NC_009442	GCT	2	6	1415858	1415863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319127
29021	NC_009442	AGAC	2	8	1415964	1415971	50 %	0 %	25 %	25 %	146319127
29022	NC_009442	T	6	6	1415991	1415996	0 %	100 %	0 %	0 %	146319127
29023	NC_009442	GAT	2	6	1416015	1416020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319127
29024	NC_009442	TGA	2	6	1416400	1416405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319128
29025	NC_009442	AAT	2	6	1416443	1416448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319128
29026	NC_009442	CGG	2	6	1416474	1416479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319128
29027	NC_009442	TGT	2	6	1416514	1416519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319128
29028	NC_009442	TCC	2	6	1416530	1416535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319128
29029	NC_009442	GCCT	2	8	1416633	1416640	0 %	25 %	25 %	50 %	146319128
29030	NC_009442	CTTT	2	8	1416682	1416689	0 %	75 %	0 %	25 %	146319128
29031	NC_009442	T	6	6	1416687	1416692	0 %	100 %	0 %	0 %	146319128
29032	NC_009442	TTTC	2	8	1416724	1416731	0 %	75 %	0 %	25 %	146319128
29033	NC_009442	A	7	7	1416766	1416772	100 %	0 %	0 %	0 %	146319128
29034	NC_009442	CAA	2	6	1416779	1416784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319128
29035	NC_009442	GTT	2	6	1416798	1416803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29036	NC_009442	ACC	2	6	1416982	1416987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29037	NC_009442	GTCG	2	8	1417027	1417034	0 %	25 %	50 %	25 %	146319129
29038	NC_009442	AAGA	2	8	1417044	1417051	75 %	0 %	25 %	0 %	146319129
29039	NC_009442	T	6	6	1417068	1417073	0 %	100 %	0 %	0 %	146319129
29040	NC_009442	TTC	2	6	1417183	1417188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319130
29041	NC_009442	TTC	2	6	1417192	1417197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319130
29042	NC_009442	TTG	2	6	1417210	1417215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319130
29043	NC_009442	TTTC	2	8	1417233	1417240	0 %	75 %	0 %	25 %	146319130
29044	NC_009442	GCG	2	6	1417345	1417350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319130
29045	NC_009442	T	6	6	1417465	1417470	0 %	100 %	0 %	0 %	146319130
29046	NC_009442	ATA	2	6	1417477	1417482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319130
29047	NC_009442	TGG	2	6	1417536	1417541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319130
29048	NC_009442	TGA	2	6	1417551	1417556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319130
29049	NC_009442	CCT	2	6	1417620	1417625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319130
29050	NC_009442	TGGT	2	8	1417643	1417650	0 %	50 %	50 %	0 %	146319130
29051	NC_009442	TCA	2	6	1417655	1417660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319130
29052	NC_009442	GTT	3	9	1417672	1417680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319130
29053	NC_009442	GAG	2	6	1417699	1417704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319130
29054	NC_009442	CAT	2	6	1417752	1417757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319130
29055	NC_009442	CTC	2	6	1417831	1417836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319130
29056	NC_009442	TAG	2	6	1417880	1417885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319130
29057	NC_009442	CGA	2	6	1417941	1417946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319130
29058	NC_009442	GTT	2	6	1417961	1417966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319130
29059	NC_009442	CAATGG	2	12	1417989	1418000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319130
29060	NC_009442	GCA	2	6	1418063	1418068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319130
29061	NC_009442	GC	3	6	1418195	1418200	0 %	0 %	50 %	50 %	146319130
29062	NC_009442	TGG	2	6	1418202	1418207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319130
29063	NC_009442	TCT	2	6	1418240	1418245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319130
29064	NC_009442	CTG	2	6	1418263	1418268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319130
29065	NC_009442	CAA	2	6	1418316	1418321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319130
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29067	NC_009442	CAGTGT	2	12	1418371	1418382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146319130
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29072	NC_009442	TGGTC	2	10	1418598	1418607	0 %	40 %	40 %	20 %	146319130
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29082	NC_009442	A	6	6	1419152	1419157	100 %	0 %	0 %	0 %	146319130
29083	NC_009442	ACC	2	6	1419209	1419214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319131
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29087	NC_009442	CTAT	2	8	1419396	1419403	25 %	50 %	0 %	25 %	146319131
29088	NC_009442	AGAGC	2	10	1419472	1419481	40 %	0 %	40 %	20 %	146319131
29089	NC_009442	CAAGG	2	10	1419549	1419558	40 %	0 %	40 %	20 %	146319131
29090	NC_009442	CTGC	2	8	1419572	1419579	0 %	25 %	25 %	50 %	146319132
29091	NC_009442	TAA	2	6	1419714	1419719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319132
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29097	NC_009442	TCA	2	6	1419860	1419865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319132
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29101	NC_009442	AAT	2	6	1420096	1420101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319132
29102	NC_009442	TCTT	2	8	1420271	1420278	0 %	75 %	0 %	25 %	146319133
29103	NC_009442	CTG	2	6	1420322	1420327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319133
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29112	NC_009442	TTC	2	6	1420695	1420700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319133
29113	NC_009442	CAT	2	6	1420765	1420770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319133
29114	NC_009442	AAT	2	6	1420771	1420776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319133
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29117	NC_009442	TCC	2	6	1420895	1420900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319133
29118	NC_009442	ATT	2	6	1421028	1421033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319133
29119	NC_009442	TCT	2	6	1421042	1421047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29120	NC_009442	CTT	2	6	1421081	1421086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29121	NC_009442	TA	3	6	1421090	1421095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29122	NC_009442	GTTTG	2	10	1421144	1421153	0 %	60 %	40 %	0 %	146319134
29123	NC_009442	ATC	2	6	1421175	1421180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319134
29124	NC_009442	T	7	7	1421336	1421342	0 %	100 %	0 %	0 %	146319134
29125	NC_009442	CGG	2	6	1421347	1421352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319134
29126	NC_009442	TCT	2	6	1421383	1421388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319134
29127	NC_009442	CCGCT	2	10	1421471	1421480	0 %	20 %	20 %	60 %	146319134
29128	NC_009442	GAT	2	6	1421529	1421534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319134
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29130	NC_009442	ATG	2	6	1421632	1421637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319134
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29141	NC_009442	TCC	2	6	1422133	1422138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319134
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29146	NC_009442	GTC	2	6	1422355	1422360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319134
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29159	NC_009442	TAT	2	6	1423086	1423091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29160	NC_009442	T	6	6	1423095	1423100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29161	NC_009442	A	6	6	1423114	1423119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29162	NC_009442	ACC	2	6	1423184	1423189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319135
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29181	NC_009442	TAT	2	6	1424078	1424083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29182	NC_009442	ATA	2	6	1424111	1424116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29184	NC_009442	AAC	2	6	1424241	1424246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319138
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29229	NC_009442	CCA	2	6	1426590	1426595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319141
29230	NC_009442	T	6	6	1426597	1426602	0 %	100 %	0 %	0 %	146319141
29231	NC_009442	ACC	2	6	1426678	1426683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319141
29232	NC_009442	TTC	2	6	1426684	1426689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319141
29233	NC_009442	GAA	2	6	1426746	1426751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319141
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29235	NC_009442	CAA	2	6	1426842	1426847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319141
29236	NC_009442	ATTTTT	2	12	1426861	1426872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	146319141
29237	NC_009442	ATTC	2	8	1426879	1426886	25 %	50 %	0 %	25 %	146319141
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29239	NC_009442	AT	3	6	1426926	1426931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29240	NC_009442	CCATCG	2	12	1426939	1426950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29241	NC_009442	TCA	2	6	1426953	1426958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29242	NC_009442	TAA	2	6	1426976	1426981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29243	NC_009442	A	6	6	1427102	1427107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29244	NC_009442	TCC	2	6	1427165	1427170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29245	NC_009442	ATCTC	2	10	1427174	1427183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29246	NC_009442	TGG	2	6	1427418	1427423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29248	NC_009442	CAC	2	6	1427508	1427513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29250	NC_009442	TTC	2	6	1427543	1427548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29252	NC_009442	CTT	2	6	1427675	1427680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319143
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29343	NC_009442	CCTT	2	8	1431430	1431437	0 %	50 %	0 %	50 %	146319145
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29347	NC_009442	T	6	6	1431623	1431628	0 %	100 %	0 %	0 %	146319145
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29472	NC_009442	CAAA	2	8	1438103	1438110	75 %	0 %	0 %	25 %	146319152
29473	NC_009442	GAA	2	6	1438138	1438143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319152
29474	NC_009442	T	6	6	1438282	1438287	0 %	100 %	0 %	0 %	146319153
29475	NC_009442	TTTTCA	2	12	1438348	1438359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146319153
29476	NC_009442	GCAG	2	8	1438417	1438424	25 %	0 %	50 %	25 %	146319153
29477	NC_009442	TGTT	2	8	1438475	1438482	0 %	75 %	25 %	0 %	146319153
29478	NC_009442	T	6	6	1438481	1438486	0 %	100 %	0 %	0 %	146319153
29479	NC_009442	GCAAG	2	10	1438487	1438496	40 %	0 %	40 %	20 %	146319153
29480	NC_009442	AG	3	6	1438539	1438544	50 %	0 %	50 %	0 %	146319153
29481	NC_009442	GAT	2	6	1438545	1438550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319153
29482	NC_009442	TAC	2	6	1438598	1438603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319153
29483	NC_009442	AAT	2	6	1438617	1438622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319153
29484	NC_009442	TCGG	2	8	1438714	1438721	0 %	25 %	50 %	25 %	146319153
29485	NC_009442	CGAA	2	8	1438740	1438747	50 %	0 %	25 %	25 %	146319153
29486	NC_009442	CCA	2	6	1438775	1438780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319153
29487	NC_009442	TGA	2	6	1438800	1438805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319153
29488	NC_009442	CTT	2	6	1438830	1438835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319153
29489	NC_009442	CA	3	6	1438836	1438841	50 %	0 %	0 %	50 %	146319153
29490	NC_009442	TA	3	6	1438848	1438853	50 %	50 %	0 %	0 %	146319153
29491	NC_009442	AGC	2	6	1438863	1438868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319153
29492	NC_009442	A	6	6	1438899	1438904	100 %	0 %	0 %	0 %	146319153
29493	NC_009442	ATC	2	6	1438915	1438920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319153
29494	NC_009442	TATCAA	2	12	1438985	1438996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29495	NC_009442	ATTC	2	8	1439036	1439043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29496	NC_009442	ATC	2	6	1439137	1439142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319154
29497	NC_009442	CGATA	2	10	1439172	1439181	40 %	20 %	20 %	20 %	146319154
29498	NC_009442	ACA	2	6	1439271	1439276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319154
29499	NC_009442	TCA	2	6	1439409	1439414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319155
29500	NC_009442	TGA	2	6	1439421	1439426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319155

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