MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_009442	CAT	2	6	1338702	1338707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
27502	NC_009442	CAC	2	6	1338718	1338723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319045
27503	NC_009442	CAA	2	6	1338738	1338743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319045
27504	NC_009442	TTCCG	2	10	1338793	1338802	0 %	40 %	20 %	40 %	146319045
27505	NC_009442	CTT	2	6	1338820	1338825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
27506	NC_009442	TCT	2	6	1338834	1338839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
27507	NC_009442	CTTCCG	2	12	1338951	1338962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146319045
27508	NC_009442	ATC	2	6	1339060	1339065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
27509	NC_009442	TCA	2	6	1339073	1339078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
27510	NC_009442	GAC	2	6	1339197	1339202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319045
27511	NC_009442	CTT	2	6	1339302	1339307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
27512	NC_009442	TTA	2	6	1339403	1339408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27513	NC_009442	TCA	2	6	1339459	1339464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27514	NC_009442	CAA	2	6	1339580	1339585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27515	NC_009442	TTG	2	6	1339594	1339599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27516	NC_009442	GCAAA	2	10	1339619	1339628	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27517	NC_009442	A	7	7	1339729	1339735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27518	NC_009442	TACT	2	8	1339768	1339775	25 %	50 %	0 %	25 %	146319046
27519	NC_009442	AGA	2	6	1339893	1339898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319046
27520	NC_009442	T	6	6	1339921	1339926	0 %	100 %	0 %	0 %	146319046
27521	NC_009442	GCTG	2	8	1339927	1339934	0 %	25 %	50 %	25 %	146319046
27522	NC_009442	TAA	2	6	1339983	1339988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319046
27523	NC_009442	T	7	7	1340002	1340008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27524	NC_009442	TC	3	6	1340077	1340082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27525	NC_009442	AGT	2	6	1340145	1340150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27526	NC_009442	TAC	2	6	1340154	1340159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27527	NC_009442	AGC	2	6	1340304	1340309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319047
27528	NC_009442	CAT	2	6	1340322	1340327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319047
27529	NC_009442	CAA	2	6	1340333	1340338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
27530	NC_009442	ATT	2	6	1340349	1340354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319047
27531	NC_009442	GTTG	2	8	1340360	1340367	0 %	50 %	50 %	0 %	146319047
27532	NC_009442	CTT	2	6	1340390	1340395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319047
27533	NC_009442	CAA	2	6	1340469	1340474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
27534	NC_009442	CAA	2	6	1340642	1340647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
27535	NC_009442	TCTG	2	8	1340659	1340666	0 %	50 %	25 %	25 %	146319047
27536	NC_009442	AAC	2	6	1340700	1340705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
27537	NC_009442	AGC	2	6	1340712	1340717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319047
27538	NC_009442	AAT	3	9	1340721	1340729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319047
27539	NC_009442	T	6	6	1340811	1340816	0 %	100 %	0 %	0 %	146319047
27540	NC_009442	AAG	2	6	1340874	1340879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319047
27541	NC_009442	CCA	2	6	1340882	1340887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319047
27542	NC_009442	ACC	2	6	1340928	1340933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319047
27543	NC_009442	GTAAG	2	10	1341078	1341087	40 %	20 %	40 %	0 %	146319048
27544	NC_009442	A	6	6	1341093	1341098	100 %	0 %	0 %	0 %	146319048
27545	NC_009442	ACC	2	6	1341118	1341123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319048
27546	NC_009442	CAT	2	6	1341157	1341162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319048
27547	NC_009442	ATA	2	6	1341253	1341258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319048
27548	NC_009442	CCAA	2	8	1341351	1341358	50 %	0 %	0 %	50 %	146319048
27549	NC_009442	ACT	2	6	1341385	1341390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319048
27550	NC_009442	CGT	2	6	1341393	1341398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319048
27551	NC_009442	TCC	2	6	1341411	1341416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319049
27552	NC_009442	CCGCT	2	10	1341451	1341460	0 %	20 %	20 %	60 %	146319049
27553	NC_009442	CAC	2	6	1341470	1341475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319049
27554	NC_009442	AAAG	2	8	1341501	1341508	75 %	0 %	25 %	0 %	146319049
27555	NC_009442	AGC	2	6	1341512	1341517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319049
27556	NC_009442	CTG	2	6	1341575	1341580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319049
27557	NC_009442	CCTG	2	8	1341709	1341716	0 %	25 %	25 %	50 %	146319049
27558	NC_009442	AAC	2	6	1341884	1341889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319049
27559	NC_009442	CGCATC	2	12	1341890	1341901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146319049
27560	NC_009442	TC	3	6	1341921	1341926	0 %	50 %	0 %	50 %	146319049
27561	NC_009442	TCTG	2	8	1342054	1342061	0 %	50 %	25 %	25 %	146319050
27562	NC_009442	AAT	2	6	1342103	1342108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319050
27563	NC_009442	CCAT	2	8	1342120	1342127	25 %	25 %	0 %	50 %	146319050
27564	NC_009442	ACC	2	6	1342161	1342166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319050
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27568	NC_009442	TCC	2	6	1342396	1342401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319050
27569	NC_009442	CAG	2	6	1342458	1342463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319050
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27571	NC_009442	TGTT	2	8	1342540	1342547	0 %	75 %	25 %	0 %	146319050
27572	NC_009442	GGCA	2	8	1342548	1342555	25 %	0 %	50 %	25 %	146319050
27573	NC_009442	ACG	2	6	1342644	1342649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319050
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27576	NC_009442	CA	3	6	1342873	1342878	50 %	0 %	0 %	50 %	146319050
27577	NC_009442	CTAT	2	8	1342886	1342893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27578	NC_009442	CTTTC	2	10	1343051	1343060	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27579	NC_009442	CTG	2	6	1343222	1343227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27580	NC_009442	T	6	6	1343293	1343298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27581	NC_009442	CT	3	6	1343379	1343384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27582	NC_009442	T	6	6	1343466	1343471	0 %	100 %	0 %	0 %	146319051
27583	NC_009442	CTTGAC	2	12	1343487	1343498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146319051
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27585	NC_009442	GAT	3	9	1343592	1343600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319051
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27589	NC_009442	CCG	2	6	1343789	1343794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319051
27590	NC_009442	ATC	2	6	1343913	1343918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319051
27591	NC_009442	GTC	2	6	1344015	1344020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319051
27592	NC_009442	CCA	2	6	1344098	1344103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319051
27593	NC_009442	GT	3	6	1344143	1344148	0 %	50 %	50 %	0 %	146319051
27594	NC_009442	CTT	2	6	1344167	1344172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319051
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27598	NC_009442	A	6	6	1344342	1344347	100 %	0 %	0 %	0 %	146319052
27599	NC_009442	AATC	2	8	1344376	1344383	50 %	25 %	0 %	25 %	146319052
27600	NC_009442	CAA	2	6	1344388	1344393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319052
27601	NC_009442	ACAA	2	8	1344407	1344414	75 %	0 %	0 %	25 %	146319052
27602	NC_009442	CTG	2	6	1344423	1344428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319052
27603	NC_009442	CCA	2	6	1344483	1344488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319052
27604	NC_009442	CAA	2	6	1344597	1344602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319052
27605	NC_009442	CTT	2	6	1344622	1344627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319052
27606	NC_009442	TTC	2	6	1344637	1344642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319052
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27608	NC_009442	CAAT	2	8	1344687	1344694	50 %	25 %	0 %	25 %	146319052
27609	NC_009442	T	6	6	1344713	1344718	0 %	100 %	0 %	0 %	146319052
27610	NC_009442	ATT	2	6	1344721	1344726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319052
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27613	NC_009442	CAT	2	6	1344944	1344949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319053
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27615	NC_009442	ACA	2	6	1345026	1345031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319053
27616	NC_009442	T	6	6	1345129	1345134	0 %	100 %	0 %	0 %	146319053
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27738	NC_009442	GTT	2	6	1350579	1350584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27765	NC_009442	ATCA	2	8	1352179	1352186	50 %	25 %	0 %	25 %	146319059
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27830	NC_009442	T	6	6	1355694	1355699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27836	NC_009442	A	6	6	1356158	1356163	100 %	0 %	0 %	0 %	146319062
27837	NC_009442	AAC	2	6	1356318	1356323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319063
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27851	NC_009442	ACAA	2	8	1356791	1356798	75 %	0 %	0 %	25 %	146319063
27852	NC_009442	TAT	2	6	1356830	1356835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319063
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27978	NC_009442	T	6	6	1363847	1363852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27983	NC_009442	AGG	2	6	1364067	1364072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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27986	NC_009442	CTA	2	6	1364220	1364225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319071
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