MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_009442	TGT	2	6	1311319	1311324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319024
27003	NC_009442	TGCC	2	8	1311333	1311340	0 %	25 %	25 %	50 %	146319024
27004	NC_009442	ATA	2	6	1311431	1311436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319024
27005	NC_009442	T	6	6	1311449	1311454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27006	NC_009442	T	6	6	1311458	1311463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27007	NC_009442	AT	3	6	1311533	1311538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27008	NC_009442	A	6	6	1311547	1311552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_009442	T	6	6	1311594	1311599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27010	NC_009442	AGA	2	6	1311600	1311605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27011	NC_009442	A	6	6	1311731	1311736	100 %	0 %	0 %	0 %	146319025
27012	NC_009442	TAT	2	6	1311788	1311793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319025
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27014	NC_009442	AAG	2	6	1311830	1311835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319025
27015	NC_009442	A	6	6	1311837	1311842	100 %	0 %	0 %	0 %	146319025
27016	NC_009442	CAT	2	6	1311846	1311851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319025
27017	NC_009442	AAC	2	6	1311860	1311865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319025
27018	NC_009442	CAG	2	6	1311911	1311916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319025
27019	NC_009442	TGG	2	6	1312107	1312112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319025
27020	NC_009442	AT	3	6	1312131	1312136	50 %	50 %	0 %	0 %	146319025
27021	NC_009442	AGA	2	6	1312155	1312160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319025
27022	NC_009442	GCT	3	9	1312240	1312248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319025
27023	NC_009442	A	7	7	1312260	1312266	100 %	0 %	0 %	0 %	146319025
27024	NC_009442	A	6	6	1312314	1312319	100 %	0 %	0 %	0 %	146319025
27025	NC_009442	TGG	2	6	1312434	1312439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319025
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27029	NC_009442	TAA	2	6	1312866	1312871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
27030	NC_009442	ATA	2	6	1312880	1312885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
27031	NC_009442	TAA	2	6	1312956	1312961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
27032	NC_009442	ATA	2	6	1312970	1312975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
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27041	NC_009442	TAT	2	6	1313436	1313441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319025
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27043	NC_009442	TAA	2	6	1313482	1313487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
27044	NC_009442	TATT	2	8	1313639	1313646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27045	NC_009442	T	6	6	1313645	1313650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27046	NC_009442	CTCG	2	8	1313816	1313823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27047	NC_009442	TAA	2	6	1313830	1313835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27048	NC_009442	TAA	2	6	1313883	1313888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27049	NC_009442	TGAT	2	8	1314042	1314049	25 %	50 %	25 %	0 %	146319026
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27053	NC_009442	TCT	2	6	1314174	1314179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319026
27054	NC_009442	TTGT	2	8	1314305	1314312	0 %	75 %	25 %	0 %	146319026
27055	NC_009442	TTG	2	6	1314378	1314383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319026
27056	NC_009442	TGTC	2	8	1314520	1314527	0 %	50 %	25 %	25 %	146319026
27057	NC_009442	TTTC	2	8	1314592	1314599	0 %	75 %	0 %	25 %	146319026
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27060	NC_009442	ATC	2	6	1314656	1314661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319026
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27062	NC_009442	T	6	6	1314801	1314806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27063	NC_009442	T	7	7	1315027	1315033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27064	NC_009442	ATA	2	6	1315035	1315040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27065	NC_009442	T	7	7	1315048	1315054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27066	NC_009442	T	6	6	1315057	1315062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27067	NC_009442	TA	3	6	1315075	1315080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27068	NC_009442	T	7	7	1315098	1315104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27069	NC_009442	CAT	2	6	1315145	1315150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319027
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27077	NC_009442	GGTT	2	8	1315594	1315601	0 %	50 %	50 %	0 %	146319027
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27088	NC_009442	GTTAC	2	10	1316148	1316157	20 %	40 %	20 %	20 %	146319027
27089	NC_009442	A	6	6	1316217	1316222	100 %	0 %	0 %	0 %	146319027
27090	NC_009442	CCT	2	6	1316226	1316231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27091	NC_009442	AGG	2	6	1316242	1316247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27092	NC_009442	ACCGTA	2	12	1316278	1316289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319028
27093	NC_009442	TCA	2	6	1316355	1316360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319028
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27102	NC_009442	T	7	7	1316908	1316914	0 %	100 %	0 %	0 %	146319028
27103	NC_009442	TCA	2	6	1316948	1316953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319028
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27114	NC_009442	TCTT	2	8	1317359	1317366	0 %	75 %	0 %	25 %	146319028
27115	NC_009442	TTTA	2	8	1317402	1317409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27116	NC_009442	CCAT	2	8	1317473	1317480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27117	NC_009442	TCT	2	6	1317580	1317585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27118	NC_009442	ATAG	2	8	1317602	1317609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27119	NC_009442	CAA	2	6	1317618	1317623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27120	NC_009442	A	7	7	1317658	1317664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27240	NC_009442	GAA	2	6	1324082	1324087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319033
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27248	NC_009442	CT	3	6	1324633	1324638	0 %	50 %	0 %	50 %	146319034
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27341	NC_009442	CCA	2	6	1329877	1329882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319039
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27344	NC_009442	T	6	6	1329997	1330002	0 %	100 %	0 %	0 %	146319039
27345	NC_009442	TTTTA	2	10	1330076	1330085	20 %	80 %	0 %	0 %	146319039
27346	NC_009442	GCAATG	2	12	1330089	1330100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319039
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27349	NC_009442	AGAT	2	8	1330227	1330234	50 %	25 %	25 %	0 %	146319039
27350	NC_009442	TCTGC	2	10	1330237	1330246	0 %	40 %	20 %	40 %	146319039
27351	NC_009442	TAT	2	6	1330247	1330252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319039
27352	NC_009442	TCTG	2	8	1330314	1330321	0 %	50 %	25 %	25 %	146319039
27353	NC_009442	GCT	2	6	1330323	1330328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319039
27354	NC_009442	TGC	2	6	1330376	1330381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319039
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27356	NC_009442	TGTC	2	8	1330426	1330433	0 %	50 %	25 %	25 %	146319039
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27358	NC_009442	GAT	2	6	1330622	1330627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319039
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27386	NC_009442	TCTA	2	8	1332172	1332179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27387	NC_009442	CAT	2	6	1332180	1332185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27390	NC_009442	TATT	2	8	1332318	1332325	25 %	75 %	0 %	0 %	146319041
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27428	NC_009442	CCAA	2	8	1334235	1334242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27455	NC_009442	GGT	2	6	1335884	1335889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319043
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27462	NC_009442	TTG	2	6	1336165	1336170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319043
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27466	NC_009442	A	6	6	1336469	1336474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27467	NC_009442	CTT	2	6	1336697	1336702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319044
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27470	NC_009442	TCT	2	6	1336977	1336982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
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27472	NC_009442	TTTCTT	2	12	1337014	1337025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146319045
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27476	NC_009442	ATC	2	6	1337134	1337139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
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