MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_009442	TAT	2	6	1236892	1236897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318948
25503	NC_009442	CTT	2	6	1236935	1236940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318948
25504	NC_009442	TCC	2	6	1237023	1237028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318948
25505	NC_009442	AAT	2	6	1237136	1237141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318948
25506	NC_009442	TCA	2	6	1237185	1237190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318948
25507	NC_009442	GAA	2	6	1237230	1237235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318948
25508	NC_009442	CA	3	6	1237297	1237302	50 %	0 %	0 %	50 %	146318948
25509	NC_009442	AAGA	2	8	1237303	1237310	75 %	0 %	25 %	0 %	146318948
25510	NC_009442	AAT	2	6	1237311	1237316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318948
25511	NC_009442	T	7	7	1237324	1237330	0 %	100 %	0 %	0 %	146318948
25512	NC_009442	AAC	2	6	1237365	1237370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318948
25513	NC_009442	TCT	2	6	1237403	1237408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318949
25514	NC_009442	TCT	2	6	1237414	1237419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318949
25515	NC_009442	AACC	2	8	1237435	1237442	50 %	0 %	0 %	50 %	146318949
25516	NC_009442	TTGCCT	2	12	1237561	1237572	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146318949
25517	NC_009442	TTGT	2	8	1237652	1237659	0 %	75 %	25 %	0 %	146318949
25518	NC_009442	AGTT	2	8	1237719	1237726	25 %	50 %	25 %	0 %	146318949
25519	NC_009442	AAT	2	6	1237852	1237857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318949
25520	NC_009442	AGT	2	6	1237927	1237932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318949
25521	NC_009442	CAT	2	6	1237991	1237996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318949
25522	NC_009442	GCC	2	6	1238023	1238028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146318949
25523	NC_009442	CTT	2	6	1238030	1238035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318949
25524	NC_009442	GTAATG	2	12	1238076	1238087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318949
25525	NC_009442	ACA	2	6	1238131	1238136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318949
25526	NC_009442	CTG	2	6	1238144	1238149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318949
25527	NC_009442	TTC	2	6	1238175	1238180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318949
25528	NC_009442	CAT	2	6	1238220	1238225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318949
25529	NC_009442	AT	3	6	1238281	1238286	50 %	50 %	0 %	0 %	146318949
25530	NC_009442	TCA	3	9	1238305	1238313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318949
25531	NC_009442	CTG	2	6	1238345	1238350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318949
25532	NC_009442	CCT	2	6	1238386	1238391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318949
25533	NC_009442	CAA	2	6	1238418	1238423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318949
25534	NC_009442	CTTT	2	8	1238438	1238445	0 %	75 %	0 %	25 %	146318949
25535	NC_009442	TTTCT	2	10	1238470	1238479	0 %	80 %	0 %	20 %	146318949
25536	NC_009442	CTT	2	6	1238502	1238507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318949
25537	NC_009442	GTTGA	2	10	1238558	1238567	20 %	40 %	40 %	0 %	146318950
25538	NC_009442	TCT	2	6	1238669	1238674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318950
25539	NC_009442	GTA	2	6	1238695	1238700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318950
25540	NC_009442	TGCT	2	8	1238707	1238714	0 %	50 %	25 %	25 %	146318950
25541	NC_009442	CCA	2	6	1238721	1238726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318950
25542	NC_009442	GAC	2	6	1238766	1238771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318950
25543	NC_009442	AAG	2	6	1239182	1239187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318950
25544	NC_009442	TAA	2	6	1239365	1239370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_009442	TAA	2	6	1239378	1239383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318952
25546	NC_009442	CTT	2	6	1239417	1239422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318952
25547	NC_009442	CCA	2	6	1239433	1239438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318952
25548	NC_009442	GA	3	6	1239483	1239488	50 %	0 %	50 %	0 %	146318952
25549	NC_009442	CCAA	2	8	1239508	1239515	50 %	0 %	0 %	50 %	146318952
25550	NC_009442	TTGC	2	8	1239530	1239537	0 %	50 %	25 %	25 %	146318952
25551	NC_009442	ATAGC	2	10	1239542	1239551	40 %	20 %	20 %	20 %	146318952
25552	NC_009442	GTCA	2	8	1239571	1239578	25 %	25 %	25 %	25 %	146318952
25553	NC_009442	T	6	6	1239609	1239614	0 %	100 %	0 %	0 %	146318952
25554	NC_009442	CTT	2	6	1239633	1239638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318952
25555	NC_009442	TGT	2	6	1239639	1239644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318952
25556	NC_009442	TCT	2	6	1239645	1239650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318952
25557	NC_009442	GTT	2	6	1239847	1239852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318952
25558	NC_009442	AGC	2	6	1239919	1239924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318952
25559	NC_009442	TGA	2	6	1239931	1239936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318952
25560	NC_009442	TGA	2	6	1239943	1239948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318952
25561	NC_009442	AAGG	2	8	1240020	1240027	50 %	0 %	50 %	0 %	146318952
25562	NC_009442	TCG	2	6	1240040	1240045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318952
25563	NC_009442	TGG	2	6	1240055	1240060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318952
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25565	NC_009442	AGC	2	6	1240198	1240203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318952
25566	NC_009442	CAAC	2	8	1240212	1240219	50 %	0 %	0 %	50 %	146318952
25567	NC_009442	CAA	2	6	1240239	1240244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318952
25568	NC_009442	TAAG	2	8	1240298	1240305	50 %	25 %	25 %	0 %	146318952
25569	NC_009442	GAT	2	6	1240335	1240340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318952
25570	NC_009442	TA	3	6	1240344	1240349	50 %	50 %	0 %	0 %	146318952
25571	NC_009442	CCA	2	6	1240385	1240390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318952
25572	NC_009442	ATA	2	6	1240397	1240402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318952
25573	NC_009442	T	7	7	1240419	1240425	0 %	100 %	0 %	0 %	146318952
25574	NC_009442	T	7	7	1240436	1240442	0 %	100 %	0 %	0 %	146318952
25575	NC_009442	T	6	6	1240444	1240449	0 %	100 %	0 %	0 %	146318952
25576	NC_009442	GT	3	6	1240450	1240455	0 %	50 %	50 %	0 %	146318952
25577	NC_009442	AGCAA	2	10	1240544	1240553	60 %	0 %	20 %	20 %	146318952
25578	NC_009442	AC	3	6	1240577	1240582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25579	NC_009442	TCGCT	2	10	1240591	1240600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25580	NC_009442	T	6	6	1240604	1240609	0 %	100 %	0 %	0 %	146318953
25581	NC_009442	GGTA	2	8	1240726	1240733	25 %	25 %	50 %	0 %	146318953
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25584	NC_009442	TTCATG	2	12	1240845	1240856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146318953
25585	NC_009442	TCA	2	6	1240886	1240891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318953
25586	NC_009442	CTC	2	6	1240923	1240928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318953
25587	NC_009442	TGCC	2	8	1240983	1240990	0 %	25 %	25 %	50 %	146318953
25588	NC_009442	CTGCT	2	10	1241061	1241070	0 %	40 %	20 %	40 %	146318953
25589	NC_009442	GGT	2	6	1241137	1241142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318954
25590	NC_009442	CTT	2	6	1241167	1241172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318954
25591	NC_009442	AGT	2	6	1241251	1241256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318954
25592	NC_009442	CG	3	6	1241317	1241322	0 %	0 %	50 %	50 %	146318954
25593	NC_009442	GGTA	2	8	1241359	1241366	25 %	25 %	50 %	0 %	146318954
25594	NC_009442	CCG	2	6	1241418	1241423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146318954
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25597	NC_009442	ATT	2	6	1241498	1241503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318954
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25599	NC_009442	T	6	6	1241554	1241559	0 %	100 %	0 %	0 %	146318954
25600	NC_009442	GCT	2	6	1241652	1241657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318954
25601	NC_009442	TTC	2	6	1241797	1241802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318955
25602	NC_009442	CCAA	2	8	1241889	1241896	50 %	0 %	0 %	50 %	146318955
25603	NC_009442	CGC	2	6	1241931	1241936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146318955
25604	NC_009442	TAAG	2	8	1241941	1241948	50 %	25 %	25 %	0 %	146318955
25605	NC_009442	TTG	2	6	1241951	1241956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318955
25606	NC_009442	CAT	2	6	1242018	1242023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318955
25607	NC_009442	TTC	2	6	1242079	1242084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318955
25608	NC_009442	CAA	2	6	1242117	1242122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318955
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25611	NC_009442	TTC	2	6	1242271	1242276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318955
25612	NC_009442	ATA	2	6	1242281	1242286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318955
25613	NC_009442	GTT	2	6	1242315	1242320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318955
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25616	NC_009442	ATAG	2	8	1242469	1242476	50 %	25 %	25 %	0 %	146318955
25617	NC_009442	ACC	2	6	1242529	1242534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318955
25618	NC_009442	AAT	2	6	1242541	1242546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318955
25619	NC_009442	A	6	6	1242622	1242627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25620	NC_009442	GAC	2	6	1242634	1242639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25621	NC_009442	ATC	2	6	1242675	1242680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318956
25622	NC_009442	ATG	2	6	1242681	1242686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318956
25623	NC_009442	ACG	2	6	1242762	1242767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318956
25624	NC_009442	CTG	2	6	1242850	1242855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318956
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25629	NC_009442	CAC	3	9	1243132	1243140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318956
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25631	NC_009442	A	7	7	1243203	1243209	100 %	0 %	0 %	0 %	146318956
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25634	NC_009442	CTG	3	9	1243231	1243239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318956
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25642	NC_009442	TAAA	2	8	1243561	1243568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25643	NC_009442	A	6	6	1243582	1243587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25644	NC_009442	GTC	2	6	1243613	1243618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25647	NC_009442	T	7	7	1243748	1243754	0 %	100 %	0 %	0 %	146318957
25648	NC_009442	ATAA	2	8	1243756	1243763	75 %	25 %	0 %	0 %	146318957
25649	NC_009442	ATG	2	6	1243773	1243778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318957
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25651	NC_009442	GTA	2	6	1243884	1243889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318957
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25717	NC_009442	AT	3	6	1247437	1247442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25718	NC_009442	CA	3	6	1247471	1247476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25719	NC_009442	GCT	2	6	1247478	1247483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25720	NC_009442	CTA	2	6	1247484	1247489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25722	NC_009442	TTC	2	6	1247551	1247556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25724	NC_009442	CCTG	2	8	1247638	1247645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25725	NC_009442	CTT	2	6	1247681	1247686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25726	NC_009442	CAGTG	2	10	1247706	1247715	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25727	NC_009442	TTA	3	9	1247827	1247835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318962
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25730	NC_009442	GTT	2	6	1248002	1248007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318962
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25733	NC_009442	CTG	2	6	1248129	1248134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318962
25734	NC_009442	GTAGC	2	10	1248147	1248156	20 %	20 %	40 %	20 %	146318962
25735	NC_009442	CTGT	2	8	1248165	1248172	0 %	50 %	25 %	25 %	146318962
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25857	NC_009442	ACA	2	6	1253727	1253732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318965
25858	NC_009442	TCA	2	6	1253809	1253814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318965
25859	NC_009442	ACA	2	6	1253815	1253820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318965
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25861	NC_009442	TCT	2	6	1253971	1253976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318965
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25863	NC_009442	AC	3	6	1254374	1254379	50 %	0 %	0 %	50 %	146318965
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25960	NC_009442	CCAA	2	8	1259172	1259179	50 %	0 %	0 %	50 %	146318969
25961	NC_009442	TTG	2	6	1259340	1259345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318969
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25963	NC_009442	TCTG	2	8	1259523	1259530	0 %	50 %	25 %	25 %	146318969
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25965	NC_009442	GTTCTT	2	12	1259560	1259571	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146318969
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25968	NC_009442	ATCCT	2	10	1259614	1259623	20 %	40 %	0 %	40 %	146318970
25969	NC_009442	CTT	2	6	1259630	1259635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318970
25970	NC_009442	GCG	2	6	1259700	1259705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146318970
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