MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_009442	A	7	7	1168252	1168258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24004	NC_009442	A	6	6	1168293	1168298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24005	NC_009442	ACT	2	6	1168457	1168462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318876
24006	NC_009442	TAG	2	6	1168526	1168531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318876
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24009	NC_009442	CAT	2	6	1168904	1168909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318876
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24103	NC_009442	CAT	2	6	1173210	1173215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
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24121	NC_009442	TAAA	2	8	1174112	1174119	75 %	25 %	0 %	0 %	146318881
24122	NC_009442	ATAG	2	8	1174133	1174140	50 %	25 %	25 %	0 %	146318881
24123	NC_009442	GAA	2	6	1174173	1174178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318881
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24131	NC_009442	TCAA	2	8	1174495	1174502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24233	NC_009442	CAA	2	6	1179372	1179377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318890
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24241	NC_009442	TTC	2	6	1179706	1179711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318890
24242	NC_009442	CTG	2	6	1179786	1179791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318890
24243	NC_009442	CTT	2	6	1179855	1179860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318890
24244	NC_009442	TCT	2	6	1179873	1179878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318890
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24253	NC_009442	TCT	2	6	1180361	1180366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318890
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24259	NC_009442	GATT	2	8	1180726	1180733	25 %	50 %	25 %	0 %	146318890
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24262	NC_009442	TTAAA	2	10	1181060	1181069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24263	NC_009442	TAA	2	6	1181087	1181092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24264	NC_009442	CTTTC	2	10	1181143	1181152	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24265	NC_009442	ATT	2	6	1181203	1181208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24266	NC_009442	CAT	2	6	1181233	1181238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318891
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24269	NC_009442	A	6	6	1181450	1181455	100 %	0 %	0 %	0 %	146318891
24270	NC_009442	AGAA	2	8	1181475	1181482	75 %	0 %	25 %	0 %	146318891
24271	NC_009442	CTT	2	6	1181530	1181535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318891
24272	NC_009442	CAC	2	6	1181658	1181663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318891
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24274	NC_009442	ACC	2	6	1181757	1181762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24275	NC_009442	TTCA	2	8	1181763	1181770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24276	NC_009442	A	6	6	1181811	1181816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24277	NC_009442	TA	4	8	1181821	1181828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24278	NC_009442	CTA	2	6	1181853	1181858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24279	NC_009442	CAA	2	6	1181905	1181910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24280	NC_009442	TAA	2	6	1181950	1181955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24304	NC_009442	TTC	2	6	1182649	1182654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318892
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24315	NC_009442	GTTT	2	8	1182959	1182966	0 %	75 %	25 %	0 %	146318892
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24323	NC_009442	AAAAT	2	10	1183319	1183328	80 %	20 %	0 %	0 %	146318893
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24328	NC_009442	TGA	2	6	1183613	1183618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318893
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24331	NC_009442	AGGT	2	8	1183801	1183808	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24332	NC_009442	A	6	6	1183951	1183956	100 %	0 %	0 %	0 %	146318895
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24334	NC_009442	CTG	2	6	1184065	1184070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318895
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24336	NC_009442	CA	3	6	1184122	1184127	50 %	0 %	0 %	50 %	146318895
24337	NC_009442	ATC	2	6	1184209	1184214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318895
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24339	NC_009442	GTT	2	6	1184355	1184360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318895
24340	NC_009442	CT	3	6	1184380	1184385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24341	NC_009442	TTA	2	6	1184386	1184391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318896
24342	NC_009442	GAC	2	6	1184482	1184487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318896
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24344	NC_009442	C	6	6	1184498	1184503	0 %	0 %	0 %	100 %	146318896
24345	NC_009442	TCT	2	6	1184582	1184587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318896
24346	NC_009442	AT	4	8	1184676	1184683	50 %	50 %	0 %	0 %	146318896
24347	NC_009442	ACA	2	6	1184720	1184725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318896
24348	NC_009442	CTTG	2	8	1184742	1184749	0 %	50 %	25 %	25 %	146318896
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24351	NC_009442	CAT	2	6	1184899	1184904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318897
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24353	NC_009442	AGT	2	6	1184983	1184988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318897
24354	NC_009442	TCT	2	6	1185006	1185011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318897
24355	NC_009442	TGC	3	9	1185047	1185055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318897
24356	NC_009442	TTC	2	6	1185137	1185142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318897
24357	NC_009442	GACCT	2	10	1185209	1185218	20 %	20 %	20 %	40 %	146318897
24358	NC_009442	TCT	2	6	1185333	1185338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318897
24359	NC_009442	TCAG	2	8	1185357	1185364	25 %	25 %	25 %	25 %	146318897
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24363	NC_009442	AAT	2	6	1185634	1185639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318897
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24474	NC_009442	CAA	2	6	1191555	1191560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318903
24475	NC_009442	TTC	2	6	1191602	1191607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318903
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24477	NC_009442	TAC	2	6	1191649	1191654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318903
24478	NC_009442	TCA	3	9	1191710	1191718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318903
24479	NC_009442	ACCA	2	8	1191724	1191731	50 %	0 %	0 %	50 %	146318903
24480	NC_009442	ATT	2	6	1191749	1191754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318903
24481	NC_009442	CGTC	2	8	1191771	1191778	0 %	25 %	25 %	50 %	146318903
24482	NC_009442	A	6	6	1191920	1191925	100 %	0 %	0 %	0 %	146318903
24483	NC_009442	ACA	2	6	1191950	1191955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318903
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24486	NC_009442	GAA	2	6	1192069	1192074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318904
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