MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_009442	CT	3	6	830049	830054	0 %	50 %	0 %	50 %	146318512
17003	NC_009442	TTC	2	6	830062	830067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318512
17004	NC_009442	AAT	2	6	830068	830073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318512
17005	NC_009442	T	6	6	830123	830128	0 %	100 %	0 %	0 %	146318512
17006	NC_009442	T	6	6	830164	830169	0 %	100 %	0 %	0 %	146318512
17007	NC_009442	AGA	2	6	830187	830192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318512
17008	NC_009442	AGA	2	6	830224	830229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318512
17009	NC_009442	ATA	2	6	830303	830308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318512
17010	NC_009442	TTTG	2	8	830378	830385	0 %	75 %	25 %	0 %	146318512
17011	NC_009442	A	6	6	830387	830392	100 %	0 %	0 %	0 %	146318512
17012	NC_009442	TTCT	2	8	830419	830426	0 %	75 %	0 %	25 %	146318512
17013	NC_009442	TAA	2	6	830454	830459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318512
17014	NC_009442	CTT	2	6	830461	830466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318512
17015	NC_009442	TCA	2	6	830468	830473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318512
17016	NC_009442	CCAT	2	8	830570	830577	25 %	25 %	0 %	50 %	146318512
17017	NC_009442	TAGA	2	8	830583	830590	50 %	25 %	25 %	0 %	146318512
17018	NC_009442	TCG	2	6	830599	830604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318512
17019	NC_009442	ATT	3	9	830605	830613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318512
17020	NC_009442	TTC	2	6	830615	830620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318512
17021	NC_009442	AAT	2	6	830646	830651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318512
17022	NC_009442	AGA	2	6	830678	830683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318512
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17024	NC_009442	TA	3	6	830785	830790	50 %	50 %	0 %	0 %	146318512
17025	NC_009442	AGA	2	6	830797	830802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318512
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17027	NC_009442	A	6	6	830901	830906	100 %	0 %	0 %	0 %	146318512
17028	NC_009442	AAG	2	6	830954	830959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318512
17029	NC_009442	GAC	2	6	830977	830982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_009442	TCCCAC	2	12	830985	830996	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17031	NC_009442	TGA	2	6	831015	831020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318513
17032	NC_009442	TCT	2	6	831038	831043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318513
17033	NC_009442	TTC	2	6	831058	831063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318513
17034	NC_009442	TAG	2	6	831101	831106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318513
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17037	NC_009442	AGT	2	6	831382	831387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318513
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17040	NC_009442	GCTG	2	8	831552	831559	0 %	25 %	50 %	25 %	146318513
17041	NC_009442	AGT	2	6	831565	831570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318513
17042	NC_009442	ATTA	2	8	831646	831653	50 %	50 %	0 %	0 %	146318513
17043	NC_009442	TAGA	2	8	831729	831736	50 %	25 %	25 %	0 %	146318513
17044	NC_009442	AT	3	6	831820	831825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_009442	AT	3	6	831830	831835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_009442	TA	3	6	831886	831891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_009442	ACA	2	6	831968	831973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17048	NC_009442	GGA	2	6	831979	831984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318514
17049	NC_009442	TCAAT	2	10	832003	832012	40 %	40 %	0 %	20 %	146318514
17050	NC_009442	TAG	2	6	832047	832052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318514
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17052	NC_009442	CTAT	2	8	832095	832102	25 %	50 %	0 %	25 %	146318514
17053	NC_009442	GATA	2	8	832150	832157	50 %	25 %	25 %	0 %	146318514
17054	NC_009442	ATT	2	6	832240	832245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318514
17055	NC_009442	TGA	2	6	832293	832298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318514
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17057	NC_009442	TGA	2	6	832336	832341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318514
17058	NC_009442	TGA	2	6	832351	832356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318514
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17062	NC_009442	CAT	2	6	832649	832654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318514
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17092	NC_009442	AGCA	2	8	834000	834007	50 %	0 %	25 %	25 %	146318515
17093	NC_009442	TCAA	2	8	834106	834113	50 %	25 %	0 %	25 %	146318515
17094	NC_009442	TACAA	2	10	834122	834131	60 %	20 %	0 %	20 %	146318515
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17112	NC_009442	T	6	6	834863	834868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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