MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_009442	TCT	2	6	608163	608168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318282
12503	NC_009442	AAC	2	6	608256	608261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318282
12504	NC_009442	GCA	2	6	608291	608296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318282
12505	NC_009442	AAG	2	6	608301	608306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318282
12506	NC_009442	TTC	2	6	608473	608478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318282
12507	NC_009442	GCT	2	6	608483	608488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318282
12508	NC_009442	GTTTA	2	10	608550	608559	20 %	60 %	20 %	0 %	146318282
12509	NC_009442	GAA	2	6	608570	608575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318282
12510	NC_009442	CG	3	6	608641	608646	0 %	0 %	50 %	50 %	146318282
12511	NC_009442	TCA	2	6	608658	608663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318282
12512	NC_009442	GAA	2	6	608705	608710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318282
12513	NC_009442	TCA	2	6	608739	608744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318282
12514	NC_009442	TCT	2	6	608757	608762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318282
12515	NC_009442	CTT	2	6	608776	608781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318282
12516	NC_009442	TCA	2	6	608792	608797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318282
12517	NC_009442	CAT	2	6	609004	609009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318282
12518	NC_009442	TTC	2	6	609044	609049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318282
12519	NC_009442	AT	3	6	609136	609141	50 %	50 %	0 %	0 %	146318283
12520	NC_009442	TTA	2	6	609148	609153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318283
12521	NC_009442	AGG	2	6	609202	609207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318283
12522	NC_009442	A	6	6	609328	609333	100 %	0 %	0 %	0 %	146318283
12523	NC_009442	CTG	2	6	609358	609363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318283
12524	NC_009442	TAT	2	6	609366	609371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318283
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12526	NC_009442	TTA	2	6	609402	609407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318283
12527	NC_009442	CTG	2	6	609436	609441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318283
12528	NC_009442	CGC	2	6	609463	609468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146318283
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12538	NC_009442	GAT	2	6	609888	609893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318283
12539	NC_009442	TGC	2	6	609932	609937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318283
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12541	NC_009442	ATC	2	6	609991	609996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318283
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12544	NC_009442	TG	3	6	610377	610382	0 %	50 %	50 %	0 %	146318283
12545	NC_009442	AACA	2	8	610411	610418	75 %	0 %	0 %	25 %	146318283
12546	NC_009442	AGA	2	6	610448	610453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318283
12547	NC_009442	TA	3	6	610456	610461	50 %	50 %	0 %	0 %	146318283
12548	NC_009442	GAA	2	6	610582	610587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_009442	GA	4	8	610603	610610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_009442	AAG	2	6	610628	610633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_009442	AT	3	6	610643	610648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_009442	TTA	2	6	610660	610665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_009442	TAGG	2	8	610844	610851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_009442	AGG	2	6	610871	610876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12556	NC_009442	AAGT	2	8	610896	610903	50 %	25 %	25 %	0 %	146318284
12557	NC_009442	A	6	6	610909	610914	100 %	0 %	0 %	0 %	146318284
12558	NC_009442	T	6	6	610947	610952	0 %	100 %	0 %	0 %	146318284
12559	NC_009442	GGGCA	2	10	610958	610967	20 %	0 %	60 %	20 %	146318284
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12573	NC_009442	CGA	2	6	611808	611813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318284
12574	NC_009442	TAC	2	6	611820	611825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318284
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12580	NC_009442	GAT	2	6	612085	612090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318284
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12587	NC_009442	A	6	6	612301	612306	100 %	0 %	0 %	0 %	146318284
12588	NC_009442	A	7	7	612355	612361	100 %	0 %	0 %	0 %	146318284
12589	NC_009442	ATG	2	6	612392	612397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318284
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12592	NC_009442	A	6	6	612643	612648	100 %	0 %	0 %	0 %	146318284
12593	NC_009442	TCA	2	6	612728	612733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318284
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12600	NC_009442	TTA	2	6	613176	613181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318284
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12602	NC_009442	GCAC	2	8	613375	613382	25 %	0 %	25 %	50 %	146318284
12603	NC_009442	TTG	2	6	613565	613570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318284
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12605	NC_009442	ATT	2	6	613651	613656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318284
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12612	NC_009442	GATG	2	8	613851	613858	25 %	25 %	50 %	0 %	146318284
12613	NC_009442	A	7	7	613880	613886	100 %	0 %	0 %	0 %	146318284
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12617	NC_009442	TTC	2	6	614153	614158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318284
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12993	NC_009442	CAT	2	6	631059	631064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318301
12994	NC_009442	GGC	2	6	631101	631106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146318301
12995	NC_009442	GAT	2	6	631131	631136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318301
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12999	NC_009442	GAT	2	6	631257	631262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318301
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