MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009442	CTT	2	6	537225	537230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318203
11003	NC_009442	CTG	2	6	537344	537349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318203
11004	NC_009442	ACT	2	6	537713	537718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318203
11005	NC_009442	TTGAAA	2	12	537739	537750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146318203
11006	NC_009442	ATTG	2	8	537813	537820	25 %	50 %	25 %	0 %	146318203
11007	NC_009442	ATC	2	6	537854	537859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318203
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11009	NC_009442	GTG	2	6	537908	537913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318203
11010	NC_009442	GTT	2	6	538009	538014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318203
11011	NC_009442	AAG	2	6	538106	538111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318203
11012	NC_009442	T	7	7	538133	538139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_009442	A	6	6	538150	538155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_009442	TTA	2	6	538176	538181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_009442	T	6	6	538215	538220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_009442	TAA	2	6	538235	538240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_009442	CTA	2	6	538289	538294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318204
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11020	NC_009442	T	6	6	538369	538374	0 %	100 %	0 %	0 %	146318204
11021	NC_009442	ATTA	2	8	538423	538430	50 %	50 %	0 %	0 %	146318204
11022	NC_009442	AATT	2	8	538455	538462	50 %	50 %	0 %	0 %	146318204
11023	NC_009442	TTA	2	6	538468	538473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318204
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11032	NC_009442	ATAG	2	8	538893	538900	50 %	25 %	25 %	0 %	146318204
11033	NC_009442	TTG	2	6	538995	539000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318205
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11053	NC_009442	TTGA	2	8	540124	540131	25 %	50 %	25 %	0 %	146318206
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11066	NC_009442	TTG	2	6	540753	540758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_009442	TAG	2	6	542184	542189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_009442	TGGA	2	8	542302	542309	25 %	25 %	50 %	0 %	146318209
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11111	NC_009442	A	7	7	542921	542927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_009442	CTT	2	6	542933	542938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_009442	TTTG	2	8	542946	542953	0 %	75 %	25 %	0 %	146318210
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11125	NC_009442	AAGG	2	8	543924	543931	50 %	0 %	50 %	0 %	146318210
11126	NC_009442	TC	3	6	543967	543972	0 %	50 %	0 %	50 %	146318210
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11129	NC_009442	TCAA	2	8	544048	544055	50 %	25 %	0 %	25 %	146318210
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11133	NC_009442	CAA	2	6	544221	544226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318210
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11138	NC_009442	GCT	2	6	544347	544352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318210
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11157	NC_009442	CTT	2	6	545375	545380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318210
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11160	NC_009442	T	7	7	545441	545447	0 %	100 %	0 %	0 %	146318210
11161	NC_009442	T	6	6	545493	545498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11162	NC_009442	CT	3	6	545527	545532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11163	NC_009442	AGA	2	6	545603	545608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11230	NC_009442	A	6	6	548796	548801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_009442	GTTTT	2	10	548818	548827	0 %	80 %	20 %	0 %	146318214
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11233	NC_009442	TGAC	2	8	548841	548848	25 %	25 %	25 %	25 %	146318214
11234	NC_009442	TTGCT	2	10	548862	548871	0 %	60 %	20 %	20 %	146318214
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11238	NC_009442	AGCAG	2	10	549114	549123	40 %	0 %	40 %	20 %	146318214
11239	NC_009442	CTT	2	6	549154	549159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318214
11240	NC_009442	TGAT	2	8	549164	549171	25 %	50 %	25 %	0 %	146318214
11241	NC_009442	TTTTCC	2	12	549217	549228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11242	NC_009442	GAAA	2	8	549242	549249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_009442	GTAA	2	8	549284	549291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_009442	A	8	8	549312	549319	100 %	0 %	0 %	0 %	146318215
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11493	NC_009442	A	6	6	560656	560661	100 %	0 %	0 %	0 %	146318225
11494	NC_009442	GAT	2	6	560662	560667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318225
11495	NC_009442	CAT	2	6	560725	560730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318225
11496	NC_009442	A	7	7	560779	560785	100 %	0 %	0 %	0 %	146318225
11497	NC_009442	CAT	2	6	560848	560853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318225
11498	NC_009442	AATT	2	8	560897	560904	50 %	50 %	0 %	0 %	146318225
11499	NC_009442	CTA	2	6	560939	560944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318225
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