MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009442	TCT	2	6	342988	342993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318010
7002	NC_009442	AGA	2	6	343035	343040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318010
7003	NC_009442	CGT	2	6	343105	343110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318010
7004	NC_009442	TAC	2	6	343144	343149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318010
7005	NC_009442	AAG	2	6	343162	343167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318010
7006	NC_009442	TTTGG	2	10	343261	343270	0 %	60 %	40 %	0 %	146318010
7007	NC_009442	CTG	2	6	343361	343366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318010
7008	NC_009442	AGA	2	6	343419	343424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318010
7009	NC_009442	GCT	2	6	343441	343446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318010
7010	NC_009442	CGA	2	6	343457	343462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318010
7011	NC_009442	CAA	2	6	343477	343482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318010
7012	NC_009442	CTAA	2	8	343502	343509	50 %	25 %	0 %	25 %	146318010
7013	NC_009442	ATT	2	6	343524	343529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318011
7014	NC_009442	TCCT	2	8	343648	343655	0 %	50 %	0 %	50 %	146318011
7015	NC_009442	TAA	2	6	343661	343666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318011
7016	NC_009442	GATTGA	2	12	343820	343831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318011
7017	NC_009442	AGA	2	6	343835	343840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318011
7018	NC_009442	ATTG	2	8	343955	343962	25 %	50 %	25 %	0 %	146318011
7019	NC_009442	GAG	2	6	343995	344000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318011
7020	NC_009442	TC	3	6	344098	344103	0 %	50 %	0 %	50 %	146318011
7021	NC_009442	GCA	2	6	344186	344191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7022	NC_009442	GGT	2	6	344226	344231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318011
7023	NC_009442	CAG	2	6	344238	344243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7024	NC_009442	TCG	2	6	344249	344254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7025	NC_009442	AGG	2	6	344296	344301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318011
7026	NC_009442	TGA	2	6	344354	344359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318011
7027	NC_009442	ATG	2	6	344449	344454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318011
7028	NC_009442	CTT	2	6	344489	344494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318011
7029	NC_009442	AGC	2	6	344498	344503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7030	NC_009442	GCA	2	6	344508	344513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7031	NC_009442	GAT	2	6	344627	344632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318011
7032	NC_009442	AAG	2	6	344698	344703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318011
7033	NC_009442	CAG	2	6	344758	344763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318011
7034	NC_009442	CCA	2	6	344780	344785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318011
7035	NC_009442	TGA	2	6	344866	344871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318011
7036	NC_009442	CAA	2	6	344907	344912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318011
7037	NC_009442	GTT	2	6	344936	344941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318011
7038	NC_009442	T	6	6	344999	345004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_009442	ATA	2	6	345015	345020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_009442	ATT	3	9	345021	345029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_009442	ATC	2	6	345030	345035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_009442	AATA	2	8	345058	345065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_009442	GAT	2	6	345084	345089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318012
7044	NC_009442	T	6	6	345089	345094	0 %	100 %	0 %	0 %	146318012
7045	NC_009442	GAG	2	6	345105	345110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318012
7046	NC_009442	ATT	2	6	345187	345192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318012
7047	NC_009442	CAA	2	6	345225	345230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318012
7048	NC_009442	TTG	2	6	345322	345327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318012
7049	NC_009442	ATT	2	6	345328	345333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318012
7050	NC_009442	A	8	8	345336	345343	100 %	0 %	0 %	0 %	146318012
7051	NC_009442	TAA	2	6	345350	345355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318012
7052	NC_009442	TGTC	2	8	345379	345386	0 %	50 %	25 %	25 %	146318012
7053	NC_009442	GTT	2	6	345387	345392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318012
7054	NC_009442	TCA	2	6	345437	345442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318012
7055	NC_009442	A	6	6	345516	345521	100 %	0 %	0 %	0 %	146318013
7056	NC_009442	A	7	7	345527	345533	100 %	0 %	0 %	0 %	146318013
7057	NC_009442	AGA	2	6	345642	345647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318013
7058	NC_009442	TTG	2	6	345713	345718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318013
7059	NC_009442	ACT	2	6	345776	345781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318013
7060	NC_009442	TTG	2	6	345805	345810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318013
7061	NC_009442	A	6	6	345870	345875	100 %	0 %	0 %	0 %	146318013
7062	NC_009442	AAG	2	6	345885	345890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318013
7063	NC_009442	ATG	2	6	345899	345904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318013
7064	NC_009442	TTTTA	2	10	345913	345922	20 %	80 %	0 %	0 %	146318013
7065	NC_009442	TAT	2	6	345939	345944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318013
7066	NC_009442	A	6	6	346000	346005	100 %	0 %	0 %	0 %	146318013
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7070	NC_009442	ATT	2	6	346149	346154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318013
7071	NC_009442	ATGA	2	8	346165	346172	50 %	25 %	25 %	0 %	146318013
7072	NC_009442	T	6	6	346191	346196	0 %	100 %	0 %	0 %	146318013
7073	NC_009442	AAGAA	2	10	346243	346252	80 %	0 %	20 %	0 %	146318013
7074	NC_009442	ATG	2	6	346276	346281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318013
7075	NC_009442	TA	3	6	346303	346308	50 %	50 %	0 %	0 %	146318013
7076	NC_009442	ATG	2	6	346343	346348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318013
7077	NC_009442	GTG	2	6	346532	346537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318014
7078	NC_009442	TGA	2	6	346663	346668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318014
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7081	NC_009442	TTC	2	6	346931	346936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318014
7082	NC_009442	TCAG	2	8	346959	346966	25 %	25 %	25 %	25 %	146318014
7083	NC_009442	AGA	2	6	347075	347080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318014
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7085	NC_009442	GAT	2	6	347129	347134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318014
7086	NC_009442	CTT	2	6	347143	347148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318014
7087	NC_009442	GGA	2	6	347149	347154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318014
7088	NC_009442	AGT	3	9	347236	347244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318014
7089	NC_009442	TTG	2	6	347303	347308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318014
7090	NC_009442	T	6	6	347318	347323	0 %	100 %	0 %	0 %	146318014
7091	NC_009442	TTC	2	6	347477	347482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_009442	TAA	2	6	347527	347532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_009442	TTG	2	6	347558	347563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_009442	AGG	2	6	347598	347603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_009442	AAC	2	6	347619	347624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318015
7096	NC_009442	TCT	2	6	347673	347678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318015
7097	NC_009442	TGG	2	6	347722	347727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318015
7098	NC_009442	GCT	2	6	347768	347773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318015
7099	NC_009442	TGA	2	6	347782	347787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318015
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7101	NC_009442	AAG	2	6	347916	347921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318015
7102	NC_009442	TCA	3	9	347990	347998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318015
7103	NC_009442	AGA	2	6	348031	348036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318015
7104	NC_009442	AAAC	2	8	348083	348090	75 %	0 %	0 %	25 %	146318015
7105	NC_009442	TGTGAT	2	12	348226	348237	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146318015
7106	NC_009442	CAA	2	6	348247	348252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318015
7107	NC_009442	GAA	2	6	348314	348319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318015
7108	NC_009442	GAA	2	6	348473	348478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318015
7109	NC_009442	GTC	2	6	348498	348503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318015
7110	NC_009442	CA	3	6	348575	348580	50 %	0 %	0 %	50 %	146318015
7111	NC_009442	AAG	2	6	348591	348596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318015
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7114	NC_009442	TTG	2	6	348816	348821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318016
7115	NC_009442	TGG	2	6	348891	348896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318016
7116	NC_009442	TTGA	2	8	348935	348942	25 %	50 %	25 %	0 %	146318016
7117	NC_009442	TGA	2	6	349038	349043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318016
7118	NC_009442	CCGAGT	2	12	349046	349057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146318016
7119	NC_009442	TAT	2	6	349178	349183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318016
7120	NC_009442	GCT	2	6	349262	349267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318016
7121	NC_009442	AAGC	2	8	349278	349285	50 %	0 %	25 %	25 %	146318016
7122	NC_009442	ATC	2	6	349341	349346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318016
7123	NC_009442	ACC	2	6	349359	349364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318016
7124	NC_009442	ATT	2	6	349367	349372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318016
7125	NC_009442	TAC	2	6	349424	349429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318016
7126	NC_009442	TTA	2	6	349473	349478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318016
7127	NC_009442	AGC	2	6	349494	349499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318016
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7129	NC_009442	TTG	2	6	349517	349522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318016
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7131	NC_009442	CAG	2	6	349719	349724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318016
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7133	NC_009442	GAT	2	6	349784	349789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318016
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7137	NC_009442	AAGA	2	8	349958	349965	75 %	0 %	25 %	0 %	146318016
7138	NC_009442	TTGA	2	8	349976	349983	25 %	50 %	25 %	0 %	146318016
7139	NC_009442	ATC	2	6	350079	350084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318016
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7142	NC_009442	AAGA	2	8	350277	350284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7143	NC_009442	ATG	2	6	350345	350350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318017
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7154	NC_009442	TGGT	2	8	351072	351079	0 %	50 %	50 %	0 %	146318017
7155	NC_009442	T	6	6	351128	351133	0 %	100 %	0 %	0 %	146318017
7156	NC_009442	TGGT	2	8	351140	351147	0 %	50 %	50 %	0 %	146318017
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7161	NC_009442	A	6	6	351282	351287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7173	NC_009442	TAA	2	6	351965	351970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7176	NC_009442	TGTT	2	8	352094	352101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7186	NC_009442	CATTA	2	10	352586	352595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7187	NC_009442	A	6	6	352678	352683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7188	NC_009442	GAC	2	6	352691	352696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318020
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7190	NC_009442	AGT	2	6	352784	352789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318020
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7220	NC_009442	TTGAT	2	10	354368	354377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7223	NC_009442	TAA	2	6	354597	354602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7229	NC_009442	AAGA	2	8	354870	354877	75 %	0 %	25 %	0 %	146318023
7230	NC_009442	AAG	2	6	354913	354918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318023
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7232	NC_009442	GGGA	2	8	355013	355020	25 %	0 %	75 %	0 %	146318024
7233	NC_009442	ATTC	2	8	355109	355116	25 %	50 %	0 %	25 %	146318024
7234	NC_009442	AAGA	2	8	355131	355138	75 %	0 %	25 %	0 %	146318024
7235	NC_009442	GTG	2	6	355231	355236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318024
7236	NC_009442	A	7	7	355273	355279	100 %	0 %	0 %	0 %	146318024
7237	NC_009442	ATT	3	9	355291	355299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318024
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7240	NC_009442	TTG	2	6	355375	355380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318024
7241	NC_009442	TCC	2	6	355455	355460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318024
7242	NC_009442	CAAG	2	8	355481	355488	50 %	0 %	25 %	25 %	146318024
7243	NC_009442	GAA	2	6	355536	355541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318024
7244	NC_009442	GCA	2	6	355562	355567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318025
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7494	NC_009442	GTT	2	6	366147	366152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318037
7495	NC_009442	ATC	2	6	366190	366195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318037
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7498	NC_009442	GA	3	6	366309	366314	50 %	0 %	50 %	0 %	146318037
7499	NC_009442	A	6	6	366322	366327	100 %	0 %	0 %	0 %	146318037
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