MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009442	GAAA	2	8	266687	266694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009442	T	6	6	266727	266732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009442	TGGT	2	8	266742	266749	0 %	50 %	50 %	0 %	146317936
5504	NC_009442	A	8	8	266775	266782	100 %	0 %	0 %	0 %	146317936
5505	NC_009442	T	9	9	266789	266797	0 %	100 %	0 %	0 %	146317936
5506	NC_009442	GAA	2	6	266855	266860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
5507	NC_009442	GTG	2	6	266868	266873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
5508	NC_009442	CTA	2	6	266889	266894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
5509	NC_009442	GAT	2	6	266966	266971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
5510	NC_009442	CGGT	2	8	267000	267007	0 %	25 %	50 %	25 %	146317936
5511	NC_009442	GTT	2	6	267008	267013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317936
5512	NC_009442	CAA	3	9	267027	267035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
5513	NC_009442	ATTG	2	8	267064	267071	25 %	50 %	25 %	0 %	146317936
5514	NC_009442	TCT	2	6	267125	267130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
5515	NC_009442	AGC	2	6	267157	267162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
5516	NC_009442	TGA	2	6	267234	267239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
5517	NC_009442	ATG	2	6	267243	267248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
5518	NC_009442	CAA	2	6	267255	267260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
5519	NC_009442	TGG	2	6	267271	267276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
5520	NC_009442	GTGC	2	8	267287	267294	0 %	25 %	50 %	25 %	146317936
5521	NC_009442	GCA	2	6	267380	267385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
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5523	NC_009442	ACTT	2	8	267503	267510	25 %	50 %	0 %	25 %	146317936
5524	NC_009442	TAA	2	6	267514	267519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317936
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5526	NC_009442	CTT	2	6	267533	267538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
5527	NC_009442	GAA	2	6	267539	267544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
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5533	NC_009442	TCG	2	6	268213	268218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317936
5534	NC_009442	TAA	2	6	268219	268224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317936
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5538	NC_009442	GGT	3	9	268334	268342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
5539	NC_009442	TGC	2	6	268354	268359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317936
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5542	NC_009442	ACT	2	6	268575	268580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
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5550	NC_009442	CGA	2	6	269149	269154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
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5552	NC_009442	ATC	2	6	269258	269263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
5553	NC_009442	CTA	2	6	269272	269277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
5554	NC_009442	TAGG	2	8	269463	269470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009442	AGT	2	6	269471	269476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009442	TTGT	2	8	269568	269575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009442	TGG	2	6	269586	269591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009442	TCTA	2	8	269653	269660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_009442	TAGAA	2	10	269689	269698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009442	A	6	6	269697	269702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009442	T	6	6	269707	269712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009442	ATCA	2	8	269738	269745	50 %	25 %	0 %	25 %	229577509
5563	NC_009442	CGAC	2	8	269801	269808	25 %	0 %	25 %	50 %	229577509
5564	NC_009442	GGT	2	6	269809	269814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577509
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5590	NC_009442	GTTT	2	8	271248	271255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009442	TTAAA	2	10	271268	271277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_009442	TA	3	6	271307	271312	50 %	50 %	0 %	0 %	146317938
5593	NC_009442	GAT	2	6	271334	271339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317938
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5595	NC_009442	A	6	6	271374	271379	100 %	0 %	0 %	0 %	146317938
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5599	NC_009442	GGGCT	2	10	271614	271623	0 %	20 %	60 %	20 %	146317939
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5601	NC_009442	CGG	3	9	271705	271713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317939
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5991	NC_009442	GCA	2	6	291977	291982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317956
5992	NC_009442	CACTT	2	10	291987	291996	20 %	40 %	0 %	40 %	146317956
5993	NC_009442	GGT	2	6	292130	292135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317956
5994	NC_009442	CAAA	2	8	292191	292198	75 %	0 %	0 %	25 %	146317956
5995	NC_009442	GGT	2	6	292244	292249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317956
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6000	NC_009442	CCAG	2	8	292405	292412	25 %	0 %	25 %	50 %	146317956

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