MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009442	ATG	2	6	242692	242697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317910
5003	NC_009442	TGG	2	6	242710	242715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317910
5004	NC_009442	CAC	2	6	242836	242841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317910
5005	NC_009442	AGG	2	6	242926	242931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317910
5006	NC_009442	ATG	2	6	242935	242940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317910
5007	NC_009442	AAAGA	2	10	242961	242970	80 %	0 %	20 %	0 %	146317910
5008	NC_009442	GAGC	2	8	242985	242992	25 %	0 %	50 %	25 %	146317910
5009	NC_009442	GGA	2	6	243059	243064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317910
5010	NC_009442	TGAT	2	8	243088	243095	25 %	50 %	25 %	0 %	146317910
5011	NC_009442	TGG	2	6	243116	243121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317910
5012	NC_009442	ATC	2	6	243180	243185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317910
5013	NC_009442	TGG	2	6	243428	243433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317910
5014	NC_009442	GAG	2	6	243523	243528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317910
5015	NC_009442	AG	3	6	243527	243532	50 %	0 %	50 %	0 %	146317911
5016	NC_009442	GAT	2	6	243535	243540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317911
5017	NC_009442	ATGG	2	8	243563	243570	25 %	25 %	50 %	0 %	146317911
5018	NC_009442	AG	3	6	243602	243607	50 %	0 %	50 %	0 %	146317911
5019	NC_009442	TAC	2	6	243687	243692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317911
5020	NC_009442	TCG	2	6	243775	243780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317911
5021	NC_009442	T	6	6	243817	243822	0 %	100 %	0 %	0 %	146317911
5022	NC_009442	ATGT	2	8	243840	243847	25 %	50 %	25 %	0 %	146317911
5023	NC_009442	TGT	2	6	243852	243857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317911
5024	NC_009442	TGG	2	6	244086	244091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317911
5025	NC_009442	GACA	2	8	244273	244280	50 %	0 %	25 %	25 %	146317911
5026	NC_009442	GAA	2	6	244346	244351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317911
5027	NC_009442	TA	3	6	244365	244370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009442	A	6	6	244372	244377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009442	ACC	2	6	244485	244490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317912
5030	NC_009442	AG	3	6	244531	244536	50 %	0 %	50 %	0 %	146317912
5031	NC_009442	CAG	2	6	244577	244582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317912
5032	NC_009442	GATA	2	8	244600	244607	50 %	25 %	25 %	0 %	146317912
5033	NC_009442	TCCAT	2	10	244771	244780	20 %	40 %	0 %	40 %	146317912
5034	NC_009442	GTT	2	6	244827	244832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317912
5035	NC_009442	GAG	3	9	244892	244900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317912
5036	NC_009442	TCAA	2	8	245088	245095	50 %	25 %	0 %	25 %	146317912
5037	NC_009442	GAA	2	6	245114	245119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317912
5038	NC_009442	CAT	2	6	245144	245149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317912
5039	NC_009442	AT	3	6	245181	245186	50 %	50 %	0 %	0 %	146317912
5040	NC_009442	TTC	2	6	245187	245192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317912
5041	NC_009442	ACG	2	6	245217	245222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317912
5042	NC_009442	CTTGG	2	10	245223	245232	0 %	40 %	40 %	20 %	146317912
5043	NC_009442	AGC	2	6	245241	245246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317912
5044	NC_009442	A	6	6	245475	245480	100 %	0 %	0 %	0 %	146317913
5045	NC_009442	AAG	2	6	245485	245490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317913
5046	NC_009442	TGA	2	6	245587	245592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317913
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5052	NC_009442	GTA	2	6	245797	245802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317913
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5054	NC_009442	AG	3	6	245864	245869	50 %	0 %	50 %	0 %	146317913
5055	NC_009442	AGAA	2	8	245908	245915	75 %	0 %	25 %	0 %	146317913
5056	NC_009442	TCA	2	6	245936	245941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317913
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5058	NC_009442	AAT	2	6	246048	246053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317914
5059	NC_009442	ATC	2	6	246124	246129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317914
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5062	NC_009442	GGT	2	6	246331	246336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317914
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5064	NC_009442	A	7	7	246419	246425	100 %	0 %	0 %	0 %	146317914
5065	NC_009442	TGG	2	6	246437	246442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317914
5066	NC_009442	ATA	2	6	246509	246514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317914
5067	NC_009442	TCAA	2	8	246533	246540	50 %	25 %	0 %	25 %	146317914
5068	NC_009442	CAT	2	6	246576	246581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317914
5069	NC_009442	TCCAA	2	10	246624	246633	40 %	20 %	0 %	40 %	146317914
5070	NC_009442	TGG	3	9	246759	246767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009442	GAT	2	6	246800	246805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317915
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5075	NC_009442	A	6	6	247058	247063	100 %	0 %	0 %	0 %	146317916
5076	NC_009442	AT	3	6	247070	247075	50 %	50 %	0 %	0 %	146317916
5077	NC_009442	GAG	2	6	247077	247082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317916
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5081	NC_009442	ATG	2	6	247326	247331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317916
5082	NC_009442	CAT	2	6	247344	247349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317916
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5088	NC_009442	TTC	2	6	247617	247622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_009442	A	6	6	247725	247730	100 %	0 %	0 %	0 %	146317917
5090	NC_009442	TCAA	2	8	247849	247856	50 %	25 %	0 %	25 %	146317917
5091	NC_009442	TGA	2	6	247898	247903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317917
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5095	NC_009442	ACT	2	6	247990	247995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317917
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5100	NC_009442	GGC	2	6	248231	248236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317917
5101	NC_009442	GACT	2	8	248305	248312	25 %	25 %	25 %	25 %	146317917
5102	NC_009442	TCA	2	6	248506	248511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317917
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5105	NC_009442	GCAG	2	8	248579	248586	25 %	0 %	50 %	25 %	146317917
5106	NC_009442	AAC	2	6	248593	248598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317917
5107	NC_009442	CTG	2	6	248620	248625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317917
5108	NC_009442	ATCA	2	8	248682	248689	50 %	25 %	0 %	25 %	146317917
5109	NC_009442	GGA	2	6	248715	248720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317917
5110	NC_009442	ACTCT	2	10	248734	248743	20 %	40 %	0 %	40 %	146317917
5111	NC_009442	TTG	2	6	248784	248789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317917
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5113	NC_009442	CAGC	2	8	248812	248819	25 %	0 %	25 %	50 %	146317917
5114	NC_009442	TTGG	2	8	248880	248887	0 %	50 %	50 %	0 %	146317917
5115	NC_009442	TGGCA	2	10	248990	248999	20 %	20 %	40 %	20 %	146317917
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5120	NC_009442	AAT	2	6	249282	249287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317917
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5124	NC_009442	GTG	2	6	249427	249432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317917
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5232	NC_009442	TAG	2	6	254227	254232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317924
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5234	NC_009442	CAT	2	6	254267	254272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317924
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5240	NC_009442	T	6	6	254483	254488	0 %	100 %	0 %	0 %	146317924
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5244	NC_009442	A	8	8	254641	254648	100 %	0 %	0 %	0 %	146317924
5245	NC_009442	AT	3	6	254703	254708	50 %	50 %	0 %	0 %	146317925
5246	NC_009442	TTA	2	6	254735	254740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317925
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5495	NC_009442	AATTA	2	10	266585	266594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_009442	TTG	2	6	266599	266604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_009442	GGT	2	6	266663	266668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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