MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009442	AAAATT	2	12	218074	218085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_009442	TTTA	2	8	218120	218127	25 %	75 %	0 %	0 %	146317886
4503	NC_009442	T	7	7	218165	218171	0 %	100 %	0 %	0 %	146317886
4504	NC_009442	TGT	2	6	218180	218185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317886
4505	NC_009442	TGA	2	6	218198	218203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317886
4506	NC_009442	GTC	2	6	218223	218228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317886
4507	NC_009442	TTG	2	6	218263	218268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317886
4508	NC_009442	T	6	6	218420	218425	0 %	100 %	0 %	0 %	146317886
4509	NC_009442	TCCACG	2	12	218620	218631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146317886
4510	NC_009442	GTC	2	6	218634	218639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317886
4511	NC_009442	TCCT	2	8	218739	218746	0 %	50 %	0 %	50 %	146317886
4512	NC_009442	CAA	2	6	218765	218770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317886
4513	NC_009442	GTT	2	6	218799	218804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317886
4514	NC_009442	TTC	2	6	218841	218846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317886
4515	NC_009442	TTC	2	6	218874	218879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317886
4516	NC_009442	AAAGTC	2	12	218880	218891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146317886
4517	NC_009442	ATG	2	6	218893	218898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317886
4518	NC_009442	GTG	2	6	218934	218939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317886
4519	NC_009442	TGG	3	9	219002	219010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317886
4520	NC_009442	TCA	2	6	219065	219070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317886
4521	NC_009442	CGGT	2	8	219097	219104	0 %	25 %	50 %	25 %	146317886
4522	NC_009442	TCT	2	6	219136	219141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317886
4523	NC_009442	TAA	2	6	219167	219172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317886
4524	NC_009442	ACC	2	6	219217	219222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317886
4525	NC_009442	TTC	2	6	219231	219236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317886
4526	NC_009442	GTA	2	6	219294	219299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317886
4527	NC_009442	CCA	2	6	219334	219339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317886
4528	NC_009442	CAGT	2	8	219352	219359	25 %	25 %	25 %	25 %	146317886
4529	NC_009442	TTC	2	6	219504	219509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317886
4530	NC_009442	AAT	2	6	219651	219656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317886
4531	NC_009442	AAC	2	6	219720	219725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317886
4532	NC_009442	CT	4	8	219751	219758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_009442	CTT	2	6	219772	219777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_009442	AGG	2	6	219792	219797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009442	CCT	2	6	219815	219820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_009442	TGGT	2	8	219912	219919	0 %	50 %	50 %	0 %	146317887
4537	NC_009442	CAG	2	6	219949	219954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4538	NC_009442	TGA	2	6	219958	219963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317887
4539	NC_009442	TCCAA	2	10	220044	220053	40 %	20 %	0 %	40 %	146317887
4540	NC_009442	AGC	2	6	220283	220288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4541	NC_009442	CAA	2	6	220297	220302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317887
4542	NC_009442	CTT	2	6	220324	220329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317887
4543	NC_009442	TCT	2	6	220338	220343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317887
4544	NC_009442	T	7	7	220343	220349	0 %	100 %	0 %	0 %	146317887
4545	NC_009442	ACA	2	6	220395	220400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317887
4546	NC_009442	CAA	2	6	220405	220410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317887
4547	NC_009442	ACC	2	6	220469	220474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317887
4548	NC_009442	GCT	2	6	220488	220493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4549	NC_009442	AG	3	6	220511	220516	50 %	0 %	50 %	0 %	146317887
4550	NC_009442	AGC	2	6	220544	220549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4551	NC_009442	TTG	2	6	220621	220626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317887
4552	NC_009442	ACC	2	6	220739	220744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317887
4553	NC_009442	CAAT	2	8	220753	220760	50 %	25 %	0 %	25 %	146317887
4554	NC_009442	GAT	2	6	220937	220942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317887
4555	NC_009442	GAA	2	6	220948	220953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317887
4556	NC_009442	AAC	2	6	220994	220999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317887
4557	NC_009442	AGA	2	6	221008	221013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317887
4558	NC_009442	AGG	2	6	221043	221048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317887
4559	NC_009442	TGC	2	6	221129	221134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4560	NC_009442	GAG	2	6	221170	221175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317887
4561	NC_009442	AAG	2	6	221259	221264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317887
4562	NC_009442	CCG	2	6	221451	221456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317887
4563	NC_009442	CTT	2	6	221554	221559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317887
4564	NC_009442	AGA	2	6	221602	221607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317887
4565	NC_009442	GAT	2	6	221624	221629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317887
4566	NC_009442	CTG	2	6	221668	221673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317887
4567	NC_009442	T	6	6	221702	221707	0 %	100 %	0 %	0 %	146317887
4568	NC_009442	GT	3	6	221744	221749	0 %	50 %	50 %	0 %	146317887
4569	NC_009442	CTT	2	6	221800	221805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317887
4570	NC_009442	AT	3	6	221820	221825	50 %	50 %	0 %	0 %	146317887
4571	NC_009442	T	6	6	221865	221870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009442	TC	3	6	221876	221881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_009442	T	6	6	221893	221898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009442	A	6	6	221948	221953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_009442	T	8	8	221976	221983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_009442	ATG	2	6	222052	222057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317888
4577	NC_009442	A	6	6	222058	222063	100 %	0 %	0 %	0 %	146317888
4578	NC_009442	A	6	6	222092	222097	100 %	0 %	0 %	0 %	146317888
4579	NC_009442	CAG	2	6	222142	222147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317888
4580	NC_009442	GAGG	2	8	222208	222215	25 %	0 %	75 %	0 %	146317888
4581	NC_009442	TGT	2	6	222342	222347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317888
4582	NC_009442	TAG	2	6	222372	222377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317888
4583	NC_009442	GAT	2	6	222637	222642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317888
4584	NC_009442	CAA	2	6	222685	222690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317888
4585	NC_009442	AGCA	2	8	222706	222713	50 %	0 %	25 %	25 %	146317888
4586	NC_009442	GA	3	6	222769	222774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_009442	T	6	6	222789	222794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009442	ATAG	2	8	222803	222810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009442	AAG	2	6	222811	222816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009442	AAAGA	2	10	222949	222958	80 %	0 %	20 %	0 %	146317889
4591	NC_009442	CGG	2	6	222965	222970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317889
4592	NC_009442	CAAT	2	8	222998	223005	50 %	25 %	0 %	25 %	146317889
4593	NC_009442	CG	3	6	223025	223030	0 %	0 %	50 %	50 %	146317889
4594	NC_009442	TTGA	2	8	223102	223109	25 %	50 %	25 %	0 %	146317889
4595	NC_009442	ATT	2	6	223149	223154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317890
4596	NC_009442	TAT	2	6	223229	223234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317890
4597	NC_009442	TGG	2	6	223240	223245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317890
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4599	NC_009442	TCCT	2	8	223275	223282	0 %	50 %	0 %	50 %	146317890
4600	NC_009442	ACT	2	6	223327	223332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317890
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4602	NC_009442	CTTT	2	8	223388	223395	0 %	75 %	0 %	25 %	146317890
4603	NC_009442	GCG	2	6	223495	223500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317890
4604	NC_009442	GAT	2	6	223571	223576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317890
4605	NC_009442	AGT	2	6	223593	223598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317890
4606	NC_009442	CAT	2	6	223610	223615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317890
4607	NC_009442	AC	3	6	223624	223629	50 %	0 %	0 %	50 %	146317890
4608	NC_009442	TAG	2	6	223637	223642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317890
4609	NC_009442	TC	3	6	223653	223658	0 %	50 %	0 %	50 %	146317890
4610	NC_009442	GTT	2	6	223741	223746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_009442	TGA	2	6	223751	223756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009442	AT	3	6	223829	223834	50 %	50 %	0 %	0 %	146317891
4613	NC_009442	AAT	2	6	223836	223841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317891
4614	NC_009442	ATT	2	6	223845	223850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317891
4615	NC_009442	A	6	6	223879	223884	100 %	0 %	0 %	0 %	146317891
4616	NC_009442	GAA	2	6	223917	223922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317891
4617	NC_009442	TGG	2	6	223942	223947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317891
4618	NC_009442	CGA	2	6	223973	223978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317891
4619	NC_009442	GACA	2	8	223982	223989	50 %	0 %	25 %	25 %	146317891
4620	NC_009442	GCT	2	6	224028	224033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317891
4621	NC_009442	CGT	2	6	224058	224063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317891
4622	NC_009442	ATT	2	6	224096	224101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317891
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4624	NC_009442	CAG	2	6	224178	224183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317891
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4996	NC_009442	TAT	2	6	242381	242386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317910
4997	NC_009442	ATT	3	9	242394	242402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317910
4998	NC_009442	CAT	2	6	242471	242476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317910
4999	NC_009442	TTC	2	6	242509	242514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317910
5000	NC_009442	GAG	2	6	242515	242520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317910

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