MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens CN-32 chromosome

Total Repeats: 82957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009438	TGCT	2	8	200371	200378	0 %	50 %	25 %	25 %	146291284
3502	NC_009438	GTCG	2	8	200379	200386	0 %	25 %	50 %	25 %	146291284
3503	NC_009438	GTC	2	6	200523	200528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291284
3504	NC_009438	CTT	2	6	200535	200540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291284
3505	NC_009438	ATA	2	6	200610	200615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291284
3506	NC_009438	TTC	2	6	200709	200714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291285
3507	NC_009438	GCC	2	6	200727	200732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291285
3508	NC_009438	T	6	6	200733	200738	0 %	100 %	0 %	0 %	146291285
3509	NC_009438	CTGC	2	8	200755	200762	0 %	25 %	25 %	50 %	146291285
3510	NC_009438	CAG	2	6	200794	200799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291285
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3512	NC_009438	T	6	6	200831	200836	0 %	100 %	0 %	0 %	146291285
3513	NC_009438	GCT	2	6	200841	200846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291285
3514	NC_009438	TA	3	6	200857	200862	50 %	50 %	0 %	0 %	146291285
3515	NC_009438	ATT	2	6	200982	200987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291285
3516	NC_009438	ATCAC	2	10	201215	201224	40 %	20 %	0 %	40 %	146291286
3517	NC_009438	GCGG	2	8	201229	201236	0 %	0 %	75 %	25 %	146291286
3518	NC_009438	CAT	2	6	201267	201272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291286
3519	NC_009438	A	6	6	201314	201319	100 %	0 %	0 %	0 %	146291286
3520	NC_009438	TCA	2	6	201347	201352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291286
3521	NC_009438	GGAATA	2	12	201419	201430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146291286
3522	NC_009438	AC	3	6	201440	201445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_009438	AAT	2	6	201508	201513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009438	TAAAA	2	10	201523	201532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009438	AAAT	2	8	201556	201563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009438	A	7	7	201584	201590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_009438	TA	3	6	201602	201607	50 %	50 %	0 %	0 %	146291287
3528	NC_009438	TGAT	2	8	201616	201623	25 %	50 %	25 %	0 %	146291287
3529	NC_009438	A	7	7	201655	201661	100 %	0 %	0 %	0 %	146291287
3530	NC_009438	AACT	2	8	201762	201769	50 %	25 %	0 %	25 %	146291287
3531	NC_009438	TC	3	6	201840	201845	0 %	50 %	0 %	50 %	146291287
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3537	NC_009438	GCA	2	6	202163	202168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291288
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3539	NC_009438	A	6	6	202178	202183	100 %	0 %	0 %	0 %	146291288
3540	NC_009438	TGAT	2	8	202219	202226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009438	TAAA	2	8	202286	202293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009438	T	6	6	202383	202388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009438	T	6	6	202410	202415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009438	A	7	7	202423	202429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009438	ATT	2	6	202471	202476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009438	ACG	2	6	202556	202561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_009438	ACC	2	6	202736	202741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_009438	A	6	6	202813	202818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009438	TCA	2	6	202840	202845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291289
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3552	NC_009438	CTGA	2	8	202919	202926	25 %	25 %	25 %	25 %	146291289
3553	NC_009438	GCCGT	2	10	202976	202985	0 %	20 %	40 %	40 %	146291289
3554	NC_009438	AC	3	6	203080	203085	50 %	0 %	0 %	50 %	146291289
3555	NC_009438	CCAAAT	2	12	203131	203142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146291289
3556	NC_009438	TCAA	2	8	203145	203152	50 %	25 %	0 %	25 %	146291289
3557	NC_009438	CGG	2	6	203156	203161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291289
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3559	NC_009438	CTT	2	6	203219	203224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291289
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3577	NC_009438	TACT	2	8	204531	204538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3580	NC_009438	CATT	2	8	204669	204676	25 %	50 %	0 %	25 %	146291291
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3592	NC_009438	T	6	6	205207	205212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_009438	T	7	7	205258	205264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_009438	ATT	2	6	205282	205287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_009438	AG	3	6	206001	206006	50 %	0 %	50 %	0 %	146291292
3599	NC_009438	GAA	2	6	206017	206022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291292
3600	NC_009438	GA	3	6	206060	206065	50 %	0 %	50 %	0 %	146291292
3601	NC_009438	TCA	2	6	206120	206125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291293
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3606	NC_009438	ATT	2	6	206359	206364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_009438	CTT	2	6	206373	206378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_009438	GTG	2	6	206442	206447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_009438	GAA	2	6	206452	206457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009438	GGAA	2	8	206464	206471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_009438	TTG	2	6	206485	206490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_009438	ATC	2	6	206504	206509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_009438	ATC	2	6	206554	206559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_009438	CTAA	2	8	206569	206576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_009438	A	6	6	206592	206597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_009438	T	6	6	206616	206621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_009438	A	6	6	206681	206686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_009438	A	6	6	206699	206704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_009438	TTGCA	2	10	206719	206728	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3621	NC_009438	A	7	7	206747	206753	100 %	0 %	0 %	0 %	146291294
3622	NC_009438	AAC	2	6	206792	206797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291294
3623	NC_009438	T	6	6	206820	206825	0 %	100 %	0 %	0 %	146291294
3624	NC_009438	AAACG	2	10	206873	206882	60 %	0 %	20 %	20 %	146291294
3625	NC_009438	GCC	2	6	206886	206891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291294
3626	NC_009438	AGATG	2	10	206960	206969	40 %	20 %	40 %	0 %	146291294
3627	NC_009438	CA	3	6	206972	206977	50 %	0 %	0 %	50 %	146291294
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3867	NC_009438	GGT	2	6	220067	220072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3869	NC_009438	TTGG	2	8	220173	220180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3870	NC_009438	ATT	2	6	220196	220201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3871	NC_009438	TA	3	6	220241	220246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3872	NC_009438	A	6	6	220270	220275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3873	NC_009438	A	6	6	220284	220289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3874	NC_009438	T	6	6	220306	220311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3876	NC_009438	TATCCG	2	12	220367	220378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146291309
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3989	NC_009438	A	6	6	226920	226925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_009438	GGT	2	6	227006	227011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291318
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3995	NC_009438	TGC	3	9	227404	227412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291318
3996	NC_009438	GCG	2	6	227467	227472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291318
3997	NC_009438	CCA	2	6	227511	227516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291318
3998	NC_009438	CTGA	2	8	227532	227539	25 %	25 %	25 %	25 %	146291318
3999	NC_009438	GTA	2	6	227683	227688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291318
4000	NC_009438	CAT	2	6	227787	227792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291318

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