MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_009380	GCC	2	6	688628	688633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593169
18002	NC_009380	GTC	2	6	688634	688639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593169
18003	NC_009380	GGTCG	2	10	688681	688690	0 %	20 %	60 %	20 %	145593169
18004	NC_009380	CCGG	2	8	688770	688777	0 %	0 %	50 %	50 %	145593169
18005	NC_009380	GTG	2	6	688789	688794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593169
18006	NC_009380	GCG	2	6	688806	688811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593169
18007	NC_009380	CGC	2	6	688893	688898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593169
18008	NC_009380	GCA	2	6	688994	688999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_009380	GC	3	6	689019	689024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18010	NC_009380	CGGC	2	8	689064	689071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18011	NC_009380	CGC	3	9	689077	689085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18012	NC_009380	GGT	2	6	689161	689166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_009380	CCA	2	6	689223	689228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593170
18014	NC_009380	CG	3	6	689262	689267	0 %	0 %	50 %	50 %	145593170
18015	NC_009380	GCCGG	2	10	689268	689277	0 %	0 %	60 %	40 %	145593170
18016	NC_009380	GTG	2	6	689318	689323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593170
18017	NC_009380	ATG	2	6	689325	689330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593170
18018	NC_009380	CCGG	2	8	689357	689364	0 %	0 %	50 %	50 %	145593170
18019	NC_009380	TGC	2	6	689375	689380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18020	NC_009380	GC	3	6	689379	689384	0 %	0 %	50 %	50 %	145593170
18021	NC_009380	CTG	2	6	689387	689392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18022	NC_009380	CCG	4	12	689403	689414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18023	NC_009380	GCGA	2	8	689447	689454	25 %	0 %	50 %	25 %	145593170
18024	NC_009380	GCT	2	6	689458	689463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18025	NC_009380	CCG	3	9	689475	689483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18026	NC_009380	CTG	2	6	689525	689530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18027	NC_009380	GCC	2	6	689558	689563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18028	NC_009380	ACC	2	6	689580	689585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593170
18029	NC_009380	GCC	2	6	689618	689623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18030	NC_009380	CGA	2	6	689650	689655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18031	NC_009380	ACA	2	6	689694	689699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593170
18032	NC_009380	CGC	2	6	689701	689706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18033	NC_009380	AGC	2	6	689709	689714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18034	NC_009380	GCA	2	6	689776	689781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593170
18035	NC_009380	GCCACC	2	12	689807	689818	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145593170
18036	NC_009380	CGG	2	6	689824	689829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593170
18037	NC_009380	CAT	2	6	689833	689838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593170
18038	NC_009380	CGC	2	6	689857	689862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18039	NC_009380	CCG	2	6	689883	689888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593170
18040	NC_009380	CCA	2	6	689892	689897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593170
18041	NC_009380	GGA	2	6	690028	690033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_009380	CG	3	6	690149	690154	0 %	0 %	50 %	50 %	145593171
18043	NC_009380	GCG	2	6	690203	690208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593171
18044	NC_009380	GGC	2	6	690211	690216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593171
18045	NC_009380	GCC	2	6	690248	690253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593171
18046	NC_009380	CGG	2	6	690383	690388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593171
18047	NC_009380	CAC	2	6	690395	690400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593171
18048	NC_009380	GTCC	2	8	690449	690456	0 %	25 %	25 %	50 %	145593171
18049	NC_009380	CGC	2	6	690535	690540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593171
18050	NC_009380	CGA	2	6	690583	690588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593171
18051	NC_009380	GCG	2	6	690599	690604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593171
18052	NC_009380	GGC	2	6	690622	690627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593171
18053	NC_009380	ACTG	2	8	690631	690638	25 %	25 %	25 %	25 %	145593171
18054	NC_009380	AGA	2	6	690668	690673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593171
18055	NC_009380	ACCG	2	8	690687	690694	25 %	0 %	25 %	50 %	145593171
18056	NC_009380	AGC	2	6	690705	690710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593171
18057	NC_009380	GTG	2	6	690759	690764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593171
18058	NC_009380	TC	3	6	690772	690777	0 %	50 %	0 %	50 %	145593171
18059	NC_009380	ATGGAA	2	12	690788	690799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145593171
18060	NC_009380	GCC	2	6	690813	690818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593171
18061	NC_009380	CG	3	6	690819	690824	0 %	0 %	50 %	50 %	145593171
18062	NC_009380	CGA	2	6	690829	690834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593171
18063	NC_009380	CCG	2	6	690886	690891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593171
18064	NC_009380	TGC	2	6	690899	690904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593171
18065	NC_009380	CACG	2	8	691006	691013	25 %	0 %	25 %	50 %	145593171
18066	NC_009380	CT	4	8	691024	691031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18067	NC_009380	CGG	2	6	691119	691124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_009380	ACC	2	6	691131	691136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18069	NC_009380	GAA	2	6	691174	691179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_009380	GGA	2	6	691189	691194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_009380	GCT	2	6	691221	691226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_009380	GCGG	2	8	691237	691244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18073	NC_009380	GCG	3	9	691250	691258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18074	NC_009380	CG	3	6	691279	691284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18075	NC_009380	TG	3	6	691303	691308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_009380	ACT	2	6	691364	691369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18077	NC_009380	TCC	2	6	691428	691433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_009380	GTGGCG	2	12	691434	691445	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18079	NC_009380	CGT	2	6	691473	691478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_009380	GCC	2	6	691519	691524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18081	NC_009380	GGC	2	6	691539	691544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_009380	ATCC	2	8	691579	691586	25 %	25 %	0 %	50 %	145593172
18083	NC_009380	GCG	2	6	691622	691627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593172
18084	NC_009380	TGA	2	6	691630	691635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593172
18085	NC_009380	CGG	3	9	691645	691653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593172
18086	NC_009380	CGA	2	6	691708	691713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593172
18087	NC_009380	CGA	2	6	691729	691734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593172
18088	NC_009380	CTC	2	6	691777	691782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593172
18089	NC_009380	GTG	2	6	691856	691861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_009380	CGC	2	6	691948	691953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18091	NC_009380	GTCG	2	8	691990	691997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18092	NC_009380	GCG	2	6	692064	692069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18093	NC_009380	GCG	2	6	692085	692090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593173
18094	NC_009380	CCGGT	2	10	692111	692120	0 %	20 %	40 %	40 %	145593173
18095	NC_009380	CGC	2	6	692149	692154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593173
18096	NC_009380	T	6	6	692203	692208	0 %	100 %	0 %	0 %	145593173
18097	NC_009380	GCCA	2	8	692209	692216	25 %	0 %	25 %	50 %	145593173
18098	NC_009380	CGGTG	2	10	692225	692234	0 %	20 %	60 %	20 %	145593173
18099	NC_009380	TG	3	6	692233	692238	0 %	50 %	50 %	0 %	145593173
18100	NC_009380	CGAC	2	8	692297	692304	25 %	0 %	25 %	50 %	145593173
18101	NC_009380	CGTC	2	8	692320	692327	0 %	25 %	25 %	50 %	145593173
18102	NC_009380	GCT	2	6	692333	692338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593173
18103	NC_009380	GCA	2	6	692393	692398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593173
18104	NC_009380	GTT	2	6	692406	692411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593173
18105	NC_009380	CGGG	2	8	692427	692434	0 %	0 %	75 %	25 %	145593173
18106	NC_009380	CCG	2	6	692494	692499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593173
18107	NC_009380	CCA	2	6	692556	692561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593173
18108	NC_009380	CGC	2	6	692711	692716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593173
18109	NC_009380	CGTGGC	2	12	692733	692744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145593173
18110	NC_009380	CGC	2	6	692835	692840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593173
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18112	NC_009380	CAC	2	6	692892	692897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593173
18113	NC_009380	TCC	2	6	692911	692916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593173
18114	NC_009380	GCG	2	6	692917	692922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593173
18115	NC_009380	GCG	2	6	693006	693011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593173
18116	NC_009380	CGA	2	6	693041	693046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593173
18117	NC_009380	GAA	2	6	693054	693059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593173
18118	NC_009380	GTC	2	6	693096	693101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593173
18119	NC_009380	GC	4	8	693119	693126	0 %	0 %	50 %	50 %	145593173
18120	NC_009380	GCT	2	6	693146	693151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593173
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18122	NC_009380	TGC	2	6	693239	693244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593173
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18241	NC_009380	CGC	2	6	698204	698209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593177
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18244	NC_009380	CGC	2	6	698306	698311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593177
18245	NC_009380	CGA	2	6	698411	698416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593177
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18251	NC_009380	GAC	2	6	698666	698671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18485	NC_009380	ACCGTC	2	12	708718	708729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145593186
18486	NC_009380	ATG	2	6	708799	708804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593186
18487	NC_009380	CGT	2	6	708859	708864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18488	NC_009380	CTG	2	6	708908	708913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18489	NC_009380	TCG	2	6	708958	708963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18490	NC_009380	GC	3	6	709037	709042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18491	NC_009380	CGG	2	6	709058	709063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18493	NC_009380	TGA	2	6	709109	709114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593187
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