MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_009380	TCC	2	6	667643	667648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593154
17503	NC_009380	CTA	2	6	667730	667735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593154
17504	NC_009380	GTCG	2	8	667741	667748	0 %	25 %	50 %	25 %	145593154
17505	NC_009380	CCAG	2	8	667799	667806	25 %	0 %	25 %	50 %	145593154
17506	NC_009380	GACGGC	2	12	667848	667859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145593154
17507	NC_009380	GC	3	6	667858	667863	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17508	NC_009380	TGG	2	6	667873	667878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593154
17509	NC_009380	ACT	2	6	667882	667887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593154
17510	NC_009380	G	6	6	667974	667979	0 %	0 %	100 %	0 %	145593154
17511	NC_009380	CTTT	2	8	667991	667998	0 %	75 %	0 %	25 %	145593154
17512	NC_009380	CG	3	6	668066	668071	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17513	NC_009380	TGC	2	6	668116	668121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17514	NC_009380	CCGG	2	8	668177	668184	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17515	NC_009380	GC	3	6	668221	668226	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17516	NC_009380	CACCTA	2	12	668279	668290	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	145593154
17517	NC_009380	CAC	2	6	668333	668338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593154
17518	NC_009380	AG	3	6	668354	668359	50 %	0 %	50 %	0 %	145593154
17519	NC_009380	CGACGG	2	12	668489	668500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145593154
17520	NC_009380	TGC	2	6	668512	668517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17521	NC_009380	GCT	2	6	668591	668596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17522	NC_009380	GAC	2	6	668634	668639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17523	NC_009380	TGG	2	6	668678	668683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593154
17524	NC_009380	TGG	2	6	668785	668790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593154
17525	NC_009380	CCAG	2	8	668839	668846	25 %	0 %	25 %	50 %	145593154
17526	NC_009380	CGGC	2	8	668933	668940	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17527	NC_009380	CTT	2	6	669002	669007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593154
17528	NC_009380	GTG	2	6	669033	669038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593154
17529	NC_009380	CGG	2	6	669049	669054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593154
17530	NC_009380	ACG	3	9	669112	669120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593154
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17532	NC_009380	TCA	2	6	669294	669299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593155
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17534	NC_009380	TCGG	2	8	669330	669337	0 %	25 %	50 %	25 %	145593155
17535	NC_009380	CGC	2	6	669448	669453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593155
17536	NC_009380	GCT	2	6	669454	669459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593155
17537	NC_009380	GGC	2	6	669481	669486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593155
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17539	NC_009380	ACT	2	6	669610	669615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593155
17540	NC_009380	GTGC	2	8	669706	669713	0 %	25 %	50 %	25 %	145593155
17541	NC_009380	GGC	2	6	669734	669739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593155
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17543	NC_009380	CTG	2	6	669821	669826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593155
17544	NC_009380	CTGCG	2	10	669867	669876	0 %	20 %	40 %	40 %	145593155
17545	NC_009380	GCG	2	6	669903	669908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593155
17546	NC_009380	GTT	2	6	669913	669918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593155
17547	NC_009380	GCT	2	6	669938	669943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593155
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17550	NC_009380	CGG	2	6	670049	670054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593155
17551	NC_009380	CGCT	2	8	670063	670070	0 %	25 %	25 %	50 %	145593155
17552	NC_009380	CGC	2	6	670145	670150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593155
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17554	NC_009380	CCG	2	6	670196	670201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17555	NC_009380	GCCG	2	8	670259	670266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17556	NC_009380	GCT	3	9	670292	670300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17557	NC_009380	CCTGGC	2	12	670337	670348	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17558	NC_009380	CGG	2	6	670410	670415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_009380	GGA	2	6	670447	670452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_009380	GC	3	6	670538	670543	0 %	0 %	50 %	50 %	145593156
17561	NC_009380	CTG	2	6	670578	670583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593156
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17569	NC_009380	CCTG	2	8	671143	671150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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17573	NC_009380	CGGG	2	8	671284	671291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17574	NC_009380	CGC	2	6	671321	671326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17587	NC_009380	GC	3	6	671786	671791	0 %	0 %	50 %	50 %	145593157
17588	NC_009380	TCG	2	6	671802	671807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593157
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17601	NC_009380	CCCA	2	8	672654	672661	25 %	0 %	0 %	75 %	145593158
17602	NC_009380	TGC	2	6	672685	672690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593158
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17605	NC_009380	GGC	2	6	672778	672783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593158
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17609	NC_009380	TGGC	2	8	672981	672988	0 %	25 %	50 %	25 %	145593158
17610	NC_009380	GCT	2	6	673007	673012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593158
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17612	NC_009380	TCG	2	6	673039	673044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593158
17613	NC_009380	GCCTT	2	10	673066	673075	0 %	40 %	20 %	40 %	145593158
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17846	NC_009380	TGCG	2	8	682167	682174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17847	NC_009380	AGC	2	6	682191	682196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17851	NC_009380	GCG	2	6	682420	682425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17852	NC_009380	GCA	2	6	682430	682435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17853	NC_009380	ACG	2	6	682502	682507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17855	NC_009380	TGCCGT	6	36	682539	682574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17856	NC_009380	GAG	2	6	682579	682584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17857	NC_009380	GTT	2	6	682623	682628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593163
17858	NC_009380	GCC	2	6	682632	682637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593163
17859	NC_009380	TGC	2	6	682648	682653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593163
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17862	NC_009380	CTG	2	6	682686	682691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593163
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17981	NC_009380	GC	3	6	687784	687789	0 %	0 %	50 %	50 %	145593168
17982	NC_009380	CGC	2	6	687825	687830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593168
17983	NC_009380	CGA	2	6	687850	687855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593168
17984	NC_009380	GC	4	8	687871	687878	0 %	0 %	50 %	50 %	145593168
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