MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_009380	ACC	2	6	646094	646099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593134
17003	NC_009380	GCA	2	6	646100	646105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17004	NC_009380	ACCT	2	8	646136	646143	25 %	25 %	0 %	50 %	145593135
17005	NC_009380	ACC	2	6	646164	646169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593135
17006	NC_009380	GTG	2	6	646190	646195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593135
17007	NC_009380	TCG	2	6	646200	646205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17008	NC_009380	CCA	2	6	646259	646264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593135
17009	NC_009380	CCA	2	6	646297	646302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593135
17010	NC_009380	GCT	2	6	646366	646371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17011	NC_009380	CAG	2	6	646403	646408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17012	NC_009380	CCG	2	6	646416	646421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593135
17013	NC_009380	CGCT	2	8	646422	646429	0 %	25 %	25 %	50 %	145593135
17014	NC_009380	GCC	2	6	646440	646445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593135
17015	NC_009380	CCT	2	6	646453	646458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593135
17016	NC_009380	TCC	2	6	646473	646478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593135
17017	NC_009380	GCG	2	6	646572	646577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593135
17018	NC_009380	ACG	2	6	646614	646619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17019	NC_009380	ACG	2	6	646645	646650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593135
17020	NC_009380	CTGG	2	8	646705	646712	0 %	25 %	50 %	25 %	145593135
17021	NC_009380	CAC	2	6	646726	646731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593135
17022	NC_009380	GCG	2	6	646740	646745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593135
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17024	NC_009380	CCT	2	6	646783	646788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593135
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17029	NC_009380	GACC	2	8	647005	647012	25 %	0 %	25 %	50 %	145593135
17030	NC_009380	CGA	2	6	647020	647025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593135
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17035	NC_009380	GAGCA	2	10	647287	647296	40 %	0 %	40 %	20 %	145593136
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17040	NC_009380	CGC	2	6	647355	647360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593136
17041	NC_009380	GTCATC	2	12	647428	647439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145593136
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17052	NC_009380	C	6	6	647816	647821	0 %	0 %	0 %	100 %	145593136
17053	NC_009380	CGTC	2	8	647877	647884	0 %	25 %	25 %	50 %	145593136
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17109	NC_009380	AC	3	6	649998	650003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17112	NC_009380	CG	3	6	650103	650108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17119	NC_009380	CGG	2	6	650302	650307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17120	NC_009380	GTA	2	6	650362	650367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_009380	GGC	2	6	650494	650499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593137
17122	NC_009380	CGG	2	6	650568	650573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593137
17123	NC_009380	ACCCC	2	10	650598	650607	20 %	0 %	0 %	80 %	145593137
17124	NC_009380	GCC	2	6	650609	650614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593137
17125	NC_009380	CCG	2	6	650656	650661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593137
17126	NC_009380	CGC	2	6	650669	650674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593137
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17129	NC_009380	GGT	2	6	650783	650788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593137
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17134	NC_009380	CGG	2	6	651020	651025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593138
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17146	NC_009380	GC	3	6	651425	651430	0 %	0 %	50 %	50 %	145593138
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17151	NC_009380	CCG	2	6	651883	651888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17152	NC_009380	CCCAG	2	10	651893	651902	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17153	NC_009380	CGG	2	6	651939	651944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17154	NC_009380	CA	3	6	652002	652007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17155	NC_009380	CAT	2	6	652015	652020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17156	NC_009380	CCG	2	6	652026	652031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17157	NC_009380	CCG	2	6	652041	652046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17158	NC_009380	TTC	2	6	652113	652118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17159	NC_009380	AC	3	6	652169	652174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17160	NC_009380	TGCA	2	8	652198	652205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17161	NC_009380	GCA	2	6	652224	652229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593139
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17164	NC_009380	CGG	2	6	652329	652334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593139
17165	NC_009380	C	7	7	652518	652524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17166	NC_009380	CCG	2	6	652569	652574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17167	NC_009380	TAC	2	6	652643	652648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17170	NC_009380	TCAA	2	8	652977	652984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17171	NC_009380	CCGT	2	8	653017	653024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17172	NC_009380	CCG	2	6	653047	653052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17173	NC_009380	GGC	2	6	653067	653072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593140
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17196	NC_009380	ACG	2	6	654226	654231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17198	NC_009380	GAG	2	6	654296	654301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17199	NC_009380	CGT	2	6	654381	654386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17202	NC_009380	CCG	2	6	654537	654542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17221	NC_009380	GAT	2	6	655462	655467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593143
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17225	NC_009380	GCG	2	6	655614	655619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593143
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17227	NC_009380	TGG	2	6	655725	655730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17228	NC_009380	CGG	2	6	655773	655778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17229	NC_009380	TCCGCC	2	12	655791	655802	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17230	NC_009380	CGG	3	9	655876	655884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
17231	NC_009380	CCG	2	6	655901	655906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593144
17232	NC_009380	TCT	2	6	655933	655938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593144
17233	NC_009380	GCT	2	6	655966	655971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593144
17234	NC_009380	CGA	2	6	655990	655995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593144
17235	NC_009380	GCG	2	6	656000	656005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
17236	NC_009380	ATC	2	6	656030	656035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593144
17237	NC_009380	ACC	2	6	656039	656044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593144
17238	NC_009380	TTC	2	6	656048	656053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593144
17239	NC_009380	GTT	2	6	656060	656065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593144
17240	NC_009380	GATCC	2	10	656135	656144	20 %	20 %	20 %	40 %	145593144
17241	NC_009380	TTGGC	2	10	656159	656168	0 %	40 %	40 %	20 %	145593144
17242	NC_009380	CTG	2	6	656177	656182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593144
17243	NC_009380	TGC	2	6	656205	656210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593144
17244	NC_009380	GCG	2	6	656211	656216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
17245	NC_009380	GCG	2	6	656234	656239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
17246	NC_009380	G	6	6	656255	656260	0 %	0 %	100 %	0 %	145593144
17247	NC_009380	GAC	2	6	656270	656275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593144
17248	NC_009380	CCGAA	2	10	656277	656286	40 %	0 %	20 %	40 %	145593144
17249	NC_009380	GTT	2	6	656326	656331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593144
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17252	NC_009380	GGCGTC	2	12	656384	656395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145593144
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17254	NC_009380	CGAC	2	8	656508	656515	25 %	0 %	25 %	50 %	145593144
17255	NC_009380	CG	4	8	656554	656561	0 %	0 %	50 %	50 %	145593144
17256	NC_009380	CGG	2	6	656574	656579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
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17260	NC_009380	GTC	2	6	656831	656836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593144
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17263	NC_009380	GCC	2	6	657024	657029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593145
17264	NC_009380	GCT	2	6	657039	657044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593145
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17276	NC_009380	TCG	2	6	657314	657319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593145
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17283	NC_009380	GCT	2	6	657597	657602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593145
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17290	NC_009380	GGC	2	6	657940	657945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593145
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17293	NC_009380	TGC	2	6	658058	658063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593145
17294	NC_009380	TGCGT	2	10	658070	658079	0 %	40 %	40 %	20 %	145593145
17295	NC_009380	CGC	3	9	658221	658229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17296	NC_009380	ACC	2	6	658260	658265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593146
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17298	NC_009380	CCA	2	6	658307	658312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593146
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17300	NC_009380	TCG	3	9	658366	658374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17301	NC_009380	CCG	2	6	658375	658380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17302	NC_009380	CGG	2	6	658402	658407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17303	NC_009380	GGC	2	6	658415	658420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17304	NC_009380	CGC	2	6	658580	658585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17305	NC_009380	ACGG	2	8	658631	658638	25 %	0 %	50 %	25 %	145593146
17306	NC_009380	TCGA	2	8	658657	658664	25 %	25 %	25 %	25 %	145593146
17307	NC_009380	CGA	2	6	658733	658738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17308	NC_009380	CGAG	2	8	658805	658812	25 %	0 %	50 %	25 %	145593146
17309	NC_009380	CAC	2	6	658913	658918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593146
17310	NC_009380	TACC	2	8	658954	658961	25 %	25 %	0 %	50 %	145593146
17311	NC_009380	ATCGG	2	10	658977	658986	20 %	20 %	40 %	20 %	145593146
17312	NC_009380	CGG	3	9	658984	658992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17313	NC_009380	CGC	2	6	659024	659029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17314	NC_009380	ACC	2	6	659043	659048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593146
17315	NC_009380	GCGA	2	8	659068	659075	25 %	0 %	50 %	25 %	145593146
17316	NC_009380	CTG	2	6	659079	659084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17317	NC_009380	TCG	2	6	659107	659112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17318	NC_009380	TCG	2	6	659119	659124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
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17320	NC_009380	CGT	2	6	659306	659311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17321	NC_009380	CGA	2	6	659381	659386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17322	NC_009380	GCG	3	9	659391	659399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17323	NC_009380	GGC	2	6	659429	659434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17324	NC_009380	CGGG	2	8	659438	659445	0 %	0 %	75 %	25 %	145593146
17325	NC_009380	GCG	2	6	659509	659514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17326	NC_009380	CGA	2	6	659570	659575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593146
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17328	NC_009380	GCA	2	6	659651	659656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17329	NC_009380	GCC	2	6	659661	659666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17330	NC_009380	CTG	2	6	659682	659687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593146
17331	NC_009380	CCGA	2	8	659727	659734	25 %	0 %	25 %	50 %	145593146
17332	NC_009380	GGC	2	6	659735	659740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
17333	NC_009380	GC	3	6	659739	659744	0 %	0 %	50 %	50 %	145593146
17334	NC_009380	CGCAT	2	10	659787	659796	20 %	20 %	20 %	40 %	145593146
17335	NC_009380	GCC	2	6	659806	659811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593146
17336	NC_009380	AC	3	6	659872	659877	50 %	0 %	0 %	50 %	145593146
17337	NC_009380	GTT	2	6	659882	659887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593146
17338	NC_009380	TCCC	2	8	659913	659920	0 %	25 %	0 %	75 %	145593146
17339	NC_009380	ACC	2	6	659948	659953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17340	NC_009380	AAG	2	6	660164	660169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593147
17341	NC_009380	CGG	3	9	660195	660203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
17342	NC_009380	GCA	2	6	660217	660222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
17343	NC_009380	CTC	2	6	660275	660280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593147
17344	NC_009380	CGA	2	6	660355	660360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
17345	NC_009380	CCGG	2	8	660366	660373	0 %	0 %	50 %	50 %	145593147
17346	NC_009380	CGGG	2	8	660455	660462	0 %	0 %	75 %	25 %	145593147
17347	NC_009380	GAC	2	6	660550	660555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
17348	NC_009380	GGC	2	6	660657	660662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
17349	NC_009380	GGT	2	6	660688	660693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593147
17350	NC_009380	GGCAGG	2	12	660723	660734	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	145593147
17351	NC_009380	GTG	2	6	660755	660760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593147
17352	NC_009380	ACGTG	2	10	660784	660793	20 %	20 %	40 %	20 %	145593147
17353	NC_009380	CGG	2	6	660814	660819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
17354	NC_009380	CAG	2	6	660956	660961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
17355	NC_009380	CGT	2	6	660964	660969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593147
17356	NC_009380	AGA	2	6	661017	661022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593147
17357	NC_009380	GCC	2	6	661067	661072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593147
17358	NC_009380	GAG	2	6	661085	661090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593147
17359	NC_009380	CAC	3	9	661204	661212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593147
17360	NC_009380	CAT	2	6	661213	661218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593147
17361	NC_009380	GCC	2	6	661247	661252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593147
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17482	NC_009380	CCA	2	6	666866	666871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593153
17483	NC_009380	CGC	2	6	666907	666912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593153
17484	NC_009380	GCC	2	6	666980	666985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593153
17485	NC_009380	CGC	2	6	667006	667011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593153
17486	NC_009380	GGC	2	6	667054	667059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593153
17487	NC_009380	CCG	3	9	667092	667100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593153
17488	NC_009380	GC	3	6	667106	667111	0 %	0 %	50 %	50 %	145593153
17489	NC_009380	GGT	2	6	667161	667166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593153
17490	NC_009380	CTG	2	6	667194	667199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593153
17491	NC_009380	GGC	2	6	667245	667250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17492	NC_009380	GCC	2	6	667255	667260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17493	NC_009380	CCATGT	2	12	667276	667287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145593154
17494	NC_009380	TGC	2	6	667300	667305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17495	NC_009380	TCG	2	6	667327	667332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17496	NC_009380	CCGG	2	8	667355	667362	0 %	0 %	50 %	50 %	145593154
17497	NC_009380	GCT	2	6	667520	667525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17498	NC_009380	ACG	2	6	667549	667554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593154
17499	NC_009380	TG	3	6	667556	667561	0 %	50 %	50 %	0 %	145593154
17500	NC_009380	GAC	2	6	667578	667583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593154

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