MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_009380	CA	3	6	623446	623451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16502	NC_009380	GCC	2	6	623455	623460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16503	NC_009380	CTGGC	2	10	623530	623539	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16504	NC_009380	GC	3	6	623573	623578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16505	NC_009380	GCGA	2	8	623619	623626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16506	NC_009380	CTG	2	6	623874	623879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_009380	GGT	2	6	623889	623894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_009380	CGC	2	6	623916	623921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16509	NC_009380	ACG	2	6	623994	623999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_009380	TGG	2	6	624013	624018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593114
16511	NC_009380	GCC	2	6	624082	624087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593114
16512	NC_009380	CGC	2	6	624137	624142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593114
16513	NC_009380	CGA	2	6	624159	624164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593114
16514	NC_009380	TGGC	2	8	624264	624271	0 %	25 %	50 %	25 %	145593114
16515	NC_009380	TCGGC	2	10	624300	624309	0 %	20 %	40 %	40 %	145593114
16516	NC_009380	CCG	2	6	624324	624329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593114
16517	NC_009380	TGA	2	6	624382	624387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_009380	GAG	2	6	624401	624406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_009380	AG	3	6	624405	624410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_009380	AG	3	6	624419	624424	50 %	0 %	50 %	0 %	145593115
16521	NC_009380	TAC	2	6	624584	624589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593115
16522	NC_009380	GAC	2	6	624611	624616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593115
16523	NC_009380	CGGG	2	8	624685	624692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16524	NC_009380	TGA	2	6	624708	624713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_009380	CTG	2	6	624765	624770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593116
16526	NC_009380	GAC	2	6	624876	624881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593116
16527	NC_009380	GTG	2	6	624912	624917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593116
16528	NC_009380	TGA	2	6	624929	624934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593116
16529	NC_009380	AAC	2	6	625010	625015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593116
16530	NC_009380	GCG	2	6	625068	625073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593116
16531	NC_009380	ACG	2	6	625075	625080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593116
16532	NC_009380	GCA	2	6	625192	625197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593117
16533	NC_009380	GACT	2	8	625208	625215	25 %	25 %	25 %	25 %	145593117
16534	NC_009380	GAAG	2	8	625239	625246	50 %	0 %	50 %	0 %	145593117
16535	NC_009380	GCC	2	6	625266	625271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593117
16536	NC_009380	GAG	2	6	625272	625277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593117
16537	NC_009380	ACTC	2	8	625281	625288	25 %	25 %	0 %	50 %	145593117
16538	NC_009380	CAG	2	6	625425	625430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593117
16539	NC_009380	GGC	2	6	625480	625485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593117
16540	NC_009380	TG	3	6	625567	625572	0 %	50 %	50 %	0 %	145593117
16541	NC_009380	GC	4	8	625633	625640	0 %	0 %	50 %	50 %	145593117
16542	NC_009380	AGA	2	6	625712	625717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593117
16543	NC_009380	CAA	2	6	625733	625738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593117
16544	NC_009380	GA	3	6	625842	625847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_009380	ACT	2	6	625856	625861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593118
16546	NC_009380	AGG	2	6	625867	625872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593118
16547	NC_009380	AGG	2	6	625953	625958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593118
16548	NC_009380	TCA	2	6	626054	626059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593118
16549	NC_009380	CGA	2	6	626067	626072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593118
16550	NC_009380	CGGC	2	8	626158	626165	0 %	0 %	50 %	50 %	145593118
16551	NC_009380	CGG	2	6	626168	626173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593118
16552	NC_009380	TGGT	2	8	626189	626196	0 %	50 %	50 %	0 %	145593118
16553	NC_009380	GCT	3	9	626227	626235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593118
16554	NC_009380	CGA	2	6	626340	626345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593118
16555	NC_009380	CAC	2	6	626419	626424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593118
16556	NC_009380	CG	3	6	626455	626460	0 %	0 %	50 %	50 %	145593118
16557	NC_009380	GCC	2	6	626489	626494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593118
16558	NC_009380	GGA	2	6	626605	626610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_009380	GCG	2	6	626686	626691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_009380	CCA	3	9	626824	626832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16561	NC_009380	CGGAT	2	10	626840	626849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16562	NC_009380	GGC	2	6	626910	626915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_009380	GGC	2	6	626955	626960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_009380	CCG	2	6	627023	627028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16565	NC_009380	GCAA	2	8	627052	627059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16566	NC_009380	GCCC	2	8	627165	627172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16567	NC_009380	TCA	2	6	627261	627266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_009380	CGTCAC	2	12	627286	627297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16569	NC_009380	CAC	2	6	627301	627306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16570	NC_009380	GAT	2	6	627316	627321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_009380	GGC	2	6	627352	627357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16572	NC_009380	CTGGAG	2	12	627415	627426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16573	NC_009380	CGG	2	6	627464	627469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16574	NC_009380	GGGC	2	8	627470	627477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16575	NC_009380	GAC	2	6	627544	627549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16576	NC_009380	CTG	2	6	627550	627555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16577	NC_009380	CCG	2	6	627635	627640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16578	NC_009380	GGT	2	6	627680	627685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_009380	GCC	2	6	627692	627697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16580	NC_009380	ATC	2	6	627726	627731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16581	NC_009380	CGG	2	6	627737	627742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16582	NC_009380	CG	3	6	627780	627785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16583	NC_009380	GCC	2	6	627824	627829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16584	NC_009380	GTGA	2	8	627903	627910	25 %	25 %	50 %	0 %	145593119
16585	NC_009380	CGA	2	6	627932	627937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593119
16586	NC_009380	CTG	2	6	627999	628004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593119
16587	NC_009380	CGC	2	6	628025	628030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593119
16588	NC_009380	TGT	2	6	628094	628099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593119
16589	NC_009380	GCAC	2	8	628113	628120	25 %	0 %	25 %	50 %	145593119
16590	NC_009380	GTTG	2	8	628142	628149	0 %	50 %	50 %	0 %	145593119
16591	NC_009380	GTG	2	6	628155	628160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593119
16592	NC_009380	TGG	2	6	628192	628197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593119
16593	NC_009380	TTC	2	6	628271	628276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16594	NC_009380	CCA	2	6	628278	628283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16595	NC_009380	GGA	2	6	628363	628368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16596	NC_009380	GC	3	6	628394	628399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16597	NC_009380	CCG	2	6	628402	628407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16598	NC_009380	CGG	2	6	628420	628425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16599	NC_009380	GCGG	2	8	628526	628533	0 %	0 %	75 %	25 %	145593120
16600	NC_009380	G	6	6	628532	628537	0 %	0 %	100 %	0 %	145593120
16601	NC_009380	GTG	2	6	628551	628556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593120
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16603	NC_009380	TCGA	2	8	628651	628658	25 %	25 %	25 %	25 %	145593120
16604	NC_009380	CACG	2	8	628678	628685	25 %	0 %	25 %	50 %	145593120
16605	NC_009380	CG	3	6	628733	628738	0 %	0 %	50 %	50 %	145593120
16606	NC_009380	GTG	2	6	628803	628808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593120
16607	NC_009380	CAT	2	6	628816	628821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593120
16608	NC_009380	CAC	2	6	628908	628913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593120
16609	NC_009380	CGG	2	6	628993	628998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593120
16610	NC_009380	GGT	2	6	629040	629045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593120
16611	NC_009380	CTGT	2	8	629122	629129	0 %	50 %	25 %	25 %	145593120
16612	NC_009380	AGG	2	6	629204	629209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593120
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16614	NC_009380	ATC	2	6	629220	629225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593120
16615	NC_009380	CCT	2	6	629267	629272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16616	NC_009380	GGT	2	6	629372	629377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16617	NC_009380	CGG	2	6	629406	629411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16618	NC_009380	CGAG	2	8	629436	629443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16619	NC_009380	GGA	2	6	629511	629516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16620	NC_009380	CGTCG	2	10	629578	629587	0 %	20 %	40 %	40 %	145593121
16621	NC_009380	GCG	2	6	629663	629668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593121
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16623	NC_009380	GGC	2	6	629702	629707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593121
16624	NC_009380	CGGT	2	8	629717	629724	0 %	25 %	50 %	25 %	145593122
16625	NC_009380	TAA	2	6	629746	629751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145593122
16626	NC_009380	AGA	2	6	629766	629771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593122
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16667	NC_009380	CCG	2	6	631449	631454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16695	NC_009380	GCACA	2	10	632508	632517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16746	NC_009380	CCA	2	6	634427	634432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16992	NC_009380	GCC	3	9	645690	645698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593134
16993	NC_009380	CCG	2	6	645701	645706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593134
16994	NC_009380	ACC	2	6	645734	645739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593134
16995	NC_009380	CGA	2	6	645779	645784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593134
16996	NC_009380	ACG	2	6	645834	645839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593134
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