MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009380	GCC	2	6	598040	598045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593089
16002	NC_009380	AGGC	2	8	598050	598057	25 %	0 %	50 %	25 %	145593089
16003	NC_009380	CG	3	6	598102	598107	0 %	0 %	50 %	50 %	145593089
16004	NC_009380	CAC	2	6	598132	598137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593089
16005	NC_009380	TCA	2	6	598479	598484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_009380	CGTA	2	8	598549	598556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_009380	CTAT	2	8	598588	598595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_009380	AAT	2	6	598596	598601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_009380	CCG	2	6	598681	598686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593090
16010	NC_009380	CTG	2	6	598691	598696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593090
16011	NC_009380	TCA	2	6	598787	598792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593090
16012	NC_009380	CGGC	2	8	598817	598824	0 %	0 %	50 %	50 %	145593090
16013	NC_009380	CGG	2	6	598866	598871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593090
16014	NC_009380	TGG	2	6	598878	598883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593090
16015	NC_009380	CAC	3	9	598888	598896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593090
16016	NC_009380	GAT	2	6	598969	598974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593090
16017	NC_009380	CCG	2	6	599038	599043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593091
16018	NC_009380	GC	3	6	599110	599115	0 %	0 %	50 %	50 %	145593091
16019	NC_009380	CGG	2	6	599255	599260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593091
16020	NC_009380	GGC	2	6	599285	599290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593091
16021	NC_009380	GTC	2	6	599332	599337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593091
16022	NC_009380	GGC	2	6	599340	599345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593091
16023	NC_009380	ACC	2	6	599474	599479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593091
16024	NC_009380	TCAC	2	8	599533	599540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16025	NC_009380	AGT	2	6	599548	599553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_009380	GAT	2	6	599554	599559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_009380	TC	3	6	599718	599723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16028	NC_009380	GCC	2	6	599746	599751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16029	NC_009380	GCT	2	6	599810	599815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_009380	CGGC	2	8	599977	599984	0 %	0 %	50 %	50 %	145593092
16031	NC_009380	CGGAG	2	10	599996	600005	20 %	0 %	60 %	20 %	145593092
16032	NC_009380	ACG	2	6	600022	600027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593092
16033	NC_009380	GCC	2	6	600057	600062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593092
16034	NC_009380	CGG	2	6	600070	600075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593092
16035	NC_009380	GGT	2	6	600137	600142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593092
16036	NC_009380	GC	3	6	600150	600155	0 %	0 %	50 %	50 %	145593092
16037	NC_009380	TCA	2	6	600184	600189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593092
16038	NC_009380	CGA	2	6	600271	600276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593093
16039	NC_009380	GCCGC	2	10	600354	600363	0 %	0 %	40 %	60 %	145593093
16040	NC_009380	CGG	2	6	600607	600612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593093
16041	NC_009380	GC	3	6	600759	600764	0 %	0 %	50 %	50 %	145593093
16042	NC_009380	CGA	2	6	600824	600829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593093
16043	NC_009380	CTGC	2	8	600841	600848	0 %	25 %	25 %	50 %	145593093
16044	NC_009380	CG	3	6	600852	600857	0 %	0 %	50 %	50 %	145593093
16045	NC_009380	CGT	2	6	600880	600885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593093
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16047	NC_009380	CGGC	2	8	600939	600946	0 %	0 %	50 %	50 %	145593093
16048	NC_009380	CGG	2	6	600952	600957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593093
16049	NC_009380	AAG	2	6	600959	600964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593093
16050	NC_009380	GGC	2	6	601047	601052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593093
16051	NC_009380	AGT	2	6	601084	601089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593093
16052	NC_009380	TTG	2	6	601140	601145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593093
16053	NC_009380	GCC	2	6	601154	601159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593093
16054	NC_009380	GCA	2	6	601167	601172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593093
16055	NC_009380	CTC	2	6	601190	601195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593093
16056	NC_009380	TC	4	8	601231	601238	0 %	50 %	0 %	50 %	145593093
16057	NC_009380	GCT	2	6	601298	601303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_009380	CGC	2	6	601336	601341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16059	NC_009380	TGA	2	6	601349	601354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_009380	CGA	3	9	601388	601396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_009380	GTC	2	6	601407	601412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_009380	GGTT	2	8	601418	601425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_009380	GGT	2	6	601427	601432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_009380	ACG	2	6	601627	601632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16065	NC_009380	GAC	2	6	601649	601654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16066	NC_009380	GTC	2	6	601701	601706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16067	NC_009380	CGGA	2	8	601714	601721	25 %	0 %	50 %	25 %	145593094
16068	NC_009380	CG	3	6	601751	601756	0 %	0 %	50 %	50 %	145593094
16069	NC_009380	GTA	2	6	601766	601771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593094
16070	NC_009380	CGT	2	6	601772	601777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16071	NC_009380	GGCG	2	8	601778	601785	0 %	0 %	75 %	25 %	145593094
16072	NC_009380	CAC	2	6	601793	601798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593094
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16074	NC_009380	CGG	2	6	601897	601902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
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16076	NC_009380	CGG	2	6	601958	601963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
16077	NC_009380	CGG	2	6	601970	601975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
16078	NC_009380	GTG	2	6	601986	601991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593094
16079	NC_009380	CACTC	2	10	602005	602014	20 %	20 %	0 %	60 %	145593094
16080	NC_009380	CG	3	6	602036	602041	0 %	0 %	50 %	50 %	145593094
16081	NC_009380	CCA	2	6	602048	602053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593094
16082	NC_009380	GCG	2	6	602106	602111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
16083	NC_009380	GC	3	6	602254	602259	0 %	0 %	50 %	50 %	145593094
16084	NC_009380	CGT	2	6	602267	602272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16085	NC_009380	GTG	2	6	602349	602354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593094
16086	NC_009380	TCG	2	6	602509	602514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16087	NC_009380	CGC	2	6	602521	602526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593094
16088	NC_009380	CGG	2	6	602530	602535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
16089	NC_009380	GCC	2	6	602606	602611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593094
16090	NC_009380	TGG	2	6	602704	602709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593094
16091	NC_009380	GTA	2	6	602732	602737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593094
16092	NC_009380	ACCCG	2	10	602741	602750	20 %	0 %	20 %	60 %	145593094
16093	NC_009380	TGC	2	6	602845	602850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593094
16094	NC_009380	CGG	2	6	602902	602907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593094
16095	NC_009380	C	6	6	602930	602935	0 %	0 %	0 %	100 %	145593095
16096	NC_009380	AG	3	6	603026	603031	50 %	0 %	50 %	0 %	145593095
16097	NC_009380	CGAGG	2	10	603125	603134	20 %	0 %	60 %	20 %	145593095
16098	NC_009380	CAG	2	6	603237	603242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593095
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16101	NC_009380	CGC	2	6	603340	603345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593095
16102	NC_009380	GCA	2	6	603405	603410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593095
16103	NC_009380	ACG	2	6	603431	603436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593095
16104	NC_009380	ACGCC	2	10	603450	603459	20 %	0 %	20 %	60 %	145593095
16105	NC_009380	CCG	2	6	603515	603520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593095
16106	NC_009380	GCTG	2	8	603561	603568	0 %	25 %	50 %	25 %	145593095
16107	NC_009380	GTC	2	6	603592	603597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593095
16108	NC_009380	CGT	2	6	603712	603717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593096
16109	NC_009380	CCG	2	6	603753	603758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593096
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16111	NC_009380	GC	3	6	603923	603928	0 %	0 %	50 %	50 %	145593096
16112	NC_009380	CGCGC	2	10	603963	603972	0 %	0 %	40 %	60 %	145593096
16113	NC_009380	CGG	2	6	603996	604001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593096
16114	NC_009380	CCA	2	6	604126	604131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593096
16115	NC_009380	ATC	2	6	604150	604155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593096
16116	NC_009380	TCC	2	6	604166	604171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593096
16117	NC_009380	GTC	2	6	604252	604257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593096
16118	NC_009380	TCG	2	6	604288	604293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593096
16119	NC_009380	ATC	2	6	604331	604336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593096
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16121	NC_009380	GCC	2	6	604421	604426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593096
16122	NC_009380	CTC	2	6	604477	604482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593096
16123	NC_009380	CCTG	2	8	604509	604516	0 %	25 %	25 %	50 %	145593096
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16195	NC_009380	GCG	2	6	607893	607898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593098
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16209	NC_009380	CAA	2	6	608521	608526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593098
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16222	NC_009380	GGTC	2	8	609190	609197	0 %	25 %	50 %	25 %	145593098
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16225	NC_009380	GTG	2	6	609251	609256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16226	NC_009380	GGT	2	6	609296	609301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16227	NC_009380	GC	3	6	609326	609331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16228	NC_009380	C	7	7	609403	609409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16229	NC_009380	GTC	2	6	609642	609647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593099
16230	NC_009380	GCC	2	6	609673	609678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593099
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16234	NC_009380	CG	3	6	609873	609878	0 %	0 %	50 %	50 %	145593099
16235	NC_009380	GTC	2	6	609882	609887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593099
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16239	NC_009380	GGC	2	6	609962	609967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593099
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16482	NC_009380	GAC	2	6	622384	622389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16483	NC_009380	CGCGTG	2	12	622571	622582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16484	NC_009380	GTG	2	6	622586	622591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16485	NC_009380	CGTTCC	2	12	622668	622679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16486	NC_009380	CGGC	2	8	622695	622702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16487	NC_009380	G	6	6	622911	622916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16488	NC_009380	CAG	2	6	622924	622929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16489	NC_009380	GC	3	6	622962	622967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16490	NC_009380	CGG	2	6	622993	622998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16491	NC_009380	GGC	2	6	623142	623147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16492	NC_009380	CCG	2	6	623174	623179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16493	NC_009380	GACCGG	2	12	623199	623210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16494	NC_009380	ACG	2	6	623297	623302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16495	NC_009380	CGC	2	6	623307	623312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16496	NC_009380	GTGGG	2	10	623323	623332	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16497	NC_009380	GGC	2	6	623336	623341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16498	NC_009380	GCC	2	6	623360	623365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16499	NC_009380	GAG	2	6	623418	623423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16500	NC_009380	CAC	2	6	623436	623441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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