MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_009380	CGG	2	6	576623	576628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593063
15503	NC_009380	GC	3	6	576684	576689	0 %	0 %	50 %	50 %	145593063
15504	NC_009380	TCG	2	6	576697	576702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593063
15505	NC_009380	CCT	2	6	576709	576714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593063
15506	NC_009380	GGT	2	6	576776	576781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593063
15507	NC_009380	ACC	2	6	576816	576821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593063
15508	NC_009380	CGG	2	6	576833	576838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593063
15509	NC_009380	AAC	2	6	576849	576854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593063
15510	NC_009380	TCG	2	6	576868	576873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593063
15511	NC_009380	GGT	2	6	576893	576898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593063
15512	NC_009380	GGC	2	6	576908	576913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593063
15513	NC_009380	GATG	2	8	577025	577032	25 %	25 %	50 %	0 %	145593063
15514	NC_009380	ACGGGA	2	12	577046	577057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	145593063
15515	NC_009380	GGC	2	6	577063	577068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593063
15516	NC_009380	CGC	2	6	577119	577124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593063
15517	NC_009380	AG	3	6	577149	577154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_009380	AC	3	6	577229	577234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15519	NC_009380	ACCG	2	8	577244	577251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15520	NC_009380	CGG	2	6	577285	577290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_009380	TGA	2	6	577312	577317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_009380	GCCT	2	8	577400	577407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15523	NC_009380	GCG	2	6	577471	577476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_009380	TGA	2	6	577548	577553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593064
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15527	NC_009380	GGC	2	6	577597	577602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593064
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15530	NC_009380	GTT	2	6	577649	577654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593064
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15532	NC_009380	TCT	2	6	577692	577697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593064
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15534	NC_009380	GC	3	6	577750	577755	0 %	0 %	50 %	50 %	145593064
15535	NC_009380	ACG	2	6	577771	577776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593064
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15537	NC_009380	CTT	3	9	577834	577842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593064
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15540	NC_009380	CGAGG	2	10	577914	577923	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15541	NC_009380	GGC	2	6	577981	577986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_009380	TGA	2	6	578022	578027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593065
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15544	NC_009380	GGT	2	6	578065	578070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593065
15545	NC_009380	CGG	2	6	578080	578085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593065
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15552	NC_009380	CGC	2	6	578511	578516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593066
15553	NC_009380	GCGG	2	8	578524	578531	0 %	0 %	75 %	25 %	145593066
15554	NC_009380	ATC	2	6	578627	578632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593066
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15557	NC_009380	GGC	2	6	578737	578742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593066
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15569	NC_009380	CACC	2	8	579127	579134	25 %	0 %	0 %	75 %	145593066
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15581	NC_009380	CCGCC	2	10	579782	579791	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15582	NC_009380	CGGG	2	8	579797	579804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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15601	NC_009380	TCG	2	6	580877	580882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_009380	TGT	2	6	580918	580923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_009380	GCG	2	6	580946	580951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_009380	CGT	2	6	580999	581004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_009380	TATT	2	8	581006	581013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_009380	GTC	3	9	581053	581061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15608	NC_009380	GAAG	2	8	581083	581090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_009380	CCGG	2	8	581147	581154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15610	NC_009380	CG	3	6	581175	581180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15611	NC_009380	GGCC	2	8	581198	581205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15613	NC_009380	GGAC	2	8	581215	581222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15614	NC_009380	TTG	2	6	581275	581280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_009380	CGG	2	6	581360	581365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593068
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15624	NC_009380	CGGG	2	8	581731	581738	0 %	0 %	75 %	25 %	145593068
15625	NC_009380	AGG	2	6	581782	581787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593068
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15640	NC_009380	CGG	2	6	582436	582441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15643	NC_009380	GCA	2	6	582500	582505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15671	NC_009380	CAC	2	6	583448	583453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15672	NC_009380	TCG	2	6	583471	583476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15674	NC_009380	GAC	2	6	583605	583610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15727	NC_009380	G	6	6	585941	585946	0 %	0 %	100 %	0 %	145593073
15728	NC_009380	CTGCC	2	10	585952	585961	0 %	20 %	20 %	60 %	145593073
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15990	NC_009380	CGC	2	6	597713	597718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593089
15991	NC_009380	GCC	2	6	597744	597749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593089
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