MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009380	GGA	2	6	502404	502409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593004
13502	NC_009380	AGC	2	6	502427	502432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593004
13503	NC_009380	CAC	2	6	502525	502530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_009380	GCG	2	6	502563	502568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_009380	GCG	2	6	502573	502578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_009380	ATC	2	6	502592	502597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_009380	GTGC	2	8	502602	502609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13508	NC_009380	CGC	2	6	502613	502618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_009380	TCGCG	2	10	502645	502654	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13510	NC_009380	CTG	2	6	502679	502684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_009380	CTG	3	9	502694	502702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_009380	CTGC	2	8	502733	502740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13513	NC_009380	ACCG	2	8	502760	502767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_009380	CGAC	2	8	502815	502822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13515	NC_009380	CGGG	2	8	502834	502841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13516	NC_009380	GGC	2	6	502865	502870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_009380	GGC	2	6	502888	502893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_009380	GGTGCC	2	12	502979	502990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145593005
13519	NC_009380	TCT	2	6	503018	503023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593005
13520	NC_009380	CGG	2	6	503029	503034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593005
13521	NC_009380	GTG	2	6	503046	503051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593005
13522	NC_009380	CGG	2	6	503079	503084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593005
13523	NC_009380	GCTC	2	8	503125	503132	0 %	25 %	25 %	50 %	145593005
13524	NC_009380	GAG	2	6	503166	503171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593005
13525	NC_009380	CG	3	6	503180	503185	0 %	0 %	50 %	50 %	145593005
13526	NC_009380	TCG	2	6	503239	503244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593005
13527	NC_009380	CTGG	2	8	503246	503253	0 %	25 %	50 %	25 %	145593005
13528	NC_009380	GTG	2	6	503274	503279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593005
13529	NC_009380	GCT	2	6	503310	503315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593005
13530	NC_009380	GCC	2	6	503316	503321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593005
13531	NC_009380	TGG	2	6	503323	503328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593005
13532	NC_009380	CCG	3	9	503329	503337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593005
13533	NC_009380	GGC	2	6	503373	503378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593005
13534	NC_009380	CCGGC	2	10	503392	503401	0 %	0 %	40 %	60 %	145593005
13535	NC_009380	CCT	2	6	503426	503431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593005
13536	NC_009380	G	6	6	503438	503443	0 %	0 %	100 %	0 %	145593005
13537	NC_009380	CGA	2	6	503447	503452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593005
13538	NC_009380	GTC	2	6	503514	503519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593005
13539	NC_009380	GAG	2	6	503541	503546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593005
13540	NC_009380	CGG	2	6	503575	503580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593005
13541	NC_009380	AGG	2	6	503696	503701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_009380	GAA	2	6	503709	503714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593006
13543	NC_009380	CCAGG	2	10	503724	503733	20 %	0 %	40 %	40 %	145593006
13544	NC_009380	CGG	2	6	503808	503813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593006
13545	NC_009380	ATG	2	6	503848	503853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593006
13546	NC_009380	GCGACC	2	12	503873	503884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145593006
13547	NC_009380	GGCC	2	8	503949	503956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13548	NC_009380	CGC	2	6	504036	504041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13549	NC_009380	GGA	2	6	504059	504064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593007
13550	NC_009380	CCA	2	6	504086	504091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593007
13551	NC_009380	C	6	6	504106	504111	0 %	0 %	0 %	100 %	145593007
13552	NC_009380	CG	3	6	504171	504176	0 %	0 %	50 %	50 %	145593007
13553	NC_009380	TGG	2	6	504214	504219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593007
13554	NC_009380	CGT	2	6	504237	504242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593007
13555	NC_009380	GGT	2	6	504255	504260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593007
13556	NC_009380	GTG	2	6	504331	504336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593007
13557	NC_009380	GCC	2	6	504341	504346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13558	NC_009380	GA	3	6	504385	504390	50 %	0 %	50 %	0 %	145593007
13559	NC_009380	CGC	2	6	504402	504407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13560	NC_009380	AGT	2	6	504416	504421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593007
13561	NC_009380	GTTGG	2	10	504426	504435	0 %	40 %	60 %	0 %	145593007
13562	NC_009380	GTC	2	6	504471	504476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593007
13563	NC_009380	GCC	2	6	504487	504492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13564	NC_009380	TGG	2	6	504521	504526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593007
13565	NC_009380	GGC	2	6	504528	504533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593007
13566	NC_009380	CCG	2	6	504568	504573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13567	NC_009380	CAG	2	6	504579	504584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593007
13568	NC_009380	GA	3	6	504595	504600	50 %	0 %	50 %	0 %	145593007
13569	NC_009380	CCG	2	6	504601	504606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593007
13570	NC_009380	CAC	2	6	504672	504677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13571	NC_009380	GCG	2	6	504678	504683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13572	NC_009380	ACGG	2	8	504692	504699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13573	NC_009380	GGC	2	6	504792	504797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_009380	TGT	2	6	504969	504974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593008
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13577	NC_009380	CGG	2	6	505049	505054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593008
13578	NC_009380	CGC	2	6	505057	505062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593008
13579	NC_009380	CCA	2	6	505081	505086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593008
13580	NC_009380	CCG	2	6	505096	505101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593008
13581	NC_009380	GCA	2	6	505120	505125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593008
13582	NC_009380	GTT	2	6	505146	505151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593008
13583	NC_009380	TGG	2	6	505293	505298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593008
13584	NC_009380	TGCGG	2	10	505316	505325	0 %	20 %	60 %	20 %	145593008
13585	NC_009380	GGC	2	6	505330	505335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593008
13586	NC_009380	GGT	2	6	505384	505389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593008
13587	NC_009380	TGC	2	6	505398	505403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593008
13588	NC_009380	GCGT	2	8	505407	505414	0 %	25 %	50 %	25 %	145593008
13589	NC_009380	GCC	2	6	505424	505429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593008
13590	NC_009380	TGC	2	6	505485	505490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593008
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13592	NC_009380	GCC	2	6	505514	505519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593008
13593	NC_009380	GCC	2	6	505523	505528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593008
13594	NC_009380	GCG	2	6	505604	505609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593008
13595	NC_009380	CGC	2	6	505641	505646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13596	NC_009380	GAC	2	6	505685	505690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_009380	ACGTGG	2	12	505755	505766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145593009
13598	NC_009380	GTA	2	6	505841	505846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593009
13599	NC_009380	GTT	2	6	505889	505894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593009
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13602	NC_009380	GCC	2	6	506075	506080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593009
13603	NC_009380	GGT	2	6	506081	506086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593009
13604	NC_009380	GCC	2	6	506180	506185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593009
13605	NC_009380	CGA	2	6	506203	506208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593009
13606	NC_009380	TTGC	2	8	506267	506274	0 %	50 %	25 %	25 %	145593009
13607	NC_009380	TCG	2	6	506283	506288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593009
13608	NC_009380	CCCGT	2	10	506440	506449	0 %	20 %	20 %	60 %	145593009
13609	NC_009380	G	6	6	506482	506487	0 %	0 %	100 %	0 %	145593009
13610	NC_009380	GTC	2	6	506501	506506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593009
13611	NC_009380	GGC	2	6	506534	506539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593009
13612	NC_009380	CTC	2	6	506627	506632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593009
13613	NC_009380	G	7	7	506652	506658	0 %	0 %	100 %	0 %	145593009
13614	NC_009380	CCA	2	6	506719	506724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593009
13615	NC_009380	GCG	2	6	506738	506743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593009
13616	NC_009380	CCG	2	6	506777	506782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593009
13617	NC_009380	GGGCTG	2	12	506798	506809	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145593009
13618	NC_009380	CTCGC	2	10	506859	506868	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13619	NC_009380	GTG	2	6	506878	506883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_009380	GC	3	6	506901	506906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13621	NC_009380	CGG	2	6	506910	506915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_009380	CCG	2	6	507026	507031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13743	NC_009380	CTG	2	6	511022	511027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593014
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13982	NC_009380	GCT	2	6	518676	518681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593022
13983	NC_009380	TGC	2	6	518690	518695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593022
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