MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
137001	NC_009380	CGA	2	6	5120834	5120839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597042
137002	NC_009380	AC	3	6	5120841	5120846	50 %	0 %	0 %	50 %	145597042
137003	NC_009380	CGC	2	6	5120868	5120873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597042
137004	NC_009380	CCCCG	2	10	5120882	5120891	0 %	0 %	20 %	80 %	145597042
137005	NC_009380	CAG	2	6	5120910	5120915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597042
137006	NC_009380	AGC	2	6	5120938	5120943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597042
137007	NC_009380	CGG	2	6	5120951	5120956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597042
137008	NC_009380	GAG	2	6	5120958	5120963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597042
137009	NC_009380	CGG	2	6	5120981	5120986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597042
137010	NC_009380	GCG	2	6	5121013	5121018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597042
137011	NC_009380	C	6	6	5121024	5121029	0 %	0 %	0 %	100 %	145597042
137012	NC_009380	CGG	2	6	5121033	5121038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597042
137013	NC_009380	CCA	2	6	5121086	5121091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597042
137014	NC_009380	GCG	2	6	5121103	5121108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597042
137015	NC_009380	ACCG	2	8	5121150	5121157	25 %	0 %	25 %	50 %	145597042
137016	NC_009380	GGCT	2	8	5121162	5121169	0 %	25 %	50 %	25 %	145597042
137017	NC_009380	CAC	2	6	5121210	5121215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597042
137018	NC_009380	CGC	2	6	5121216	5121221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597042
137019	NC_009380	CCG	2	6	5121293	5121298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597042
137020	NC_009380	GCCG	2	8	5121313	5121320	0 %	0 %	50 %	50 %	145597042
137021	NC_009380	CCG	2	6	5121334	5121339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137022	NC_009380	CCG	2	6	5121343	5121348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137023	NC_009380	CGGC	2	8	5121381	5121388	0 %	0 %	50 %	50 %	145597043
137024	NC_009380	CAC	2	6	5121414	5121419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597043
137025	NC_009380	GTC	2	6	5121430	5121435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597043
137026	NC_009380	CAC	2	6	5121436	5121441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597043
137027	NC_009380	CCG	2	6	5121492	5121497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137028	NC_009380	CAG	2	6	5121535	5121540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597043
137029	NC_009380	GCG	2	6	5121551	5121556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597043
137030	NC_009380	CGG	2	6	5121575	5121580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597043
137031	NC_009380	CCCG	2	8	5121612	5121619	0 %	0 %	25 %	75 %	145597043
137032	NC_009380	GGTC	2	8	5121654	5121661	0 %	25 %	50 %	25 %	145597043
137033	NC_009380	AGC	2	6	5121662	5121667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597043
137034	NC_009380	TCG	2	6	5121692	5121697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597043
137035	NC_009380	CGC	2	6	5121751	5121756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137036	NC_009380	ACCG	2	8	5121761	5121768	25 %	0 %	25 %	50 %	145597043
137037	NC_009380	CCCG	2	8	5121769	5121776	0 %	0 %	25 %	75 %	145597043
137038	NC_009380	GCC	2	6	5121819	5121824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137039	NC_009380	CCGC	2	8	5121825	5121832	0 %	0 %	25 %	75 %	145597043
137040	NC_009380	CGC	2	6	5121842	5121847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137041	NC_009380	GCTC	2	8	5121854	5121861	0 %	25 %	25 %	50 %	145597043
137042	NC_009380	CGAC	2	8	5121870	5121877	25 %	0 %	25 %	50 %	145597043
137043	NC_009380	GCC	2	6	5121896	5121901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137044	NC_009380	CGG	3	9	5121936	5121944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597043
137045	NC_009380	CG	3	6	5122141	5122146	0 %	0 %	50 %	50 %	145597043
137046	NC_009380	GCT	2	6	5122155	5122160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597043
137047	NC_009380	GCC	2	6	5122172	5122177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137048	NC_009380	GCCC	2	8	5122200	5122207	0 %	0 %	25 %	75 %	145597043
137049	NC_009380	CGG	2	6	5122233	5122238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597043
137050	NC_009380	CG	3	6	5122283	5122288	0 %	0 %	50 %	50 %	145597043
137051	NC_009380	CCA	2	6	5122317	5122322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597043
137052	NC_009380	CCG	2	6	5122335	5122340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597043
137053	NC_009380	CGG	2	6	5122365	5122370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597043
137054	NC_009380	ACC	2	6	5122451	5122456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597043
137055	NC_009380	TCCA	2	8	5122482	5122489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137056	NC_009380	CGGC	2	8	5122544	5122551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137057	NC_009380	CCAC	2	8	5122552	5122559	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137058	NC_009380	CCA	2	6	5122626	5122631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597044
137059	NC_009380	CGG	2	6	5122656	5122661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597044
137060	NC_009380	CGA	2	6	5122692	5122697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137061	NC_009380	CTT	2	6	5122758	5122763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597044
137062	NC_009380	GGC	2	6	5122773	5122778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597044
137063	NC_009380	AGG	2	6	5122796	5122801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597044
137064	NC_009380	CTG	2	6	5122846	5122851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137065	NC_009380	CCCGA	2	10	5122879	5122888	20 %	0 %	20 %	60 %	145597044
137066	NC_009380	CGG	2	6	5122985	5122990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597044
137067	NC_009380	ACA	2	6	5122991	5122996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597044
137068	NC_009380	GGT	2	6	5123021	5123026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597044
137069	NC_009380	TCG	2	6	5123027	5123032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137070	NC_009380	GCT	2	6	5123040	5123045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137071	NC_009380	GTCG	2	8	5123061	5123068	0 %	25 %	50 %	25 %	145597044
137072	NC_009380	GC	3	6	5123075	5123080	0 %	0 %	50 %	50 %	145597044
137073	NC_009380	GCC	3	9	5123125	5123133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597044
137074	NC_009380	CGG	2	6	5123136	5123141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597044
137075	NC_009380	CGA	2	6	5123142	5123147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137076	NC_009380	CCG	2	6	5123149	5123154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597044
137077	NC_009380	ACG	2	6	5123201	5123206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137078	NC_009380	CTGG	2	8	5123214	5123221	0 %	25 %	50 %	25 %	145597044
137079	NC_009380	GCA	2	6	5123230	5123235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137080	NC_009380	GACC	2	8	5123253	5123260	25 %	0 %	25 %	50 %	145597044
137081	NC_009380	GCACC	2	10	5123287	5123296	20 %	0 %	20 %	60 %	145597044
137082	NC_009380	ACG	2	6	5123321	5123326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597044
137083	NC_009380	GC	3	6	5123465	5123470	0 %	0 %	50 %	50 %	145597044
137084	NC_009380	CGAC	2	8	5123495	5123502	25 %	0 %	25 %	50 %	145597044
137085	NC_009380	CGG	2	6	5123598	5123603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
137086	NC_009380	CTC	2	6	5123633	5123638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597045
137087	NC_009380	GAC	3	9	5123639	5123647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137088	NC_009380	GCG	2	6	5123677	5123682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
137089	NC_009380	GGT	2	6	5123711	5123716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597045
137090	NC_009380	CCGGC	2	10	5123728	5123737	0 %	0 %	40 %	60 %	145597045
137091	NC_009380	TCG	2	6	5123748	5123753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137092	NC_009380	CGG	2	6	5123754	5123759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
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137094	NC_009380	ACC	2	6	5123795	5123800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597045
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137096	NC_009380	CGA	2	6	5123909	5123914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137097	NC_009380	GCG	2	6	5124000	5124005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
137098	NC_009380	ACGAGG	2	12	5124009	5124020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	145597045
137099	NC_009380	GCT	2	6	5124028	5124033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137100	NC_009380	CCG	2	6	5124126	5124131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597045
137101	NC_009380	TGC	2	6	5124147	5124152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137102	NC_009380	AC	3	6	5124160	5124165	50 %	0 %	0 %	50 %	145597045
137103	NC_009380	CGGGG	2	10	5124188	5124197	0 %	0 %	80 %	20 %	145597045
137104	NC_009380	CGG	2	6	5124201	5124206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
137105	NC_009380	CTGG	2	8	5124211	5124218	0 %	25 %	50 %	25 %	145597045
137106	NC_009380	CGG	2	6	5124223	5124228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597045
137107	NC_009380	CCCGG	2	10	5124229	5124238	0 %	0 %	40 %	60 %	145597045
137108	NC_009380	CAC	2	6	5124298	5124303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597045
137109	NC_009380	CGA	4	12	5124376	5124387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137110	NC_009380	CGCC	2	8	5124391	5124398	0 %	0 %	25 %	75 %	145597045
137111	NC_009380	CGA	2	6	5124442	5124447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597045
137112	NC_009380	CGAT	2	8	5124470	5124477	25 %	25 %	25 %	25 %	145597045
137113	NC_009380	CAA	2	6	5124517	5124522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597046
137114	NC_009380	CGA	2	6	5124524	5124529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597046
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137116	NC_009380	GCCG	2	8	5124591	5124598	0 %	0 %	50 %	50 %	145597046
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137231	NC_009380	TCG	2	6	5128638	5128643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597048
137232	NC_009380	GGT	2	6	5128792	5128797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597048
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137330	NC_009380	AGC	2	6	5132181	5132186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597052
137331	NC_009380	CGA	2	6	5132194	5132199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597052
137332	NC_009380	CCA	2	6	5132218	5132223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597052
137333	NC_009380	CGG	2	6	5132282	5132287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597052
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137335	NC_009380	CGA	2	6	5132328	5132333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597052
137336	NC_009380	GTC	2	6	5132376	5132381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137337	NC_009380	GAC	2	6	5132488	5132493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137338	NC_009380	TGAC	2	8	5132509	5132516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137339	NC_009380	CGC	2	6	5132590	5132595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597053
137340	NC_009380	CGC	2	6	5132614	5132619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597053
137341	NC_009380	GACC	2	8	5132629	5132636	25 %	0 %	25 %	50 %	145597053
137342	NC_009380	CTG	2	6	5132648	5132653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597053
137343	NC_009380	CGA	2	6	5132654	5132659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597053
137344	NC_009380	CACCGA	2	12	5132677	5132688	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145597053
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137346	NC_009380	GAC	2	6	5132748	5132753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597053
137347	NC_009380	CGG	2	6	5132763	5132768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597053
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