MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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129002	NC_009380	CAC	2	6	4829245	4829250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596769
129003	NC_009380	CAG	2	6	4829279	4829284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596770
129004	NC_009380	CGGG	2	8	4829309	4829316	0 %	0 %	75 %	25 %	145596770
129005	NC_009380	ACC	2	6	4829352	4829357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596770
129006	NC_009380	TCG	2	6	4829388	4829393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596770
129007	NC_009380	GTCG	2	8	4829402	4829409	0 %	25 %	50 %	25 %	145596770
129008	NC_009380	CGG	2	6	4829410	4829415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
129009	NC_009380	C	6	6	4829434	4829439	0 %	0 %	0 %	100 %	145596770
129010	NC_009380	GCG	2	6	4829452	4829457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
129011	NC_009380	CCGC	2	8	4829464	4829471	0 %	0 %	25 %	75 %	145596770
129012	NC_009380	ACC	2	6	4829535	4829540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596770
129013	NC_009380	CGT	2	6	4829560	4829565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596770
129014	NC_009380	GACCG	3	15	4829566	4829580	20 %	0 %	40 %	40 %	145596770
129015	NC_009380	CGGG	2	8	4829605	4829612	0 %	0 %	75 %	25 %	145596770
129016	NC_009380	CGT	2	6	4829629	4829634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596770
129017	NC_009380	CGG	2	6	4829656	4829661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
129018	NC_009380	AGCG	2	8	4829669	4829676	25 %	0 %	50 %	25 %	145596770
129019	NC_009380	CGG	2	6	4829677	4829682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
129020	NC_009380	CGC	2	6	4829704	4829709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596770
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129023	NC_009380	CCA	3	9	4829782	4829790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596770
129024	NC_009380	CGG	3	9	4829806	4829814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
129025	NC_009380	CGG	2	6	4829820	4829825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596770
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129028	NC_009380	CG	3	6	4829935	4829940	0 %	0 %	50 %	50 %	145596770
129029	NC_009380	GAT	2	6	4829972	4829977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596770
129030	NC_009380	AGC	2	6	4830041	4830046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596771
129031	NC_009380	CGA	2	6	4830093	4830098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596771
129032	NC_009380	CGCTCC	2	12	4830149	4830160	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145596771
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129035	NC_009380	TGA	2	6	4830420	4830425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596771
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129038	NC_009380	TTC	2	6	4830606	4830611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129039	NC_009380	TAA	2	6	4830637	4830642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129040	NC_009380	TGC	2	6	4830664	4830669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129041	NC_009380	CGC	2	6	4830835	4830840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596772
129042	NC_009380	GAC	3	9	4830842	4830850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596772
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129050	NC_009380	TGG	2	6	4830999	4831004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596772
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129052	NC_009380	TGG	2	6	4831137	4831142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596772
129053	NC_009380	CTG	2	6	4831172	4831177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596772
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129064	NC_009380	CTCCA	2	10	4831445	4831454	20 %	20 %	0 %	60 %	145596772
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129115	NC_009380	CGC	2	6	4833076	4833081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
129116	NC_009380	CG	3	6	4833083	4833088	0 %	0 %	50 %	50 %	145596774
129117	NC_009380	CCAG	2	8	4833120	4833127	25 %	0 %	25 %	50 %	145596774
129118	NC_009380	CGA	2	6	4833144	4833149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596774
129119	NC_009380	AGCC	2	8	4833154	4833161	25 %	0 %	25 %	50 %	145596774
129120	NC_009380	CGC	2	6	4833168	4833173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
129121	NC_009380	AGC	2	6	4833176	4833181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596774
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129123	NC_009380	CCG	2	6	4833279	4833284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
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129130	NC_009380	CGC	2	6	4833517	4833522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
129131	NC_009380	GCC	2	6	4833685	4833690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
129132	NC_009380	GTC	2	6	4833745	4833750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596774
129133	NC_009380	GCC	2	6	4833782	4833787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596774
129134	NC_009380	GCG	2	6	4833791	4833796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596774
129135	NC_009380	CGG	2	6	4833812	4833817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596774
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129138	NC_009380	TCCG	2	8	4833865	4833872	0 %	25 %	25 %	50 %	145596775
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129141	NC_009380	GCCA	2	8	4833976	4833983	25 %	0 %	25 %	50 %	145596775
129142	NC_009380	CGG	2	6	4834052	4834057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596775
129143	NC_009380	GC	3	6	4834061	4834066	0 %	0 %	50 %	50 %	145596775
129144	NC_009380	AAC	2	6	4834078	4834083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596775
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129148	NC_009380	GGC	2	6	4834205	4834210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596775
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129151	NC_009380	CCA	2	6	4834268	4834273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596775
129152	NC_009380	CGG	2	6	4834301	4834306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596775
129153	NC_009380	ACC	2	6	4834321	4834326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596775
129154	NC_009380	CGG	2	6	4834340	4834345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596775
129155	NC_009380	GAG	2	6	4834416	4834421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596775
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129166	NC_009380	CG	3	6	4834742	4834747	0 %	0 %	50 %	50 %	145596776
129167	NC_009380	GGT	2	6	4834757	4834762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596776
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129170	NC_009380	G	6	6	4834831	4834836	0 %	0 %	100 %	0 %	145596776
129171	NC_009380	CCGG	2	8	4834844	4834851	0 %	0 %	50 %	50 %	145596776
129172	NC_009380	GGT	2	6	4834856	4834861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596776
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129182	NC_009380	CTGG	2	8	4835216	4835223	0 %	25 %	50 %	25 %	145596776
129183	NC_009380	CCG	2	6	4835227	4835232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129184	NC_009380	CTC	2	6	4835238	4835243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596776
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129186	NC_009380	CGA	3	9	4835282	4835290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596776
129187	NC_009380	GCGG	2	8	4835331	4835338	0 %	0 %	75 %	25 %	145596776
129188	NC_009380	CCG	2	6	4835347	4835352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129189	NC_009380	CGC	2	6	4835369	4835374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129190	NC_009380	GCC	2	6	4835396	4835401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129191	NC_009380	CCG	2	6	4835406	4835411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129192	NC_009380	ACC	2	6	4835453	4835458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596776
129193	NC_009380	GCG	2	6	4835470	4835475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596776
129194	NC_009380	GCC	2	6	4835511	4835516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596776
129195	NC_009380	GAG	2	6	4835710	4835715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129196	NC_009380	CCG	2	6	4835829	4835834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596777
129197	NC_009380	ACCGT	2	10	4835837	4835846	20 %	20 %	20 %	40 %	145596777
129198	NC_009380	CTG	2	6	4835900	4835905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596777
129199	NC_009380	CGA	2	6	4835941	4835946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596777
129200	NC_009380	CAC	2	6	4836004	4836009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596777
129201	NC_009380	CGT	2	6	4836025	4836030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596777
129202	NC_009380	CGG	2	6	4836066	4836071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596777
129203	NC_009380	CCCA	2	8	4836077	4836084	25 %	0 %	0 %	75 %	145596777
129204	NC_009380	CGG	2	6	4836132	4836137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596777
129205	NC_009380	TGC	2	6	4836204	4836209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596777
129206	NC_009380	GGT	2	6	4836272	4836277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596777
129207	NC_009380	ATC	2	6	4836341	4836346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596777
129208	NC_009380	GAG	2	6	4836365	4836370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596777
129209	NC_009380	GGA	2	6	4836373	4836378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596777
129210	NC_009380	CGG	2	6	4836385	4836390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596777
129211	NC_009380	ACC	2	6	4836444	4836449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596778
129212	NC_009380	TCC	2	6	4836456	4836461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596778
129213	NC_009380	CGG	2	6	4836476	4836481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596778
129214	NC_009380	CCGCGC	2	12	4836482	4836493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596778
129215	NC_009380	GCCCC	2	10	4836503	4836512	0 %	0 %	20 %	80 %	145596778
129216	NC_009380	GCG	2	6	4836574	4836579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596778
129217	NC_009380	GTC	2	6	4836591	4836596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596778
129218	NC_009380	CCGG	2	8	4836625	4836632	0 %	0 %	50 %	50 %	145596778
129219	NC_009380	CG	3	6	4836662	4836667	0 %	0 %	50 %	50 %	145596778
129220	NC_009380	CCA	2	6	4836676	4836681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596778
129221	NC_009380	GCGCC	2	10	4836685	4836694	0 %	0 %	40 %	60 %	145596778
129222	NC_009380	CG	3	6	4836695	4836700	0 %	0 %	50 %	50 %	145596778
129223	NC_009380	GCCC	2	8	4836702	4836709	0 %	0 %	25 %	75 %	145596778
129224	NC_009380	CGG	2	6	4836740	4836745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596778
129225	NC_009380	GGT	2	6	4836764	4836769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596778
129226	NC_009380	GCA	2	6	4836824	4836829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596778
129227	NC_009380	GCC	2	6	4836834	4836839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596778
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129456	NC_009380	CG	3	6	4845726	4845731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129457	NC_009380	AGC	2	6	4845833	4845838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596786
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129460	NC_009380	TCG	2	6	4845905	4845910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596786
129461	NC_009380	TCG	3	9	4845923	4845931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596786
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129465	NC_009380	CCA	2	6	4845987	4845992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596786
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129480	NC_009380	GCA	2	6	4846647	4846652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596786
129481	NC_009380	CCT	2	6	4846788	4846793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596786
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129485	NC_009380	GC	3	6	4846959	4846964	0 %	0 %	50 %	50 %	145596786
129486	NC_009380	GCCGTC	2	12	4847002	4847013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145596786
129487	NC_009380	CCCG	2	8	4847061	4847068	0 %	0 %	25 %	75 %	145596786
129488	NC_009380	CGG	2	6	4847210	4847215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596786
129489	NC_009380	GTC	2	6	4847236	4847241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596786
129490	NC_009380	GCCG	2	8	4847358	4847365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129491	NC_009380	CGT	2	6	4847390	4847395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129492	NC_009380	G	6	6	4847397	4847402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129493	NC_009380	ACC	2	6	4847451	4847456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129494	NC_009380	ATC	2	6	4847528	4847533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596787
129495	NC_009380	GTG	2	6	4847539	4847544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596787
129496	NC_009380	TCA	2	6	4847565	4847570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596787
129497	NC_009380	C	6	6	4847584	4847589	0 %	0 %	0 %	100 %	145596787
129498	NC_009380	CTC	2	6	4847620	4847625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596787
129499	NC_009380	CGATC	2	10	4847640	4847649	20 %	20 %	20 %	40 %	145596787
129500	NC_009380	GCG	2	6	4847753	4847758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596787

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