MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124501	NC_009380	CCA	2	6	4659758	4659763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596610
124502	NC_009380	GAAC	2	8	4659779	4659786	50 %	0 %	25 %	25 %	145596610
124503	NC_009380	CTT	2	6	4659803	4659808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596610
124504	NC_009380	TCAA	2	8	4659831	4659838	50 %	25 %	0 %	25 %	145596610
124505	NC_009380	GCG	2	6	4659873	4659878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596610
124506	NC_009380	TCGGC	2	10	4659880	4659889	0 %	20 %	40 %	40 %	145596610
124507	NC_009380	CTG	2	6	4659893	4659898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596610
124508	NC_009380	GC	3	6	4659900	4659905	0 %	0 %	50 %	50 %	145596610
124509	NC_009380	ACG	2	6	4659921	4659926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596610
124510	NC_009380	GCG	2	6	4659957	4659962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596610
124511	NC_009380	GCC	2	6	4660009	4660014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596610
124512	NC_009380	GCA	2	6	4660054	4660059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596610
124513	NC_009380	GCTGCC	2	12	4660108	4660119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145596611
124514	NC_009380	CAT	2	6	4660157	4660162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596611
124515	NC_009380	CGC	2	6	4660167	4660172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596611
124516	NC_009380	CGG	2	6	4660200	4660205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124517	NC_009380	GCCG	2	8	4660215	4660222	0 %	0 %	50 %	50 %	145596611
124518	NC_009380	GAA	2	6	4660236	4660241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596611
124519	NC_009380	CTG	2	6	4660260	4660265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124520	NC_009380	CGTCGG	2	12	4660292	4660303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145596611
124521	NC_009380	CGG	2	6	4660328	4660333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124522	NC_009380	CGG	2	6	4660358	4660363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124523	NC_009380	ACG	2	6	4660390	4660395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124524	NC_009380	CGG	2	6	4660457	4660462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124525	NC_009380	GACCG	2	10	4660503	4660512	20 %	0 %	40 %	40 %	145596611
124526	NC_009380	CGCC	2	8	4660543	4660550	0 %	0 %	25 %	75 %	145596611
124527	NC_009380	GGC	3	9	4660554	4660562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124528	NC_009380	C	6	6	4660573	4660578	0 %	0 %	0 %	100 %	145596611
124529	NC_009380	CGG	2	6	4660604	4660609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124530	NC_009380	CAA	2	6	4660677	4660682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596611
124531	NC_009380	CGG	2	6	4660703	4660708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124532	NC_009380	CGG	3	9	4660757	4660765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124533	NC_009380	CGG	2	6	4660799	4660804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124534	NC_009380	CGG	2	6	4660820	4660825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124535	NC_009380	GCA	2	6	4660841	4660846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124536	NC_009380	GCC	2	6	4660861	4660866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596611
124537	NC_009380	CGG	3	9	4660919	4660927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596611
124538	NC_009380	AGC	2	6	4660955	4660960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124539	NC_009380	TGA	2	6	4660970	4660975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596611
124540	NC_009380	GC	3	6	4661066	4661071	0 %	0 %	50 %	50 %	145596611
124541	NC_009380	CGA	2	6	4661075	4661080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124542	NC_009380	AGCGC	2	10	4661147	4661156	20 %	0 %	40 %	40 %	145596611
124543	NC_009380	CCA	2	6	4661159	4661164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596611
124544	NC_009380	GCC	2	6	4661225	4661230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596611
124545	NC_009380	CGT	2	6	4661237	4661242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596611
124546	NC_009380	C	6	6	4661258	4661263	0 %	0 %	0 %	100 %	145596611
124547	NC_009380	CG	3	6	4661301	4661306	0 %	0 %	50 %	50 %	145596611
124548	NC_009380	CCG	2	6	4661323	4661328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596611
124549	NC_009380	CGGCG	2	10	4661370	4661379	0 %	0 %	60 %	40 %	145596611
124550	NC_009380	GCC	2	6	4661424	4661429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124551	NC_009380	GTCAGC	2	12	4661435	4661446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124552	NC_009380	GGCA	2	8	4661456	4661463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124553	NC_009380	GCG	2	6	4661525	4661530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124554	NC_009380	GGGT	2	8	4661554	4661561	0 %	25 %	75 %	0 %	145596612
124555	NC_009380	GTT	2	6	4661604	4661609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145596612
124556	NC_009380	TCGCC	2	10	4661612	4661621	0 %	20 %	20 %	60 %	145596612
124557	NC_009380	GGCG	2	8	4661711	4661718	0 %	0 %	75 %	25 %	145596612
124558	NC_009380	CTG	2	6	4661790	4661795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596612
124559	NC_009380	TGA	2	6	4661860	4661865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596612
124560	NC_009380	CGA	2	6	4661870	4661875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596612
124561	NC_009380	CAG	2	6	4661913	4661918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596613
124562	NC_009380	CG	3	6	4661925	4661930	0 %	0 %	50 %	50 %	145596613
124563	NC_009380	CCG	3	9	4661936	4661944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596613
124564	NC_009380	GGTC	2	8	4661945	4661952	0 %	25 %	50 %	25 %	145596613
124565	NC_009380	CAG	2	6	4661994	4661999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596613
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124567	NC_009380	CGA	2	6	4662071	4662076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596613
124568	NC_009380	GCA	2	6	4662095	4662100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596613
124569	NC_009380	GGT	2	6	4662125	4662130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596613
124570	NC_009380	CGG	2	6	4662140	4662145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596613
124571	NC_009380	GAT	2	6	4662195	4662200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596613
124572	NC_009380	GTTC	2	8	4662214	4662221	0 %	50 %	25 %	25 %	145596613
124573	NC_009380	CGC	2	6	4662223	4662228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596613
124574	NC_009380	GTC	2	6	4662297	4662302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596613
124575	NC_009380	GCC	2	6	4662322	4662327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596613
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124581	NC_009380	CGT	2	6	4662632	4662637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124582	NC_009380	CATC	2	8	4662667	4662674	25 %	25 %	0 %	50 %	145596614
124583	NC_009380	CAG	2	6	4662704	4662709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124584	NC_009380	CGT	3	9	4662796	4662804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124585	NC_009380	GTCGCC	2	12	4662840	4662851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145596614
124586	NC_009380	CGG	2	6	4662853	4662858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596614
124587	NC_009380	TGG	2	6	4662859	4662864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596614
124588	NC_009380	GCA	2	6	4662865	4662870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124589	NC_009380	CGA	2	6	4662893	4662898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124590	NC_009380	CGGG	2	8	4662912	4662919	0 %	0 %	75 %	25 %	145596614
124591	NC_009380	GAAG	2	8	4662967	4662974	50 %	0 %	50 %	0 %	145596614
124592	NC_009380	CGA	2	6	4663004	4663009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
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124594	NC_009380	CAGGCC	2	12	4663058	4663069	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145596614
124595	NC_009380	C	6	6	4663073	4663078	0 %	0 %	0 %	100 %	145596614
124596	NC_009380	GTC	2	6	4663092	4663097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124597	NC_009380	CTG	2	6	4663106	4663111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124598	NC_009380	GTC	2	6	4663139	4663144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124599	NC_009380	ACG	2	6	4663167	4663172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124600	NC_009380	ACC	2	6	4663182	4663187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596614
124601	NC_009380	CG	3	6	4663191	4663196	0 %	0 %	50 %	50 %	145596614
124602	NC_009380	ACCGC	2	10	4663252	4663261	20 %	0 %	20 %	60 %	145596614
124603	NC_009380	CTG	2	6	4663310	4663315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124604	NC_009380	CAG	2	6	4663316	4663321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124605	NC_009380	TCC	2	6	4663389	4663394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596614
124606	NC_009380	CGTC	2	8	4663462	4663469	0 %	25 %	25 %	50 %	145596614
124607	NC_009380	TCG	2	6	4663503	4663508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124608	NC_009380	CAG	2	6	4663598	4663603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124609	NC_009380	CAG	4	12	4663610	4663621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124610	NC_009380	GCG	2	6	4663630	4663635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596614
124611	NC_009380	GCT	2	6	4663696	4663701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124612	NC_009380	TCC	2	6	4663710	4663715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596614
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124614	NC_009380	TCC	2	6	4663794	4663799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596614
124615	NC_009380	CAG	2	6	4663871	4663876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596614
124616	NC_009380	CTC	2	6	4663877	4663882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596614
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124724	NC_009380	TGC	2	6	4667921	4667926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596615
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124955	NC_009380	CGT	2	6	4675292	4675297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596622
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