MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_009380	CTC	2	6	448339	448344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592954
12003	NC_009380	CGC	2	6	448347	448352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12004	NC_009380	CGC	2	6	448371	448376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12005	NC_009380	GCT	2	6	448380	448385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592954
12006	NC_009380	CCG	2	6	448388	448393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12007	NC_009380	CTG	2	6	448405	448410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592954
12008	NC_009380	CAG	2	6	448441	448446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592954
12009	NC_009380	ACG	2	6	448484	448489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592954
12010	NC_009380	GGCA	2	8	448508	448515	25 %	0 %	50 %	25 %	145592954
12011	NC_009380	GT	3	6	448517	448522	0 %	50 %	50 %	0 %	145592954
12012	NC_009380	CCG	2	6	448538	448543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12013	NC_009380	TCG	2	6	448612	448617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592954
12014	NC_009380	GCC	2	6	448627	448632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12015	NC_009380	TCC	2	6	448664	448669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592954
12016	NC_009380	TCC	2	6	448682	448687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592954
12017	NC_009380	CCG	2	6	448688	448693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12018	NC_009380	GCC	2	6	448705	448710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592954
12019	NC_009380	CTG	2	6	448717	448722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592954
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12022	NC_009380	CGG	2	6	448796	448801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592954
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12025	NC_009380	CGA	2	6	448847	448852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592955
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12027	NC_009380	CGG	2	6	448879	448884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592955
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12029	NC_009380	GGCG	2	8	448938	448945	0 %	0 %	75 %	25 %	145592955
12030	NC_009380	CGG	2	6	448969	448974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592955
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12039	NC_009380	CGG	2	6	449311	449316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592955
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12053	NC_009380	GGC	2	6	449783	449788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592955
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12062	NC_009380	CGG	2	6	450268	450273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592955
12063	NC_009380	TCG	2	6	450301	450306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592955
12064	NC_009380	CTG	2	6	450309	450314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592955
12065	NC_009380	GAGG	2	8	450454	450461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12066	NC_009380	AGGTGC	2	12	450466	450477	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145592956
12067	NC_009380	CCGAT	2	10	450495	450504	20 %	20 %	20 %	40 %	145592956
12068	NC_009380	CTG	2	6	450560	450565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592956
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12073	NC_009380	GCT	2	6	450869	450874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592956
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12079	NC_009380	GC	3	6	450980	450985	0 %	0 %	50 %	50 %	145592956
12080	NC_009380	CCGCC	2	10	451000	451009	0 %	0 %	20 %	80 %	145592956
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12082	NC_009380	GTC	2	6	451050	451055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12088	NC_009380	GACC	2	8	451226	451233	25 %	0 %	25 %	50 %	145592957
12089	NC_009380	ACC	2	6	451301	451306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592957
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12092	NC_009380	CGT	2	6	451484	451489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592957
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12101	NC_009380	CAGG	2	8	451814	451821	25 %	0 %	50 %	25 %	145592957
12102	NC_009380	CCA	2	6	451852	451857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592957
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12104	NC_009380	GCT	2	6	451927	451932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592957
12105	NC_009380	G	6	6	451940	451945	0 %	0 %	100 %	0 %	145592957
12106	NC_009380	GGTC	2	8	451978	451985	0 %	25 %	50 %	25 %	145592957
12107	NC_009380	CTC	2	6	452027	452032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592957
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12109	NC_009380	ATCCTC	2	12	452109	452120	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12110	NC_009380	GCGCCG	2	12	452135	452146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12111	NC_009380	CGGC	2	8	452177	452184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12112	NC_009380	GCC	2	6	452237	452242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12113	NC_009380	CAC	2	6	452343	452348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592958
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12115	NC_009380	ACG	2	6	452411	452416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592958
12116	NC_009380	CG	3	6	452422	452427	0 %	0 %	50 %	50 %	145592958
12117	NC_009380	GAC	2	6	452434	452439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592958
12118	NC_009380	CTT	2	6	452457	452462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592958
12119	NC_009380	CT	3	6	452470	452475	0 %	50 %	0 %	50 %	145592958
12120	NC_009380	GCC	2	6	452491	452496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592958
12121	NC_009380	GTG	3	9	452506	452514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592958
12122	NC_009380	GCT	3	9	452544	452552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592958
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12124	NC_009380	GGT	2	6	452592	452597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592958
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12237	NC_009380	CTA	2	6	457254	457259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12239	NC_009380	GCA	2	6	457311	457316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12241	NC_009380	GGT	2	6	457325	457330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_009380	CA	3	6	457388	457393	50 %	0 %	0 %	50 %	145592963
12243	NC_009380	GTC	2	6	457394	457399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592963
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12246	NC_009380	GAT	2	6	457483	457488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592963
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12248	NC_009380	GCCG	3	12	457529	457540	0 %	0 %	50 %	50 %	145592963
12249	NC_009380	TGC	2	6	457578	457583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592963
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12348	NC_009380	CCGCC	2	10	461013	461022	0 %	0 %	20 %	80 %	145592966
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12353	NC_009380	CGGT	2	8	461115	461122	0 %	25 %	50 %	25 %	145592967
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12480	NC_009380	GTC	2	6	464417	464422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12481	NC_009380	ATC	2	6	464441	464446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592970
12482	NC_009380	GGGC	2	8	464455	464462	0 %	0 %	75 %	25 %	145592970
12483	NC_009380	GGC	2	6	464476	464481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592970
12484	NC_009380	GCTCG	2	10	464506	464515	0 %	20 %	40 %	40 %	145592970
12485	NC_009380	TGC	3	9	464517	464525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12486	NC_009380	TGG	2	6	464526	464531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592970
12487	NC_009380	TGG	3	9	464538	464546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592970
12488	NC_009380	CGG	2	6	464562	464567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592970
12489	NC_009380	CGG	2	6	464584	464589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592970
12490	NC_009380	CTG	2	6	464630	464635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12491	NC_009380	CA	3	6	464694	464699	50 %	0 %	0 %	50 %	145592970
12492	NC_009380	TGC	2	6	464739	464744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12493	NC_009380	CTC	2	6	464933	464938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592970
12494	NC_009380	TCA	2	6	465003	465008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592970
12495	NC_009380	CTG	2	6	465014	465019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12496	NC_009380	TTC	2	6	465020	465025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592970
12497	NC_009380	GCT	2	6	465112	465117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592970
12498	NC_009380	CGC	2	6	465124	465129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592970
12499	NC_009380	CGC	2	6	465190	465195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592970
12500	NC_009380	GGT	2	6	465206	465211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592970

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