MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_009380	GCT	2	6	4605825	4605830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596561
123002	NC_009380	TCG	2	6	4605884	4605889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596561
123003	NC_009380	TCC	2	6	4605905	4605910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596561
123004	NC_009380	GGC	2	6	4605937	4605942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596561
123005	NC_009380	CGA	2	6	4605963	4605968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596561
123006	NC_009380	CGC	2	6	4606010	4606015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596561
123007	NC_009380	CCG	2	6	4606029	4606034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596561
123008	NC_009380	ATGT	2	8	4606094	4606101	25 %	50 %	25 %	0 %	145596561
123009	NC_009380	GGT	2	6	4606159	4606164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596561
123010	NC_009380	CG	3	6	4606187	4606192	0 %	0 %	50 %	50 %	145596561
123011	NC_009380	CGAC	2	8	4606223	4606230	25 %	0 %	25 %	50 %	145596561
123012	NC_009380	GC	3	6	4606248	4606253	0 %	0 %	50 %	50 %	145596561
123013	NC_009380	ACC	2	6	4606304	4606309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596561
123014	NC_009380	AGTG	2	8	4606432	4606439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123015	NC_009380	ACCGG	2	10	4606516	4606525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123016	NC_009380	CGC	2	6	4606560	4606565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123017	NC_009380	CCGGT	2	10	4606577	4606586	0 %	20 %	40 %	40 %	145596562
123018	NC_009380	GCCGG	2	10	4606620	4606629	0 %	0 %	60 %	40 %	145596562
123019	NC_009380	CGG	2	6	4606633	4606638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596562
123020	NC_009380	GCG	2	6	4606641	4606646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596562
123021	NC_009380	GC	5	10	4606653	4606662	0 %	0 %	50 %	50 %	145596562
123022	NC_009380	GACC	2	8	4606764	4606771	25 %	0 %	25 %	50 %	145596562
123023	NC_009380	CGT	2	6	4606809	4606814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596562
123024	NC_009380	ACA	2	6	4606830	4606835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596562
123025	NC_009380	GTC	2	6	4606918	4606923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596562
123026	NC_009380	CCAG	2	8	4606961	4606968	25 %	0 %	25 %	50 %	145596562
123027	NC_009380	TCT	2	6	4607043	4607048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596562
123028	NC_009380	GGT	2	6	4607064	4607069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596562
123029	NC_009380	GC	3	6	4607131	4607136	0 %	0 %	50 %	50 %	145596562
123030	NC_009380	CGCGG	2	10	4607191	4607200	0 %	0 %	60 %	40 %	145596562
123031	NC_009380	C	6	6	4607265	4607270	0 %	0 %	0 %	100 %	145596562
123032	NC_009380	CGT	3	9	4607295	4607303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596562
123033	NC_009380	GGTG	2	8	4607319	4607326	0 %	25 %	75 %	0 %	145596562
123034	NC_009380	CCA	3	9	4607331	4607339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596562
123035	NC_009380	CGG	2	6	4607340	4607345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596562
123036	NC_009380	CCA	2	6	4607394	4607399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596562
123037	NC_009380	GCGG	2	8	4607403	4607410	0 %	0 %	75 %	25 %	145596562
123038	NC_009380	AGG	2	6	4607432	4607437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596562
123039	NC_009380	GGC	2	6	4607443	4607448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596562
123040	NC_009380	GCC	2	6	4607581	4607586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596562
123041	NC_009380	CAC	2	6	4607641	4607646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596562
123042	NC_009380	CCA	2	6	4607652	4607657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123043	NC_009380	CGGGG	2	10	4607681	4607690	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123044	NC_009380	GT	3	6	4607779	4607784	0 %	50 %	50 %	0 %	145596563
123045	NC_009380	AGC	2	6	4607821	4607826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123046	NC_009380	CAGC	2	8	4607889	4607896	25 %	0 %	25 %	50 %	145596563
123047	NC_009380	ACG	3	9	4607902	4607910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123048	NC_009380	ACC	2	6	4607953	4607958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596563
123049	NC_009380	ACCA	2	8	4608007	4608014	50 %	0 %	0 %	50 %	145596563
123050	NC_009380	ACC	2	6	4608021	4608026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596563
123051	NC_009380	CGC	2	6	4608033	4608038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
123052	NC_009380	GGTG	2	8	4608164	4608171	0 %	25 %	75 %	0 %	145596563
123053	NC_009380	CAG	2	6	4608297	4608302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123054	NC_009380	GAG	2	6	4608322	4608327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596563
123055	NC_009380	AGC	2	6	4608334	4608339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123056	NC_009380	CGA	2	6	4608377	4608382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123057	NC_009380	GCA	2	6	4608461	4608466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123058	NC_009380	CGC	2	6	4608477	4608482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
123059	NC_009380	CGGCG	2	10	4608561	4608570	0 %	0 %	60 %	40 %	145596563
123060	NC_009380	CAG	2	6	4608582	4608587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
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123062	NC_009380	AGC	2	6	4608619	4608624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123063	NC_009380	CCG	2	6	4608650	4608655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
123064	NC_009380	TGG	2	6	4608662	4608667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596563
123065	NC_009380	CGC	2	6	4608681	4608686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
123066	NC_009380	CGG	2	6	4608701	4608706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596563
123067	NC_009380	GAA	2	6	4608738	4608743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596563
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123069	NC_009380	CAG	2	6	4608795	4608800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123070	NC_009380	CCG	2	6	4608801	4608806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
123071	NC_009380	GC	3	6	4608818	4608823	0 %	0 %	50 %	50 %	145596563
123072	NC_009380	CAG	2	6	4608873	4608878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
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123074	NC_009380	GTC	2	6	4608975	4608980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596563
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123077	NC_009380	CGC	2	6	4609022	4609027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596563
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123081	NC_009380	CAG	2	6	4609191	4609196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123082	NC_009380	CAC	2	6	4609212	4609217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596563
123083	NC_009380	GCG	2	6	4609267	4609272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596563
123084	NC_009380	CAG	2	6	4609275	4609280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596563
123085	NC_009380	TCGA	2	8	4609309	4609316	25 %	25 %	25 %	25 %	145596563
123086	NC_009380	GCTC	2	8	4609328	4609335	0 %	25 %	25 %	50 %	145596563
123087	NC_009380	CCT	2	6	4609345	4609350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596564
123088	NC_009380	TCG	2	6	4609399	4609404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596564
123089	NC_009380	CAG	2	6	4609411	4609416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596564
123090	NC_009380	TGA	2	6	4609420	4609425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596564
123091	NC_009380	AGC	2	6	4609455	4609460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596564
123092	NC_009380	CCA	2	6	4609483	4609488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596564
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123097	NC_009380	GCGAG	2	10	4609708	4609717	20 %	0 %	60 %	20 %	145596564
123098	NC_009380	GAA	2	6	4609724	4609729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596564
123099	NC_009380	CAG	2	6	4609742	4609747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596564
123100	NC_009380	GCC	2	6	4609766	4609771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596564
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123102	NC_009380	ACC	2	6	4609818	4609823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596564
123103	NC_009380	GCACC	2	10	4609867	4609876	20 %	0 %	20 %	60 %	145596564
123104	NC_009380	GCC	2	6	4609881	4609886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596564
123105	NC_009380	GACC	2	8	4609972	4609979	25 %	0 %	25 %	50 %	145596564
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123107	NC_009380	GAT	2	6	4609997	4610002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596564
123108	NC_009380	CAGCGC	2	12	4610015	4610026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145596564
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123111	NC_009380	CGA	2	6	4610206	4610211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596564
123112	NC_009380	CAGC	2	8	4610225	4610232	25 %	0 %	25 %	50 %	145596564
123113	NC_009380	ACC	2	6	4610295	4610300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596564
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123115	NC_009380	GAA	2	6	4610354	4610359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596564
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123224	NC_009380	GTA	2	6	4614152	4614157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596568
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123355	NC_009380	ATC	2	6	4619134	4619139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596571
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123371	NC_009380	TCA	2	6	4619564	4619569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596571
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123373	NC_009380	CGC	2	6	4619699	4619704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596571
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123378	NC_009380	CGC	2	6	4619948	4619953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596572
123379	NC_009380	GCCG	3	12	4620029	4620040	0 %	0 %	50 %	50 %	145596572
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123382	NC_009380	GCG	3	9	4620069	4620077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596572
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123399	NC_009380	GCA	2	6	4620721	4620726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596572
123400	NC_009380	GAT	2	6	4620761	4620766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596572
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123403	NC_009380	CAC	2	6	4620879	4620884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596573
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123405	NC_009380	C	6	6	4620985	4620990	0 %	0 %	0 %	100 %	145596573
123406	NC_009380	CGGG	2	8	4621053	4621060	0 %	0 %	75 %	25 %	145596573
123407	NC_009380	CCA	2	6	4621206	4621211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596573
123408	NC_009380	CCGG	2	8	4621221	4621228	0 %	0 %	50 %	50 %	145596573
123409	NC_009380	CGA	2	6	4621248	4621253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596573
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123416	NC_009380	GCCAC	2	10	4621583	4621592	20 %	0 %	20 %	60 %	145596573
123417	NC_009380	CTCCCG	2	12	4621657	4621668	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145596573
123418	NC_009380	CAT	2	6	4621681	4621686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596573
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123420	NC_009380	CAT	2	6	4621756	4621761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596573
123421	NC_009380	TGG	2	6	4621773	4621778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596573
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123424	NC_009380	TTC	2	6	4621919	4621924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596573
123425	NC_009380	CGA	2	6	4621947	4621952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596573
123426	NC_009380	CGTG	2	8	4622010	4622017	0 %	25 %	50 %	25 %	145596573
123427	NC_009380	TGC	2	6	4622024	4622029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596573
123428	NC_009380	GAC	2	6	4622041	4622046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596573
123429	NC_009380	TCG	2	6	4622054	4622059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596573
123430	NC_009380	GAC	2	6	4622083	4622088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596573
123431	NC_009380	CCG	2	6	4622099	4622104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596573
123432	NC_009380	CGG	2	6	4622127	4622132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596573
123433	NC_009380	CTC	2	6	4622209	4622214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123434	NC_009380	CTCA	2	8	4622262	4622269	25 %	25 %	0 %	50 %	145596574
123435	NC_009380	CGG	2	6	4622283	4622288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596574
123436	NC_009380	CGG	2	6	4622291	4622296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596574
123437	NC_009380	GTC	2	6	4622372	4622377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596574
123438	NC_009380	CGG	2	6	4622458	4622463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596574
123439	NC_009380	CGG	2	6	4622503	4622508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596574
123440	NC_009380	CCG	2	6	4622512	4622517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596574
123441	NC_009380	GGCA	2	8	4622578	4622585	25 %	0 %	50 %	25 %	145596574
123442	NC_009380	CGA	2	6	4622615	4622620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596574
123443	NC_009380	GTC	2	6	4622645	4622650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596574
123444	NC_009380	TCGCC	2	10	4622734	4622743	0 %	20 %	20 %	60 %	145596574
123445	NC_009380	CCT	2	6	4622758	4622763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596574
123446	NC_009380	TCG	2	6	4622781	4622786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596574
123447	NC_009380	GCC	2	6	4622811	4622816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596574
123448	NC_009380	CCG	2	6	4622844	4622849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596574
123449	NC_009380	CGG	2	6	4622896	4622901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596574
123450	NC_009380	CCG	2	6	4622970	4622975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596574
123451	NC_009380	CGTC	2	8	4622977	4622984	0 %	25 %	25 %	50 %	145596574
123452	NC_009380	CTT	2	6	4623051	4623056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596575
123453	NC_009380	CTG	2	6	4623069	4623074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123454	NC_009380	GCT	2	6	4623113	4623118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123455	NC_009380	CGGCG	2	10	4623152	4623161	0 %	0 %	60 %	40 %	145596575
123456	NC_009380	ACG	3	9	4623179	4623187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123457	NC_009380	CAC	2	6	4623204	4623209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596575
123458	NC_009380	CG	3	6	4623221	4623226	0 %	0 %	50 %	50 %	145596575
123459	NC_009380	CATG	2	8	4623272	4623279	25 %	25 %	25 %	25 %	145596575
123460	NC_009380	TCT	2	6	4623281	4623286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596575
123461	NC_009380	CCGG	2	8	4623320	4623327	0 %	0 %	50 %	50 %	145596575
123462	NC_009380	GAC	2	6	4623360	4623365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123463	NC_009380	GTT	2	6	4623393	4623398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145596575
123464	NC_009380	GCT	2	6	4623411	4623416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123465	NC_009380	TCT	2	6	4623491	4623496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596575
123466	NC_009380	CCCG	2	8	4623503	4623510	0 %	0 %	25 %	75 %	145596575
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123469	NC_009380	GCC	2	6	4623595	4623600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596575
123470	NC_009380	ATC	2	6	4623601	4623606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596575
123471	NC_009380	GCA	2	6	4623615	4623620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596575
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123473	NC_009380	CGA	2	6	4623648	4623653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596575
123474	NC_009380	CGG	2	6	4623701	4623706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596575
123475	NC_009380	TCCT	2	8	4623736	4623743	0 %	50 %	0 %	50 %	145596576
123476	NC_009380	CAGTCC	2	12	4623744	4623755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145596576
123477	NC_009380	GCC	2	6	4623758	4623763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596576
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123479	NC_009380	CGA	2	6	4623787	4623792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596576
123480	NC_009380	CGA	2	6	4623799	4623804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596576
123481	NC_009380	CGAA	2	8	4623847	4623854	50 %	0 %	25 %	25 %	145596576
123482	NC_009380	GAT	2	6	4623875	4623880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596576
123483	NC_009380	GCC	2	6	4623938	4623943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596576
123484	NC_009380	GCTCG	2	10	4623959	4623968	0 %	20 %	40 %	40 %	145596576
123485	NC_009380	TGT	2	6	4624000	4624005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145596576
123486	NC_009380	GGCG	2	8	4624024	4624031	0 %	0 %	75 %	25 %	145596576
123487	NC_009380	CGC	2	6	4624055	4624060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596576
123488	NC_009380	AAC	2	6	4624071	4624076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596576
123489	NC_009380	CGG	2	6	4624185	4624190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123490	NC_009380	CA	3	6	4624219	4624224	50 %	0 %	0 %	50 %	145596577
123491	NC_009380	GCC	2	6	4624231	4624236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596577
123492	NC_009380	TGA	2	6	4624250	4624255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596577
123493	NC_009380	CG	3	6	4624277	4624282	0 %	0 %	50 %	50 %	145596577
123494	NC_009380	GGTC	2	8	4624283	4624290	0 %	25 %	50 %	25 %	145596577
123495	NC_009380	GGC	2	6	4624353	4624358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596577
123496	NC_009380	GC	3	6	4624357	4624362	0 %	0 %	50 %	50 %	145596577
123497	NC_009380	GAC	2	6	4624373	4624378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596577
123498	NC_009380	CCG	2	6	4624399	4624404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596577
123499	NC_009380	GTA	2	6	4624410	4624415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596577
123500	NC_009380	GCC	2	6	4624416	4624421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596577

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