MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_009380	CCA	2	6	4569906	4569911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596533
122003	NC_009380	GCC	2	6	4569960	4569965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122004	NC_009380	CGG	2	6	4569987	4569992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122005	NC_009380	CCGG	2	8	4570018	4570025	0 %	0 %	50 %	50 %	145596533
122006	NC_009380	GCC	2	6	4570027	4570032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122007	NC_009380	CCA	2	6	4570083	4570088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596533
122008	NC_009380	CGC	2	6	4570090	4570095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122009	NC_009380	CGG	2	6	4570107	4570112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122010	NC_009380	GCG	2	6	4570124	4570129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122011	NC_009380	CGC	2	6	4570141	4570146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122012	NC_009380	CGG	2	6	4570190	4570195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122013	NC_009380	GCC	2	6	4570221	4570226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122014	NC_009380	GCCC	2	8	4570229	4570236	0 %	0 %	25 %	75 %	145596533
122015	NC_009380	CGG	2	6	4570254	4570259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122016	NC_009380	GCC	2	6	4570319	4570324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596533
122017	NC_009380	GTC	2	6	4570381	4570386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596533
122018	NC_009380	TGGA	2	8	4570391	4570398	25 %	25 %	50 %	0 %	145596533
122019	NC_009380	GC	3	6	4570401	4570406	0 %	0 %	50 %	50 %	145596533
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122021	NC_009380	CGG	2	6	4570464	4570469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
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122023	NC_009380	GGC	2	6	4570534	4570539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
122024	NC_009380	GC	3	6	4570553	4570558	0 %	0 %	50 %	50 %	145596533
122025	NC_009380	ACC	2	6	4570592	4570597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596533
122026	NC_009380	GTG	2	6	4570628	4570633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596533
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122029	NC_009380	CG	3	6	4570697	4570702	0 %	0 %	50 %	50 %	145596533
122030	NC_009380	CGAC	3	12	4570704	4570715	25 %	0 %	25 %	50 %	145596533
122031	NC_009380	GGC	2	6	4570724	4570729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
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122033	NC_009380	CGG	3	9	4570881	4570889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596533
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122041	NC_009380	TCG	2	6	4571164	4571169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596534
122042	NC_009380	GCG	2	6	4571179	4571184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
122043	NC_009380	CGG	3	9	4571210	4571218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
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122047	NC_009380	TCG	2	6	4571398	4571403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596534
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122050	NC_009380	CAC	2	6	4571496	4571501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596534
122051	NC_009380	GTG	2	6	4571511	4571516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596534
122052	NC_009380	CGG	2	6	4571525	4571530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
122053	NC_009380	AGC	2	6	4571536	4571541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596534
122054	NC_009380	GC	3	6	4571548	4571553	0 %	0 %	50 %	50 %	145596534
122055	NC_009380	AGC	2	6	4571584	4571589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596534
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122057	NC_009380	ACC	2	6	4571638	4571643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596534
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122059	NC_009380	C	6	6	4571713	4571718	0 %	0 %	0 %	100 %	145596534
122060	NC_009380	CGG	2	6	4571738	4571743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
122061	NC_009380	GCC	2	6	4571771	4571776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596534
122062	NC_009380	CTT	2	6	4571817	4571822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145596534
122063	NC_009380	GTC	2	6	4571823	4571828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596534
122064	NC_009380	TGCC	2	8	4571861	4571868	0 %	25 %	25 %	50 %	145596534
122065	NC_009380	AGC	4	12	4571881	4571892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596534
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122068	NC_009380	CCA	2	6	4571944	4571949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596534
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122071	NC_009380	TCG	2	6	4572040	4572045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596534
122072	NC_009380	CGC	2	6	4572053	4572058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596534
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122079	NC_009380	ATC	2	6	4572226	4572231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596534
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122091	NC_009380	GAC	2	6	4572645	4572650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596534
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122098	NC_009380	GCA	2	6	4572950	4572955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596534
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122100	NC_009380	GGC	2	6	4573017	4573022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
122101	NC_009380	GAG	2	6	4573038	4573043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596534
122102	NC_009380	GGC	2	6	4573065	4573070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596534
122103	NC_009380	GCTG	2	8	4573148	4573155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122104	NC_009380	GCCGG	2	10	4573183	4573192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122105	NC_009380	GCGG	2	8	4573201	4573208	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122106	NC_009380	CTG	2	6	4573233	4573238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122107	NC_009380	CCGG	2	8	4573305	4573312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122108	NC_009380	CCAC	2	8	4573364	4573371	25 %	0 %	0 %	75 %	145596535
122109	NC_009380	GCCC	2	8	4573377	4573384	0 %	0 %	25 %	75 %	145596535
122110	NC_009380	CAC	2	6	4573429	4573434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596535
122111	NC_009380	GC	3	6	4573458	4573463	0 %	0 %	50 %	50 %	145596535
122112	NC_009380	CG	3	6	4573474	4573479	0 %	0 %	50 %	50 %	145596535
122113	NC_009380	CCG	2	6	4573495	4573500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596535
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122115	NC_009380	GC	3	6	4573554	4573559	0 %	0 %	50 %	50 %	145596535
122116	NC_009380	GCC	2	6	4573627	4573632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596535
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122153	NC_009380	CGGG	2	8	4574697	4574704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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122346	NC_009380	ACC	2	6	4582015	4582020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596541
122347	NC_009380	GAT	2	6	4582029	4582034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596541
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122451	NC_009380	G	6	6	4586047	4586052	0 %	0 %	100 %	0 %	145596544
122452	NC_009380	GCC	2	6	4586064	4586069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596544
122453	NC_009380	CGCC	2	8	4586072	4586079	0 %	0 %	25 %	75 %	145596544
122454	NC_009380	CGA	2	6	4586087	4586092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596544
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122458	NC_009380	CAAC	2	8	4586206	4586213	50 %	0 %	0 %	50 %	145596544
122459	NC_009380	GCA	2	6	4586294	4586299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122460	NC_009380	CGGG	2	8	4586303	4586310	0 %	0 %	75 %	25 %	145596544
122461	NC_009380	AGG	2	6	4586326	4586331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596544
122462	NC_009380	CCA	2	6	4586381	4586386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596544
122463	NC_009380	CCA	2	6	4586434	4586439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596544
122464	NC_009380	GCC	3	9	4586472	4586480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596544
122465	NC_009380	CAC	2	6	4586485	4586490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596544
122466	NC_009380	GACCTG	2	12	4586502	4586513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122467	NC_009380	GGT	2	6	4586584	4586589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596544
122468	NC_009380	CGG	2	6	4586627	4586632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596544
122469	NC_009380	GTG	2	6	4586652	4586657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596544
122470	NC_009380	GCT	2	6	4586675	4586680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122471	NC_009380	CGG	2	6	4586693	4586698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596544
122472	NC_009380	GTC	2	6	4586699	4586704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122473	NC_009380	CTG	2	6	4586712	4586717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122474	NC_009380	GC	3	6	4586788	4586793	0 %	0 %	50 %	50 %	145596544
122475	NC_009380	GAG	2	6	4586805	4586810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145596544
122476	NC_009380	GGT	2	6	4586852	4586857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596544
122477	NC_009380	CGGTC	2	10	4586860	4586869	0 %	20 %	40 %	40 %	145596544
122478	NC_009380	CCAG	2	8	4586920	4586927	25 %	0 %	25 %	50 %	145596544
122479	NC_009380	GTG	2	6	4586928	4586933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596544
122480	NC_009380	CCCG	2	8	4586994	4587001	0 %	0 %	25 %	75 %	145596544
122481	NC_009380	GC	3	6	4587085	4587090	0 %	0 %	50 %	50 %	145596544
122482	NC_009380	CGC	2	6	4587095	4587100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596544
122483	NC_009380	CGC	2	6	4587107	4587112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596544
122484	NC_009380	TGC	2	6	4587121	4587126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122485	NC_009380	CGG	2	6	4587158	4587163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596544
122486	NC_009380	ACCG	2	8	4587197	4587204	25 %	0 %	25 %	50 %	145596544
122487	NC_009380	ACG	2	6	4587214	4587219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122488	NC_009380	CGG	2	6	4587227	4587232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596544
122489	NC_009380	CGG	2	6	4587262	4587267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596544
122490	NC_009380	CGGCAA	2	12	4587353	4587364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122491	NC_009380	CGT	2	6	4587404	4587409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596544
122492	NC_009380	GCCA	2	8	4587501	4587508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122493	NC_009380	CCGG	2	8	4587514	4587521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122494	NC_009380	GGCCCG	2	12	4587553	4587564	0 %	0 %	50 %	50 %	145596545
122495	NC_009380	CAG	2	6	4587622	4587627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596545
122496	NC_009380	TGG	2	6	4587705	4587710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596545
122497	NC_009380	CGC	2	6	4587727	4587732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596545
122498	NC_009380	CCG	2	6	4587753	4587758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596545
122499	NC_009380	CCTG	2	8	4587764	4587771	0 %	25 %	25 %	50 %	145596545
122500	NC_009380	CCG	2	6	4587798	4587803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596545

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