MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_009380	CCCA	2	8	4551309	4551316	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121502	NC_009380	GCC	2	6	4551327	4551332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121503	NC_009380	GCG	2	6	4551370	4551375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121504	NC_009380	ACA	2	6	4551376	4551381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121505	NC_009380	CCG	2	6	4551382	4551387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121506	NC_009380	GCCG	2	8	4551399	4551406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121507	NC_009380	CGGC	2	8	4551421	4551428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121508	NC_009380	TCG	2	6	4551441	4551446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121509	NC_009380	AC	3	6	4551449	4551454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121510	NC_009380	GGC	2	6	4551485	4551490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596511
121511	NC_009380	GC	3	6	4551528	4551533	0 %	0 %	50 %	50 %	145596511
121512	NC_009380	GTG	2	6	4551540	4551545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596511
121513	NC_009380	GCC	2	6	4551548	4551553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596511
121514	NC_009380	CAT	2	6	4551606	4551611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596511
121515	NC_009380	TGA	2	6	4551616	4551621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596511
121516	NC_009380	CA	3	6	4551628	4551633	50 %	0 %	0 %	50 %	145596511
121517	NC_009380	TGT	2	6	4551656	4551661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145596511
121518	NC_009380	GCA	2	6	4551678	4551683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596511
121519	NC_009380	TGG	2	6	4551688	4551693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596511
121520	NC_009380	TCC	2	6	4551697	4551702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596511
121521	NC_009380	GCG	2	6	4551783	4551788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596511
121522	NC_009380	GGT	2	6	4551818	4551823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596511
121523	NC_009380	CAGC	2	8	4551905	4551912	25 %	0 %	25 %	50 %	145596511
121524	NC_009380	CGG	2	6	4551944	4551949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596511
121525	NC_009380	GGT	2	6	4551953	4551958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596511
121526	NC_009380	GGC	2	6	4551974	4551979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596511
121527	NC_009380	GCG	2	6	4552099	4552104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121528	NC_009380	GGT	2	6	4552120	4552125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596512
121529	NC_009380	GCG	2	6	4552142	4552147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121530	NC_009380	CCG	2	6	4552151	4552156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596512
121531	NC_009380	GTG	2	6	4552157	4552162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596512
121532	NC_009380	CAG	2	6	4552171	4552176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121533	NC_009380	GGTG	3	12	4552182	4552193	0 %	25 %	75 %	0 %	145596512
121534	NC_009380	GCC	2	6	4552211	4552216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596512
121535	NC_009380	GTC	2	6	4552279	4552284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121536	NC_009380	CCGG	2	8	4552339	4552346	0 %	0 %	50 %	50 %	145596512
121537	NC_009380	CGG	2	6	4552362	4552367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121538	NC_009380	C	6	6	4552420	4552425	0 %	0 %	0 %	100 %	145596512
121539	NC_009380	GGT	2	6	4552426	4552431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596512
121540	NC_009380	GGT	2	6	4552515	4552520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596512
121541	NC_009380	CCCG	2	8	4552531	4552538	0 %	0 %	25 %	75 %	145596512
121542	NC_009380	GCT	3	9	4552539	4552547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121543	NC_009380	CCG	2	6	4552598	4552603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596512
121544	NC_009380	GCC	2	6	4552639	4552644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596512
121545	NC_009380	CGT	2	6	4552650	4552655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121546	NC_009380	CAG	2	6	4552669	4552674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121547	NC_009380	CGG	2	6	4552749	4552754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121548	NC_009380	GCA	2	6	4552755	4552760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121549	NC_009380	GGCCG	2	10	4552783	4552792	0 %	0 %	60 %	40 %	145596512
121550	NC_009380	CCGA	2	8	4552802	4552809	25 %	0 %	25 %	50 %	145596512
121551	NC_009380	GTC	2	6	4552853	4552858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121552	NC_009380	CGGG	2	8	4552881	4552888	0 %	0 %	75 %	25 %	145596512
121553	NC_009380	CGG	2	6	4552890	4552895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121554	NC_009380	GGT	2	6	4552927	4552932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596512
121555	NC_009380	GT	3	6	4553001	4553006	0 %	50 %	50 %	0 %	145596512
121556	NC_009380	CGC	2	6	4553010	4553015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596512
121557	NC_009380	GC	3	6	4553037	4553042	0 %	0 %	50 %	50 %	145596512
121558	NC_009380	TCG	2	6	4553060	4553065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596512
121559	NC_009380	CGG	2	6	4553127	4553132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596512
121560	NC_009380	GGT	2	6	4553205	4553210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121561	NC_009380	CCAG	2	8	4553224	4553231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121562	NC_009380	TG	3	6	4553336	4553341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121563	NC_009380	ATG	2	6	4553348	4553353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121564	NC_009380	GGC	2	6	4553363	4553368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596513
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121566	NC_009380	CTCG	2	8	4553434	4553441	0 %	25 %	25 %	50 %	145596513
121567	NC_009380	GGT	2	6	4553471	4553476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596513
121568	NC_009380	GT	3	6	4553494	4553499	0 %	50 %	50 %	0 %	145596513
121569	NC_009380	GGT	2	6	4553504	4553509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596513
121570	NC_009380	CCCG	2	8	4553512	4553519	0 %	0 %	25 %	75 %	145596513
121571	NC_009380	GCG	2	6	4553546	4553551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596513
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121573	NC_009380	GCG	2	6	4553610	4553615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596513
121574	NC_009380	CCGG	2	8	4553710	4553717	0 %	0 %	50 %	50 %	145596513
121575	NC_009380	CGG	2	6	4553811	4553816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596513
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121578	NC_009380	CCG	2	6	4553935	4553940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121579	NC_009380	GGC	2	6	4553977	4553982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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121581	NC_009380	CGGG	2	8	4554122	4554129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121582	NC_009380	CGG	4	12	4554132	4554143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121583	NC_009380	TGG	2	6	4554159	4554164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121584	NC_009380	CCG	2	6	4554176	4554181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121585	NC_009380	GGC	3	9	4554189	4554197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121586	NC_009380	GGTG	2	8	4554202	4554209	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121587	NC_009380	GCG	3	9	4554224	4554232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596514
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121590	NC_009380	GCG	2	6	4554293	4554298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596514
121591	NC_009380	GGC	3	9	4554310	4554318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596514
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121593	NC_009380	GCGA	2	8	4554361	4554368	25 %	0 %	50 %	25 %	145596514
121594	NC_009380	CGGG	2	8	4554388	4554395	0 %	0 %	75 %	25 %	145596514
121595	NC_009380	GCC	2	6	4554413	4554418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596514
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121598	NC_009380	CAG	2	6	4554466	4554471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121599	NC_009380	GCGT	2	8	4554510	4554517	0 %	25 %	50 %	25 %	145596514
121600	NC_009380	GATCGT	2	12	4554538	4554549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145596514
121601	NC_009380	GC	3	6	4554564	4554569	0 %	0 %	50 %	50 %	145596514
121602	NC_009380	TCC	2	6	4554573	4554578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596514
121603	NC_009380	TGA	2	6	4554601	4554606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596514
121604	NC_009380	GCA	2	6	4554621	4554626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121605	NC_009380	TCG	2	6	4554654	4554659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121606	NC_009380	GCAG	2	8	4554710	4554717	25 %	0 %	50 %	25 %	145596514
121607	NC_009380	AGC	2	6	4554791	4554796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121608	NC_009380	CT	3	6	4554804	4554809	0 %	50 %	0 %	50 %	145596514
121609	NC_009380	TCA	2	6	4554825	4554830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596514
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121611	NC_009380	GTC	2	6	4554865	4554870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121612	NC_009380	CG	3	6	4554897	4554902	0 %	0 %	50 %	50 %	145596514
121613	NC_009380	GAA	2	6	4554913	4554918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596514
121614	NC_009380	TCG	2	6	4554939	4554944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596514
121615	NC_009380	CAC	2	6	4554952	4554957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596514
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121617	NC_009380	GC	3	6	4554998	4555003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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