MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_009380	GAT	2	6	4533083	4533088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596492
121002	NC_009380	TCG	2	6	4533108	4533113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121003	NC_009380	GCA	2	6	4533226	4533231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121004	NC_009380	CGA	2	6	4533325	4533330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121005	NC_009380	GTG	2	6	4533366	4533371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596492
121006	NC_009380	CAG	2	6	4533422	4533427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121007	NC_009380	CGT	2	6	4533467	4533472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121008	NC_009380	CAG	2	6	4533479	4533484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121009	NC_009380	CCG	2	6	4533532	4533537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596492
121010	NC_009380	GCC	2	6	4533577	4533582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596492
121011	NC_009380	CGC	2	6	4533596	4533601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596492
121012	NC_009380	GTC	2	6	4533626	4533631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121013	NC_009380	GCG	2	6	4533642	4533647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596492
121014	NC_009380	GGGT	2	8	4533749	4533756	0 %	25 %	75 %	0 %	145596492
121015	NC_009380	CGC	3	9	4533785	4533793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596492
121016	NC_009380	GCC	2	6	4533797	4533802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596492
121017	NC_009380	GCCG	2	8	4533805	4533812	0 %	0 %	50 %	50 %	145596492
121018	NC_009380	CGG	3	9	4533826	4533834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596492
121019	NC_009380	AACGC	2	10	4533865	4533874	40 %	0 %	20 %	40 %	145596492
121020	NC_009380	GTC	2	6	4533878	4533883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121021	NC_009380	CGT	2	6	4533889	4533894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596492
121022	NC_009380	GGC	2	6	4533906	4533911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596492
121023	NC_009380	ATC	2	6	4534000	4534005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121024	NC_009380	T	6	6	4534070	4534075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121025	NC_009380	GCT	2	6	4534124	4534129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121026	NC_009380	CCG	2	6	4534131	4534136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121027	NC_009380	GTG	2	6	4534160	4534165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596493
121028	NC_009380	GTG	2	6	4534169	4534174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596493
121029	NC_009380	CGGTGG	2	12	4534274	4534285	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145596493
121030	NC_009380	TGC	2	6	4534339	4534344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121031	NC_009380	GAT	2	6	4534388	4534393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145596493
121032	NC_009380	CGG	2	6	4534408	4534413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121033	NC_009380	ACG	2	6	4534443	4534448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121034	NC_009380	ACG	2	6	4534464	4534469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121035	NC_009380	GAA	2	6	4534486	4534491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596493
121036	NC_009380	GACGCG	2	12	4534556	4534567	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145596493
121037	NC_009380	CGG	2	6	4534600	4534605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121038	NC_009380	ACCT	2	8	4534634	4534641	25 %	25 %	0 %	50 %	145596493
121039	NC_009380	CCG	2	6	4534647	4534652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596493
121040	NC_009380	CGG	2	6	4534702	4534707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121041	NC_009380	AAG	2	6	4534709	4534714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145596493
121042	NC_009380	ACC	2	6	4534715	4534720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596493
121043	NC_009380	CGC	3	9	4534729	4534737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596493
121044	NC_009380	TGG	2	6	4534771	4534776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145596493
121045	NC_009380	CAA	2	6	4534789	4534794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596493
121046	NC_009380	CGG	2	6	4534807	4534812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121047	NC_009380	CGACGG	2	12	4534819	4534830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145596493
121048	NC_009380	G	6	6	4534832	4534837	0 %	0 %	100 %	0 %	145596493
121049	NC_009380	ACC	2	6	4534865	4534870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596493
121050	NC_009380	CGG	2	6	4534900	4534905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121051	NC_009380	GGC	3	9	4534910	4534918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121052	NC_009380	CAA	2	6	4534924	4534929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596493
121053	NC_009380	CAC	2	6	4534933	4534938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596493
121054	NC_009380	CCG	2	6	4534971	4534976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596493
121055	NC_009380	GCG	2	6	4534986	4534991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121056	NC_009380	CTG	2	6	4535009	4535014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121057	NC_009380	GTC	2	6	4535018	4535023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121058	NC_009380	ACA	3	9	4535037	4535045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596493
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121060	NC_009380	CCA	2	6	4535082	4535087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596493
121061	NC_009380	CACCGT	2	12	4535089	4535100	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145596493
121062	NC_009380	GGC	2	6	4535105	4535110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121063	NC_009380	CGG	2	6	4535155	4535160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596493
121064	NC_009380	CAC	2	6	4535179	4535184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596493
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121067	NC_009380	GTGGCG	2	12	4535211	4535222	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145596493
121068	NC_009380	ACA	2	6	4535277	4535282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596493
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121070	NC_009380	GTC	2	6	4535333	4535338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596493
121071	NC_009380	CAT	2	6	4535347	4535352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596493
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121074	NC_009380	AC	3	6	4535422	4535427	50 %	0 %	0 %	50 %	145596493
121075	NC_009380	ATC	2	6	4535432	4535437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596493
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121079	NC_009380	TCA	2	6	4535598	4535603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145596493
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121081	NC_009380	CCG	2	6	4535707	4535712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121082	NC_009380	ACG	2	6	4535739	4535744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121083	NC_009380	ACC	2	6	4535797	4535802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596494
121084	NC_009380	CGG	2	6	4535828	4535833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145596494
121085	NC_009380	CG	3	6	4535839	4535844	0 %	0 %	50 %	50 %	145596494
121086	NC_009380	CTC	2	6	4535884	4535889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145596494
121087	NC_009380	CCG	2	6	4535897	4535902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596494
121088	NC_009380	GCT	2	6	4535943	4535948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596494
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121091	NC_009380	GGTCGT	2	12	4536012	4536023	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145596494
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121095	NC_009380	CGC	2	6	4536183	4536188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596494
121096	NC_009380	GC	3	6	4536217	4536222	0 %	0 %	50 %	50 %	145596494
121097	NC_009380	ACC	3	9	4536237	4536245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145596494
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121099	NC_009380	TCC	2	6	4536300	4536305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121100	NC_009380	GCCC	2	8	4536312	4536319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121101	NC_009380	GAG	2	6	4536336	4536341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121102	NC_009380	CCG	2	6	4536373	4536378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
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121104	NC_009380	TCG	2	6	4536435	4536440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596495
121105	NC_009380	GCC	2	6	4536461	4536466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
121106	NC_009380	GCC	2	6	4536551	4536556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
121107	NC_009380	CGC	2	6	4536559	4536564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
121108	NC_009380	CCG	2	6	4536600	4536605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
121109	NC_009380	GCC	2	6	4536634	4536639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145596495
121110	NC_009380	GCA	2	6	4536663	4536668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596495
121111	NC_009380	TCG	2	6	4536681	4536686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596495
121112	NC_009380	TCG	2	6	4536705	4536710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596495
121113	NC_009380	TGC	2	6	4536810	4536815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145596495
121114	NC_009380	GAC	2	6	4536845	4536850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596495
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121343	NC_009380	ACA	2	6	4545260	4545265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145596503
121344	NC_009380	CCCTG	2	10	4545276	4545285	0 %	20 %	20 %	60 %	145596503
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121347	NC_009380	GCA	2	6	4545332	4545337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145596503
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121453	NC_009380	CG	3	6	4549692	4549697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121454	NC_009380	CCA	2	6	4549727	4549732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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121456	NC_009380	GTT	2	6	4549747	4549752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145596509
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