MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009380	GTG	2	6	413436	413441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11002	NC_009380	GGATCA	2	12	413479	413490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145592926
11003	NC_009380	TGA	2	6	413512	413517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592926
11004	NC_009380	GCG	2	6	413532	413537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11005	NC_009380	CGG	2	6	413582	413587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11006	NC_009380	CGT	2	6	413605	413610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11007	NC_009380	GTC	2	6	413639	413644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11008	NC_009380	CGG	2	6	413714	413719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11009	NC_009380	AGT	2	6	413791	413796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592926
11010	NC_009380	CCAC	2	8	413802	413809	25 %	0 %	0 %	75 %	145592926
11011	NC_009380	CGT	2	6	413812	413817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11012	NC_009380	GTGC	2	8	413835	413842	0 %	25 %	50 %	25 %	145592926
11013	NC_009380	TGG	2	6	413872	413877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11014	NC_009380	TGC	2	6	413890	413895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11015	NC_009380	CGT	2	6	413920	413925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11016	NC_009380	TGGG	2	8	413934	413941	0 %	25 %	75 %	0 %	145592926
11017	NC_009380	CGG	2	6	413976	413981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11018	NC_009380	GTC	2	6	413990	413995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11019	NC_009380	CCAG	2	8	414025	414032	25 %	0 %	25 %	50 %	145592926
11020	NC_009380	TCGGCG	2	12	414036	414047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592926
11021	NC_009380	GCAC	2	8	414090	414097	25 %	0 %	25 %	50 %	145592926
11022	NC_009380	GGT	2	6	414156	414161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11023	NC_009380	ACC	2	6	414180	414185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592926
11024	NC_009380	TGT	2	6	414247	414252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592926
11025	NC_009380	CCG	2	6	414309	414314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11026	NC_009380	TGG	2	6	414361	414366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11027	NC_009380	GTCG	2	8	414374	414381	0 %	25 %	50 %	25 %	145592926
11028	NC_009380	GGA	2	6	414397	414402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592926
11029	NC_009380	GGA	2	6	414425	414430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592926
11030	NC_009380	GAC	2	6	414455	414460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11031	NC_009380	CGT	2	6	414469	414474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11032	NC_009380	CG	3	6	414477	414482	0 %	0 %	50 %	50 %	145592926
11033	NC_009380	CTG	2	6	414483	414488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11034	NC_009380	GCG	2	6	414514	414519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11035	NC_009380	CGGT	2	8	414522	414529	0 %	25 %	50 %	25 %	145592926
11036	NC_009380	CTC	2	6	414536	414541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592926
11037	NC_009380	GGT	2	6	414548	414553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11038	NC_009380	GGT	2	6	414617	414622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11039	NC_009380	ACC	2	6	414648	414653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592926
11040	NC_009380	CGG	2	6	414664	414669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11041	NC_009380	ACCG	2	8	414710	414717	25 %	0 %	25 %	50 %	145592926
11042	NC_009380	CCGG	2	8	414720	414727	0 %	0 %	50 %	50 %	145592926
11043	NC_009380	CGA	2	6	414793	414798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11044	NC_009380	GTCG	2	8	414812	414819	0 %	25 %	50 %	25 %	145592926
11045	NC_009380	CCG	2	6	414847	414852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11046	NC_009380	GAT	2	6	414875	414880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592926
11047	NC_009380	CGT	2	6	414904	414909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11048	NC_009380	GC	3	6	414919	414924	0 %	0 %	50 %	50 %	145592926
11049	NC_009380	GTGTCG	2	12	414939	414950	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145592926
11050	NC_009380	CGG	2	6	414964	414969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11051	NC_009380	GAC	2	6	415007	415012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11052	NC_009380	GCC	2	6	415115	415120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11053	NC_009380	GCG	2	6	415121	415126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11054	NC_009380	CGT	2	6	415138	415143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11055	NC_009380	CGC	2	6	415193	415198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11056	NC_009380	CGA	2	6	415205	415210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592926
11057	NC_009380	AAGACA	2	12	415218	415229	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	145592926
11058	NC_009380	CGC	2	6	415235	415240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11059	NC_009380	GGT	2	6	415262	415267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11060	NC_009380	GTG	2	6	415272	415277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592926
11061	NC_009380	GCC	3	9	415307	415315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592926
11062	NC_009380	GC	3	6	415330	415335	0 %	0 %	50 %	50 %	145592926
11063	NC_009380	TTG	3	9	415362	415370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592926
11064	NC_009380	GCG	2	6	415413	415418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11065	NC_009380	GGC	2	6	415421	415426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592926
11066	NC_009380	GCGCG	2	10	415491	415500	0 %	0 %	60 %	40 %	145592926
11067	NC_009380	GGTG	2	8	415519	415526	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009380	GGT	2	6	415586	415591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_009380	CG	3	6	415790	415795	0 %	0 %	50 %	50 %	145592927
11070	NC_009380	ACG	2	6	415824	415829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592927
11071	NC_009380	CGGGT	2	10	415851	415860	0 %	20 %	60 %	20 %	145592927
11072	NC_009380	CCA	2	6	415873	415878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592927
11073	NC_009380	GCAG	2	8	415954	415961	25 %	0 %	50 %	25 %	145592927
11074	NC_009380	CTC	2	6	416015	416020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592927
11075	NC_009380	CG	3	6	416046	416051	0 %	0 %	50 %	50 %	145592927
11076	NC_009380	CGAC	2	8	416221	416228	25 %	0 %	25 %	50 %	145592927
11077	NC_009380	ACC	2	6	416241	416246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592927
11078	NC_009380	CCT	2	6	416269	416274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592927
11079	NC_009380	CGG	2	6	416283	416288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592927
11080	NC_009380	GCG	2	6	416324	416329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592927
11081	NC_009380	TGC	2	6	416365	416370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592927
11082	NC_009380	ACC	2	6	416388	416393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592927
11083	NC_009380	GGC	2	6	416402	416407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592927
11084	NC_009380	CCG	2	6	416435	416440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592927
11085	NC_009380	CAT	2	6	416450	416455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592927
11086	NC_009380	CGG	2	6	416512	416517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592927
11087	NC_009380	CAG	2	6	416540	416545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592927
11088	NC_009380	CGG	2	6	416557	416562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592927
11089	NC_009380	ACG	2	6	416563	416568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592927
11090	NC_009380	GCC	2	6	416611	416616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_009380	CTG	2	6	416619	416624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_009380	GAT	2	6	416658	416663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_009380	TGCC	2	8	416680	416687	0 %	25 %	25 %	50 %	145592928
11094	NC_009380	GTT	2	6	416734	416739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592928
11095	NC_009380	CCA	2	6	416758	416763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592928
11096	NC_009380	GCC	2	6	416788	416793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592928
11097	NC_009380	GGC	3	9	416809	416817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592928
11098	NC_009380	GCG	2	6	416822	416827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592928
11099	NC_009380	TCG	2	6	416828	416833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592928
11100	NC_009380	GGT	2	6	416890	416895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592928
11101	NC_009380	CGGT	2	8	416957	416964	0 %	25 %	50 %	25 %	145592928
11102	NC_009380	CCGC	2	8	416980	416987	0 %	0 %	25 %	75 %	145592928
11103	NC_009380	GAT	2	6	417010	417015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592928
11104	NC_009380	GCCC	2	8	417026	417033	0 %	0 %	25 %	75 %	145592928
11105	NC_009380	GTT	2	6	417052	417057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592928
11106	NC_009380	GCC	2	6	417209	417214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592928
11107	NC_009380	CGG	2	6	417231	417236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592928
11108	NC_009380	GCC	2	6	417302	417307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592928
11109	NC_009380	CGT	2	6	417334	417339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592928
11110	NC_009380	GGT	2	6	417355	417360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592928
11111	NC_009380	CAG	2	6	417391	417396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592928
11112	NC_009380	GCC	2	6	417404	417409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592928
11113	NC_009380	AGC	2	6	417428	417433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592928
11114	NC_009380	GCC	2	6	417439	417444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592928
11115	NC_009380	GCTC	2	8	417575	417582	0 %	25 %	25 %	50 %	145592928
11116	NC_009380	CGGCC	2	10	417583	417592	0 %	0 %	40 %	60 %	145592928
11117	NC_009380	TCG	2	6	417614	417619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592928
11118	NC_009380	TCG	2	6	417647	417652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592928
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11120	NC_009380	GCG	2	6	417692	417697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592928
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11241	NC_009380	GCC	2	6	421875	421880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11242	NC_009380	TG	3	6	422002	422007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_009380	GTG	3	9	422032	422040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_009380	CGG	3	9	422042	422050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11245	NC_009380	CGACA	2	10	422063	422072	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11246	NC_009380	GGAT	2	8	422086	422093	25 %	25 %	50 %	0 %	145592932
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11252	NC_009380	CTG	2	6	422211	422216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592932
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11261	NC_009380	CGCC	2	8	422470	422477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11262	NC_009380	TGG	3	9	422491	422499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11275	NC_009380	CCT	2	6	422840	422845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11277	NC_009380	CAGC	2	8	422904	422911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11278	NC_009380	TGGGT	2	10	422942	422951	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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11281	NC_009380	TGC	2	6	422991	422996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11284	NC_009380	GTGCG	2	10	423033	423042	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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11357	NC_009380	GTAC	2	8	425539	425546	25 %	25 %	25 %	25 %	145592935
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11363	NC_009380	GCA	2	6	425712	425717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592935
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11487	NC_009380	CGG	2	6	430445	430450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592939
11488	NC_009380	TGG	2	6	430489	430494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592939
11489	NC_009380	GCC	2	6	430539	430544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592939
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11491	NC_009380	CCA	2	6	430604	430609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592939
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11496	NC_009380	CGA	2	6	430849	430854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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