MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009380	CCG	2	6	376695	376700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592891
10002	NC_009380	CCA	2	6	376731	376736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592891
10003	NC_009380	TGG	2	6	376755	376760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592891
10004	NC_009380	GCCG	2	8	376770	376777	0 %	0 %	50 %	50 %	145592891
10005	NC_009380	CCG	2	6	376811	376816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592891
10006	NC_009380	GCC	2	6	376849	376854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592891
10007	NC_009380	CGGC	2	8	376858	376865	0 %	0 %	50 %	50 %	145592891
10008	NC_009380	CAC	2	6	376873	376878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592891
10009	NC_009380	GCCG	2	8	376899	376906	0 %	0 %	50 %	50 %	145592891
10010	NC_009380	CGGC	2	8	376992	376999	0 %	0 %	50 %	50 %	145592891
10011	NC_009380	GCG	2	6	377051	377056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592891
10012	NC_009380	GAT	2	6	377062	377067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592891
10013	NC_009380	GTC	2	6	377083	377088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592891
10014	NC_009380	GTAC	2	8	377175	377182	25 %	25 %	25 %	25 %	145592891
10015	NC_009380	TCGGC	2	10	377220	377229	0 %	20 %	40 %	40 %	145592891
10016	NC_009380	GTG	2	6	377234	377239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592891
10017	NC_009380	CAC	2	6	377248	377253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592891
10018	NC_009380	CGGCG	2	10	377280	377289	0 %	0 %	60 %	40 %	145592891
10019	NC_009380	CGT	2	6	377320	377325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592891
10020	NC_009380	C	6	6	377335	377340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10021	NC_009380	CCT	2	6	377364	377369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592892
10022	NC_009380	CGGT	2	8	377564	377571	0 %	25 %	50 %	25 %	145592892
10023	NC_009380	CCA	2	6	377574	377579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592892
10024	NC_009380	TCCG	2	8	377590	377597	0 %	25 %	25 %	50 %	145592892
10025	NC_009380	GGCGC	2	10	377624	377633	0 %	0 %	60 %	40 %	145592892
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10029	NC_009380	CGGC	2	8	377721	377728	0 %	0 %	50 %	50 %	145592892
10030	NC_009380	ATC	2	6	377732	377737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592892
10031	NC_009380	CGG	2	6	377760	377765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592892
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10033	NC_009380	G	6	6	377847	377852	0 %	0 %	100 %	0 %	145592892
10034	NC_009380	GTA	2	6	377854	377859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592892
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10042	NC_009380	GCCG	2	8	378106	378113	0 %	0 %	50 %	50 %	145592892
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10050	NC_009380	CAG	2	6	378415	378420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592892
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10052	NC_009380	CGT	2	6	378549	378554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592892
10053	NC_009380	GGT	2	6	378564	378569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592892
10054	NC_009380	CGCT	2	8	378756	378763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_009380	CTC	2	6	378811	378816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_009380	CTC	2	6	378873	378878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10057	NC_009380	CTCA	2	8	378882	378889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_009380	CCT	2	6	378896	378901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_009380	AG	3	6	378939	378944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009380	CTC	2	6	378949	378954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_009380	GGT	2	6	378964	378969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009380	GCT	2	6	378992	378997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10065	NC_009380	GCG	2	6	379043	379048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_009380	GCCA	2	8	379064	379071	25 %	0 %	25 %	50 %	145592893
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10076	NC_009380	CAGG	2	8	379322	379329	25 %	0 %	50 %	25 %	145592893
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10088	NC_009380	CGTGC	2	10	379790	379799	0 %	20 %	40 %	40 %	145592893
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10091	NC_009380	ACG	2	6	379947	379952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592894
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10103	NC_009380	GTCG	2	8	380444	380451	0 %	25 %	50 %	25 %	145592894
10104	NC_009380	CGC	2	6	380470	380475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592894
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10106	NC_009380	CGGT	2	8	380524	380531	0 %	25 %	50 %	25 %	145592894
10107	NC_009380	TGC	2	6	380566	380571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592894
10108	NC_009380	GC	3	6	380576	380581	0 %	0 %	50 %	50 %	145592894
10109	NC_009380	GGTC	2	8	380623	380630	0 %	25 %	50 %	25 %	145592894
10110	NC_009380	TTC	2	6	380637	380642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592894
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10112	NC_009380	GCC	2	6	380708	380713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592894
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10120	NC_009380	CAGC	2	8	381090	381097	25 %	0 %	25 %	50 %	145592895
10121	NC_009380	GCC	3	9	381127	381135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592895
10122	NC_009380	CGGG	2	8	381229	381236	0 %	0 %	75 %	25 %	145592895
10123	NC_009380	TGG	2	6	381245	381250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592895
10124	NC_009380	TCG	2	6	381289	381294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592895
10125	NC_009380	CACC	2	8	381300	381307	25 %	0 %	0 %	75 %	145592895
10126	NC_009380	TCG	2	6	381325	381330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592895
10127	NC_009380	CAG	2	6	381345	381350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592895
10128	NC_009380	GAGC	2	8	381359	381366	25 %	0 %	50 %	25 %	145592895
10129	NC_009380	GC	3	6	381365	381370	0 %	0 %	50 %	50 %	145592895
10130	NC_009380	TCG	2	6	381377	381382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592895
10131	NC_009380	TCG	2	6	381406	381411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592895
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10133	NC_009380	GGCC	2	8	381455	381462	0 %	0 %	50 %	50 %	145592895
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10142	NC_009380	CGT	2	6	381757	381762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592895
10143	NC_009380	CCG	2	6	381770	381775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592895
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10150	NC_009380	GGC	3	9	382085	382093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592896
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10154	NC_009380	CGT	2	6	382222	382227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592896
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10164	NC_009380	GCG	2	6	382452	382457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592896
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10170	NC_009380	CG	3	6	382599	382604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10171	NC_009380	GCGG	2	8	382685	382692	0 %	0 %	75 %	25 %	145592897
10172	NC_009380	TCA	2	6	382742	382747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592897
10173	NC_009380	CCGT	2	8	382757	382764	0 %	25 %	25 %	50 %	145592897
10174	NC_009380	CCG	2	6	382775	382780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592897
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10177	NC_009380	GTCGAG	2	12	382893	382904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145592897
10178	NC_009380	CCG	2	6	382935	382940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592897
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10181	NC_009380	AGG	2	6	383008	383013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592897
10182	NC_009380	ACT	2	6	383104	383109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592897
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10184	NC_009380	G	6	6	383149	383154	0 %	0 %	100 %	0 %	145592897
10185	NC_009380	CGC	2	6	383207	383212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592897
10186	NC_009380	CCGG	2	8	383219	383226	0 %	0 %	50 %	50 %	145592897
10187	NC_009380	GAG	2	6	383250	383255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592897
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10190	NC_009380	GGT	2	6	383351	383356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592897
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10193	NC_009380	CGT	2	6	383427	383432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592897
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10212	NC_009380	GCCG	2	8	383910	383917	0 %	0 %	50 %	50 %	145592897
10213	NC_009380	GC	3	6	383918	383923	0 %	0 %	50 %	50 %	145592897
10214	NC_009380	GC	3	6	383938	383943	0 %	0 %	50 %	50 %	145592897
10215	NC_009380	ACGCC	2	10	383945	383954	20 %	0 %	20 %	60 %	145592897
10216	NC_009380	CCG	2	6	384083	384088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10217	NC_009380	CCTGG	2	10	384208	384217	0 %	20 %	40 %	40 %	145592898
10218	NC_009380	ATC	2	6	384290	384295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592898
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10222	NC_009380	CGGT	2	8	384420	384427	0 %	25 %	50 %	25 %	145592898
10223	NC_009380	CGGG	2	8	384442	384449	0 %	0 %	75 %	25 %	145592898
10224	NC_009380	CGG	2	6	384456	384461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592898
10225	NC_009380	CGA	2	6	384472	384477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592898
10226	NC_009380	CGA	2	6	384514	384519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592898
10227	NC_009380	CGG	2	6	384563	384568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592898
10228	NC_009380	GAGTGG	2	12	384569	384580	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	145592898
10229	NC_009380	GCG	2	6	384591	384596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592898
10230	NC_009380	GGCCG	2	10	384652	384661	0 %	0 %	60 %	40 %	145592898
10231	NC_009380	GCC	3	9	384692	384700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592898
10232	NC_009380	G	6	6	384703	384708	0 %	0 %	100 %	0 %	145592898
10233	NC_009380	GTGCG	2	10	384741	384750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10234	NC_009380	GCCG	2	8	384758	384765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10235	NC_009380	CG	3	6	384764	384769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10236	NC_009380	GGAC	2	8	384774	384781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10237	NC_009380	GGA	2	6	384786	384791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_009380	AGC	2	6	384811	384816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592899
10239	NC_009380	GGT	2	6	384826	384831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592899
10240	NC_009380	CGGAC	2	10	384841	384850	20 %	0 %	40 %	40 %	145592899
10241	NC_009380	CGC	2	6	384878	384883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592899
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10243	NC_009380	GCC	2	6	385049	385054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592899
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