MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009380	CTT	2	6	339358	339363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592863
9002	NC_009380	TGCG	2	8	339387	339394	0 %	25 %	50 %	25 %	145592863
9003	NC_009380	CGGCA	2	10	339401	339410	20 %	0 %	40 %	40 %	145592863
9004	NC_009380	TCA	2	6	339423	339428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592863
9005	NC_009380	GGC	2	6	339451	339456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592863
9006	NC_009380	CG	3	6	339541	339546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_009380	GGA	2	6	339563	339568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_009380	CGT	2	6	339587	339592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_009380	GCA	2	6	339602	339607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_009380	CG	3	6	339620	339625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_009380	GTC	2	6	339634	339639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_009380	GAC	2	6	339658	339663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_009380	TCG	2	6	339677	339682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_009380	GC	3	6	339690	339695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9015	NC_009380	TCC	2	6	339773	339778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592864
9016	NC_009380	CCG	2	6	339806	339811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592864
9017	NC_009380	CCG	2	6	339855	339860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592864
9018	NC_009380	GGT	2	6	339923	339928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592864
9019	NC_009380	GCG	2	6	339990	339995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592864
9020	NC_009380	CGGGG	2	10	340041	340050	0 %	0 %	80 %	20 %	145592864
9021	NC_009380	TCG	2	6	340071	340076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592864
9022	NC_009380	ACC	2	6	340096	340101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9023	NC_009380	ACCC	3	12	340133	340144	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9024	NC_009380	GAG	2	6	340180	340185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_009380	TTG	2	6	340241	340246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_009380	GAG	2	6	340285	340290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_009380	CGA	2	6	340327	340332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592865
9028	NC_009380	TGA	2	6	340339	340344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592865
9029	NC_009380	TCAGG	2	10	340347	340356	20 %	20 %	40 %	20 %	145592865
9030	NC_009380	GCC	2	6	340544	340549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9031	NC_009380	GC	3	6	340564	340569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_009380	CG	3	6	340580	340585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9033	NC_009380	GCTG	2	8	340586	340593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_009380	GGTGG	2	10	340621	340630	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_009380	CGG	2	6	340731	340736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_009380	ACT	2	6	340799	340804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_009380	CAC	2	6	340821	340826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9038	NC_009380	GCCA	2	8	340917	340924	25 %	0 %	25 %	50 %	145592866
9039	NC_009380	GAA	2	6	340938	340943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592866
9040	NC_009380	GGC	2	6	340951	340956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592866
9041	NC_009380	GCT	2	6	341013	341018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592866
9042	NC_009380	GCGCT	2	10	341051	341060	0 %	20 %	40 %	40 %	145592866
9043	NC_009380	CG	3	6	341065	341070	0 %	0 %	50 %	50 %	145592866
9044	NC_009380	CGC	2	6	341142	341147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592866
9045	NC_009380	CGC	2	6	341160	341165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592866
9046	NC_009380	AGCC	2	8	341190	341197	25 %	0 %	25 %	50 %	145592866
9047	NC_009380	CGC	2	6	341202	341207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592866
9048	NC_009380	CTC	2	6	341212	341217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592866
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9051	NC_009380	CAC	3	9	341293	341301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592866
9052	NC_009380	ACC	2	6	341328	341333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592866
9053	NC_009380	GACT	2	8	341389	341396	25 %	25 %	25 %	25 %	145592866
9054	NC_009380	CCG	2	6	341401	341406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592867
9055	NC_009380	TCGG	2	8	341424	341431	0 %	25 %	50 %	25 %	145592867
9056	NC_009380	TCAC	2	8	341446	341453	25 %	25 %	0 %	50 %	145592867
9057	NC_009380	AGC	2	6	341458	341463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592867
9058	NC_009380	GCCA	2	8	341522	341529	25 %	0 %	25 %	50 %	145592867
9059	NC_009380	CCA	2	6	341560	341565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592867
9060	NC_009380	GAC	2	6	341567	341572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592867
9061	NC_009380	CCG	2	6	341580	341585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592867
9062	NC_009380	CTGG	2	8	341603	341610	0 %	25 %	50 %	25 %	145592867
9063	NC_009380	CAA	2	6	341620	341625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592867
9064	NC_009380	CGCGG	2	10	341726	341735	0 %	0 %	60 %	40 %	145592867
9065	NC_009380	CGCGG	2	10	341786	341795	0 %	0 %	60 %	40 %	145592867
9066	NC_009380	GC	3	6	341820	341825	0 %	0 %	50 %	50 %	145592867
9067	NC_009380	CAC	2	6	342016	342021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592867
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9069	NC_009380	CGT	2	6	342124	342129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592867
9070	NC_009380	GGC	2	6	342143	342148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592867
9071	NC_009380	GAC	2	6	342284	342289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_009380	GCC	2	6	342371	342376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_009380	TTG	2	6	342392	342397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_009380	CGG	2	6	342403	342408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_009380	GGTT	3	12	342409	342420	0 %	50 %	50 %	0 %	145592868
9076	NC_009380	TGGTG	2	10	342423	342432	0 %	40 %	60 %	0 %	145592868
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9083	NC_009380	GCG	2	6	342648	342653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592868
9084	NC_009380	GGT	2	6	342713	342718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592868
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9090	NC_009380	GGT	2	6	342929	342934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592868
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9104	NC_009380	GAAG	2	8	343503	343510	50 %	0 %	50 %	0 %	145592868
9105	NC_009380	GCT	2	6	343517	343522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592868
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9111	NC_009380	TCG	2	6	343788	343793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592868
9112	NC_009380	GCG	2	6	343794	343799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592868
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9116	NC_009380	CGTC	2	8	344109	344116	0 %	25 %	25 %	50 %	145592868
9117	NC_009380	TGG	3	9	344161	344169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592868
9118	NC_009380	CGG	2	6	344170	344175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592868
9119	NC_009380	GCT	2	6	344186	344191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592868
9120	NC_009380	CGT	3	9	344194	344202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592868
9121	NC_009380	GCT	2	6	344240	344245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592868
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9124	NC_009380	TG	3	6	344409	344414	0 %	50 %	50 %	0 %	145592868
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9488	NC_009380	CGC	2	6	359113	359118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592871
9489	NC_009380	CGT	2	6	359163	359168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592871
9490	NC_009380	CGA	2	6	359172	359177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592871
9491	NC_009380	GTGC	2	8	359191	359198	0 %	25 %	50 %	25 %	145592871
9492	NC_009380	GTT	2	6	359206	359211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592871
9493	NC_009380	GCC	3	9	359278	359286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592871
9494	NC_009380	TGC	2	6	359327	359332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592871
9495	NC_009380	CGC	2	6	359367	359372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592871
9496	NC_009380	G	6	6	359397	359402	0 %	0 %	100 %	0 %	145592871
9497	NC_009380	GCCTCG	2	12	359444	359455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145592871
9498	NC_009380	TCG	2	6	359528	359533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592871
9499	NC_009380	CT	3	6	359597	359602	0 %	50 %	0 %	50 %	145592871
9500	NC_009380	AGC	2	6	359609	359614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592871

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