MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009380	CCT	2	6	232522	232527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592767
6002	NC_009380	TGC	2	6	232584	232589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592767
6003	NC_009380	CGG	2	6	232590	232595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592767
6004	NC_009380	CAC	2	6	232600	232605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592767
6005	NC_009380	CGA	2	6	232633	232638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592767
6006	NC_009380	GCG	2	6	232699	232704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_009380	CCG	2	6	232709	232714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_009380	GAC	2	6	232791	232796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592768
6009	NC_009380	CGC	2	6	232808	232813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592768
6010	NC_009380	GAC	2	6	232815	232820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592768
6011	NC_009380	CGGT	2	8	232825	232832	0 %	25 %	50 %	25 %	145592768
6012	NC_009380	GCT	2	6	232835	232840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592768
6013	NC_009380	GGC	2	6	232960	232965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592768
6014	NC_009380	TGG	2	6	232981	232986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592768
6015	NC_009380	GGT	2	6	233045	233050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592768
6016	NC_009380	CGGC	2	8	233080	233087	0 %	0 %	50 %	50 %	145592768
6017	NC_009380	TGC	2	6	233101	233106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592768
6018	NC_009380	CGG	2	6	233141	233146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592768
6019	NC_009380	CGG	3	9	233164	233172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592768
6020	NC_009380	GC	3	6	233177	233182	0 %	0 %	50 %	50 %	145592768
6021	NC_009380	CTT	2	6	233183	233188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592768
6022	NC_009380	CCG	2	6	233206	233211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_009380	CGG	2	6	233221	233226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_009380	ATC	2	6	233227	233232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_009380	GC	3	6	233248	233253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_009380	CGGT	2	8	233265	233272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_009380	GAT	2	6	233309	233314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592769
6028	NC_009380	CCA	2	6	233332	233337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592769
6029	NC_009380	GC	3	6	233419	233424	0 %	0 %	50 %	50 %	145592769
6030	NC_009380	GCG	2	6	233439	233444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592769
6031	NC_009380	GCGA	2	8	233496	233503	25 %	0 %	50 %	25 %	145592769
6032	NC_009380	CCGG	2	8	233515	233522	0 %	0 %	50 %	50 %	145592769
6033	NC_009380	CCG	2	6	233539	233544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592769
6034	NC_009380	GCT	2	6	233578	233583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592769
6035	NC_009380	GCA	2	6	233605	233610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592769
6036	NC_009380	GGA	2	6	233681	233686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592769
6037	NC_009380	CCA	2	6	233698	233703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592769
6038	NC_009380	CATGCC	2	12	233813	233824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145592769
6039	NC_009380	AGGT	2	8	233913	233920	25 %	25 %	50 %	0 %	145592769
6040	NC_009380	CTCG	2	8	233965	233972	0 %	25 %	25 %	50 %	145592769
6041	NC_009380	TC	3	6	233977	233982	0 %	50 %	0 %	50 %	145592769
6042	NC_009380	CGT	2	6	234037	234042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_009380	CGG	2	6	234082	234087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_009380	CGC	2	6	234162	234167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_009380	CGGT	2	8	234195	234202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_009380	TGC	2	6	234243	234248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_009380	GCTC	2	8	234285	234292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_009380	CCGG	2	8	234310	234317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_009380	GCG	2	6	234380	234385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009380	CTC	2	6	234395	234400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_009380	CGA	2	6	234449	234454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009380	AGC	2	6	234467	234472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_009380	GTC	2	6	234497	234502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_009380	CGG	2	6	234512	234517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592770
6055	NC_009380	TCG	2	6	234584	234589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592770
6056	NC_009380	AGT	2	6	234615	234620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592770
6057	NC_009380	GGC	2	6	234664	234669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592770
6058	NC_009380	GAG	2	6	234697	234702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592770
6059	NC_009380	GGGTC	2	10	234834	234843	0 %	20 %	60 %	20 %	145592770
6060	NC_009380	CTC	2	6	234904	234909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592770
6061	NC_009380	TCG	2	6	234942	234947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592770
6062	NC_009380	CAC	2	6	234996	235001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592770
6063	NC_009380	AGC	2	6	235013	235018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592770
6064	NC_009380	GGT	2	6	235020	235025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592770
6065	NC_009380	GC	3	6	235026	235031	0 %	0 %	50 %	50 %	145592770
6066	NC_009380	CCA	2	6	235104	235109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592770
6067	NC_009380	CTG	3	9	235138	235146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592770
6068	NC_009380	GCGG	2	8	235164	235171	0 %	0 %	75 %	25 %	145592770
6069	NC_009380	AGGT	2	8	235208	235215	25 %	25 %	50 %	0 %	145592770
6070	NC_009380	AGT	2	6	235248	235253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592770
6071	NC_009380	GCC	2	6	235257	235262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592770
6072	NC_009380	CCA	2	6	235266	235271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592770
6073	NC_009380	CAG	2	6	235321	235326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592770
6074	NC_009380	CAGC	2	8	235344	235351	25 %	0 %	25 %	50 %	145592770
6075	NC_009380	CGG	2	6	235386	235391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592770
6076	NC_009380	GCCA	2	8	235420	235427	25 %	0 %	25 %	50 %	145592770
6077	NC_009380	ATC	2	6	235517	235522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592770
6078	NC_009380	ACGT	2	8	235599	235606	25 %	25 %	25 %	25 %	145592771
6079	NC_009380	GCA	2	6	235614	235619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592771
6080	NC_009380	CGG	3	9	235657	235665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592771
6081	NC_009380	TCG	2	6	235689	235694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592771
6082	NC_009380	TCG	2	6	235716	235721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592771
6083	NC_009380	GGCT	2	8	235752	235759	0 %	25 %	50 %	25 %	145592771
6084	NC_009380	TGC	2	6	235845	235850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592771
6085	NC_009380	TGG	2	6	235859	235864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592771
6086	NC_009380	GCA	2	6	235955	235960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592771
6087	NC_009380	AGG	2	6	235977	235982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592771
6088	NC_009380	G	6	6	236019	236024	0 %	0 %	100 %	0 %	145592772
6089	NC_009380	GCT	2	6	236028	236033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592772
6090	NC_009380	CGC	2	6	236044	236049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592772
6091	NC_009380	CTC	2	6	236055	236060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592772
6092	NC_009380	AGT	2	6	236075	236080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592772
6093	NC_009380	GCCA	2	8	236107	236114	25 %	0 %	25 %	50 %	145592772
6094	NC_009380	CGG	2	6	236117	236122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592772
6095	NC_009380	GCG	2	6	236200	236205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592772
6096	NC_009380	CCG	2	6	236272	236277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592772
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6098	NC_009380	TGG	2	6	236296	236301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592772
6099	NC_009380	CGC	2	6	236306	236311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592772
6100	NC_009380	CGC	2	6	236347	236352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592772
6101	NC_009380	GA	3	6	236386	236391	50 %	0 %	50 %	0 %	145592772
6102	NC_009380	GCT	2	6	236405	236410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592772
6103	NC_009380	AGGG	2	8	236413	236420	25 %	0 %	75 %	0 %	145592772
6104	NC_009380	CTC	2	6	236421	236426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592772
6105	NC_009380	CTC	2	6	236457	236462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592772
6106	NC_009380	GCA	2	6	236549	236554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592772
6107	NC_009380	GAT	2	6	236568	236573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592772
6108	NC_009380	GAA	2	6	236627	236632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_009380	CCGG	2	8	236634	236641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_009380	GCC	2	6	236731	236736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_009380	ACC	2	6	236773	236778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592773
6112	NC_009380	GGT	2	6	236783	236788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592773
6113	NC_009380	CGC	2	6	236854	236859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592773
6114	NC_009380	CGG	3	9	236875	236883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592773
6115	NC_009380	CGGC	2	8	236901	236908	0 %	0 %	50 %	50 %	145592773
6116	NC_009380	CGG	2	6	237061	237066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_009380	CGGTGC	2	12	237096	237107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592774
6118	NC_009380	CGA	2	6	237111	237116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592774
6119	NC_009380	ACG	2	6	237125	237130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592774
6120	NC_009380	GCC	2	6	237145	237150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592774
6121	NC_009380	CGG	3	9	237246	237254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592774
6122	NC_009380	CGG	2	6	237261	237266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592774
6123	NC_009380	GCA	2	6	237285	237290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592774
6124	NC_009380	GCCA	2	8	237302	237309	25 %	0 %	25 %	50 %	145592774
6125	NC_009380	CCA	2	6	237321	237326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592774
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6232	NC_009380	GAC	2	6	241916	241921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6233	NC_009380	GAC	2	6	241928	241933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6234	NC_009380	GAC	2	6	241940	241945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6235	NC_009380	GGCC	2	8	241966	241973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6236	NC_009380	TTC	2	6	241980	241985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6237	NC_009380	GGA	2	6	242000	242005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6238	NC_009380	TCC	2	6	242078	242083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6239	NC_009380	GCCC	2	8	242114	242121	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6240	NC_009380	CAC	2	6	242122	242127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6241	NC_009380	C	6	6	242167	242172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6242	NC_009380	GCG	2	6	242175	242180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_009380	GCA	2	6	242212	242217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6244	NC_009380	G	6	6	242245	242250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_009380	GCC	2	6	242260	242265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6247	NC_009380	GCGGG	2	10	242354	242363	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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6490	NC_009380	TCG	2	6	251490	251495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592786
6491	NC_009380	CGA	2	6	251497	251502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592786
6492	NC_009380	GGT	2	6	251539	251544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592786
6493	NC_009380	CCT	2	6	251548	251553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592786
6494	NC_009380	CGA	2	6	251554	251559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592786
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6496	NC_009380	CGT	2	6	251611	251616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592786
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