MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 138746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009380	GCG	2	6	214145	214150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5502	NC_009380	AGC	2	6	214163	214168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592754
5503	NC_009380	CAG	3	9	214192	214200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592754
5504	NC_009380	ACCA	2	8	214201	214208	50 %	0 %	0 %	50 %	145592754
5505	NC_009380	CTC	2	6	214212	214217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592754
5506	NC_009380	ACCG	2	8	214221	214228	25 %	0 %	25 %	50 %	145592754
5507	NC_009380	CAG	2	6	214234	214239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592754
5508	NC_009380	CGAA	2	8	214259	214266	50 %	0 %	25 %	25 %	145592754
5509	NC_009380	GCCC	2	8	214272	214279	0 %	0 %	25 %	75 %	145592754
5510	NC_009380	GTG	2	6	214322	214327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592754
5511	NC_009380	GCG	2	6	214415	214420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5512	NC_009380	GCC	2	6	214430	214435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592754
5513	NC_009380	CGG	2	6	214436	214441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5514	NC_009380	GTG	2	6	214465	214470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592754
5515	NC_009380	ACGGCG	2	12	214472	214483	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145592754
5516	NC_009380	GTG	2	6	214532	214537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592754
5517	NC_009380	GC	3	6	214542	214547	0 %	0 %	50 %	50 %	145592754
5518	NC_009380	CGG	2	6	214554	214559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5519	NC_009380	GGCG	2	8	214569	214576	0 %	0 %	75 %	25 %	145592754
5520	NC_009380	CAG	2	6	214612	214617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592754
5521	NC_009380	CGG	2	6	214623	214628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5522	NC_009380	CGG	2	6	214641	214646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592754
5523	NC_009380	TCG	2	6	214700	214705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592754
5524	NC_009380	AGG	2	6	214748	214753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592755
5525	NC_009380	CGC	2	6	214766	214771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592755
5526	NC_009380	C	6	6	214771	214776	0 %	0 %	0 %	100 %	145592755
5527	NC_009380	CCG	2	6	214793	214798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592755
5528	NC_009380	CGG	2	6	214803	214808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5529	NC_009380	CCGG	2	8	214838	214845	0 %	0 %	50 %	50 %	145592755
5530	NC_009380	GCG	2	6	214909	214914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5531	NC_009380	GCG	2	6	214966	214971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5532	NC_009380	CGA	2	6	214985	214990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5533	NC_009380	G	6	6	215015	215020	0 %	0 %	100 %	0 %	145592755
5534	NC_009380	GCG	2	6	215071	215076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5535	NC_009380	CGA	2	6	215090	215095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5536	NC_009380	GCC	2	6	215097	215102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592755
5537	NC_009380	ACCG	2	8	215124	215131	25 %	0 %	25 %	50 %	145592755
5538	NC_009380	CAG	2	6	215133	215138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5539	NC_009380	GCCG	2	8	215176	215183	0 %	0 %	50 %	50 %	145592755
5540	NC_009380	GAG	2	6	215220	215225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592755
5541	NC_009380	GAG	2	6	215235	215240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592755
5542	NC_009380	CGG	2	6	215309	215314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5543	NC_009380	CGG	2	6	215318	215323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5544	NC_009380	AGCC	2	8	215329	215336	25 %	0 %	25 %	50 %	145592755
5545	NC_009380	TGC	2	6	215338	215343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5546	NC_009380	CGA	2	6	215351	215356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5549	NC_009380	GCT	2	6	215522	215527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5550	NC_009380	CTGG	2	8	215562	215569	0 %	25 %	50 %	25 %	145592755
5551	NC_009380	CGG	2	6	215570	215575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5552	NC_009380	CGA	2	6	215576	215581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5553	NC_009380	CGG	2	6	215591	215596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5554	NC_009380	TCGGTG	2	12	215611	215622	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145592755
5555	NC_009380	CGGC	2	8	215633	215640	0 %	0 %	50 %	50 %	145592755
5556	NC_009380	AGG	2	6	215656	215661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592755
5557	NC_009380	GGT	2	6	215685	215690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
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5559	NC_009380	TGG	2	6	215768	215773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
5560	NC_009380	ACCG	2	8	215799	215806	25 %	0 %	25 %	50 %	145592755
5561	NC_009380	TGG	2	6	215852	215857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
5562	NC_009380	CGT	2	6	215927	215932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5564	NC_009380	CGT	2	6	215957	215962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5565	NC_009380	GCGAA	2	10	216016	216025	40 %	0 %	40 %	20 %	145592755
5566	NC_009380	CGT	2	6	216074	216079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5569	NC_009380	CGTC	2	8	216319	216326	0 %	25 %	25 %	50 %	145592755
5570	NC_009380	TGG	2	6	216347	216352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
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5572	NC_009380	CGG	2	6	216401	216406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5573	NC_009380	GAC	3	9	216408	216416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5588	NC_009380	GACCG	2	10	217050	217059	20 %	0 %	40 %	40 %	145592755
5589	NC_009380	GTC	2	6	217065	217070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5591	NC_009380	ACC	2	6	217149	217154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592755
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5594	NC_009380	GTC	2	6	217266	217271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
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5603	NC_009380	GTG	2	6	217579	217584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
5604	NC_009380	GGCGG	2	10	217599	217608	0 %	0 %	80 %	20 %	145592755
5605	NC_009380	GAC	2	6	217620	217625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5606	NC_009380	CCAG	2	8	217655	217662	25 %	0 %	25 %	50 %	145592755
5607	NC_009380	CGG	2	6	217664	217669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
5608	NC_009380	CG	3	6	217696	217701	0 %	0 %	50 %	50 %	145592755
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5610	NC_009380	GCTGG	2	10	217732	217741	0 %	20 %	60 %	20 %	145592755
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5615	NC_009380	GC	3	6	217922	217927	0 %	0 %	50 %	50 %	145592755
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5621	NC_009380	GCC	2	6	218136	218141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592755
5622	NC_009380	ACG	2	6	218186	218191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5623	NC_009380	CGC	2	6	218192	218197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592755
5624	NC_009380	CGT	2	6	218202	218207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592755
5625	NC_009380	TGG	2	6	218225	218230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592755
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5633	NC_009380	CGG	2	6	218476	218481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592755
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5643	NC_009380	CGA	2	6	219063	219068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5646	NC_009380	CGTCG	2	10	219226	219235	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5742	NC_009380	GCA	2	6	222559	222564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5743	NC_009380	GCC	2	6	222658	222663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5744	NC_009380	GGT	3	9	222670	222678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5745	NC_009380	GCGGTG	2	12	222695	222706	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145592757
5746	NC_009380	GTC	2	6	222713	222718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5747	NC_009380	TGG	3	9	222726	222734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5748	NC_009380	GCT	2	6	222737	222742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5749	NC_009380	T	6	6	222742	222747	0 %	100 %	0 %	0 %	145592757
5750	NC_009380	CTCCG	2	10	222782	222791	0 %	20 %	20 %	60 %	145592757
5751	NC_009380	GGA	2	6	222805	222810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592757
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5753	NC_009380	TGG	2	6	222850	222855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592758
5754	NC_009380	CTGT	2	8	222873	222880	0 %	50 %	25 %	25 %	145592758
5755	NC_009380	GGC	2	6	222890	222895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592758
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5769	NC_009380	GAG	2	6	223352	223357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592759
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5782	NC_009380	CA	3	6	223778	223783	50 %	0 %	0 %	50 %	145592759
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5862	NC_009380	TCG	2	6	227486	227491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
5863	NC_009380	TGG	2	6	227512	227517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592762
5864	NC_009380	AGTG	2	8	227537	227544	25 %	25 %	50 %	0 %	145592762
5865	NC_009380	CCT	2	6	227600	227605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592762
5866	NC_009380	CGTCC	2	10	227622	227631	0 %	20 %	20 %	60 %	145592762
5867	NC_009380	TCG	2	6	227653	227658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
5868	NC_009380	CGA	2	6	227675	227680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592762
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5870	NC_009380	TCG	2	6	227749	227754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
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5872	NC_009380	GGA	2	6	227852	227857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592762
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5874	NC_009380	CGC	2	6	227877	227882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592762
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5879	NC_009380	CG	3	6	228025	228030	0 %	0 %	50 %	50 %	145592762
5880	NC_009380	GGCC	2	8	228038	228045	0 %	0 %	50 %	50 %	145592762
5881	NC_009380	GCC	2	6	228049	228054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592762
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5885	NC_009380	CGGAG	2	10	228161	228170	20 %	0 %	60 %	20 %	145592762
5886	NC_009380	TGA	2	6	228188	228193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592762
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5889	NC_009380	CGG	2	6	228325	228330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592762
5890	NC_009380	GCGG	2	8	228342	228349	0 %	0 %	75 %	25 %	145592762
5891	NC_009380	GTC	2	6	228369	228374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
5892	NC_009380	GTC	2	6	228381	228386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
5893	NC_009380	TCG	2	6	228463	228468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592762
5894	NC_009380	CCG	2	6	228517	228522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5895	NC_009380	CGG	2	6	228547	228552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5896	NC_009380	GCTGC	2	10	228594	228603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5897	NC_009380	TCA	2	6	228661	228666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592763
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5900	NC_009380	GTC	2	6	228801	228806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592763
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5931	NC_009380	GC	3	6	229807	229812	0 %	0 %	50 %	50 %	145592764
5932	NC_009380	C	6	6	229849	229854	0 %	0 %	0 %	100 %	145592764
5933	NC_009380	GC	3	6	229857	229862	0 %	0 %	50 %	50 %	145592764
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5940	NC_009380	GCC	2	6	230285	230290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592764
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5943	NC_009380	GCC	2	6	230379	230384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592764
5944	NC_009380	CTC	2	6	230405	230410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592764
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5948	NC_009380	GC	3	6	230547	230552	0 %	0 %	50 %	50 %	145592764
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5952	NC_009380	CCA	2	6	230787	230792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592765
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5965	NC_009380	TGC	2	6	231228	231233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592765
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5968	NC_009380	GTC	2	6	231319	231324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592765
5969	NC_009380	GAGCAG	2	12	231351	231362	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	145592765
5970	NC_009380	GCG	2	6	231378	231383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592765
5971	NC_009380	GGGA	2	8	231432	231439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5972	NC_009380	GAG	2	6	231450	231455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5973	NC_009380	GACC	2	8	231464	231471	25 %	0 %	25 %	50 %	145592766
5974	NC_009380	ACG	2	6	231475	231480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592766
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5977	NC_009380	CCA	2	6	231595	231600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592766
5978	NC_009380	TGC	2	6	231607	231612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592766
5979	NC_009380	TGG	2	6	231651	231656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592766
5980	NC_009380	CTGG	2	8	231680	231687	0 %	25 %	50 %	25 %	145592766
5981	NC_009380	CTG	3	9	231693	231701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592766
5982	NC_009380	TCG	3	9	231742	231750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592766
5983	NC_009380	CGG	3	9	231769	231777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592766
5984	NC_009380	TCG	2	6	231778	231783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592766
5985	NC_009380	GCC	2	6	231857	231862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5986	NC_009380	CTC	2	6	231887	231892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5987	NC_009380	GCG	2	6	231909	231914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5988	NC_009380	GCC	2	6	231925	231930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5989	NC_009380	GCGA	2	8	232004	232011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5990	NC_009380	GCCG	2	8	232065	232072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5991	NC_009380	CGA	2	6	232074	232079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_009380	CGA	2	6	232168	232173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592767
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