MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009332	GAT	2	6	160660	160665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473022
3502	NC_009332	CTT	2	6	160738	160743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473022
3503	NC_009332	GAT	2	6	160820	160825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473022
3504	NC_009332	GTT	2	6	160826	160831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473022
3505	NC_009332	GAA	2	6	160907	160912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473022
3506	NC_009332	CAA	2	6	161101	161106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473022
3507	NC_009332	ATTG	2	8	161149	161156	25 %	50 %	25 %	0 %	139473022
3508	NC_009332	ATG	2	6	161244	161249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473022
3509	NC_009332	AAGGT	2	10	161295	161304	40 %	20 %	40 %	0 %	139473022
3510	NC_009332	GAA	2	6	161342	161347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473022
3511	NC_009332	AAG	2	6	161352	161357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473022
3512	NC_009332	CAT	2	6	161404	161409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473022
3513	NC_009332	CAAA	2	8	161427	161434	75 %	0 %	0 %	25 %	139473022
3514	NC_009332	CGTCA	2	10	161492	161501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_009332	GTT	2	6	161586	161591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009332	TTA	3	9	161608	161616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009332	CTT	2	6	161665	161670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_009332	TG	3	6	161671	161676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009332	T	6	6	161687	161692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_009332	CTTTAT	2	12	161729	161740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3521	NC_009332	A	6	6	161867	161872	100 %	0 %	0 %	0 %	139473023
3522	NC_009332	GCC	2	6	162005	162010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139473023
3523	NC_009332	GCT	3	9	162035	162043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473023
3524	NC_009332	AGA	2	6	162055	162060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473023
3525	NC_009332	TCA	2	6	162069	162074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473023
3526	NC_009332	CT	3	6	162090	162095	0 %	50 %	0 %	50 %	139473023
3527	NC_009332	TCA	2	6	162162	162167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473023
3528	NC_009332	CAT	2	6	162175	162180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473023
3529	NC_009332	CGA	2	6	162195	162200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473023
3530	NC_009332	CTT	2	6	162215	162220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3531	NC_009332	ATC	2	6	162266	162271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473023
3532	NC_009332	CAA	3	9	162359	162367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473023
3533	NC_009332	A	6	6	162410	162415	100 %	0 %	0 %	0 %	139473023
3534	NC_009332	GAA	2	6	162416	162421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473023
3535	NC_009332	CTT	2	6	162448	162453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3536	NC_009332	TGT	2	6	162472	162477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473023
3537	NC_009332	AAGC	2	8	162587	162594	50 %	0 %	25 %	25 %	139473023
3538	NC_009332	TTC	2	6	162596	162601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3539	NC_009332	CT	3	6	162619	162624	0 %	50 %	0 %	50 %	139473023
3540	NC_009332	TGTT	2	8	162669	162676	0 %	75 %	25 %	0 %	139473023
3541	NC_009332	TTC	2	6	162769	162774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3542	NC_009332	CTT	2	6	162833	162838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3543	NC_009332	GTG	2	6	162927	162932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473023
3544	NC_009332	AGC	2	6	162940	162945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473023
3545	NC_009332	ATTT	2	8	162958	162965	25 %	75 %	0 %	0 %	139473023
3546	NC_009332	TGCTGT	2	12	162991	163002	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	139473023
3547	NC_009332	GGT	2	6	163022	163027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473023
3548	NC_009332	TTC	2	6	163050	163055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3549	NC_009332	TCT	2	6	163119	163124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473023
3550	NC_009332	TTA	2	6	163174	163179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473023
3551	NC_009332	AACAA	2	10	163231	163240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_009332	TAA	2	6	163241	163246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_009332	GGA	2	6	163256	163261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009332	A	6	6	163261	163266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_009332	TCAG	2	8	163370	163377	25 %	25 %	25 %	25 %	139473024
3556	NC_009332	CTT	2	6	163378	163383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473024
3557	NC_009332	TTGG	2	8	163482	163489	0 %	50 %	50 %	0 %	139473024
3558	NC_009332	GATG	2	8	163502	163509	25 %	25 %	50 %	0 %	139473024
3559	NC_009332	AAG	2	6	163534	163539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473024
3560	NC_009332	CTCTTT	2	12	163593	163604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_009332	GT	4	8	163629	163636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009332	ACA	2	6	163695	163700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473025
3563	NC_009332	TGAT	2	8	163767	163774	25 %	50 %	25 %	0 %	139473025
3564	NC_009332	TAC	2	6	163796	163801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473025
3565	NC_009332	CAT	2	6	163807	163812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473025
3566	NC_009332	TTA	2	6	163837	163842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473025
3567	NC_009332	CA	3	6	164000	164005	50 %	0 %	0 %	50 %	139473025
3568	NC_009332	TGG	2	6	164064	164069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473025
3569	NC_009332	AGA	2	6	164104	164109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473025
3570	NC_009332	CTTA	2	8	164124	164131	25 %	50 %	0 %	25 %	139473025
3571	NC_009332	ATG	2	6	164182	164187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_009332	AGC	2	6	164308	164313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473026
3573	NC_009332	GTTT	2	8	164357	164364	0 %	75 %	25 %	0 %	139473026
3574	NC_009332	GTG	2	6	164484	164489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473026
3575	NC_009332	CGA	2	6	164517	164522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473026
3576	NC_009332	AGC	2	6	164536	164541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473026
3577	NC_009332	AGA	2	6	164557	164562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473026
3578	NC_009332	ACC	2	6	164661	164666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473026
3579	NC_009332	CTT	2	6	164681	164686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473026
3580	NC_009332	ATTG	2	8	164731	164738	25 %	50 %	25 %	0 %	139473026
3581	NC_009332	TGG	2	6	164764	164769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473026
3582	NC_009332	AGA	2	6	164848	164853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473026
3583	NC_009332	CTG	2	6	164856	164861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473026
3584	NC_009332	GCG	2	6	164864	164869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473026
3585	NC_009332	TGTC	2	8	165016	165023	0 %	50 %	25 %	25 %	139473027
3586	NC_009332	GC	3	6	165045	165050	0 %	0 %	50 %	50 %	139473027
3587	NC_009332	GAA	2	6	165066	165071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473027
3588	NC_009332	TGA	2	6	165196	165201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473027
3589	NC_009332	GAA	2	6	165273	165278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473027
3590	NC_009332	GAA	2	6	165339	165344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473027
3591	NC_009332	TG	3	6	165606	165611	0 %	50 %	50 %	0 %	139473027
3592	NC_009332	T	6	6	165662	165667	0 %	100 %	0 %	0 %	139473027
3593	NC_009332	GGA	2	6	165701	165706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473027
3594	NC_009332	GCT	2	6	165714	165719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473027
3595	NC_009332	AAG	2	6	165724	165729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473027
3596	NC_009332	ATA	2	6	165773	165778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473027
3597	NC_009332	TCA	2	6	165905	165910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473028
3598	NC_009332	GTT	2	6	165955	165960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473028
3599	NC_009332	CTT	2	6	166001	166006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473028
3600	NC_009332	CAGG	2	8	166099	166106	25 %	0 %	50 %	25 %	139473028
3601	NC_009332	ACT	2	6	166142	166147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473028
3602	NC_009332	TC	3	6	166174	166179	0 %	50 %	0 %	50 %	139473028
3603	NC_009332	AGA	2	6	166233	166238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473028
3604	NC_009332	GTG	2	6	166282	166287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473028
3605	NC_009332	AGA	2	6	166353	166358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473028
3606	NC_009332	AATC	2	8	166389	166396	50 %	25 %	0 %	25 %	139473028
3607	NC_009332	ATT	2	6	166436	166441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473028
3608	NC_009332	TTA	2	6	166464	166469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473028
3609	NC_009332	TTA	2	6	166497	166502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009332	TGT	2	6	166629	166634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473029
3611	NC_009332	GGTGTT	2	12	166659	166670	0 %	50 %	50 %	0 %	139473029
3612	NC_009332	TTA	2	6	166713	166718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009332	GGAT	2	8	166776	166783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009332	AG	3	6	166788	166793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_009332	ATG	2	6	166807	166812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473030
3616	NC_009332	CGT	2	6	166909	166914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473030
3617	NC_009332	TTA	2	6	166920	166925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473030
3618	NC_009332	CGG	2	6	167006	167011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473030
3619	NC_009332	GCT	2	6	167020	167025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473030
3620	NC_009332	TTA	3	9	167032	167040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473030
3621	NC_009332	GAA	2	6	167041	167046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473030
3622	NC_009332	TGA	2	6	167076	167081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473030
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3624	NC_009332	CTGA	2	8	167188	167195	25 %	25 %	25 %	25 %	139473030
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