MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_009332	AAT	2	6	1454491	1454496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474286
31003	NC_009332	TTCT	2	8	1454573	1454580	0 %	75 %	0 %	25 %	139474287
31004	NC_009332	GC	3	6	1454690	1454695	0 %	0 %	50 %	50 %	139474287
31005	NC_009332	T	7	7	1454707	1454713	0 %	100 %	0 %	0 %	139474287
31006	NC_009332	GAT	3	9	1454735	1454743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474287
31007	NC_009332	CCA	2	6	1454764	1454769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474287
31008	NC_009332	ACA	3	9	1454826	1454834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474287
31009	NC_009332	TTG	2	6	1454855	1454860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474287
31010	NC_009332	GAT	2	6	1454914	1454919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474287
31011	NC_009332	TCT	2	6	1454931	1454936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474287
31012	NC_009332	CTT	2	6	1454953	1454958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474287
31013	NC_009332	TAA	2	6	1454972	1454977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474287
31014	NC_009332	ATT	2	6	1454996	1455001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474287
31015	NC_009332	CTT	2	6	1455028	1455033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474287
31016	NC_009332	TCA	2	6	1455057	1455062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474287
31017	NC_009332	TGA	2	6	1455106	1455111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474287
31018	NC_009332	GTC	2	6	1455158	1455163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474287
31019	NC_009332	TTCTGT	2	12	1455308	1455319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	139474287
31020	NC_009332	TTA	2	6	1455339	1455344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474287
31021	NC_009332	GGT	2	6	1455347	1455352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474287
31022	NC_009332	ATG	2	6	1455369	1455374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474287
31023	NC_009332	T	6	6	1455379	1455384	0 %	100 %	0 %	0 %	139474287
31024	NC_009332	GAC	2	6	1455427	1455432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474287
31025	NC_009332	TCCTT	2	10	1455528	1455537	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31026	NC_009332	CAT	2	6	1455550	1455555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31027	NC_009332	CTTT	2	8	1455575	1455582	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31028	NC_009332	ATA	2	6	1455620	1455625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474288
31029	NC_009332	ATC	2	6	1455653	1455658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474288
31030	NC_009332	CTG	2	6	1455669	1455674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474288
31031	NC_009332	TAGC	2	8	1455693	1455700	25 %	25 %	25 %	25 %	139474288
31032	NC_009332	A	7	7	1455776	1455782	100 %	0 %	0 %	0 %	139474288
31033	NC_009332	A	6	6	1455823	1455828	100 %	0 %	0 %	0 %	139474288
31034	NC_009332	TTC	2	6	1455883	1455888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474288
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31036	NC_009332	TAT	2	6	1455969	1455974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474288
31037	NC_009332	TCT	2	6	1456032	1456037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474289
31038	NC_009332	CAT	2	6	1456193	1456198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474289
31039	NC_009332	CAG	2	6	1456216	1456221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474289
31040	NC_009332	TAAA	2	8	1456237	1456244	75 %	25 %	0 %	0 %	139474289
31041	NC_009332	CTT	2	6	1456326	1456331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474289
31042	NC_009332	TTTCTT	2	12	1456357	1456368	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	139474289
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31045	NC_009332	ATT	2	6	1456522	1456527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31046	NC_009332	TAA	2	6	1456669	1456674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474290
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31049	NC_009332	GGT	2	6	1456913	1456918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474290
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31051	NC_009332	CTA	2	6	1457070	1457075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474290
31052	NC_009332	CAA	2	6	1457091	1457096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474290
31053	NC_009332	TAA	2	6	1457097	1457102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474290
31054	NC_009332	GAG	2	6	1457115	1457120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474290
31055	NC_009332	CAT	2	6	1457121	1457126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474290
31056	NC_009332	GA	3	6	1457156	1457161	50 %	0 %	50 %	0 %	139474290
31057	NC_009332	ATA	2	6	1457177	1457182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474290
31058	NC_009332	ATC	2	6	1457194	1457199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474290
31059	NC_009332	TCC	2	6	1457207	1457212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31060	NC_009332	CAT	2	6	1457232	1457237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31061	NC_009332	CTGG	2	8	1457286	1457293	0 %	25 %	50 %	25 %	139474291
31062	NC_009332	ATA	2	6	1457369	1457374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474291
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31064	NC_009332	AATC	2	8	1457424	1457431	50 %	25 %	0 %	25 %	139474291
31065	NC_009332	ATCA	2	8	1457461	1457468	50 %	25 %	0 %	25 %	139474291
31066	NC_009332	ATG	2	6	1457570	1457575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474291
31067	NC_009332	TTTC	2	8	1457748	1457755	0 %	75 %	0 %	25 %	139474291
31068	NC_009332	A	6	6	1457768	1457773	100 %	0 %	0 %	0 %	139474291
31069	NC_009332	ATA	2	6	1457813	1457818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474291
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31072	NC_009332	CAT	2	6	1457910	1457915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474291
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31082	NC_009332	ATC	2	6	1458403	1458408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31084	NC_009332	ACT	2	6	1458443	1458448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31086	NC_009332	T	7	7	1458509	1458515	0 %	100 %	0 %	0 %	139474292
31087	NC_009332	TAA	2	6	1458586	1458591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474292
31088	NC_009332	AAG	2	6	1458661	1458666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474292
31089	NC_009332	GAATA	2	10	1458692	1458701	60 %	20 %	20 %	0 %	139474292
31090	NC_009332	GGT	2	6	1458908	1458913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474292
31091	NC_009332	TTC	2	6	1458921	1458926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474292
31092	NC_009332	CTC	2	6	1458948	1458953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474292
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31094	NC_009332	TGA	2	6	1459094	1459099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474292
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31097	NC_009332	ATC	2	6	1459251	1459256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474292
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31099	NC_009332	ACC	2	6	1459293	1459298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474292
31100	NC_009332	TTGG	2	8	1459306	1459313	0 %	50 %	50 %	0 %	139474292
31101	NC_009332	TGA	2	6	1459327	1459332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474292
31102	NC_009332	TGC	2	6	1459343	1459348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474292
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31105	NC_009332	TGTT	2	8	1459461	1459468	0 %	75 %	25 %	0 %	139474292
31106	NC_009332	CGT	2	6	1459511	1459516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474292
31107	NC_009332	AAT	2	6	1459533	1459538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474292
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31109	NC_009332	GAGG	2	8	1459581	1459588	25 %	0 %	75 %	0 %	139474292
31110	NC_009332	TGG	2	6	1459612	1459617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474292
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31113	NC_009332	TTC	2	6	1459758	1459763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474292
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31115	NC_009332	CT	3	6	1459841	1459846	0 %	50 %	0 %	50 %	139474292
31116	NC_009332	ATC	2	6	1459878	1459883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474292
31117	NC_009332	CCAA	2	8	1459889	1459896	50 %	0 %	0 %	50 %	139474292
31118	NC_009332	ACC	2	6	1459992	1459997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474292
31119	NC_009332	ACC	2	6	1460043	1460048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474292
31120	NC_009332	GCT	3	9	1460119	1460127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474292
31121	NC_009332	CAA	2	6	1460147	1460152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474292
31122	NC_009332	CCT	2	6	1460239	1460244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31123	NC_009332	ATC	2	6	1460266	1460271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31124	NC_009332	ATA	2	6	1460309	1460314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31125	NC_009332	TTC	2	6	1460319	1460324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31126	NC_009332	TAA	2	6	1460388	1460393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31127	NC_009332	ACA	2	6	1460444	1460449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31128	NC_009332	A	6	6	1460503	1460508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31129	NC_009332	T	8	8	1460527	1460534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31130	NC_009332	ACATGA	2	12	1460562	1460573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	139474293
31131	NC_009332	CTT	3	9	1460848	1460856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474293
31132	NC_009332	GCT	2	6	1460862	1460867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474293
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31142	NC_009332	CTT	2	6	1461136	1461141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474293
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31151	NC_009332	T	7	7	1461773	1461779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31152	NC_009332	GAAA	2	8	1461780	1461787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31153	NC_009332	TAA	3	9	1461802	1461810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31154	NC_009332	T	6	6	1461844	1461849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31155	NC_009332	TCA	2	6	1461887	1461892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474294
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31181	NC_009332	T	6	6	1463172	1463177	0 %	100 %	0 %	0 %	139474296
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31192	NC_009332	CTTT	2	8	1463520	1463527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31193	NC_009332	A	7	7	1463528	1463534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31223	NC_009332	T	6	6	1465036	1465041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31224	NC_009332	ACC	2	6	1465045	1465050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31225	NC_009332	T	6	6	1465067	1465072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31226	NC_009332	ATG	2	6	1465081	1465086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31227	NC_009332	TAT	2	6	1465130	1465135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31228	NC_009332	T	6	6	1465145	1465150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31229	NC_009332	A	6	6	1465174	1465179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31230	NC_009332	T	7	7	1465247	1465253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31231	NC_009332	TTTAGC	2	12	1465345	1465356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	139474299
31232	NC_009332	ACC	2	6	1465468	1465473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474299
31233	NC_009332	CATC	2	8	1465500	1465507	25 %	25 %	0 %	50 %	139474299
31234	NC_009332	GAC	2	6	1465566	1465571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474299
31235	NC_009332	CAT	2	6	1465582	1465587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474299
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31343	NC_009332	TC	3	6	1470163	1470168	0 %	50 %	0 %	50 %	139474302
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31347	NC_009332	A	7	7	1470504	1470510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31348	NC_009332	ATA	2	6	1470520	1470525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31350	NC_009332	TGA	2	6	1470566	1470571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31351	NC_009332	A	6	6	1470577	1470582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31352	NC_009332	T	6	6	1470650	1470655	0 %	100 %	0 %	0 %	139474303
31353	NC_009332	T	8	8	1470657	1470664	0 %	100 %	0 %	0 %	139474303
31354	NC_009332	CATC	2	8	1470666	1470673	25 %	25 %	0 %	50 %	139474303
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