MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_009332	ACA	2	6	1432022	1432027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474259
30503	NC_009332	AGA	2	6	1432038	1432043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474259
30504	NC_009332	G	6	6	1432061	1432066	0 %	0 %	100 %	0 %	139474259
30505	NC_009332	AAG	2	6	1432175	1432180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474259
30506	NC_009332	GCC	2	6	1432196	1432201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139474259
30507	NC_009332	AAAC	2	8	1432279	1432286	75 %	0 %	0 %	25 %	139474259
30508	NC_009332	ATG	3	9	1432306	1432314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474259
30509	NC_009332	GCT	2	6	1432318	1432323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474259
30510	NC_009332	TGAT	2	8	1432400	1432407	25 %	50 %	25 %	0 %	139474259
30511	NC_009332	AAG	2	6	1432415	1432420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474259
30512	NC_009332	AGA	2	6	1432491	1432496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474259
30513	NC_009332	GAATTA	2	12	1432682	1432693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	139474260
30514	NC_009332	A	6	6	1432781	1432786	100 %	0 %	0 %	0 %	139474260
30515	NC_009332	TAT	2	6	1432847	1432852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474260
30516	NC_009332	TTCA	2	8	1432853	1432860	25 %	50 %	0 %	25 %	139474260
30517	NC_009332	AAC	2	6	1432898	1432903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474260
30518	NC_009332	AAC	2	6	1432914	1432919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30519	NC_009332	TGT	2	6	1432937	1432942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30520	NC_009332	T	6	6	1432947	1432952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_009332	ATT	2	6	1432976	1432981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30522	NC_009332	GAAA	2	8	1433038	1433045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30523	NC_009332	ACT	2	6	1433056	1433061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474261
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30526	NC_009332	CCAA	2	8	1433145	1433152	50 %	0 %	0 %	50 %	139474261
30527	NC_009332	TGA	2	6	1433176	1433181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474261
30528	NC_009332	AGCT	2	8	1433217	1433224	25 %	25 %	25 %	25 %	139474261
30529	NC_009332	AAG	2	6	1433301	1433306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474261
30530	NC_009332	ATTAC	2	10	1433316	1433325	40 %	40 %	0 %	20 %	139474261
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30535	NC_009332	TTAT	2	8	1433792	1433799	25 %	75 %	0 %	0 %	139474261
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30538	NC_009332	AT	3	6	1433911	1433916	50 %	50 %	0 %	0 %	139474261
30539	NC_009332	A	7	7	1433939	1433945	100 %	0 %	0 %	0 %	139474261
30540	NC_009332	CT	3	6	1433949	1433954	0 %	50 %	0 %	50 %	139474261
30541	NC_009332	ATTAA	2	10	1433973	1433982	60 %	40 %	0 %	0 %	139474261
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30543	NC_009332	CTTT	2	8	1434028	1434035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30544	NC_009332	CCTT	2	8	1434083	1434090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30545	NC_009332	ATTAA	2	10	1434197	1434206	60 %	40 %	0 %	0 %	139474262
30546	NC_009332	GTT	2	6	1434266	1434271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474262
30547	NC_009332	TCA	2	6	1434372	1434377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474262
30548	NC_009332	CT	3	6	1434477	1434482	0 %	50 %	0 %	50 %	139474262
30549	NC_009332	TTA	2	6	1434486	1434491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474262
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30551	NC_009332	GTTC	2	8	1434541	1434548	0 %	50 %	25 %	25 %	139474262
30552	NC_009332	GCT	3	9	1434575	1434583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474262
30553	NC_009332	GAT	2	6	1434623	1434628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474262
30554	NC_009332	TTG	2	6	1434687	1434692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474262
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30556	NC_009332	ATG	2	6	1434741	1434746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474262
30557	NC_009332	TCT	2	6	1434770	1434775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474262
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30560	NC_009332	A	7	7	1434833	1434839	100 %	0 %	0 %	0 %	139474262
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30562	NC_009332	CA	3	6	1434934	1434939	50 %	0 %	0 %	50 %	139474263
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30591	NC_009332	GGACT	2	10	1436061	1436070	20 %	20 %	40 %	20 %	139474264
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30600	NC_009332	ACTG	2	8	1436490	1436497	25 %	25 %	25 %	25 %	139474264
30601	NC_009332	CTA	2	6	1436503	1436508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30602	NC_009332	A	8	8	1436518	1436525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30603	NC_009332	AACT	2	8	1436536	1436543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30604	NC_009332	T	9	9	1436547	1436555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30605	NC_009332	TAC	2	6	1436621	1436626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474265
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30610	NC_009332	T	6	6	1437151	1437156	0 %	100 %	0 %	0 %	139474265
30611	NC_009332	AT	3	6	1437226	1437231	50 %	50 %	0 %	0 %	139474265
30612	NC_009332	TTG	3	9	1437234	1437242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474265
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30615	NC_009332	ACCTT	2	10	1437334	1437343	20 %	40 %	0 %	40 %	139474266
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30617	NC_009332	T	6	6	1437541	1437546	0 %	100 %	0 %	0 %	139474266
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