MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30118	NC_009332	ATG	2	6	1413355	1413360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30235	NC_009332	TCA	2	6	1419643	1419648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474248
30236	NC_009332	GCA	2	6	1419688	1419693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474248
30237	NC_009332	ATC	3	9	1419774	1419782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474248
30238	NC_009332	ACA	2	6	1419787	1419792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474248
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30240	NC_009332	TGA	2	6	1419869	1419874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474248
30241	NC_009332	TCA	2	6	1419895	1419900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474248
30242	NC_009332	GCT	2	6	1419901	1419906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474248
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30245	NC_009332	ACA	2	6	1419971	1419976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474248
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30254	NC_009332	T	6	6	1420193	1420198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30255	NC_009332	TTTC	2	8	1420265	1420272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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30288	NC_009332	ACA	2	6	1421898	1421903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30289	NC_009332	CCTT	2	8	1421908	1421915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30290	NC_009332	TC	3	6	1421969	1421974	0 %	50 %	0 %	50 %	139474251
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30335	NC_009332	TAT	2	6	1424623	1424628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30336	NC_009332	AAG	2	6	1424641	1424646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30337	NC_009332	T	6	6	1424665	1424670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30338	NC_009332	AAGA	2	8	1424671	1424678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30339	NC_009332	AAG	2	6	1424681	1424686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30340	NC_009332	TTC	2	6	1424774	1424779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
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30343	NC_009332	T	6	6	1424911	1424916	0 %	100 %	0 %	0 %	139474254
30344	NC_009332	CCAA	2	8	1425034	1425041	50 %	0 %	0 %	50 %	139474254
30345	NC_009332	TTC	2	6	1425134	1425139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
30346	NC_009332	CAA	2	6	1425179	1425184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474254
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30349	NC_009332	TCA	2	6	1425306	1425311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
30350	NC_009332	TCA	2	6	1425351	1425356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
30351	NC_009332	ATA	2	6	1425362	1425367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474254
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30353	NC_009332	TTC	2	6	1425470	1425475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
30354	NC_009332	CAT	2	6	1425508	1425513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
30355	NC_009332	CAT	2	6	1425575	1425580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
30356	NC_009332	TGTGG	2	10	1425646	1425655	0 %	40 %	60 %	0 %	139474254
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30362	NC_009332	CTT	2	6	1425889	1425894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
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30364	NC_009332	T	6	6	1425986	1425991	0 %	100 %	0 %	0 %	139474254
30365	NC_009332	CAT	2	6	1426022	1426027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
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30367	NC_009332	ATC	2	6	1426202	1426207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474254
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30369	NC_009332	CTT	2	6	1426240	1426245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
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30372	NC_009332	TCT	2	6	1426497	1426502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474254
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30379	NC_009332	CCCT	2	8	1426785	1426792	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30380	NC_009332	CAAAA	2	10	1426821	1426830	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30381	NC_009332	A	7	7	1426827	1426833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30382	NC_009332	A	6	6	1426890	1426895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30383	NC_009332	AGGA	2	8	1426955	1426962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30384	NC_009332	CCA	2	6	1426992	1426997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30385	NC_009332	ATT	2	6	1427045	1427050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30446	NC_009332	TAT	2	6	1429503	1429508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30447	NC_009332	T	6	6	1429562	1429567	0 %	100 %	0 %	0 %	139474257
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30455	NC_009332	ATC	2	6	1429967	1429972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474257
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30457	NC_009332	TGA	2	6	1430076	1430081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474257
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30465	NC_009332	TCA	2	6	1430235	1430240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474257
30466	NC_009332	ATATT	2	10	1430256	1430265	40 %	60 %	0 %	0 %	139474257
30467	NC_009332	GCG	2	6	1430274	1430279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139474257
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30469	NC_009332	CG	3	6	1430376	1430381	0 %	0 %	50 %	50 %	139474257
30470	NC_009332	AAC	2	6	1430465	1430470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474257
30471	NC_009332	CAT	2	6	1430512	1430517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474257
30472	NC_009332	ATC	2	6	1430531	1430536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474257
30473	NC_009332	T	6	6	1430545	1430550	0 %	100 %	0 %	0 %	139474257
30474	NC_009332	T	6	6	1430670	1430675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30475	NC_009332	T	7	7	1430680	1430686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30476	NC_009332	A	6	6	1430688	1430693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30477	NC_009332	AGTA	2	8	1430695	1430702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30478	NC_009332	AAG	2	6	1430705	1430710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30479	NC_009332	TTC	2	6	1430815	1430820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474258
30480	NC_009332	TTGT	2	8	1430848	1430855	0 %	75 %	25 %	0 %	139474258
30481	NC_009332	CAG	2	6	1430993	1430998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474258
30482	NC_009332	ACC	2	6	1431023	1431028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474258
30483	NC_009332	TGA	2	6	1431126	1431131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474258
30484	NC_009332	ATG	2	6	1431142	1431147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474258
30485	NC_009332	TGAAA	2	10	1431243	1431252	60 %	20 %	20 %	0 %	139474258
30486	NC_009332	A	6	6	1431250	1431255	100 %	0 %	0 %	0 %	139474258
30487	NC_009332	AAT	2	6	1431301	1431306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474258
30488	NC_009332	CTT	2	6	1431358	1431363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474258
30489	NC_009332	GCT	2	6	1431517	1431522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474258
30490	NC_009332	TGC	3	9	1431531	1431539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474258
30491	NC_009332	ACC	2	6	1431581	1431586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474258
30492	NC_009332	CAT	2	6	1431630	1431635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474258
30493	NC_009332	GAA	2	6	1431658	1431663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474258
30494	NC_009332	AAAC	2	8	1431822	1431829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30495	NC_009332	AAGG	2	8	1431838	1431845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30496	NC_009332	TCA	2	6	1431867	1431872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474259
30497	NC_009332	AGCA	2	8	1431881	1431888	50 %	0 %	25 %	25 %	139474259
30498	NC_009332	GAA	2	6	1431922	1431927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474259
30499	NC_009332	TGA	2	6	1431936	1431941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474259
30500	NC_009332	TGC	2	6	1431963	1431968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474259

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