MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_009332	ATC	2	6	1315283	1315288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474152
28003	NC_009332	AGAATA	2	12	1315293	1315304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	139474152
28004	NC_009332	TTGGA	2	10	1315366	1315375	20 %	40 %	40 %	0 %	139474152
28005	NC_009332	TCT	2	6	1315455	1315460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474152
28006	NC_009332	A	6	6	1315571	1315576	100 %	0 %	0 %	0 %	139474152
28007	NC_009332	A	7	7	1315766	1315772	100 %	0 %	0 %	0 %	139474152
28008	NC_009332	CT	3	6	1315857	1315862	0 %	50 %	0 %	50 %	139474152
28009	NC_009332	CTT	2	6	1315917	1315922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28010	NC_009332	ATTA	2	8	1315931	1315938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28011	NC_009332	T	6	6	1315954	1315959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28012	NC_009332	A	7	7	1316104	1316110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28013	NC_009332	ATA	2	6	1316147	1316152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28014	NC_009332	ATA	2	6	1316215	1316220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28015	NC_009332	TAT	2	6	1316230	1316235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474153
28016	NC_009332	CTA	2	6	1316255	1316260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474153
28017	NC_009332	TTG	2	6	1316277	1316282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474153
28018	NC_009332	GAC	2	6	1316345	1316350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474153
28019	NC_009332	ATA	2	6	1316359	1316364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474153
28020	NC_009332	AAG	2	6	1316437	1316442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474153
28021	NC_009332	T	6	6	1316631	1316636	0 %	100 %	0 %	0 %	139474153
28022	NC_009332	T	6	6	1316721	1316726	0 %	100 %	0 %	0 %	139474153
28023	NC_009332	CAA	2	6	1316843	1316848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474153
28024	NC_009332	CTA	2	6	1317061	1317066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474153
28025	NC_009332	AGT	2	6	1317071	1317076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474153
28026	NC_009332	A	6	6	1317093	1317098	100 %	0 %	0 %	0 %	139474153
28027	NC_009332	TTGT	2	8	1317287	1317294	0 %	75 %	25 %	0 %	139474153
28028	NC_009332	A	7	7	1317295	1317301	100 %	0 %	0 %	0 %	139474153
28029	NC_009332	TGA	2	6	1317316	1317321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474153
28030	NC_009332	TCA	2	6	1317361	1317366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474153
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28033	NC_009332	TGGT	2	8	1317430	1317437	0 %	50 %	50 %	0 %	139474153
28034	NC_009332	TAAC	2	8	1317469	1317476	50 %	25 %	0 %	25 %	139474153
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28037	NC_009332	GCT	2	6	1317560	1317565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474153
28038	NC_009332	TTTG	2	8	1317566	1317573	0 %	75 %	25 %	0 %	139474153
28039	NC_009332	AAT	2	6	1317616	1317621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474153
28040	NC_009332	AGC	2	6	1317750	1317755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474153
28041	NC_009332	GAA	2	6	1317782	1317787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474153
28042	NC_009332	TTGG	2	8	1317790	1317797	0 %	50 %	50 %	0 %	139474153
28043	NC_009332	TCT	2	6	1317823	1317828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474153
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28046	NC_009332	TTG	2	6	1318063	1318068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474153
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28051	NC_009332	A	7	7	1318372	1318378	100 %	0 %	0 %	0 %	139474153
28052	NC_009332	CAA	2	6	1318421	1318426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474153
28053	NC_009332	TCAA	2	8	1318438	1318445	50 %	25 %	0 %	25 %	139474153
28054	NC_009332	AAT	2	6	1318575	1318580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474153
28055	NC_009332	ATA	2	6	1318594	1318599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474153
28056	NC_009332	AAT	2	6	1318614	1318619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474153
28057	NC_009332	ACT	2	6	1318657	1318662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474153
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28059	NC_009332	TAT	2	6	1318700	1318705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474153
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28061	NC_009332	T	6	6	1318781	1318786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28062	NC_009332	A	6	6	1318796	1318801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28063	NC_009332	TCAC	2	8	1318813	1318820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28064	NC_009332	ATACC	2	10	1318849	1318858	40 %	20 %	0 %	40 %	139474154
28065	NC_009332	TTGT	2	8	1318873	1318880	0 %	75 %	25 %	0 %	139474154
28066	NC_009332	ATC	2	6	1318898	1318903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474154
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28074	NC_009332	ATTG	2	8	1319282	1319289	25 %	50 %	25 %	0 %	139474154
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28078	NC_009332	GGCTT	2	10	1319685	1319694	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28079	NC_009332	ATTT	2	8	1319778	1319785	25 %	75 %	0 %	0 %	139474155
28080	NC_009332	T	7	7	1319796	1319802	0 %	100 %	0 %	0 %	139474155
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28082	NC_009332	TTA	2	6	1319880	1319885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474155
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28091	NC_009332	CTA	2	6	1320425	1320430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474155
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28093	NC_009332	T	6	6	1320460	1320465	0 %	100 %	0 %	0 %	139474155
28094	NC_009332	A	6	6	1320531	1320536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28095	NC_009332	TCT	2	6	1320605	1320610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28101	NC_009332	GA	3	6	1320896	1320901	50 %	0 %	50 %	0 %	139474156
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28108	NC_009332	AGAT	2	8	1321295	1321302	50 %	25 %	25 %	0 %	139474156
28109	NC_009332	CATA	2	8	1321329	1321336	50 %	25 %	0 %	25 %	139474156
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28120	NC_009332	TGT	2	6	1321801	1321806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474157
28121	NC_009332	GT	3	6	1321805	1321810	0 %	50 %	50 %	0 %	139474157
28122	NC_009332	GTT	2	6	1321824	1321829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474157
28123	NC_009332	CAAT	2	8	1321909	1321916	50 %	25 %	0 %	25 %	139474157
28124	NC_009332	GTT	2	6	1321925	1321930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474157
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28136	NC_009332	TAT	2	6	1322406	1322411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28137	NC_009332	TCCA	2	8	1322465	1322472	25 %	25 %	0 %	50 %	139474158
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28188	NC_009332	CAA	2	6	1324826	1324831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28190	NC_009332	AAGT	2	8	1324933	1324940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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28194	NC_009332	AAT	2	6	1325118	1325123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28198	NC_009332	ATA	2	6	1325238	1325243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28225	NC_009332	TTTG	2	8	1326171	1326178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28226	NC_009332	TA	3	6	1326199	1326204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28227	NC_009332	GCT	2	6	1326234	1326239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28228	NC_009332	TGAA	2	8	1326286	1326293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28229	NC_009332	A	7	7	1326298	1326304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28230	NC_009332	T	6	6	1326339	1326344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28231	NC_009332	ATT	2	6	1326347	1326352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474161
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28235	NC_009332	CAA	2	6	1326704	1326709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474161
28236	NC_009332	CAT	2	6	1326749	1326754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474161
28237	NC_009332	TCT	2	6	1326790	1326795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474161
28238	NC_009332	CTC	2	6	1326920	1326925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474161
28239	NC_009332	ATC	2	6	1326984	1326989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474162
28240	NC_009332	TTG	2	6	1327030	1327035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474162
28241	NC_009332	AAC	2	6	1327130	1327135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474162
28242	NC_009332	GTC	2	6	1327193	1327198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474162
28243	NC_009332	CAT	2	6	1327224	1327229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474162
28244	NC_009332	CAT	2	6	1327263	1327268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474162
28245	NC_009332	TCG	2	6	1327338	1327343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474162
28246	NC_009332	ATA	2	6	1327415	1327420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474162
28247	NC_009332	TC	3	6	1327529	1327534	0 %	50 %	0 %	50 %	139474162
28248	NC_009332	TCAA	2	8	1327544	1327551	50 %	25 %	0 %	25 %	139474162
28249	NC_009332	T	7	7	1327560	1327566	0 %	100 %	0 %	0 %	139474162
28250	NC_009332	ATA	2	6	1327678	1327683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474162
28251	NC_009332	TTGCC	2	10	1327739	1327748	0 %	40 %	20 %	40 %	139474162
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28254	NC_009332	A	7	7	1327895	1327901	100 %	0 %	0 %	0 %	139474162
28255	NC_009332	ACCA	2	8	1327966	1327973	50 %	0 %	0 %	50 %	139474162
28256	NC_009332	ATA	2	6	1327974	1327979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474162
28257	NC_009332	CCT	2	6	1327994	1327999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28269	NC_009332	GT	3	6	1328676	1328681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28270	NC_009332	GTT	2	6	1328689	1328694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474164
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28288	NC_009332	T	6	6	1329693	1329698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28289	NC_009332	CTTTTT	2	12	1329713	1329724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28290	NC_009332	A	6	6	1329738	1329743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28291	NC_009332	ATTT	2	8	1329806	1329813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28292	NC_009332	TAT	2	6	1329822	1329827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474165
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28340	NC_009332	A	6	6	1332371	1332376	100 %	0 %	0 %	0 %	139474168
28341	NC_009332	TTA	2	6	1332464	1332469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474168
28342	NC_009332	AAGA	2	8	1332599	1332606	75 %	0 %	25 %	0 %	139474168
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28345	NC_009332	ACA	2	6	1332711	1332716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474168
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28350	NC_009332	AAGA	2	8	1332786	1332793	75 %	0 %	25 %	0 %	139474169
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28353	NC_009332	AGA	2	6	1332938	1332943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474169
28354	NC_009332	CTTC	2	8	1332974	1332981	0 %	50 %	0 %	50 %	139474169
28355	NC_009332	TCA	2	6	1332985	1332990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474169
28356	NC_009332	AAT	2	6	1333017	1333022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474169
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28359	NC_009332	AGC	2	6	1333334	1333339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474169
28360	NC_009332	GCA	2	6	1333401	1333406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474169
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28367	NC_009332	GGAAA	2	10	1333654	1333663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28368	NC_009332	A	6	6	1333764	1333769	100 %	0 %	0 %	0 %	139474170
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28432	NC_009332	A	7	7	1336677	1336683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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