MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_009332	CCA	2	6	1218762	1218767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474039
26002	NC_009332	CGCTAG	2	12	1218801	1218812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	139474039
26003	NC_009332	TCAAC	2	10	1218840	1218849	40 %	20 %	0 %	40 %	139474039
26004	NC_009332	GAG	2	6	1218937	1218942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474039
26005	NC_009332	GCA	2	6	1218949	1218954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474039
26006	NC_009332	GAT	2	6	1218970	1218975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474039
26007	NC_009332	AAG	2	6	1218983	1218988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474039
26008	NC_009332	ATA	2	6	1219144	1219149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_009332	A	7	7	1219161	1219167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26010	NC_009332	GTGCT	2	10	1219176	1219185	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26011	NC_009332	T	6	6	1219193	1219198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26012	NC_009332	CTA	2	6	1219226	1219231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474040
26013	NC_009332	TC	3	6	1219232	1219237	0 %	50 %	0 %	50 %	139474040
26014	NC_009332	ATC	2	6	1219295	1219300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474040
26015	NC_009332	ATA	2	6	1219311	1219316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474040
26016	NC_009332	T	7	7	1219326	1219332	0 %	100 %	0 %	0 %	139474040
26017	NC_009332	CCG	2	6	1219467	1219472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139474040
26018	NC_009332	TTGGCT	2	12	1219533	1219544	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	139474040
26019	NC_009332	CTG	3	9	1219583	1219591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474040
26020	NC_009332	A	6	6	1219599	1219604	100 %	0 %	0 %	0 %	139474040
26021	NC_009332	CCA	2	6	1219734	1219739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474040
26022	NC_009332	AAT	2	6	1219781	1219786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474040
26023	NC_009332	TGA	2	6	1219845	1219850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474040
26024	NC_009332	CCT	2	6	1219903	1219908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474041
26025	NC_009332	AAAC	2	8	1219977	1219984	75 %	0 %	0 %	25 %	139474041
26026	NC_009332	AAG	2	6	1220106	1220111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474041
26027	NC_009332	GCA	2	6	1220116	1220121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474041
26028	NC_009332	AAT	3	9	1220219	1220227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474041
26029	NC_009332	AAT	2	6	1220234	1220239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474041
26030	NC_009332	TAA	2	6	1220302	1220307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474041
26031	NC_009332	T	6	6	1220336	1220341	0 %	100 %	0 %	0 %	139474041
26032	NC_009332	AAC	2	6	1220381	1220386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474041
26033	NC_009332	AAC	2	6	1220579	1220584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474041
26034	NC_009332	AAT	2	6	1220601	1220606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474041
26035	NC_009332	AATC	2	8	1220644	1220651	50 %	25 %	0 %	25 %	139474041
26036	NC_009332	CCACG	2	10	1220702	1220711	20 %	0 %	20 %	60 %	139474041
26037	NC_009332	TTGAG	2	10	1220715	1220724	20 %	40 %	40 %	0 %	139474041
26038	NC_009332	CTG	2	6	1220743	1220748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474041
26039	NC_009332	CCG	2	6	1220845	1220850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139474041
26040	NC_009332	TTTCA	2	10	1220957	1220966	20 %	60 %	0 %	20 %	139474041
26041	NC_009332	TC	3	6	1220983	1220988	0 %	50 %	0 %	50 %	139474041
26042	NC_009332	TTAT	2	8	1220997	1221004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26043	NC_009332	AGCAT	2	10	1221130	1221139	40 %	20 %	20 %	20 %	139474042
26044	NC_009332	CTC	2	6	1221140	1221145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474042
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26046	NC_009332	GGA	2	6	1221264	1221269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474042
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26048	NC_009332	TCT	2	6	1221315	1221320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474042
26049	NC_009332	TGT	2	6	1221366	1221371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474042
26050	NC_009332	GAG	2	6	1221486	1221491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474043
26051	NC_009332	CTTT	2	8	1221536	1221543	0 %	75 %	0 %	25 %	139474043
26052	NC_009332	CAT	2	6	1221557	1221562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474043
26053	NC_009332	AGT	2	6	1221574	1221579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474043
26054	NC_009332	CTT	2	6	1221587	1221592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474043
26055	NC_009332	GT	3	6	1221623	1221628	0 %	50 %	50 %	0 %	139474043
26056	NC_009332	CA	4	8	1221660	1221667	50 %	0 %	0 %	50 %	139474043
26057	NC_009332	CA	3	6	1221672	1221677	50 %	0 %	0 %	50 %	139474043
26058	NC_009332	AGA	2	6	1221678	1221683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474043
26059	NC_009332	TTTG	2	8	1221799	1221806	0 %	75 %	25 %	0 %	139474043
26060	NC_009332	TCC	2	6	1221821	1221826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26061	NC_009332	T	6	6	1221867	1221872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26062	NC_009332	TAT	2	6	1221877	1221882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26063	NC_009332	A	7	7	1221888	1221894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26064	NC_009332	T	7	7	1221914	1221920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26065	NC_009332	CTT	2	6	1221987	1221992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474044
26066	NC_009332	T	6	6	1222045	1222050	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
26067	NC_009332	CTG	2	6	1222116	1222121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
26068	NC_009332	TGA	2	6	1222145	1222150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474044
26069	NC_009332	CTCAC	2	10	1222151	1222160	20 %	20 %	0 %	60 %	139474044
26070	NC_009332	GCT	2	6	1222238	1222243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
26071	NC_009332	AGC	2	6	1222249	1222254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
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26073	NC_009332	GTCC	2	8	1222364	1222371	0 %	25 %	25 %	50 %	139474044
26074	NC_009332	TTGG	2	8	1222394	1222401	0 %	50 %	50 %	0 %	139474044
26075	NC_009332	AGCAAA	2	12	1222522	1222533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	139474044
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26078	NC_009332	ACG	2	6	1222825	1222830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
26079	NC_009332	TCC	2	6	1222864	1222869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474044
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26081	NC_009332	ACG	2	6	1222957	1222962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
26082	NC_009332	CGAA	2	8	1223248	1223255	50 %	0 %	25 %	25 %	139474044
26083	NC_009332	CAG	2	6	1223301	1223306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
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26087	NC_009332	GCAT	2	8	1223516	1223523	25 %	25 %	25 %	25 %	139474044
26088	NC_009332	ATT	2	6	1223569	1223574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474044
26089	NC_009332	CATT	2	8	1223592	1223599	25 %	50 %	0 %	25 %	139474044
26090	NC_009332	T	7	7	1223735	1223741	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
26091	NC_009332	ATGAT	2	10	1223840	1223849	40 %	40 %	20 %	0 %	139474044
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26094	NC_009332	T	6	6	1224010	1224015	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
26095	NC_009332	CA	4	8	1224093	1224100	50 %	0 %	0 %	50 %	139474044
26096	NC_009332	TCA	2	6	1224116	1224121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474044
26097	NC_009332	CAAATG	2	12	1224139	1224150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	139474044
26098	NC_009332	TGC	2	6	1224268	1224273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
26099	NC_009332	CTA	2	6	1224291	1224296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474044
26100	NC_009332	ATG	2	6	1224422	1224427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26101	NC_009332	TAT	2	6	1224465	1224470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26102	NC_009332	ATCC	2	8	1224721	1224728	25 %	25 %	0 %	50 %	161378153
26103	NC_009332	CCA	2	6	1224757	1224762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161378153
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26106	NC_009332	TGA	2	6	1224860	1224865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378153
26107	NC_009332	TCA	2	6	1224958	1224963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161378153
26108	NC_009332	ACG	2	6	1224969	1224974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378153
26109	NC_009332	TCT	2	6	1225078	1225083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
26110	NC_009332	GAT	2	6	1225118	1225123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378153
26111	NC_009332	TAA	2	6	1225153	1225158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161378153
26112	NC_009332	CAA	2	6	1225181	1225186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161378153
26113	NC_009332	TTC	2	6	1225221	1225226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
26114	NC_009332	GAC	2	6	1225268	1225273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378153
26115	NC_009332	AGC	2	6	1225323	1225328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378153
26116	NC_009332	TTC	2	6	1225347	1225352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
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26118	NC_009332	CTT	2	6	1225589	1225594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26240	NC_009332	CTT	2	6	1231074	1231079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474051
26241	NC_009332	CTG	2	6	1231080	1231085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474051
26242	NC_009332	TCA	2	6	1231088	1231093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474051
26243	NC_009332	TCA	2	6	1231181	1231186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474051
26244	NC_009332	GAA	2	6	1231303	1231308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474051
26245	NC_009332	CAA	2	6	1231413	1231418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474051
26246	NC_009332	TGA	2	6	1231434	1231439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474051
26247	NC_009332	T	7	7	1231452	1231458	0 %	100 %	0 %	0 %	139474051
26248	NC_009332	GCT	2	6	1231568	1231573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474051
26249	NC_009332	AGA	2	6	1231597	1231602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474051
26250	NC_009332	AAT	2	6	1231648	1231653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474051
26251	NC_009332	AG	3	6	1231673	1231678	50 %	0 %	50 %	0 %	139474051
26252	NC_009332	TCC	2	6	1231694	1231699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26253	NC_009332	TGAT	2	8	1231717	1231724	25 %	50 %	25 %	0 %	139474052
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26255	NC_009332	AGT	2	6	1231821	1231826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474052
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26258	NC_009332	CAT	2	6	1231869	1231874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474052
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26262	NC_009332	GAT	2	6	1232126	1232131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474052
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26265	NC_009332	ATC	2	6	1232290	1232295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474052
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26269	NC_009332	ATC	2	6	1232425	1232430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474052
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26274	NC_009332	CAT	2	6	1233000	1233005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474052
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26278	NC_009332	CAC	2	6	1233217	1233222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26279	NC_009332	GAC	2	6	1233258	1233263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474053
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26281	NC_009332	ATA	2	6	1233299	1233304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474053
26282	NC_009332	TCC	2	6	1233307	1233312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474053
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26294	NC_009332	GTT	2	6	1233635	1233640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474053
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26300	NC_009332	CTG	2	6	1233884	1233889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474054
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26308	NC_009332	TCCT	2	8	1234267	1234274	0 %	50 %	0 %	50 %	139474055
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26320	NC_009332	TAT	2	6	1235008	1235013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26321	NC_009332	AAAG	2	8	1235058	1235065	75 %	0 %	25 %	0 %	139474056
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26325	NC_009332	CTATT	2	10	1235256	1235265	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26326	NC_009332	GTCT	2	8	1235346	1235353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26327	NC_009332	TTA	2	6	1235388	1235393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26329	NC_009332	TAA	2	6	1235427	1235432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26330	NC_009332	A	6	6	1235468	1235473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26331	NC_009332	GA	3	6	1235474	1235479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26332	NC_009332	A	6	6	1235527	1235532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26333	NC_009332	TAG	2	6	1235569	1235574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26334	NC_009332	TAA	2	6	1235600	1235605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26335	NC_009332	TAT	2	6	1235612	1235617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474057
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26338	NC_009332	TCA	2	6	1235711	1235716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474057
26339	NC_009332	AAATC	2	10	1235718	1235727	60 %	20 %	0 %	20 %	139474057
26340	NC_009332	A	7	7	1235737	1235743	100 %	0 %	0 %	0 %	139474057
26341	NC_009332	T	6	6	1235753	1235758	0 %	100 %	0 %	0 %	139474057
26342	NC_009332	TCC	2	6	1235785	1235790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474057
26343	NC_009332	ATC	2	6	1235810	1235815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474057
26344	NC_009332	ACC	2	6	1235893	1235898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474057
26345	NC_009332	TTA	2	6	1235949	1235954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474057
26346	NC_009332	CTG	2	6	1236204	1236209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474057
26347	NC_009332	TGA	2	6	1236219	1236224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474057
26348	NC_009332	TCTT	2	8	1236233	1236240	0 %	75 %	0 %	25 %	139474057
26349	NC_009332	T	6	6	1236272	1236277	0 %	100 %	0 %	0 %	139474057
26350	NC_009332	TGC	2	6	1236289	1236294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474057
26351	NC_009332	AAT	2	6	1236358	1236363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474057
26352	NC_009332	CAG	2	6	1236432	1236437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474057
26353	NC_009332	CAAT	2	8	1236438	1236445	50 %	25 %	0 %	25 %	139474057
26354	NC_009332	CTT	2	6	1236470	1236475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474057
26355	NC_009332	TGT	2	6	1236505	1236510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474057
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26357	NC_009332	ATCTTC	2	12	1236668	1236679	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	139474058
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