MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_009332	CTA	2	6	801913	801918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_009332	AAAACA	2	12	801921	801932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17003	NC_009332	TGA	2	6	802049	802054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_009332	ATT	2	6	802066	802071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473645
17005	NC_009332	TTG	2	6	802072	802077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473645
17006	NC_009332	TTG	2	6	802097	802102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473645
17007	NC_009332	CTTT	2	8	802122	802129	0 %	75 %	0 %	25 %	139473645
17008	NC_009332	AGC	2	6	802160	802165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17009	NC_009332	GAA	3	9	802224	802232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473645
17010	NC_009332	TTGA	2	8	802264	802271	25 %	50 %	25 %	0 %	139473645
17011	NC_009332	CTT	2	6	802291	802296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473645
17012	NC_009332	TAGC	2	8	802374	802381	25 %	25 %	25 %	25 %	139473645
17013	NC_009332	TTG	2	6	802454	802459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473645
17014	NC_009332	AGC	2	6	802532	802537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17015	NC_009332	AAG	2	6	802564	802569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473645
17016	NC_009332	GTT	2	6	802601	802606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473645
17017	NC_009332	CAG	2	6	802663	802668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17018	NC_009332	AAT	2	6	802746	802751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473645
17019	NC_009332	ACC	2	6	802787	802792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473645
17020	NC_009332	GTA	2	6	802806	802811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473645
17021	NC_009332	CAG	2	6	802837	802842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17022	NC_009332	CGA	2	6	802924	802929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17023	NC_009332	AGC	2	6	802949	802954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17024	NC_009332	CTT	2	6	802981	802986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473645
17025	NC_009332	GCA	2	6	803046	803051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473645
17026	NC_009332	T	6	6	803063	803068	0 %	100 %	0 %	0 %	139473645
17027	NC_009332	T	6	6	803071	803076	0 %	100 %	0 %	0 %	139473645
17028	NC_009332	TCT	2	6	803091	803096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473645
17029	NC_009332	T	6	6	803162	803167	0 %	100 %	0 %	0 %	139473645
17030	NC_009332	CCG	2	6	803283	803288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139473645
17031	NC_009332	TCC	2	6	803322	803327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17032	NC_009332	T	7	7	803384	803390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_009332	A	7	7	803391	803397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_009332	T	8	8	803403	803410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_009332	TTGA	2	8	803453	803460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_009332	T	6	6	803467	803472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_009332	GCA	2	6	803704	803709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473646
17038	NC_009332	AC	3	6	803731	803736	50 %	0 %	0 %	50 %	139473646
17039	NC_009332	TCC	2	6	803754	803759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139473646
17040	NC_009332	CTTT	2	8	803789	803796	0 %	75 %	0 %	25 %	139473646
17041	NC_009332	TGA	2	6	803874	803879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473646
17042	NC_009332	TAT	2	6	803931	803936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473646
17043	NC_009332	GAT	2	6	803953	803958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473646
17044	NC_009332	A	6	6	803965	803970	100 %	0 %	0 %	0 %	139473646
17045	NC_009332	TGA	2	6	803975	803980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473646
17046	NC_009332	TAA	2	6	804027	804032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473646
17047	NC_009332	TGATAA	2	12	804045	804056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	139473646
17048	NC_009332	CAG	2	6	804074	804079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473646
17049	NC_009332	ATT	2	6	804114	804119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473646
17050	NC_009332	GAT	2	6	804127	804132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473646
17051	NC_009332	GTT	2	6	804179	804184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473646
17052	NC_009332	GTT	3	9	804292	804300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473646
17053	NC_009332	TTA	2	6	804331	804336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473646
17054	NC_009332	GAT	2	6	804361	804366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473646
17055	NC_009332	TAA	2	6	804384	804389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473646
17056	NC_009332	AATT	2	8	804404	804411	50 %	50 %	0 %	0 %	139473646
17057	NC_009332	A	7	7	804581	804587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_009332	T	7	7	804611	804617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_009332	TCA	2	6	804658	804663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_009332	CCTG	2	8	804732	804739	0 %	25 %	25 %	50 %	139473647
17061	NC_009332	TTG	2	6	804782	804787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473647
17062	NC_009332	AAAC	2	8	804805	804812	75 %	0 %	0 %	25 %	139473647
17063	NC_009332	AAC	2	6	804834	804839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473647
17064	NC_009332	AC	3	6	804890	804895	50 %	0 %	0 %	50 %	139473647
17065	NC_009332	TTG	2	6	804917	804922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473647
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17070	NC_009332	GTTG	2	8	805100	805107	0 %	50 %	50 %	0 %	139473647
17071	NC_009332	GAA	2	6	805195	805200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473647
17072	NC_009332	CAT	2	6	805210	805215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473647
17073	NC_009332	TTGC	2	8	805225	805232	0 %	50 %	25 %	25 %	139473647
17074	NC_009332	A	6	6	805233	805238	100 %	0 %	0 %	0 %	139473647
17075	NC_009332	CTT	2	6	805266	805271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473647
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17080	NC_009332	CTG	2	6	805610	805615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473647
17081	NC_009332	ATT	2	6	805665	805670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473647
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17083	NC_009332	TGA	2	6	805731	805736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473647
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17085	NC_009332	GGT	2	6	805884	805889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473647
17086	NC_009332	GAA	2	6	805915	805920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473647
17087	NC_009332	TTA	2	6	806038	806043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473647
17088	NC_009332	TTAT	2	8	806147	806154	25 %	75 %	0 %	0 %	139473647
17089	NC_009332	ATA	2	6	806181	806186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473647
17090	NC_009332	ATT	2	6	806199	806204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_009332	AAACT	2	10	806244	806253	60 %	20 %	0 %	20 %	139473648
17092	NC_009332	TATC	2	8	806291	806298	25 %	50 %	0 %	25 %	139473648
17093	NC_009332	ATT	2	6	806299	806304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473648
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17100	NC_009332	CAT	2	6	806535	806540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473648
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17102	NC_009332	GTT	2	6	806608	806613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473648
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17104	NC_009332	ACT	2	6	806655	806660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473648
17105	NC_009332	TGGT	2	8	806678	806685	0 %	50 %	50 %	0 %	139473648
17106	NC_009332	ATG	2	6	806703	806708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473648
17107	NC_009332	TGA	2	6	806974	806979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473648
17108	NC_009332	CATC	2	8	807047	807054	25 %	25 %	0 %	50 %	139473648
17109	NC_009332	AATT	2	8	807069	807076	50 %	50 %	0 %	0 %	139473648
17110	NC_009332	CTTTGA	2	12	807100	807111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	139473648
17111	NC_009332	TGT	2	6	807124	807129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473648
17112	NC_009332	TGGT	2	8	807138	807145	0 %	50 %	50 %	0 %	139473648
17113	NC_009332	CTTA	2	8	807195	807202	25 %	50 %	0 %	25 %	139473648
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17117	NC_009332	ATT	2	6	807287	807292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473648
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17119	NC_009332	AGC	2	6	807358	807363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473648
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17121	NC_009332	CAA	3	9	807430	807438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473648
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